FuNGI

A0A1Y2CEF2

Protein Details

Accession

A0A1Y2CEF2

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
391-417	VPSRPTVYQTTKRSRTRREVYEKTVAM	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 13, cyto_nucl 9.833, mito 7.5, cyto_mito 6.666, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007133 RNA_pol_II-assoc_Paf1
Gene Ontology	GO:0016593 C:Cdc73/Paf1 complex GO:0016570 P:histone modification GO:0006368 P:transcription elongation by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF03985 Paf1

Amino Acid Sequences

MSKSSAVKTKKVGNDFLCPTVYGNILPPLPFEPKLLGGFEAQRRAELSALDHHPFPLDVVGSTLDAMPTGALRLGLVWGNTAFYYELPRPSKTALDPRDAALLAPYQPPPPKSSSATNSNAAAAAKPHRPIASWLRRTEYISNDNKLAKQSSQSNNLSQNQQQQQQQTPQKKSLQQQLPNSKEALVKAIEKTFVQAASANLTKLKHPTNPSLTATELLPLFPAFVHWPSDFYSVVFDADPISSSSSSSKEDALLAEDVRERLVREEAFLKYCTVKGGDGGNAEEEEEEVASLYIPSTQTTDYLVNKRFQEEDEDDDEDVDTVSPDEASRALEYKLVRDFTYKEKKESERNWMFFNISDEVATFHQLAGRVDLVRKRVKAKTFANRYDDTPVPSRPTVYQTTKRSRTRREVYEKTVAMHRILPVEYVEPEGGVPSEDELEELQVLGKHGRDENGLEEDEQDEEDGRERKRQQVVDEDGDAEW

