Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2D0J4

Protein Details
Accession A0A1Y2D0J4    Localization Confidence High Confidence Score 19.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
91-111ALPKQQQQQQQQQQQQQRQQQHydrophilic
371-399KPLMLTKKETKKLRRQRRIEAQKERRDKIBasic
448-471KYIAEHKLTKEQRRERNRLKLIENHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
375-396LTKKETKKLRRQRRIEAQKERR
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto 5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013881  Pre-mRNA_splic_Prp3_dom  
IPR027104  Prp3  
IPR010541  Prp3_C  
Gene Ontology GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF06544  DUF1115  
PF08572  PRP3  
Amino Acid Sequences MKRTTTGAPDPKRARTDATPTATGPGPRGASNSGATATDPAPGAVPKDAASIAALIAEKKREIAAKMAAMTRNLPTAAQPNPTPLNAVAAALPKQQQQQQQQQQQQQRQQQQQTPALPQSDIQKRMAEIQARMANTLATGNIPSNIGKGGLKMDVHPLFDKSGQVDSDSIKALFVKPNFSTAKANQRVTASSKEAAAAAQRLALAALEKEKAAKEAESAEPKEEPKTLELIEPPAELFDPLKNPYFDPKIAKTMPKQRVAGKKFRFVQPNKFINQANQMRQEAMLEKLKADIAAKAKSSGLAVELDLVSDLCVRREPPPATEWWDAPFLGPDTPYEAFSFDAPHLPDILTDLIQHPIPINPPADLGPPPPKPLMLTKKETKKLRRQRRIEAQKERRDKILLGLIPPDQPKVKISNLMRVLGTEAVQDPTKIEAAVRQQMRARQLKHDKYIAEHKLTKEQRRERNRLKLIENTHVIVEACVFKVNDLRRPQHKFKVDVNANQLFLSGVVLLHPGNNLVIVEGGNRGIKQYKKLMLRRIDWTEGVDDIEEDGGEGNGPSVEDGKPNECVMIWEGKIKKRLFNGFQVIQCPTERSIREVLDKAGALHYYDAAKHYTSESL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.57
3 0.59
4 0.58
5 0.58
6 0.53
7 0.49
8 0.5
9 0.47
10 0.41
11 0.34
12 0.3
13 0.26
14 0.24
15 0.27
16 0.25
17 0.25
18 0.26
19 0.25
20 0.21
21 0.19
22 0.19
23 0.19
24 0.17
25 0.16
26 0.14
27 0.13
28 0.13
29 0.14
30 0.15
31 0.14
32 0.15
33 0.13
34 0.14
35 0.14
36 0.13
37 0.13
38 0.11
39 0.09
40 0.11
41 0.11
42 0.1
43 0.13
44 0.15
45 0.14
46 0.15
47 0.18
48 0.19
49 0.2
50 0.24
51 0.27
52 0.28
53 0.31
54 0.35
55 0.35
56 0.32
57 0.33
58 0.29
59 0.26
60 0.23
61 0.2
62 0.18
63 0.21
64 0.23
65 0.25
66 0.24
67 0.27
68 0.3
69 0.3
70 0.3
71 0.25
72 0.26
73 0.21
74 0.21
75 0.17
76 0.18
77 0.19
78 0.19
79 0.21
80 0.2
81 0.24
82 0.3
83 0.36
84 0.42
85 0.51
86 0.59
87 0.66
88 0.71
89 0.76
90 0.8
91 0.8
92 0.8
93 0.79
94 0.78
95 0.78
96 0.77
97 0.75
98 0.74
99 0.72
100 0.68
101 0.63
102 0.58
103 0.5
104 0.42
105 0.38
106 0.38
107 0.39
108 0.38
109 0.35
110 0.33
111 0.32
112 0.37
113 0.4
114 0.36
115 0.29
116 0.33
117 0.36
118 0.34
119 0.34
120 0.29
121 0.23
122 0.19
123 0.18
124 0.11
125 0.07
126 0.08
127 0.08
128 0.08
129 0.09
130 0.09
131 0.09
132 0.09
133 0.1
134 0.09
135 0.1
136 0.11
137 0.13
138 0.13
139 0.13
140 0.21
141 0.21
142 0.23
143 0.23
144 0.23
145 0.22
146 0.23
147 0.23
148 0.17
149 0.18
150 0.16
151 0.16
152 0.16
153 0.15
154 0.16
155 0.16
156 0.14
157 0.12
158 0.13
159 0.14
160 0.17
161 0.17
162 0.2
163 0.19
164 0.26
165 0.27
166 0.29
167 0.32
168 0.32
169 0.42
170 0.44
171 0.44
172 0.4
173 0.41
174 0.41
175 0.39
176 0.39
177 0.32
178 0.26
179 0.25
180 0.22
181 0.21
182 0.19
183 0.16
184 0.13
185 0.09
186 0.09
187 0.09
188 0.08
189 0.08
190 0.07
191 0.06
192 0.06
193 0.07
194 0.07
195 0.07
196 0.08
197 0.09
198 0.1
199 0.11
200 0.1
201 0.1
202 0.13
203 0.17
204 0.22
205 0.23
206 0.23
207 0.24
208 0.25
209 0.25
210 0.23
211 0.2
212 0.15
213 0.17
214 0.16
215 0.16
216 0.16
217 0.17
218 0.16
219 0.15
220 0.13
221 0.11
222 0.11
223 0.09
224 0.09
225 0.08
226 0.1
227 0.12
