Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2CDV6

Protein Details
Accession A0A1Y2CDV6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
113-134DGDKVSAKKKGKKAKNADEDDDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
100-107ASPKKRKA
116-127KVSAKKKGKKAK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 12, nucl 11.5, cyto 11.5, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012310  DNA_ligase_ATP-dep_cent  
IPR016059  DNA_ligase_ATP-dep_CS  
IPR029319  DNA_ligase_OB  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR007527  Znf_SWIM  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003910  F:DNA ligase (ATP) activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF01068  DNA_ligase_A_M  
PF14743  DNA_ligase_OB_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00333  DNA_LIGASE_A2  
PS50966  ZF_SWIM  
CDD cd07896  Adenylation_kDNA_ligase_like  
cd08041  OBF_kDNA_ligase_like  
Amino Acid Sequences MADSENDDQPNTSDVTNINGIKPNLLLADGEKKEQGDYVIKRIHDHYSCTCMGWKVSKLPIDARSCKHLKLALGDSYETARLKWKNPQGLLRPGLQAKVASPKKRKADDGDNDGDKVSAKKKGKKAKNADEDDDGDAAEKFTAKNRAKRDEIKEKAPALLLAQKYEPGSIDPTGWWISEKLDGVRAFWDHERREFVSRLGNPFTAPDWFKDAMPKDHSLDGELFGGRGKFSETVSVVKTINSPHWKKINFQVFDSPTMTTLPFEQRIVKLKSLFPPSADSPIILVAHEKCISAAHIVTALKDVESKGGEGLMLREPKSMYIGKRSTTLLKVKSFYDAEAIVIGYEAGKGRNANVTGSLKCRMASGKEFKIGTGLSDAERQNPPKIGAIVTYRFQELTNDGIPRFPSFVGVRIDADKPVDAVVRVVSKKDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.18
3 0.24
4 0.24
5 0.25
6 0.29
7 0.29
8 0.29
9 0.28
10 0.25
11 0.19
12 0.18
13 0.16
14 0.13
15 0.22
16 0.22
17 0.24
18 0.24
19 0.24
20 0.24
21 0.25
22 0.25
23 0.24
24 0.26
25 0.32
26 0.36
27 0.36
28 0.38
29 0.4
30 0.45
31 0.39
32 0.42
33 0.38
34 0.4
35 0.4
36 0.38
37 0.38
38 0.32
39 0.33
40 0.33
41 0.32
42 0.31
43 0.36
44 0.39
45 0.38
46 0.42
47 0.47
48 0.5
49 0.53
50 0.5
51 0.53
52 0.52
53 0.5
54 0.49
55 0.44
56 0.38
57 0.38
58 0.4
59 0.36
60 0.35
61 0.34
62 0.31
63 0.29
64 0.3
65 0.24
66 0.19
67 0.22
68 0.23
69 0.26
70 0.34
71 0.41
72 0.46
73 0.5
74 0.58
75 0.58
76 0.64
77 0.63
78 0.57
79 0.53
80 0.46
81 0.42
82 0.35
83 0.28
84 0.21
85 0.29
86 0.33
87 0.37
88 0.44
89 0.51
90 0.58
91 0.63
92 0.66
93 0.63
94 0.66
95 0.65
96 0.66
97 0.65
98 0.58
99 0.53
100 0.48
101 0.41
102 0.31
103 0.26
104 0.21
105 0.23
106 0.28
107 0.36
108 0.45
109 0.55
110 0.64
111 0.71
112 0.79
113 0.81
114 0.84
115 0.82
116 0.77
117 0.7
118 0.63
119 0.54
120 0.44
121 0.32
122 0.23
123 0.17
124 0.13
125 0.09
126 0.07
127 0.06
128 0.1
129 0.2
130 0.25
131 0.31
132 0.38
133 0.45
134 0.51
135 0.59
136 0.64
137 0.65
138 0.65
139 0.63
140 0.62
141 0.56
142 0.51
143 0.43
144 0.34
145 0.25
146 0.26
147 0.21
148 0.17
149 0.16
150 0.16
151 0.16
152 0.16
153 0.14
154 0.1
155 0.12
156 0.11
157 0.11
158 0.1
159 0.12
160 0.12
161 0.12
162 0.11
163 0.09
164 0.1
165 0.11
166 0.12
167 0.1
168 0.15
169 0.15
170 0.15
171 0.16
172 0.15
173 0.15
174 0.18
175 0.23
176 0.19
177 0.21
178 0.24
179 0.25
180 0.29
181 0.27
182 0.26
183 0.27
184 0.28
185 0.29
186 0.28
187 0.26
188 0.22
189 0.22
190 0.21
191 0.17
192 0.15
193 0.13
194 0.16
195 0.16
196 0.16
197 0.2
198 0.22
199 0.23
200 0.26
201 0.26
202 0.23
203 0.24
204 0.24
205 0.21
206 0.19
207 0.15
208 0.13
209 0.11
210 0.09
211 0.08
212 0.08
213 0.06
214 0.06
215 0.07
216 0.06
217 0.07
218 0.1
219 0.1
220 0.12
221 0.13
222 0.15
223 0.14
224 0.14
225 0.15
226 0.13
227 0.19
228 0.25
229 0.27
230 0.3
231 0.37
232 0.38
233 0.39
234 0.46
235 0.49
236 0.42
237 0.41
238 0.44
239 0.39
240 0.4
241 0.39
242 0.31
243 0.22
244 0.21
245 0.2
246 0.12
247 0.13
248 0.13
249 0.14
250 0.14
251 0.16
252 0.18
253 0.26
254 0.29
255 0.29
256 0.29
257 0.31
258 0.36
259 0.39
260 0.37
261 0.31
262 0.32
263 0.31
264 0.32
265 0.29
266 0.23
267 0.17
268 0.18
269 0.17
270 0.13
271 0.13
272 0.09
273 0.13
274 0.13
275 0.12
276 0.11
277 0.11
278 0.12
279 0.11
280 0.11
281 0.08
282 0.1
283 0.11
284 0.11
285 0.12
286 0.11
287 0.1
288 0.11
289 0.11
290 0.1
291 0.11
292 0.11
293 0.09
294 0.09
295 0.09
296 0.08
297 0.1
298 0.13
299 0.16
300 0.16
301 0.17
302 0.18
303 0.18
304 0.22
305 0.24
306 0.21
307 0.28
308 0.3
309 0.3
310 0.32
311 0.34
312 0.35
313 0.37
314 0.42
315 0.38
316 0.4
317 0.41
318 0.39
319 0.42
320 0.38
321 0.32
322 0.27
323 0.22
324 0.17
325 0.16
326 0.15
327 0.09
328 0.08
329 0.08
330 0.05
331 0.06
332 0.06
333 0.06
334 0.08
335 0.09
336 0.1
337 0.16
338 0.17
339 0.17
340 0.22
341 0.26
342 0.26
343 0.3
344 0.31
345 0.26
346 0.26
347 0.27
348 0.24
349 0.25
350 0.32
351 0.37
352 0.39
353 0.44
354 0.44
355 0.42
356 0.42
357 0.37
358 0.29
359 0.24
360 0.2
361 0.15
362 0.21
363 0.22
364 0.24
365 0.3
366 0.32
367 0.34
368 0.35
369 0.36
370 0.34
371 0.36
372 0.31
373 0.29
374 0.33
375 0.32
376 0.31
377 0.31
378 0.28
379 0.26
380 0.26
381 0.24
382 0.2
383 0.21
384 0.23
385 0.25
386 0.23
387 0.26
388 0.27
389 0.26
390 0.26
391 0.21
392 0.22
393 0.2
394 0.26
395 0.28
396 0.28
397 0.29
398 0.3
399 0.31
400 0.28
401 0.29
402 0.23
403 0.19
404 0.19
405 0.19
406 0.16
407 0.15
408 0.17
409 0.23
410 0.23