Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2GKM8

Protein Details
Accession A0A1Y2GKM8    Localization Confidence High Confidence Score 19.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
137-163GTGITKSANKKRRRKHRKAAEKVAGKPBasic
198-230QGGKTRKQRKIEHSPSRQHELRKKKLRRDFDARBasic
290-314TTEPEAQRKQQQRQQQEKKGSDQKIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
144-166ANKKRRRKHRKAAEKVAGKPETI
201-225KTRKQRKIEHSPSRQHELRKKKLRR
Subcellular Location(s) nucl 14, mito 9, cyto_nucl 9, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MHQSTGSKFTLDSLMTRVLPSLDVTVPISTEGTKKFKRIRPVTSTTLTAPNTPTALTSSTTTTTTTANITAIPATEIAATASADIGVTTTSLGSKLGSPSHQLKTFKDIENGAIPIQTASSSSTATGTESQTATEAGTGITKSANKKRRRKHRKAAEKVAGKPETIGKARAAGTITGTAIETETGTTIMSSLDTTEDQGGKTRKQRKIEHSPSRQHELRKKKLRRDFDARPELVGISKEEDFSTLLVKHVEETNKKLQRDLEKQSQEMEAAQQKQAEQLLKATLGTASLTTEPEAQRKQQQRQQQEKKGSDQKINPHSPSFVPRKNCNFWLKGHCRSGVNCTFRHDPALRNTASTTTTPTISDIAIAQNYV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.23
3 0.23
4 0.22
5 0.18
6 0.18
7 0.17
8 0.17
9 0.13
10 0.14
11 0.16
12 0.15
13 0.15
14 0.15
15 0.14
16 0.12
17 0.16
18 0.2
19 0.27
20 0.3
21 0.38
22 0.47
23 0.53
24 0.62
25 0.66
26 0.7
27 0.7
28 0.74
29 0.73
30 0.67
31 0.64
32 0.56
33 0.55
34 0.47
35 0.4
36 0.35
37 0.3
38 0.27
39 0.24
40 0.21
41 0.16
42 0.17
43 0.16
44 0.15
45 0.16
46 0.17
47 0.18
48 0.18
49 0.17
50 0.16
51 0.16
52 0.16
53 0.14
54 0.12
55 0.12
56 0.11
57 0.11
58 0.1
59 0.09
60 0.08
61 0.08
62 0.07
63 0.07
64 0.06
65 0.07
66 0.06
67 0.06
68 0.05
69 0.05
70 0.05
71 0.04
72 0.04
73 0.03
74 0.04
75 0.04
76 0.04
77 0.04
78 0.05
79 0.05
80 0.06
81 0.07
82 0.09
83 0.12
84 0.13
85 0.17
86 0.23
87 0.28
88 0.34
89 0.35
90 0.34
91 0.39
92 0.44
93 0.42
94 0.39
95 0.35
96 0.31
97 0.31
98 0.31
99 0.24
100 0.18
101 0.15
102 0.12
103 0.11
104 0.08
105 0.06
106 0.07
107 0.08
108 0.08
109 0.08
110 0.08
111 0.09
112 0.1
113 0.12
114 0.11
115 0.12
116 0.12
117 0.12
118 0.12
119 0.12
120 0.1
121 0.08
122 0.07
123 0.05
124 0.06
125 0.06
126 0.06
127 0.07
128 0.1
129 0.15
130 0.24
131 0.33
132 0.42
133 0.51
134 0.61
135 0.71
136 0.8
137 0.85
138 0.87
139 0.9
140 0.91
141 0.92
142 0.93
143 0.9
144 0.86
145 0.79
146 0.76
147 0.66
148 0.54
149 0.45
150 0.37
151 0.33
152 0.27
153 0.25
154 0.16
155 0.19
156 0.19
157 0.2
158 0.17
159 0.13
160 0.12
161 0.12
162 0.11
163 0.08
164 0.08
165 0.06
166 0.06
167 0.05
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.03
174 0.04
175 0.03
176 0.04
177 0.03
178 0.04
179 0.04
180 0.05
181 0.06
182 0.07
183 0.07
184 0.07
185 0.13
186 0.15
187 0.18
188 0.26
189 0.35
190 0.39
191 0.47
192 0.55
193 0.59
194 0.68
195 0.75
196 0.77
197 0.77
198 0.8
199 0.76
200 0.76
201 0.71
202 0.67
203 0.64
204 0.64
205 0.66
206 0.68
207 0.72
208 0.74
209 0.79
210 0.81
211 0.8
212 0.79
213 0.77
214 0.77
215 0.78
216 0.68
217 0.6
218 0.52
219 0.44
220 0.36
221 0.28
222 0.18
223 0.11
224 0.11
225 0.11
226 0.11
227 0.11
228 0.1
229 0.1
230 0.11
231 0.09
232 0.1
233 0.1
234 0.1
235 0.1
236 0.14
237 0.19
238 0.2
239 0.25
240 0.35
241 0.4
242 0.4
243 0.41
244 0.43
245 0.47
246 0.52
247 0.54
248 0.54
249 0.52
250 0.52
251 0.52
252 0.47
253 0.38
254 0.3
255 0.28
256 0.24
257 0.22
258 0.23
259 0.22
260 0.21
261 0.23
262 0.26
263 0.23
264 0.17
265 0.17
266 0.17
267 0.16
268 0.16
269 0.14
270 0.11
271 0.09
272 0.09
273 0.07
274 0.07
275 0.08
276 0.09
277 0.09
278 0.14
279 0.15
280 0.21
281 0.24
282 0.26
283 0.35
284 0.43
285 0.51
286 0.53
287 0.61
288 0.65
289 0.74
290 0.81
291 0.81
292 0.83
293 0.78
294 0.82
295 0.82
296 0.77
297 0.74
298 0.69
299 0.69
300 0.69
301 0.72
302 0.66
303 0.58
304 0.55
305 0.5
306 0.53
307 0.52
308 0.49
309 0.49
310 0.55
311 0.62
312 0.65
313 0.7
314 0.7
315 0.63
316 0.64
317 0.67
318 0.67
319 0.67
320 0.66
321 0.62
322 0.58
323 0.57
324 0.59
325 0.57
326 0.54
327 0.47
328 0.48
329 0.49
330 0.46
331 0.52
332 0.45
333 0.42
334 0.45
335 0.52
336 0.46
337 0.43
338 0.43
339 0.38
340 0.38
341 0.33
342 0.31
343 0.25
344 0.26
345 0.24
346 0.24
347 0.23
348 0.2
349 0.2
350 0.15
351 0.16