Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2CLF3

Protein Details
Accession A0A1Y2CLF3    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
18-70DSSTSSSKHHSHKSKKKHKKDAREKTSKGKKDKKEKHAKKHKKSHSEERDKATBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
26-63HHSHKSKKKHKKDAREKTSKGKKDKKEKHAKKHKKSHS
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019532  Nucl_RNA-splicing_assoc_SR-25  
Gene Ontology GO:0016607  C:nuclear speck  
GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF10500  SR-25  
Amino Acid Sequences MGKSKKRDRDSSSSSDSDSSTSSSKHHSHKSKKKHKKDAREKTSKGKKDKKEKHAKKHKKSHSEERDKATVASKSHLAQWMAEGMEAEFGGSATAKPATSQQPPIPPTTSDHKHHLPPSRSIQPPTASNTRTPMVPQRPEEFEREQQQVRRIIDPIDGRSRLVKGTGEIIEEIVSRERHHEINKQATKGDGAVYSKVLHSLAKDG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.52
3 0.44
4 0.35
5 0.29
6 0.23
7 0.18
8 0.17
9 0.17
10 0.22
11 0.28
12 0.34
13 0.43
14 0.51
15 0.6
16 0.69
17 0.79
18 0.84
19 0.89
20 0.92
21 0.94
22 0.94
23 0.94
24 0.95
25 0.95
26 0.95
27 0.94
28 0.88
29 0.88
30 0.88
31 0.85
32 0.84
33 0.83
34 0.82
35 0.82
36 0.88
37 0.88
38 0.89
39 0.91
40 0.91
41 0.93
42 0.94
43 0.94
44 0.94
45 0.93
46 0.92
47 0.9
48 0.9
49 0.9
50 0.89
51 0.84
52 0.8
53 0.73
54 0.63
55 0.56
56 0.49
57 0.41
58 0.31
59 0.27
60 0.23
61 0.2
62 0.22
63 0.25
64 0.21
65 0.17
66 0.16
67 0.16
68 0.14
69 0.13
70 0.11
71 0.07
72 0.06
73 0.06
74 0.05
75 0.03
76 0.03
77 0.03
78 0.03
79 0.03
80 0.04
81 0.04
82 0.04
83 0.05
84 0.08
85 0.12
86 0.14
87 0.18
88 0.19
89 0.25
90 0.27
91 0.29
92 0.27
93 0.24
94 0.25
95 0.29
96 0.31
97 0.29
98 0.32
99 0.33
100 0.36
101 0.41
102 0.46
103 0.42
104 0.43
105 0.46
106 0.49
107 0.48
108 0.46
109 0.45
110 0.39
111 0.38
112 0.38
113 0.37
114 0.31
115 0.3
116 0.31
117 0.28
118 0.25
119 0.25
120 0.28
121 0.3
122 0.34
123 0.36
124 0.37
125 0.42
126 0.43
127 0.47
128 0.43
129 0.41
130 0.41
131 0.42
132 0.42
133 0.41
134 0.44
135 0.45
136 0.42
137 0.38
138 0.35
139 0.31
140 0.32
141 0.32
142 0.31
143 0.32
144 0.31
145 0.29
146 0.31
147 0.31
148 0.26
149 0.24
150 0.2
151 0.14
152 0.18
153 0.19
154 0.18
155 0.17
156 0.16
157 0.15
158 0.14
159 0.14
160 0.13
161 0.13
162 0.13
163 0.16
164 0.19
165 0.23
166 0.28
167 0.34
168 0.39
169 0.49
170 0.55
171 0.53
172 0.51
173 0.48
174 0.45
175 0.38
176 0.32
177 0.25
178 0.21
179 0.21
180 0.21
181 0.21
182 0.2
183 0.2
184 0.19
185 0.16