Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2B0U8

Protein Details
Accession A0A1Y2B0U8    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
195-218INDPKERKRYRHLRKDGSKRKYDLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
199-214KERKRYRHLRKDGSKR
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 9.833, mito 6.5, cyto_mito 5.833, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003406  Glyco_trans_14  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0030158  F:protein xylosyltransferase activity  
GO:0030206  P:chondroitin sulfate biosynthetic process  
GO:0015012  P:heparan sulfate proteoglycan biosynthetic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF02485  Branch  
Amino Acid Sequences MNKIVLPPFNAMLHSEYNLGRIVALSQRRASIDADQTDFINDSLDALSTNALDQLDSDSGLSKISKLHFKADGFKYCYNLNNATFNLDSVIHNWPNTPPQRISEINPTTQQFTEFIDERAKKMYNTIMKIHKGAFVKEQTRRLMCYMAAEGSNALANLTDSRLVHEIDRVAYFSSFLPAIVPPTLPVSIPTPDSINDPKERKRYRHLRKDGSKRKYDLAYLIMAHGNMSRIQSIETLVDEKESLPLMKAVKDFIAKREQAVNDFIKSQKLSIDAWDDADVAGNVFMAATPFEVSWGHGSIMWSQMNGFWELLDLADWKHIINLSSQDYPLRASREIARILNQPKFDGFNFLDTGLLILHWQKDYCHSSPPEEKASDNSEFSHESAWDDVATFSQDGNT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.23
3 0.2
4 0.21
5 0.21
6 0.19
7 0.15
8 0.13
9 0.14
10 0.18
11 0.23
12 0.26
13 0.26
14 0.29
15 0.31
16 0.32
17 0.32
18 0.31
19 0.34
20 0.34
21 0.35
22 0.33
23 0.31
24 0.31
25 0.29
26 0.22
27 0.16
28 0.12
29 0.1
30 0.09
31 0.09
32 0.08
33 0.08
34 0.08
35 0.07
36 0.08
37 0.08
38 0.08
39 0.08
40 0.08
41 0.11
42 0.11
43 0.11
44 0.11
45 0.1
46 0.1
47 0.12
48 0.12
49 0.09
50 0.13
51 0.17
52 0.25
53 0.26
54 0.31
55 0.35
56 0.37
57 0.46
58 0.49
59 0.53
60 0.51
61 0.51
62 0.48
63 0.45
64 0.47
65 0.43
66 0.4
67 0.34
68 0.32
69 0.31
70 0.32
71 0.29
72 0.25
73 0.22
74 0.18
75 0.16
76 0.15
77 0.21
78 0.18
79 0.18
80 0.19
81 0.2
82 0.27
83 0.3
84 0.33
85 0.28
86 0.3
87 0.36
88 0.37
89 0.39
90 0.41
91 0.41
92 0.38
93 0.41
94 0.39
95 0.36
96 0.34
97 0.31
98 0.22
99 0.2
100 0.22
101 0.19
102 0.19
103 0.25
104 0.25
105 0.25
106 0.29
107 0.28
108 0.23
109 0.24
110 0.3
111 0.29
112 0.31
113 0.36
114 0.39
115 0.4
116 0.42
117 0.4
118 0.38
119 0.33
120 0.31
121 0.31
122 0.31
123 0.36
124 0.39
125 0.44
126 0.44
127 0.44
128 0.45
129 0.4
130 0.35
131 0.28
132 0.25
133 0.2
134 0.16
135 0.15
136 0.13
137 0.11
138 0.09
139 0.09
140 0.07
141 0.05
142 0.04
143 0.04
144 0.05
145 0.05
146 0.07
147 0.06
148 0.09
149 0.1
150 0.11
151 0.11
152 0.12
153 0.12
154 0.12
155 0.12
156 0.11
157 0.1
158 0.09
159 0.1
160 0.08
161 0.09
162 0.07
163 0.07
164 0.07
165 0.06
166 0.08
167 0.08
168 0.07
169 0.07
170 0.08
171 0.09
172 0.08
173 0.09
174 0.09
175 0.1
176 0.11
177 0.11
178 0.1
179 0.1
180 0.14
181 0.15
182 0.16
183 0.21
184 0.24
185 0.29
186 0.38
187 0.43
188 0.44
189 0.52
190 0.6
191 0.65
192 0.72
193 0.76
194 0.77
195 0.81
196 0.89
197 0.89
198 0.86
199 0.81
200 0.73
201 0.67
202 0.59
203 0.5
204 0.41
205 0.33
206 0.26
207 0.2
208 0.19
209 0.15
210 0.13
211 0.12
212 0.1
213 0.09
214 0.08
215 0.08
216 0.08
217 0.07
218 0.08
219 0.08
220 0.09
221 0.08
222 0.08
223 0.09
224 0.08
225 0.08
226 0.08
227 0.08
228 0.08
229 0.08
230 0.08
231 0.07
232 0.1
233 0.1
234 0.13
235 0.13
236 0.13
237 0.14
238 0.18
239 0.19
240 0.2
241 0.27
242 0.25
243 0.26
244 0.31
245 0.3
246 0.28
247 0.33
248 0.31
249 0.24
250 0.26
251 0.25
252 0.22
253 0.22
254 0.2
255 0.16
256 0.16
257 0.16
258 0.16
259 0.2
260 0.16
261 0.17
262 0.17
263 0.16
264 0.13
265 0.13
266 0.11
267 0.07
268 0.06
269 0.05
270 0.04
271 0.04
272 0.04
273 0.03
274 0.04
275 0.04
276 0.05
277 0.05
278 0.06
279 0.06
280 0.08
281 0.09
282 0.1
283 0.1
284 0.11
285 0.12
286 0.13
287 0.17
288 0.16
289 0.14
290 0.13
291 0.15
292 0.15
293 0.16
294 0.14
295 0.09
296 0.1
297 0.1
298 0.09
299 0.08
300 0.07
301 0.06
302 0.08
303 0.08
304 0.08
305 0.09
306 0.1
307 0.1
308 0.12
309 0.16
310 0.19
311 0.21
312 0.22
313 0.21
314 0.21
315 0.23
316 0.24
317 0.24
318 0.21
319 0.21
320 0.27
321 0.31
322 0.36
323 0.35
324 0.35
325 0.39
326 0.45
327 0.47
328 0.42
329 0.38
330 0.35
331 0.37
332 0.33
333 0.33
334 0.27
335 0.26
336 0.26
337 0.24
338 0.23
339 0.19
340 0.19
341 0.11
342 0.1
343 0.07
344 0.09
345 0.11
346 0.12
347 0.13
348 0.14
349 0.21
350 0.28
351 0.29
352 0.35
353 0.35
354 0.42
355 0.49
356 0.54
357 0.54
358 0.49
359 0.48
360 0.45
361 0.48
362 0.44
363 0.38
364 0.34
365 0.3
366 0.31
367 0.3
368 0.27
369 0.22
370 0.2
371 0.2
372 0.19
373 0.15
374 0.14
375 0.14
376 0.12
377 0.14
378 0.13