Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2C1P1

Protein Details
Accession A0A1Y2C1P1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
348-392EDAEESGEKKKKKKKSKSEDDEGAAAGDEEKPKKKKKKSKTEDDEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
287-303AKGAVGSATKGKKDGNK
327-387KKRKAEEATEEEEKPKKAKKSEDAEESGEKKKKKKKSKSEDDEGAAAGDEEKPKKKKKKSK
Subcellular Location(s) cyto 13.5, cyto_mito 12.166, cyto_nucl 9.999, mito 8.5, mito_nucl 7.499
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045056  Nop56/Nop58  
IPR042239  Nop_C  
IPR002687  Nop_dom  
IPR036070  Nop_dom_sf  
IPR012976  NOSIC  
Gene Ontology GO:0031428  C:box C/D RNP complex  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0030515  F:snoRNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF01798  Nop  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51358  NOP  
Amino Acid Sequences MRGIRSQITTLISGLPEADMNAMVLGLSHSLSRYKLKFSPDKVDTMIVQAIALLDDLDKELNTYAMRVKEWYGWHFPEMTKIIVDNLAYAKVVKTMGFRSNAAEVDLSAVLPEELEKEVKDAAEISMGTEISDEDIDNINHLADQIISITEYRVQLYDYLKNRMAAIAPNLTCLVGELVGARLIAHAGSLLNLSKQPASTIQILGAEKALFRALKSKHDTPKYGLLYHASLVGQAGPKIKGKVARTVATKCALSIRVDALGEHDGPTVGIELRAKMEARLRQLEGKAKGAVGSATKGKKDGNKKFEFKQTKAYNPSSDVAVTEEAPKKRKAEEATEEEEKPKKAKKSEDAEESGEKKKKKKKSKSEDDEGAAAGDEEKPKKKKKKSKTEDDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.13
3 0.1
4 0.1
5 0.1
6 0.07
7 0.07
8 0.07
9 0.06
10 0.05
11 0.05
12 0.05
13 0.05
14 0.06
15 0.06
16 0.07
17 0.09
18 0.12
19 0.2
20 0.22
21 0.28
22 0.32
23 0.4
24 0.48
25 0.52
26 0.6
27 0.55
28 0.57
29 0.53
30 0.51
31 0.43
32 0.37
33 0.33
34 0.22
35 0.19
36 0.15
37 0.13
38 0.1
39 0.09
40 0.06
41 0.04
42 0.05
43 0.06
44 0.06
45 0.06
46 0.06
47 0.07
48 0.08
49 0.08
50 0.1
51 0.14
52 0.15
53 0.16
54 0.17
55 0.19
56 0.22
57 0.26
58 0.3
59 0.32
60 0.33
61 0.33
62 0.35
63 0.33
64 0.34
65 0.32
66 0.28
67 0.21
68 0.19
69 0.19
70 0.18
71 0.18
72 0.13
73 0.11
74 0.11
75 0.11
76 0.11
77 0.1
78 0.1
79 0.11
80 0.1
81 0.12
82 0.16
83 0.21
84 0.23
85 0.24
86 0.24
87 0.26
88 0.26
89 0.24
90 0.19
91 0.14
92 0.14
93 0.13
94 0.11
95 0.08
96 0.07
97 0.06
98 0.06
99 0.06
100 0.05
101 0.06
102 0.07
103 0.07
104 0.08
105 0.09
106 0.09
107 0.09
108 0.08
109 0.07
110 0.09
111 0.08
112 0.08
113 0.08
114 0.08
115 0.08
116 0.07
117 0.07
118 0.06
119 0.07
120 0.06
121 0.06
122 0.08
123 0.08
124 0.08
125 0.09
126 0.08
127 0.07
128 0.07
129 0.06
130 0.04
131 0.04
132 0.04
133 0.04
134 0.04
135 0.05
136 0.05
137 0.07
138 0.08
139 0.08
140 0.08
141 0.08
142 0.11
143 0.14
144 0.2
145 0.21
146 0.25
147 0.26
148 0.26
149 0.26
150 0.24
151 0.22
152 0.16
153 0.16
154 0.17
155 0.15
156 0.16
157 0.16
158 0.15
159 0.14
160 0.12
161 0.1
162 0.05
163 0.05
164 0.04
165 0.04
166 0.05
167 0.05
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.03
173 0.03
174 0.03
175 0.03
176 0.04
177 0.04
178 0.05
179 0.05
180 0.06
181 0.06
182 0.06
183 0.07
184 0.08
185 0.1
186 0.11
187 0.11
188 0.11
189 0.14
190 0.14
191 0.13
192 0.13
193 0.1
194 0.08
195 0.08
196 0.09
197 0.06
198 0.06
199 0.13
200 0.14
201 0.22
202 0.28
203 0.35
204 0.41
205 0.46
206 0.48
207 0.45
208 0.52
209 0.47
210 0.42
211 0.35
212 0.3
213 0.26
214 0.24
215 0.22
216 0.12
217 0.1
218 0.09
219 0.1
220 0.08
221 0.09
222 0.11
223 0.11
224 0.13
225 0.14
226 0.16
227 0.2
228 0.21
229 0.29
230 0.31
231 0.34
232 0.37
233 0.39
234 0.4
235 0.37
236 0.35
237 0.27
238 0.26
239 0.23
240 0.2
241 0.19
242 0.16
243 0.15
244 0.15
245 0.15
246 0.14
247 0.14
248 0.13
249 0.12
250 0.11
251 0.09
252 0.09
253 0.09
254 0.08
255 0.06
256 0.07
257 0.07
258 0.07
259 0.09
260 0.11
261 0.11
262 0.12
263 0.17
264 0.2
265 0.25
266 0.29
267 0.3
268 0.33
269 0.37
270 0.43
271 0.39
272 0.38
273 0.34
274 0.3
275 0.28
276 0.24
277 0.21
278 0.15
279 0.15
280 0.18
281 0.2
282 0.21
283 0.22
284 0.25
285 0.31
286 0.41
287 0.48
288 0.52
289 0.58
290 0.63
291 0.67
292 0.74
293 0.75
294 0.67
295 0.68
296 0.64
297 0.64
298 0.67
299 0.66
300 0.59
301 0.54
302 0.53
303 0.44
304 0.37
305 0.29
306 0.23
307 0.19
308 0.17
309 0.2
310 0.25
311 0.28
312 0.31
313 0.34
314 0.34
315 0.36
316 0.42
317 0.41
318 0.43
319 0.48
320 0.51
321 0.55
322 0.57
323 0.56
324 0.53
325 0.53
326 0.46
327 0.42
328 0.42
329 0.43
330 0.46
331 0.54
332 0.59
333 0.64
334 0.7
335 0.73
336 0.71
337 0.68
338 0.67
339 0.62
340 0.61
341 0.58
342 0.55
343 0.55
344 0.6
345 0.66
346 0.7
347 0.77
348 0.8
349 0.85
350 0.91
351 0.92
352 0.93
353 0.91
354 0.84
355 0.74
356 0.63
357 0.52
358 0.4
359 0.3
360 0.21
361 0.16
362 0.18
363 0.21
364 0.3
365 0.38
366 0.48
367 0.59
368 0.69
369 0.76
370 0.82
371 0.88
372 0.91