Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2CBM3

Protein Details
Accession A0A1Y2CBM3    Localization Confidence High Confidence Score 20.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
21-48DNKTDVKKEFERSKRNHKEEIRNAKVKRBasic
176-199VEKQNEKRKSFSKRKAHNPDDDVTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
26-48VKKEFERSKRNHKEEIRNAKVKR
85-92KERAKEKR
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013260  mRNA_splic_SYF2  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF08231  SYF2  
Amino Acid Sequences MDERLKKLEALKKQRESSLKDNKTDVKKEFERSKRNHKEEIRNAKVKREAEILAEKLKAEEEGVDYERVRAMTYSVESVERYEKKERAKEKRKEIDFTDYAQIAAKKYKSLTKALEPNMEKYQEQKLISEIASVAAGTAVVGSAGQVVTADANSSAYAAIGNKPSQESVLKLVKEVEKQNEKRKSFSKRKAHNPDDDVTYINERNMRFNKKISRAYDKHTAEIKAAFERGTAL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.74
2 0.73
3 0.73
4 0.73
5 0.73
6 0.7
7 0.65
8 0.66
9 0.67
10 0.68
11 0.68
12 0.61
13 0.59
14 0.58
15 0.63
16 0.67
17 0.69
18 0.7
19 0.71
20 0.78
21 0.8
22 0.81
23 0.82
24 0.81
25 0.82
26 0.83
27 0.86
28 0.84
29 0.81
30 0.77
31 0.74
32 0.72
33 0.62
34 0.55
35 0.48
36 0.39
37 0.35
38 0.4
39 0.35
40 0.3
41 0.3
42 0.26
43 0.22
44 0.22
45 0.17
46 0.11
47 0.1
48 0.08
49 0.11
50 0.13
51 0.14
52 0.14
53 0.15
54 0.15
55 0.15
56 0.13
57 0.1
58 0.09
59 0.09
60 0.1
61 0.11
62 0.1
63 0.11
64 0.11
65 0.12
66 0.19
67 0.19
68 0.22
69 0.27
70 0.3
71 0.36
72 0.44
73 0.52
74 0.56
75 0.65
76 0.69
77 0.74
78 0.8
79 0.77
80 0.73
81 0.67
82 0.64
83 0.54
84 0.48
85 0.4
86 0.31
87 0.27
88 0.24
89 0.22
90 0.15
91 0.17
92 0.14
93 0.13
94 0.14
95 0.18
96 0.19
97 0.23
98 0.25
99 0.28
100 0.34
101 0.35
102 0.41
103 0.38
104 0.39
105 0.37
106 0.35
107 0.29
108 0.25
109 0.27
110 0.24
111 0.24
112 0.21
113 0.19
114 0.19
115 0.19
116 0.17
117 0.12
118 0.08
119 0.07
120 0.07
121 0.06
122 0.04
123 0.03
124 0.03
125 0.03
126 0.02
127 0.02
128 0.02
129 0.02
130 0.02
131 0.02
132 0.02
133 0.03
134 0.03
135 0.03
136 0.03
137 0.04
138 0.03
139 0.04
140 0.04
141 0.04
142 0.04
143 0.04
144 0.05
145 0.05
146 0.07
147 0.1
148 0.1
149 0.11
150 0.12
151 0.12
152 0.14
153 0.14
154 0.14
155 0.17
156 0.23
157 0.22
158 0.22
159 0.26
160 0.27
161 0.31
162 0.34
163 0.37
164 0.42
165 0.48
166 0.58
167 0.64
168 0.62
169 0.63
170 0.67
171 0.69
172 0.69
173 0.73
174 0.74
175 0.74
176 0.84
177 0.88
178 0.88
179 0.86
180 0.8
181 0.73
182 0.68
183 0.59
184 0.49
185 0.41
186 0.38
187 0.3
188 0.27
189 0.27
190 0.23
191 0.31
192 0.37
193 0.42
194 0.41
195 0.49
196 0.56
197 0.61
198 0.69
199 0.68
200 0.7
201 0.67
202 0.7
203 0.72
204 0.65
205 0.62
206 0.59
207 0.54
208 0.46
209 0.45
210 0.41
211 0.35
212 0.33
213 0.27