228 0.14
229 0.15
230 0.15
231 0.2
232 0.23
233 0.24
234 0.27
235 0.27
236 0.31
237 0.33
238 0.36
239 0.37
240 0.44
241 0.49
242 0.5
243 0.5
244 0.51
245 0.59
246 0.6
247 0.64
248 0.58
249 0.58
250 0.57
251 0.6
252 0.62
253 0.56
254 0.61
255 0.61
256 0.62
257 0.56
258 0.55
259 0.5
260 0.43
261 0.48
262 0.43
263 0.38
264 0.37
265 0.35
266 0.32
267 0.31
268 0.3
269 0.21
270 0.19
271 0.18
272 0.14
273 0.14
274 0.14
275 0.14
276 0.13
277 0.12
278 0.13
279 0.12
280 0.14
281 0.14
282 0.14
283 0.14
284 0.14
285 0.14
286 0.1
287 0.08
288 0.07
289 0.06
290 0.06
291 0.06
292 0.06
293 0.05
294 0.05
295 0.04
296 0.05
297 0.05
298 0.05
299 0.06
300 0.07
301 0.09
302 0.16
303 0.17
304 0.18
305 0.2
306 0.22
307 0.28
308 0.28
309 0.26
310 0.21
311 0.21
312 0.19
313 0.17
314 0.16
315 0.1
316 0.09
317 0.09
318 0.07
319 0.1
320 0.1
321 0.11
322 0.11
323 0.1
324 0.1
325 0.1
326 0.12
327 0.09
328 0.11
329 0.1
330 0.1
331 0.1
332 0.1
333 0.09
334 0.09
335 0.1
336 0.07
337 0.07
338 0.08
339 0.08
340 0.08
341 0.09
342 0.08
343 0.08
344 0.09
345 0.11
346 0.11
347 0.1
348 0.11
349 0.11
350 0.13
351 0.12
352 0.14
353 0.19
354 0.19
355 0.22
356 0.21
357 0.21
358 0.21
359 0.28
360 0.34
361 0.33
362 0.39
363 0.44
364 0.53
365 0.61
366 0.68
367 0.68
368 0.7
369 0.75
370 0.8
371 0.83
372 0.81
373 0.83
374 0.86
375 0.88
376 0.88
377 0.88
378 0.87
379 0.86
380 0.87
381 0.79
382 0.71
383 0.62
384 0.52
385 0.44
386 0.41
387 0.33
388 0.25
389 0.26
390 0.24
391 0.25
392 0.25
393 0.23
394 0.17
395 0.16
396 0.17
397 0.19
398 0.2
399 0.25
400 0.26
401 0.33
402 0.34
403 0.35
404 0.33
405 0.29
406 0.29
407 0.22
408 0.2
409 0.12
410 0.11
411 0.11
412 0.11
413 0.1
414 0.09
415 0.1
416 0.1
417 0.09
418 0.08
419 0.11
420 0.15
421 0.23
422 0.23
423 0.25
424 0.27
425 0.31
426 0.39
427 0.43
428 0.4
429 0.43
430 0.53
431 0.57
432 0.6
433 0.61
434 0.53
435 0.51
436 0.58
437 0.54
438 0.5
439 0.47
440 0.44
441 0.49
442 0.56
443 0.59
444 0.6
445 0.63
446 0.67
447 0.73
448 0.81
449 0.81
450 0.84
451 0.84
452 0.81
453 0.76
454 0.73
455 0.68
456 0.65
457 0.58
458 0.48
459 0.4
460 0.35
461 0.3
462 0.22
463 0.19
464 0.13
465 0.11
466 0.12
467 0.12
468 0.11
469 0.17
470 0.2
471 0.26
472 0.32
473 0.39
474 0.46
475 0.55
476 0.62
477 0.66
478 0.69
479 0.67
480 0.67
481 0.7
482 0.68
483 0.65
484 0.65
485 0.59
486 0.53
487 0.47
488 0.4
489 0.29
490 0.22
491 0.17
492 0.09
493 0.06
494 0.05
495 0.06
496 0.06
497 0.07
498 0.07
499 0.07
500 0.06
501 0.07
502 0.07
503 0.06
504 0.06
505 0.06
506 0.07
507 0.07
508 0.09
509 0.09
510 0.09
511 0.11
512 0.17
513 0.2
514 0.25
515 0.32
516 0.38
517 0.47
518 0.54
519 0.61
520 0.64
521 0.66
522 0.68
523 0.66
524 0.63
525 0.54
526 0.49
527 0.42
528 0.34
529 0.3
530 0.22
531 0.15
532 0.12
533 0.11
534 0.08
535 0.07
536 0.06
537 0.05
538 0.05
539 0.05
540 0.05
541 0.05
542 0.05
543 0.06
544 0.07
545 0.08
546 0.11
547 0.15
548 0.17
549 0.19
550 0.19
551 0.2
552 0.18
553 0.19
554 0.19
555 0.22
556 0.21
557 0.26
558 0.32
559 0.37
560 0.45
561 0.45
562 0.48
563 0.5
564 0.59
565 0.57
566 0.61
567 0.63
568 0.62
569 0.62
570 0.61
571 0.55
572 0.47
573 0.43
574 0.37
575 0.3
576 0.32
577 0.3
578 0.3
579 0.34
580 0.36
581 0.41
582 0.4
583 0.4
584 0.37
585 0.36
586 0.33
587 0.3
588 0.27
589 0.21
590 0.2
591 0.2
592 0.17
593 0.18
594 0.19
595 0.18
596 0.18
597 0.18