FuNGI

A0A1Y2CD87

Protein Details

Accession

A0A1Y2CD87

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
380-400	KDKVREREEIRKERNRQRERE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
321-323	KKE
574-576	RRK

Subcellular Location(s)

nucl 18, cyto_nucl 13, mito 5, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR017862 SKI-int_prot_SKIP IPR004015 SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom
Gene Ontology	GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
Pfam	View protein in Pfam PF02731 SKIP_SNW

Amino Acid Sequences

MSLTASLPKPRTTAKASKWDDDEDDTPRAVAAAVSSQLAVRAAPPYGQRKGWTPRSSLDFGDGGAFPEINVPQYPLDMGRKTGPAKAASANGTLALQTDADGSLRYDMVLTHNSRDGKIIHSQFKDLTAKDLDDDRARPSQEEIDKTTEKTRLALEKINESRTKSKGAGGVVSSTASSTNAPQFVRYTPSSSSGGSADTRIIRMVEAPVDPMEPPKFKFKKVPRAPASPPAPVMHSPPRKVSAEEQANWVIPPCISNWKNAKGYTIPLDKRLAADGRGIQDVQINDNFAKLGEALAIADRHAREEVKVRAEMQAKLAAKQKKEKEDKLRMLAQKAREERSGITTTAAPAAGGGIPGVSGLGAYGDSDESSSDDEEEVEDKDKVREREEIRKERNRQRERELRMSHMGQDTKSKVLGKLNADRDISEKIALGLTQPSASRESQFDQRLFNQSSGMSSGFGGDDTYGIYDKPLFAGSSANAIYRPKKAMDDHQDHVPGVRTDRIERIVDGGGGGEGSMSRGPHRGFKGTEGGVGGSRDGPVQFEREDDDVFGIDEFMSTAKRGREDSREDEGESKRRK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.52
2	0.6
3	0.63
4	0.67
5	0.66
6	0.64
7	0.59
8	0.55
9	0.5
10	0.44
11	0.41
12	0.34
13	0.3
14	0.26
15	0.22
16	0.16
17	0.13
18	0.09
19	0.09
20	0.1
21	0.1
22	0.11
23	0.1
24	0.11
25	0.11
26	0.1
27	0.09
28	0.1
29	0.1
30	0.13
31	0.2
32	0.27
33	0.31
34	0.34
35	0.35
36	0.41
37	0.51
38	0.58
39	0.56
40	0.53
41	0.54
42	0.59
43	0.59
44	0.51
45	0.46
46	0.36
47	0.31
48	0.29
49	0.23
50	0.18
51	0.16
52	0.15
53	0.11
54	0.14
55	0.14
56	0.13
57	0.13
58	0.13
59	0.13
60	0.13
61	0.14
62	0.15
63	0.21
64	0.2
65	0.22
66	0.24
67	0.29
68	0.3
69	0.33
70	0.34
71	0.3
72	0.31
73	0.32
74	0.33
75	0.29
76	0.29
77	0.25
78	0.21
79	0.19
80	0.16
81	0.14
82	0.1
83	0.08
84	0.07
85	0.07
86	0.07
87	0.07
88	0.08
89	0.07
90	0.08
91	0.08
92	0.08
93	0.07
94	0.08
95	0.11
96	0.17
97	0.18
98	0.19
99	0.24
100	0.26
101	0.26
102	0.28
103	0.25
104	0.23
105	0.3
106	0.34
107	0.37
108	0.37
109	0.39
110	0.37
111	0.42
112	0.43
113	0.35
114	0.32
115	0.27
116	0.25
117	0.25
118	0.27
119	0.25
120	0.24
121	0.25
122	0.24
123	0.27
124	0.27
125	0.26
126	0.25
127	0.3
128	0.32
129	0.34
130	0.34
131	0.36
132	0.37
133	0.39
134	0.41
135	0.37
136	0.32
137	0.29
138	0.3
139	0.29
140	0.31
141	0.34
142	0.31
143	0.37
144	0.41
145	0.45
146	0.44
147	0.42
148	0.45
149	0.42
150	0.44
151	0.36
152	0.35
153	0.33
154	0.31
155	0.29
156	0.25
157	0.24
158	0.2
159	0.19
160	0.15
161	0.11
162	0.1
163	0.08
164	0.08
165	0.09
166	0.11
167	0.14
168	0.14
169	0.15
170	0.17
171	0.17
172	0.22
173	0.21
174	0.22
175	0.19
176	0.23
177	0.24
178	0.22
179	0.22
180	0.17
181	0.18
182	0.15
183	0.14
184	0.13
185	0.12
186	0.12
187	0.11
188	0.11
189	0.09
190	0.1
191	0.1
192	0.09
193	0.09
194	0.1
195	0.09
196	0.1
197	0.1
198	0.12
199	0.14
200	0.14
201	0.16
202	0.25
203	0.27
204	0.29
205	0.39
206	0.45
207	0.54
208	0.61
209	0.7
210	0.65
211	0.7
212	0.72
213	0.71
214	0.65
215	0.56
216	0.48
217	0.38
218	0.35
219	0.29
220	0.3
221	0.3
222	0.32
223	0.32
224	0.33
225	0.37
226	0.35
227	0.36
228	0.34
229	0.34
230	0.35
231	0.34
232	0.35
233	0.32
234	0.31
235	0.29
236	0.26
237	0.16
238	0.1
239	0.1
240	0.08
241	0.16
242	0.16
243	0.22
244	0.27
245	0.32
246	0.36
247	0.36
248	0.37
249	0.29
250	0.3
251	0.3
252	0.33
253	0.28
254	0.28
255	0.29
256	0.27
257	0.26
258	0.26
259	0.21
260	0.14
261	0.15
262	0.14
263	0.14
264	0.15
265	0.14
266	0.12
267	0.14
268	0.13
269	0.13
270	0.11
271	0.1
272	0.1
273	0.1
274	0.1
275	0.07
276	0.07
277	0.05
278	0.05
279	0.04
280	0.04
281	0.04
282	0.05
283	0.05
284	0.04
285	0.06
286	0.06
287	0.07
288	0.08
289	0.08
290	0.09
291	0.15
292	0.18
293	0.19
294	0.2
295	0.2
296	0.24
297	0.27
298	0.26
299	0.22
300	0.24
301	0.22
302	0.24
303	0.3
304	0.29
305	0.29
306	0.36
307	0.4
308	0.45
309	0.52
310	0.57
311	0.61
312	0.67
313	0.7
314	0.67
315	0.69
316	0.62
317	0.6
318	0.56
319	0.5
320	0.47
321	0.46
322	0.43
323	0.37
324	0.35
325	0.31
326	0.33
327	0.3
328	0.23
329	0.2
330	0.18
331	0.17
332	0.16
333	0.15
334	0.09
335	0.06
336	0.07
337	0.06
338	0.05
339	0.04
340	0.03
341	0.03
342	0.03
343	0.03
344	0.02
345	0.02
346	0.02
347	0.02
348	0.02
349	0.02
350	0.03
351	0.03
352	0.03
353	0.04
354	0.04
355	0.05
356	0.06
357	0.06
358	0.06
359	0.06
360	0.06
361	0.07
362	0.08
363	0.08
364	0.09
365	0.09
366	0.1
367	0.13
368	0.19
369	0.2
370	0.21
371	0.28
372	0.31
373	0.41
374	0.51
375	0.57
376	0.61
377	0.69
378	0.76
379	0.78
380	0.85
381	0.83
382	0.79
383	0.79
384	0.79
385	0.77
386	0.78
387	0.72
388	0.66
389	0.63
390	0.58
391	0.53
392	0.49
393	0.43
394	0.33
395	0.36
396	0.33
397	0.28
398	0.3
399	0.27
400	0.24
401	0.28
402	0.32
403	0.32
404	0.39
405	0.42
406	0.44
407	0.43
408	0.41
409	0.38
410	0.35
411	0.3
412	0.22
413	0.18
414	0.13
415	0.13
416	0.12
417	0.11
418	0.1
419	0.09
420	0.1
421	0.1
422	0.11
423	0.14
424	0.15
425	0.16
426	0.17
427	0.2
428	0.27
429	0.32
430	0.32
431	0.33
432	0.35
433	0.41
434	0.41
435	0.38
436	0.31
437	0.26
438	0.25
439	0.23
440	0.2
441	0.13
442	0.11
443	0.11
444	0.1
445	0.1
446	0.09
447	0.06
448	0.06
449	0.06
450	0.07
451	0.06
452	0.06
453	0.07
454	0.07
455	0.08
456	0.09
457	0.09
458	0.08
459	0.08
460	0.11
461	0.1
462	0.14
463	0.15
464	0.14
465	0.15
466	0.18
467	0.21
468	0.23
469	0.26
470	0.24
471	0.28
472	0.32
473	0.4
474	0.47
475	0.51
476	0.49
477	0.53
478	0.53
479	0.48
480	0.46
481	0.4
482	0.32
483	0.28
484	0.3
485	0.25
486	0.26
487	0.31
488	0.34
489	0.3
490	0.29
491	0.3
492	0.26
493	0.23
494	0.2
495	0.16
496	0.11
497	0.09
498	0.09
499	0.05
500	0.04
501	0.06
502	0.07
503	0.08
504	0.09
505	0.15
506	0.17
507	0.25
508	0.29
509	0.34
510	0.34
511	0.38
512	0.44
513	0.39
514	0.4
515	0.34
516	0.3
517	0.26
518	0.25
519	0.21
520	0.15
521	0.14
522	0.14
523	0.13
524	0.14
525	0.14
526	0.16
527	0.16
528	0.16
529	0.2
530	0.2
531	0.21
532	0.19
533	0.19
534	0.16
535	0.16
536	0.14
537	0.11
538	0.09
539	0.08
540	0.07
541	0.07
542	0.08
543	0.08
544	0.13
545	0.16
546	0.19
547	0.23
548	0.29
549	0.37
550	0.44
551	0.5
552	0.54
553	0.54
554	0.53
555	0.56
556	0.57

A0A1Y2CD87

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer