Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2BIK0

Protein Details
Accession A0A1Y2BIK0    Localization Confidence High Confidence Score 15
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
347-377PEPSPTTKPHTRRLVKRSKVKEIKSPVKPKTHydrophilic
395-414AAVTRPTTQHRPKTVPKSAGHydrophilic
436-455GEFKGEPTASKKKKKGQTIKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
355-392PHTRRLVKRSKVKEIKSPVKPKTPAAPKTPASKTPAAK
445-453SKKKKKGQT
Subcellular Location(s) cyto 11, mito 7.5, mito_nucl 7, cyto_pero 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003533  Doublecortin_dom  
IPR036572  Doublecortin_dom_sf  
Gene Ontology GO:0035556  P:intracellular signal transduction  
Pfam View protein in Pfam  
PF03607  DCX  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50309  DC  
Amino Acid Sequences MIDEQKGIKVYLFRNGDTFTPAKRIVVSTRVFKNYEQFLHRASQDLSLLHGAIRHLYTLSGGEVTSLAQLKDGHSYVGVASGESFKQVAYKVPEEPGASRLVAGTGLGGGIALVKMPELRKVVKDAKDDEGVFTSTSKGYRVVVFLNGNTKCADLNIVLNYRTCKNFERLLTTLSTIFQRRIRRLYDAESYARLTSLAQLHDGHNLVAGGEFDPIMKVAYPLVNPLIPKEKNHAHHVPKVATFYLNGDAYYRGYQLTVKRARFPNLQELMDHLTQALDLTLAYRVTRIHRLDNGHKLTDETLDPLFSPLPSAPSKFVVVCGDDVFYNIEYDVNAHQHLILNANTDDPEPSPTTKPHTRRLVKRSKVKEIKSPVKPKTPAAPKTPASKTPAAKTPAAVTRPTTQHRPKTVPKSAGAFRHGEEGLYGNETGLQEFETGEFKGEPTASKKKKKGQTIK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.35
3 0.33
4 0.33
5 0.33
6 0.27
7 0.29
8 0.3
9 0.28
10 0.28
11 0.3
12 0.29
13 0.35
14 0.37
15 0.38
16 0.45
17 0.49
18 0.49
19 0.47
20 0.5
21 0.49
22 0.51
23 0.48
24 0.43
25 0.41
26 0.44
27 0.43
28 0.39
29 0.34
30 0.3
31 0.28
32 0.25
33 0.25
34 0.21
35 0.2
36 0.17
37 0.17
38 0.14
39 0.14
40 0.14
41 0.12
42 0.11
43 0.11
44 0.12
45 0.11
46 0.11
47 0.09
48 0.09
49 0.08
50 0.08
51 0.09
52 0.11
53 0.11
54 0.1
55 0.11
56 0.13
57 0.13
58 0.18
59 0.18
60 0.15
61 0.14
62 0.15
63 0.12
64 0.16
65 0.15
66 0.1
67 0.1
68 0.12
69 0.12
70 0.12
71 0.12
72 0.08
73 0.1
74 0.11
75 0.16
76 0.19
77 0.22
78 0.23
79 0.25
80 0.28
81 0.28
82 0.29
83 0.25
84 0.22
85 0.19
86 0.17
87 0.15
88 0.12
89 0.1
90 0.09
91 0.07
92 0.04
93 0.04
94 0.04
95 0.03
96 0.03
97 0.03
98 0.03
99 0.03
100 0.03
101 0.03
102 0.06
103 0.07
104 0.11
105 0.14
106 0.17
107 0.18
108 0.26
109 0.34
110 0.38
111 0.42
112 0.41
113 0.43
114 0.45
115 0.44
116 0.38
117 0.32
118 0.27
119 0.22
120 0.19
121 0.16
122 0.12
123 0.13
124 0.12
125 0.11
126 0.12
127 0.13
128 0.14
129 0.14
130 0.17
131 0.17
132 0.18
133 0.24
134 0.23
135 0.23
136 0.21
137 0.2
138 0.16
139 0.15
140 0.15
141 0.08
142 0.11
143 0.13
144 0.15
145 0.15
146 0.16
147 0.18
148 0.19
149 0.2
150 0.21
151 0.21
152 0.23
153 0.28
154 0.28
155 0.32
156 0.31
157 0.32
158 0.3
159 0.28
160 0.24
161 0.2
162 0.21
163 0.15
164 0.17
165 0.21
166 0.26
167 0.29
168 0.33
169 0.35
170 0.37
171 0.38
172 0.4
173 0.4
174 0.37
175 0.35
176 0.31
177 0.3
178 0.25
179 0.22
180 0.17
181 0.12
182 0.12
183 0.13
184 0.12
185 0.12
186 0.13
187 0.14
188 0.16
189 0.16
190 0.13
191 0.1
192 0.1
193 0.08
194 0.07
195 0.07
196 0.05
197 0.04
198 0.05
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.05
206 0.06
207 0.06
208 0.07
209 0.08
210 0.09
211 0.09
212 0.1
213 0.17
214 0.16
215 0.17
216 0.21
217 0.27
218 0.29
219 0.36
220 0.42
221 0.4
222 0.44
223 0.47
224 0.44
225 0.39
226 0.38
227 0.31
228 0.24
229 0.19
230 0.16
231 0.14
232 0.12
233 0.11
234 0.1
235 0.1
236 0.11
237 0.12
238 0.1
239 0.08
240 0.08
241 0.11
242 0.13
243 0.22
244 0.28
245 0.28
246 0.35
247 0.38
248 0.42
249 0.44
250 0.45
251 0.45
252 0.43
253 0.42
254 0.35
255 0.34
256 0.34
257 0.29
258 0.26
259 0.15
260 0.11
261 0.1
262 0.1
263 0.08
264 0.03
265 0.03
266 0.04
267 0.05
268 0.05
269 0.05
270 0.06
271 0.07
272 0.11
273 0.18
274 0.2
275 0.23
276 0.27
277 0.33
278 0.39
279 0.47
280 0.48
281 0.42
282 0.4
283 0.37
284 0.33
285 0.29
286 0.23
287 0.16
288 0.12
289 0.11
290 0.11
291 0.11
292 0.11
293 0.08
294 0.1
295 0.08
296 0.12
297 0.13
298 0.14
299 0.15
300 0.17
301 0.19
302 0.17
303 0.19
304 0.17
305 0.16
306 0.16
307 0.14
308 0.13
309 0.11
310 0.12
311 0.12
312 0.1
313 0.09
314 0.08
315 0.07
316 0.07
317 0.08
318 0.1
319 0.1
320 0.1
321 0.1
322 0.11
323 0.12
324 0.13
325 0.14
326 0.13
327 0.14
328 0.14
329 0.15
330 0.14
331 0.13
332 0.14
333 0.11
334 0.15
335 0.14
336 0.17
337 0.19
338 0.21
339 0.29
340 0.37
341 0.42
342 0.47
343 0.56
344 0.62
345 0.69
346 0.78
347 0.81
348 0.81
349 0.86
350 0.85
351 0.85
352 0.85
353 0.8
354 0.79
355 0.78
356 0.79
357 0.79
358 0.81
359 0.77
360 0.77
361 0.75
362 0.7
363 0.7
364 0.7
365 0.66
366 0.64
367 0.65
368 0.59
369 0.65
370 0.66
371 0.62
372 0.58
373 0.59
374 0.56
375 0.54
376 0.58
377 0.54
378 0.5
379 0.45
380 0.45
381 0.45
382 0.43
383 0.39
384 0.34
385 0.38
386 0.44
387 0.47
388 0.51
389 0.53
390 0.6
391 0.66
392 0.71
393 0.74
394 0.77
395 0.81
396 0.77
397 0.72
398 0.7
399 0.68
400 0.66
401 0.6
402 0.53
403 0.44
404 0.44
405 0.39
406 0.32
407 0.27
408 0.22
409 0.19
410 0.19
411 0.18
412 0.11
413 0.14
414 0.15
415 0.14
416 0.12
417 0.11
418 0.09
419 0.1
420 0.11
421 0.11
422 0.11
423 0.13
424 0.13
425 0.12
426 0.15
427 0.16
428 0.19
429 0.24
430 0.35
431 0.43
432 0.53
433 0.62
434 0.68
435 0.76