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.62
2	0.61
3	0.58
4	0.5
5	0.42
6	0.38
7	0.31
8	0.28
9	0.2
10	0.19
11	0.19
12	0.2
13	0.19
14	0.19
15	0.21
16	0.24
17	0.25
18	0.24
19	0.22
20	0.24
21	0.26
22	0.26
23	0.23
24	0.21
25	0.27
26	0.31
27	0.35
28	0.32
29	0.31
30	0.31
31	0.31
32	0.29
33	0.23
34	0.21
35	0.22
36	0.27
37	0.28
38	0.27
39	0.26
40	0.25
41	0.24
42	0.22
43	0.16
44	0.12
45	0.1
46	0.11
47	0.11
48	0.11
49	0.11
50	0.11
51	0.08
52	0.07
53	0.07
54	0.06
55	0.05
56	0.06
57	0.05
58	0.05
59	0.05
60	0.06
61	0.07
62	0.08
63	0.08
64	0.09
65	0.09
66	0.1
67	0.1
68	0.1
69	0.09
70	0.08
71	0.14
72	0.15
73	0.23
74	0.26
75	0.27
76	0.28
77	0.3
78	0.34
79	0.34
80	0.42
81	0.38
82	0.41
83	0.41
84	0.4
85	0.42
86	0.37
87	0.31
88	0.23
89	0.2
90	0.15
91	0.17
92	0.17
93	0.18
94	0.22
95	0.24
96	0.26
97	0.29
98	0.31
99	0.32
100	0.39
101	0.4
102	0.45
103	0.47
104	0.46
105	0.42
106	0.38
107	0.36
108	0.29
109	0.23
110	0.18
111	0.18
112	0.19
113	0.2
114	0.22
115	0.21
116	0.22
117	0.27
118	0.35
119	0.41
120	0.44
121	0.46
122	0.48
123	0.49
124	0.52
125	0.51
126	0.46
127	0.44
128	0.43
129	0.43
130	0.42
131	0.42
132	0.39
133	0.38
134	0.34
135	0.26
136	0.25
137	0.32
138	0.34
139	0.4
140	0.41
141	0.43
142	0.47
143	0.49
144	0.48
145	0.42
146	0.46
147	0.42
148	0.45
149	0.44
150	0.42
151	0.44
152	0.49
153	0.55
154	0.55
155	0.54
156	0.55
157	0.57
158	0.59
159	0.6
160	0.61
161	0.62
162	0.6
163	0.65
164	0.69
165	0.67
166	0.62
167	0.57
168	0.48
169	0.41
170	0.34
171	0.28
172	0.19
173	0.17
174	0.17
175	0.18
176	0.17
177	0.15
178	0.16
179	0.14
180	0.12
181	0.11
182	0.1
183	0.09
184	0.12
185	0.13
186	0.12
187	0.12
188	0.13
189	0.14
190	0.16
191	0.19
192	0.21
193	0.24
194	0.3
195	0.34
196	0.38
197	0.38
198	0.36
199	0.34
200	0.29
201	0.25
202	0.2
203	0.15
204	0.1
205	0.09
206	0.07
207	0.06
208	0.05
209	0.06
210	0.06
211	0.07
212	0.1
213	0.1
214	0.11
215	0.13
216	0.15
217	0.14
218	0.13
219	0.13
220	0.1
221	0.11
222	0.1
223	0.08
224	0.06
225	0.06
226	0.07
227	0.06
228	0.07
229	0.06
230	0.07
231	0.08
232	0.09
233	0.11
234	0.11
235	0.11
236	0.1
237	0.11
238	0.1
239	0.11
240	0.1
241	0.09
242	0.09
243	0.09
244	0.09
245	0.09
246	0.09
247	0.07
248	0.08
249	0.11
250	0.1
251	0.11
252	0.14
253	0.15
254	0.16
255	0.17
256	0.17
257	0.15
258	0.15
259	0.15
260	0.12
261	0.11
262	0.1
263	0.11
264	0.12
265	0.12
266	0.12
267	0.11
268	0.1
269	0.1
270	0.08
271	0.07
272	0.05
273	0.04
274	0.04
275	0.03
276	0.03
277	0.03
278	0.03
279	0.03
280	0.05
281	0.05
282	0.05
283	0.07
284	0.07
285	0.07
286	0.1
287	0.13
288	0.16
289	0.22
290	0.25
291	0.28
292	0.28
293	0.3
294	0.28
295	0.26
296	0.29
297	0.25
298	0.27
299	0.26
300	0.27
301	0.25
302	0.24
303	0.24
304	0.17
305	0.14
306	0.09
307	0.06
308	0.04
309	0.04
310	0.04
311	0.04
312	0.05
313	0.05
314	0.07
315	0.07
316	0.09
317	0.09
318	0.12
319	0.13
320	0.15
321	0.19
322	0.19
323	0.19
324	0.2
325	0.22
326	0.29
327	0.4
328	0.38
329	0.39
330	0.44
331	0.49
332	0.56
333	0.59
334	0.6
335	0.58
336	0.58
337	0.57
338	0.52
339	0.48
340	0.39
341	0.38
342	0.29
343	0.19
344	0.17
345	0.14
346	0.14
347	0.14
348	0.14
349	0.11
350	0.09
351	0.11
352	0.12
353	0.13
354	0.13
355	0.14
356	0.14
357	0.17
358	0.21
359	0.25
360	0.3
361	0.33
362	0.37
363	0.42
364	0.47
365	0.52
366	0.58
367	0.63
368	0.67
369	0.71
370	0.71
371	0.66
372	0.63
373	0.6
374	0.53
375	0.47
376	0.41
377	0.37
378	0.36
379	0.34
380	0.34
381	0.3
382	0.33
383	0.36
384	0.41
385	0.47
386	0.51
387	0.61
388	0.68
389	0.75
390	0.79
391	0.81
392	0.83
393	0.83
394	0.84
395	0.84
396	0.82
397	0.81
398	0.81
399	0.73
400	0.65
401	0.62
402	0.53
403	0.45
404	0.39
405	0.33
406	0.27
407	0.26
408	0.24
409	0.19
410	0.19
411	0.18
412	0.18
413	0.16
414	0.13
415	0.13
416	0.12
417	0.11
418	0.09
419	0.09
420	0.07
421	0.08
422	0.08
423	0.09
424	0.09
425	0.1
426	0.09
427	0.09
428	0.09
429	0.09
430	0.11
431	0.12
432	0.13
433	0.16
434	0.18
435	0.2
436	0.21
437	0.22
438	0.24
439	0.27
440	0.27
441	0.24
442	0.22
443	0.21
444	0.2
445	0.18
446	0.14
447	0.11
448	0.1
449	0.16
450	0.21
451	0.22
452	0.3
453	0.33
454	0.41
455	0.49
456	0.53
457	0.53
458	0.58
459	0.64
460	0.61
461	0.59

A0A1Y2CEF2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer