Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2CHU6

Protein Details
Accession A0A1Y2CHU6    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
6-27LETQRRTTRKSSDFRNKLPRIDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 16, mito 7, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000690  Matrin/U1-C_Znf_C2H2  
IPR024598  SF3a60/Prp9_C  
IPR021966  SF3a60_bindingd  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF12108  SF3a60_bindingd  
PF11931  SF3a60_Prp9_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50171  ZF_MATRIN  
Amino Acid Sequences MSTSILETQRRTTRKSSDFRNKLPRIDTRHKKLGQAHSANRINRHLDRIQSLSQSLLDTYADANGARKAEIASISNAGNSADFTEFYNRLKDIKDHHRRHPDEKVEVLELEVAKVDEDQELEADYKRYLAHLVEYLEGFCKRALPLLDHASLRNAATEEVNEWAASQDQDMADPSCSVTLHKKAAEVFAANGGKISQEKQTEVVQSKLEALKEVKLLEVTIQKLGESLVQQREDTRDLIERKQTLSVDEIEKAKAEDFSADEEEEEENNEIYNPLKLPMGWDGKPIPYWLFKLHGLGVEYPCEICGNFIYMGRKAFDRHFQEWRHAHGMKCLGIPNLKHFQEITKISDAFALWEKLNTAKKAEAFKAEAMEEFEDAEGNVFNKKTFEDLRRQGLL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.62
2 0.68
3 0.71
4 0.73
5 0.79
6 0.83
7 0.87
8 0.82
9 0.79
10 0.78
11 0.75
12 0.74
13 0.75
14 0.76
15 0.74
16 0.79
17 0.75
18 0.75
19 0.76
20 0.76
21 0.76
22 0.75
23 0.72
24 0.72
25 0.76
26 0.73
27 0.69
28 0.64
29 0.6
30 0.54
31 0.55
32 0.48
33 0.46
34 0.47
35 0.47
36 0.45
37 0.41
38 0.38
39 0.33
40 0.29
41 0.25
42 0.2
43 0.16
44 0.12
45 0.1
46 0.1
47 0.09
48 0.09
49 0.08
50 0.1
51 0.11
52 0.12
53 0.11
54 0.12
55 0.11
56 0.13
57 0.15
58 0.15
59 0.15
60 0.16
61 0.16
62 0.16
63 0.15
64 0.13
65 0.11
66 0.09
67 0.1
68 0.08
69 0.09
70 0.1
71 0.15
72 0.17
73 0.18
74 0.21
75 0.19
76 0.2
77 0.22
78 0.24
79 0.27
80 0.37
81 0.47
82 0.5
83 0.6
84 0.69
85 0.72
86 0.75
87 0.76
88 0.73
89 0.67
90 0.63
91 0.56
92 0.47
93 0.41
94 0.35
95 0.28
96 0.2
97 0.15
98 0.12
99 0.09
100 0.08
101 0.08
102 0.08
103 0.06
104 0.06
105 0.06
106 0.06
107 0.07
108 0.08
109 0.09
110 0.09
111 0.08
112 0.09
113 0.09
114 0.09
115 0.1
116 0.09
117 0.1
118 0.12
119 0.13
120 0.13
121 0.13
122 0.13
123 0.14
124 0.14
125 0.13
126 0.1
127 0.1
128 0.09
129 0.12
130 0.13
131 0.14
132 0.18
133 0.22
134 0.25
135 0.24
136 0.24
137 0.22
138 0.22
139 0.19
140 0.16
141 0.11
142 0.09
143 0.09
144 0.09
145 0.08
146 0.08
147 0.09
148 0.07
149 0.07
150 0.07
151 0.07
152 0.07
153 0.06
154 0.07
155 0.06
156 0.07
157 0.08
158 0.08
159 0.08
160 0.08
161 0.08
162 0.07
163 0.07
164 0.08
165 0.11
166 0.14
167 0.17
168 0.17
169 0.19
170 0.19
171 0.2
172 0.2
173 0.16
174 0.12
175 0.15
176 0.14
177 0.13
178 0.12
179 0.11
180 0.1
181 0.1
182 0.11
183 0.1
184 0.11
185 0.12
186 0.14
187 0.16
188 0.2
189 0.21
190 0.21
191 0.17
192 0.16
193 0.18
194 0.18
195 0.16
196 0.14
197 0.13
198 0.13
199 0.14
200 0.14
201 0.12
202 0.1
203 0.1
204 0.11
205 0.13
206 0.12
207 0.12
208 0.12
209 0.12
210 0.12
211 0.12
212 0.11
213 0.09
214 0.13
215 0.15
216 0.16
217 0.17
218 0.18
219 0.2
220 0.21
221 0.2
222 0.17
223 0.19
224 0.21
225 0.24
226 0.28
227 0.27
228 0.26
229 0.29
230 0.28
231 0.22
232 0.22
233 0.22
234 0.18
235 0.19
236 0.19
237 0.16
238 0.16
239 0.16
240 0.14
241 0.12
242 0.1
243 0.09
244 0.08
245 0.11
246 0.12
247 0.12
248 0.11
249 0.12
250 0.12
251 0.11
252 0.12
253 0.09
254 0.08
255 0.08
256 0.08
257 0.07
258 0.07
259 0.08
260 0.07
261 0.08
262 0.08
263 0.08
264 0.1
265 0.17
266 0.22
267 0.21
268 0.23
269 0.24
270 0.25
271 0.26
272 0.26
273 0.21
274 0.18
275 0.2
276 0.19
277 0.21
278 0.2
279 0.22
280 0.22
281 0.22
282 0.21
283 0.22
284 0.21
285 0.19
286 0.19
287 0.16
288 0.15
289 0.13
290 0.11
291 0.09
292 0.08
293 0.1
294 0.1
295 0.13
296 0.16
297 0.18
298 0.2
299 0.2
300 0.21
301 0.21
302 0.24
303 0.3
304 0.35
305 0.38
306 0.44
307 0.45
308 0.53
309 0.54
310 0.57
311 0.56
312 0.51
313 0.47
314 0.45
315 0.48
316 0.4
317 0.39
318 0.36
319 0.31
320 0.32
321 0.33
322 0.33
323 0.37
324 0.35
325 0.34
326 0.32
327 0.32
328 0.36
329 0.38
330 0.36
331 0.33
332 0.33
333 0.32
334 0.33
335 0.3
336 0.25
337 0.25
338 0.23
339 0.17
340 0.18
341 0.19
342 0.23
343 0.3
344 0.29
345 0.28
346 0.3
347 0.35
348 0.41
349 0.44
350 0.43
351 0.4
352 0.41
353 0.4
354 0.37
355 0.33
356 0.29
357 0.26
358 0.21
359 0.18
360 0.15
361 0.12
362 0.11
363 0.11
364 0.09
365 0.08
366 0.12
367 0.12
368 0.13
369 0.14
370 0.15
371 0.2
372 0.27
373 0.33
374 0.4
375 0.47