Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2CCI8

Protein Details
Accession A0A1Y2CCI8    Localization Confidence High Confidence Score 17.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
249-272EGGEKKGDKKRKVEEVKERKASHFBasic
277-302GGNKKGGEGKPHNKKQKKAEEATADEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
239-295DDKAKEKKVNEGGEKKGDKKRKVEEVKERKASHFDGRGGGNKKGGEGKPHNKKQKKA
Subcellular Location(s) nucl 18, mito 3, cyto 2, plas 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040183  THUMPD1-like  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006400  P:tRNA modification  
CDD cd11717  THUMP_THUMPD1_like  
Amino Acid Sequences MQGILGFCTRNKEQQATRELMGLLEDYGNKLYGEFKPDEEETKLDNDDDDDDDDGKEEGLSIEDAFAKEVAEFKKPVKKNAHRFRWMQVGIECCLFVRCHKSVCPTTLVQFILNDLNESKIQKTKYMQRILPAAESCLASWTRLSPWQTESFQSTFRGKAWSQRRNNETVDRKPYSTTRCNCDCTVPHTVDLKNPDLCIIVEVFKSICTISVVERYYELKKFNLESIHGRNLVNQKKNDDKAKEKKVNEGGEKKGDKKRKVEEVKERKASHFDGRGGGNKKGGEGKPHNKKQKKAEEATADE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.57
3 0.55
4 0.53
5 0.48
6 0.43
7 0.35
8 0.3
9 0.22
10 0.16
11 0.13
12 0.12
13 0.11
14 0.11
15 0.12
16 0.11
17 0.11
18 0.14
19 0.15
20 0.2
21 0.2
22 0.21
23 0.25
24 0.27
25 0.3
26 0.28
27 0.28
28 0.24
29 0.26
30 0.26
31 0.21
32 0.2
33 0.18
34 0.17
35 0.17
36 0.16
37 0.14
38 0.14
39 0.13
40 0.14
41 0.13
42 0.1
43 0.08
44 0.07
45 0.06
46 0.06
47 0.07
48 0.06
49 0.07
50 0.08
51 0.09
52 0.09
53 0.09
54 0.08
55 0.08
56 0.12
57 0.13
58 0.15
59 0.17
60 0.2
61 0.3
62 0.32
63 0.4
64 0.46
65 0.55
66 0.63
67 0.72
68 0.79
69 0.76
70 0.77
71 0.73
72 0.71
73 0.62
74 0.54
75 0.46
76 0.39
77 0.33
78 0.3
79 0.26
80 0.16
81 0.17
82 0.13
83 0.13
84 0.16
85 0.17
86 0.19
87 0.21
88 0.28
89 0.3
90 0.32
91 0.34
92 0.29
93 0.3
94 0.31
95 0.3
96 0.23
97 0.19
98 0.18
99 0.16
100 0.15
101 0.13
102 0.1
103 0.11
104 0.12
105 0.13
106 0.13
107 0.15
108 0.16
109 0.19
110 0.23
111 0.31
112 0.38
113 0.44
114 0.43
115 0.42
116 0.45
117 0.42
118 0.41
119 0.32
120 0.24
121 0.18
122 0.17
123 0.14
124 0.13
125 0.12
126 0.09
127 0.09
128 0.09
129 0.09
130 0.13
131 0.14
132 0.14
133 0.16
134 0.2
135 0.21
136 0.22
137 0.24
138 0.21
139 0.21
140 0.22
141 0.2
142 0.17
143 0.17
144 0.2
145 0.17
146 0.24
147 0.33
148 0.4
149 0.45
150 0.52
151 0.55
152 0.55
153 0.58
154 0.58
155 0.56
156 0.53
157 0.54
158 0.49
159 0.46
160 0.44
161 0.45
162 0.44
163 0.46
164 0.43
165 0.41
166 0.44
167 0.47
168 0.45
169 0.45
170 0.4
171 0.36
172 0.37
173 0.32
174 0.3
175 0.3
176 0.3
177 0.28
178 0.31
179 0.29
180 0.24
181 0.23
182 0.21
183 0.18
184 0.17
185 0.15
186 0.12
187 0.1
188 0.09
189 0.09
190 0.09
191 0.08
192 0.08
193 0.07
194 0.07
195 0.07
196 0.07
197 0.09
198 0.15
199 0.15
200 0.15
201 0.17
202 0.19
203 0.22
204 0.24
205 0.25
206 0.2
207 0.22
208 0.24
209 0.26
210 0.26
211 0.25
212 0.28
213 0.32
214 0.37
215 0.36
216 0.34
217 0.36
218 0.43
219 0.48
220 0.49
221 0.46
222 0.47
223 0.54
224 0.6
225 0.63
226 0.61
227 0.63
228 0.66
229 0.74
230 0.77
231 0.69
232 0.72
233 0.72
234 0.73
235 0.72
236 0.68
237 0.63
238 0.63
239 0.66
240 0.64
241 0.66
242 0.67
243 0.64
244 0.66
245 0.69
246 0.71
247 0.76
248 0.79
249 0.81
250 0.83
251 0.86
252 0.87
253 0.81
254 0.74
255 0.7
256 0.64
257 0.62
258 0.58
259 0.5
260 0.45
261 0.46
262 0.51
263 0.5
264 0.47
265 0.43
266 0.36
267 0.36
268 0.41
269 0.39
270 0.41
271 0.46
272 0.54
273 0.61
274 0.71
275 0.8
276 0.79
277 0.86
278 0.86
279 0.87
280 0.87
281 0.83
282 0.83