Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2B8L7

Protein Details
Accession A0A1Y2B8L7    Localization Confidence High Confidence Score 17.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
26-71SSSSANAKAKKKKDAPTPTQTQTPTTTETRRRRPPQTQLQTQPQIQHydrophilic
295-320EGLLNGKQRRQRRRRRNPQNSAQQVEHydrophilic
364-386DQGSKRPLPPRNKKPTKPPTQSSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
301-310KQRRQRRRRR
370-378PLPPRNKKP
Subcellular Location(s) nucl 10.5, cyto_nucl 10, cyto 8.5, mito 3, plas 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006073  GTP-bd  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR039177  SMG9  
Gene Ontology GO:0005525  F:GTP binding  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
Pfam View protein in Pfam  
PF01926  MMR_HSR1  
CDD cd00882  Ras_like_GTPase  
Amino Acid Sequences MEHDASRPRTAPTRTLFDPSAVMSSSSSSANAKAKKKKDAPTPTQTQTPTTTETRRRRPPQTQLQTQPQIQTPNQPIKIEQRSVSHTQNPLQPSQHQHTLTPTAIARPVSIAVQPAPSSSASTSTYKVLVEGPNGLIRLGTPVESIPPSVLSDAPGCYIVGVLGRKGVGKSTILNLLAASKVGPFSTKSTTRGVDLHATGDGIVLLDMQAIFFPITKKPKKGEDHFASTIATQLKMSEKLALFMFSVCHVILVVSSGSSARDEEMWAFLRRMENIKYRADGGTGPIDNIEELMSEGLLNGKQRRQRRRRRNPQNSAQQVENEEDDYGEERRETEDGAGGDDNEAADRDDDHPSTATENESAAEDQGSKRPLPPRNKKPTKPPTQSSQPLPNPGEPSTTTENIFFPSLIFIHNRAKPSEFGENTHLTTRNALSRAFRTSRLQVFSNILSLELVFPDLYPSIANDLAASPNFWVLPPFPQHPLSQESSSAPSMGLLERLAGCDSLRSFLKDTDGCPARYQVLCEMLRDAVLEVPRYPFELGPPLSTVYKSFDNSGVAGTEPGGLGGMSGVVPGKKWFQGSEREWGKSVAGIWNALE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.53
3 0.5
4 0.43
5 0.4
6 0.34
7 0.3
8 0.24
9 0.22
10 0.16
11 0.16
12 0.16
13 0.15
14 0.15
15 0.14
16 0.19
17 0.26
18 0.33
19 0.4
20 0.49
21 0.55
22 0.65
23 0.72
24 0.76
25 0.79
26 0.82
27 0.82
28 0.82
29 0.84
30 0.77
31 0.76
32 0.68
33 0.62
34 0.55
35 0.49
36 0.45
37 0.42
38 0.47
39 0.5
40 0.58
41 0.64
42 0.71
43 0.76
44 0.8
45 0.84
46 0.86
47 0.87
48 0.87
49 0.87
50 0.85
51 0.87
52 0.84
53 0.78
54 0.71
55 0.64
56 0.6
57 0.51
58 0.51
59 0.48
60 0.51
61 0.51
62 0.48
63 0.47
64 0.5
65 0.57
66 0.52
67 0.48
68 0.43
69 0.46
70 0.5
71 0.53
72 0.5
73 0.46
74 0.47
75 0.49
76 0.48
77 0.46
78 0.44
79 0.43
80 0.44
81 0.46
82 0.49
83 0.44
84 0.42
85 0.43
86 0.45
87 0.4
88 0.36
89 0.3
90 0.24
91 0.26
92 0.25
93 0.2
94 0.17
95 0.17
96 0.15
97 0.15
98 0.14
99 0.12
100 0.15
101 0.14
102 0.14
103 0.15
104 0.14
105 0.15
106 0.13
107 0.15
108 0.16
109 0.18
110 0.19
111 0.19
112 0.2
113 0.18
114 0.18
115 0.19
116 0.17
117 0.17
118 0.17
119 0.17
120 0.18
121 0.19
122 0.17
123 0.13
124 0.11
125 0.13
126 0.11
127 0.1
128 0.08
129 0.08
130 0.11
131 0.12
132 0.12
133 0.1
134 0.1
135 0.1
136 0.11
137 0.11
138 0.1
139 0.11
140 0.11
141 0.11
142 0.11
143 0.1
144 0.09
145 0.08
146 0.07
147 0.09
148 0.09
149 0.08
150 0.09
151 0.09
152 0.11
153 0.11
154 0.12
155 0.1
156 0.11
157 0.13
158 0.14
159 0.18
160 0.17
161 0.17
162 0.16
163 0.15
164 0.14
165 0.12
166 0.1
167 0.06
168 0.06
169 0.06
170 0.07
171 0.08
172 0.11
173 0.18
174 0.21
175 0.23
176 0.26
177 0.27
178 0.28
179 0.28
180 0.27
181 0.25
182 0.23
183 0.21
184 0.17
185 0.16
186 0.14
187 0.12
188 0.09
189 0.05
190 0.04
191 0.03
192 0.03
193 0.03
194 0.03
195 0.03
196 0.03
197 0.03
198 0.04
199 0.05
200 0.06
201 0.12
202 0.21
203 0.26
204 0.3
205 0.34
206 0.43
207 0.5
208 0.55
209 0.61
210 0.58
211 0.61
212 0.58
213 0.55
214 0.47
215 0.38
216 0.35
217 0.25
218 0.19
219 0.11
220 0.11
221 0.13
222 0.13
223 0.14
224 0.15
225 0.14
226 0.16
227 0.16
228 0.16
229 0.14
230 0.12
231 0.12
232 0.08
233 0.09
234 0.07
235 0.07
236 0.06
237 0.05
238 0.05
239 0.06
240 0.05
241 0.04
242 0.04
243 0.04
244 0.05
245 0.05
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.06
250 0.06
251 0.08
252 0.11
253 0.11
254 0.11
255 0.13
256 0.13
257 0.14
258 0.17
259 0.18
260 0.22
261 0.25
262 0.26
263 0.25
264 0.26
265 0.25
266 0.22
267 0.19
268 0.14
269 0.15
270 0.13
271 0.12
272 0.11
273 0.11
274 0.09
275 0.09
276 0.07
277 0.03
278 0.03
279 0.03
280 0.03
281 0.03
282 0.03
283 0.04
284 0.04
285 0.06
286 0.08
287 0.12
288 0.18
289 0.26
290 0.37
291 0.47
292 0.58
293 0.68
294 0.78
295 0.85
296 0.92
297 0.95
298 0.94
299 0.93
300 0.92
301 0.87
302 0.78
303 0.67
304 0.57
305 0.47
306 0.38
307 0.29
308 0.19
309 0.13
310 0.1
311 0.09
312 0.09
313 0.08
314 0.07
315 0.07
316 0.06
317 0.08
318 0.08
319 0.08
320 0.07
321 0.09
322 0.09
323 0.1
324 0.1
325 0.09
326 0.09
327 0.08
328 0.08
329 0.05
330 0.05
331 0.04
332 0.04
333 0.05
334 0.07
335 0.1
336 0.1
337 0.11
338 0.11
339 0.11
340 0.12
341 0.12
342 0.11
343 0.09
344 0.09
345 0.08
346 0.09
347 0.09
348 0.08
349 0.07
350 0.07
351 0.08
352 0.11
353 0.13
354 0.12
355 0.16
356 0.24
357 0.32
358 0.42
359 0.52
360 0.59
361 0.69
362 0.78
363 0.8
364 0.83
365 0.86
366 0.86
367 0.84
368 0.78
369 0.74
370 0.74
371 0.74
372 0.69
373 0.68
374 0.6
375 0.59
376 0.57
377 0.51
378 0.45
379 0.4
380 0.37
381 0.28
382 0.3
383 0.28
384 0.27
385 0.25
386 0.23
387 0.22
388 0.21
389 0.2
390 0.15
391 0.1
392 0.1
393 0.1
394 0.1
395 0.11
396 0.13
397 0.19
398 0.23
399 0.24
400 0.25
401 0.27
402 0.27
403 0.3
404 0.35
405 0.29
406 0.29
407 0.32
408 0.33
409 0.33
410 0.35
411 0.33
412 0.24
413 0.25
414 0.25
415 0.24
416 0.23
417 0.23
418 0.23
419 0.24
420 0.31
421 0.31
422 0.33
423 0.32
424 0.37
425 0.42
426 0.42
427 0.4
428 0.35
429 0.36
430 0.33
431 0.31
432 0.24
433 0.18
434 0.15
435 0.13
436 0.11
437 0.08
438 0.08
439 0.06
440 0.06
441 0.07
442 0.07
443 0.07
444 0.07
445 0.07
446 0.09
447 0.1
448 0.1
449 0.09
450 0.09
451 0.11
452 0.11
453 0.11
454 0.09
455 0.09
456 0.1
457 0.09
458 0.1
459 0.09
460 0.14
461 0.19
462 0.21
463 0.24
464 0.27
465 0.27
466 0.29
467 0.34
468 0.33
469 0.3
470 0.29
471 0.27
472 0.29
473 0.28
474 0.25
475 0.19
476 0.15
477 0.15
478 0.13
479 0.12
480 0.09
481 0.1
482 0.1
483 0.11
484 0.11
485 0.1
486 0.1
487 0.12
488 0.13
489 0.15
490 0.16
491 0.18
492 0.19
493 0.2
494 0.27
495 0.25
496 0.26
497 0.32
498 0.35
499 0.34
500 0.33
501 0.34
502 0.33
503 0.32
504 0.33
505 0.28
506 0.32
507 0.31
508 0.3
509 0.29
510 0.25
511 0.24
512 0.22
513 0.19
514 0.14
515 0.15
516 0.16
517 0.15
518 0.18
519 0.18
520 0.2
521 0.21
522 0.17
523 0.18
524 0.25
525 0.25
526 0.24
527 0.25
528 0.26
529 0.26
530 0.26
531 0.25
532 0.21
533 0.25
534 0.24
535 0.25
536 0.25
537 0.25
538 0.25
539 0.24
540 0.21
541 0.16
542 0.15
543 0.13
544 0.11
545 0.09
546 0.09
547 0.08
548 0.06
549 0.06
550 0.05
551 0.05
552 0.04
553 0.05
554 0.06
555 0.07
556 0.08
557 0.1
558 0.14
559 0.17
560 0.19
561 0.22
562 0.26
563 0.36
564 0.39
565 0.47
566 0.49
567 0.5
568 0.49
569 0.47
570 0.42
571 0.34
572 0.33
573 0.29
574 0.24