Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2C1P7

Protein Details
Accession A0A1Y2C1P7    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
535-560SVEDLKKLNKNKKAIKKLAKKYDQFLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
337-367KQKQKDAERRAAEAEAKKAREEAAAKPKTPA
541-554KLNKNKKAIKKLAK
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 11.5, cyto 7.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR023674  Ribosomal_L1-like  
IPR028364  Ribosomal_L1/biogenesis  
IPR016095  Ribosomal_L1_3-a/b-sand  
IPR023673  Ribosomal_L1_CS  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005840  C:ribosome  
GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00687  Ribosomal_L1  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01199  RIBOSOMAL_L1  
PS50102  RRM  
CDD cd00403  Ribosomal_L1  
Amino Acid Sequences MPPKKEKAQKMSLGSFLADESTGAWADDVGDMPSAPGGFSSYDAPLPTGPRRDNASSRPSGPSGGAPRGDIVYPTQPPYQAYIGNLSYEVVDRDIENLFSQLKVKSIRLIRDTEDNIKGFGYCEFDDLESLKGAVALHGESVKGRQIKIDVSEAKQNTGRSGGFGGERRERGDSRFSGIDDGPSDWRRRDPAAAPPSRSPERGGYGGDRGYGGDRGFGGGDRGGFGGDRNRDFGAPRDRGFGGDRGGDRGFGGGDRGGFGGDRNRDFGAPRDGGFRRDGPPAPLERKKLDLKPRTTTDSESPSTTDAPTSPVKAKPNPFGGAAARDEDEIMRRIEEKQKQKDAERRAAEAEAKKAREEAAAKPKTPAPVSKADEGSWRRDGPRPVTANSKTQQPAQRQNQQGSGKDFATARKQESAKPVPAAAAPAPQKKVQVVKPGNVFDLLNNDEDADAKVAPAAVREAIKQLIAYSTEEKPRKFTETIELQIGLKNYDPQRDKRFSGTVRLPHIPRPQMKICILADARDADHAKEISLDSMSVEDLKKLNKNKKAIKKLAKKYDQFLASEALIKQIPRLLGPGLSKAGKFPSPVTQQDNLGEKVNETKATIKFQLKKVLCMGVAVGHVKMTEDELVQNIMMSINFLVSLLKKNWQNVKSLFIKSSMGKPIRLY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.42
3 0.32
4 0.25
5 0.17
6 0.12
7 0.09
8 0.1
9 0.09
10 0.09
11 0.08
12 0.07
13 0.08
14 0.09
15 0.09
16 0.08
17 0.08
18 0.08
19 0.08
20 0.09
21 0.08
22 0.07
23 0.07
24 0.08
25 0.08
26 0.09
27 0.12
28 0.12
29 0.14
30 0.15
31 0.16
32 0.17
33 0.21
34 0.26
35 0.32
36 0.32
37 0.35
38 0.41
39 0.46
40 0.51
41 0.53
42 0.56
43 0.54
44 0.55
45 0.56
46 0.5
47 0.45
48 0.4
49 0.39
50 0.36
51 0.37
52 0.34
53 0.3
54 0.3
55 0.3
56 0.28
57 0.22
58 0.2
59 0.21
60 0.23
61 0.26
62 0.27
63 0.27
64 0.28
65 0.31
66 0.3
67 0.25
68 0.24
69 0.26
70 0.24
71 0.24
72 0.23
73 0.18
74 0.16
75 0.15
76 0.14
77 0.1
78 0.1
79 0.09
80 0.11
81 0.11
82 0.12
83 0.11
84 0.12
85 0.12
86 0.12
87 0.14
88 0.13
89 0.17
90 0.2
91 0.2
92 0.26
93 0.31
94 0.37
95 0.39
96 0.42
97 0.4
98 0.44
99 0.48
100 0.47
101 0.46
102 0.4
103 0.36
104 0.33
105 0.31
106 0.23
107 0.2
108 0.18
109 0.13
110 0.14
111 0.14
112 0.14
113 0.15
114 0.16
115 0.15
116 0.11
117 0.11
118 0.09
119 0.09
120 0.09
121 0.08
122 0.08
123 0.07
124 0.08
125 0.08
126 0.09
127 0.08
128 0.1
129 0.15
130 0.16
131 0.16
132 0.17
133 0.19
134 0.22
135 0.24
136 0.31
137 0.29
138 0.29
139 0.37
140 0.36
141 0.37
142 0.37
143 0.35
144 0.28
145 0.28
146 0.25
147 0.19
148 0.19
149 0.18
150 0.18
151 0.21
152 0.25
153 0.28
154 0.29
155 0.3
156 0.33
157 0.33
158 0.32
159 0.36
160 0.32
161 0.31
162 0.31
163 0.3
164 0.28
165 0.27
166 0.26
167 0.2
168 0.2
169 0.21
170 0.22
171 0.24
172 0.22
173 0.24
174 0.26
175 0.27
176 0.3
177 0.27
178 0.34
179 0.42
180 0.46
181 0.47
182 0.48
183 0.52
184 0.5
185 0.48
186 0.41
187 0.35
188 0.33
189 0.31
190 0.3
191 0.25
192 0.26
193 0.25
194 0.22
195 0.18
196 0.15
197 0.15
198 0.15
199 0.12
200 0.1
201 0.09
202 0.09
203 0.1
204 0.09
205 0.09
206 0.07
207 0.08
208 0.07
209 0.07
210 0.07
211 0.06
212 0.07
213 0.12
214 0.15
215 0.16
216 0.17
217 0.18
218 0.19
219 0.2
220 0.26
221 0.29
222 0.29
223 0.29
224 0.31
225 0.3
226 0.31
227 0.33
228 0.28
229 0.21
230 0.21
231 0.2
232 0.2
233 0.2
234 0.18
235 0.16
236 0.14
237 0.12
238 0.08
239 0.09
240 0.06
241 0.06
242 0.07
243 0.07
244 0.07
245 0.06
246 0.07
247 0.12
248 0.15
249 0.16
250 0.17
251 0.18
252 0.19
253 0.2
254 0.22
255 0.23
256 0.2
257 0.2
258 0.24
259 0.24
260 0.26
261 0.27
262 0.26
263 0.22
264 0.26
265 0.26
266 0.22
267 0.25
268 0.28
269 0.33
270 0.35
271 0.36
272 0.33
273 0.38
274 0.41
275 0.44
276 0.49
277 0.51
278 0.51
279 0.54
280 0.56
281 0.56
282 0.52
283 0.48
284 0.42
285 0.4
286 0.35
287 0.3
288 0.27
289 0.23
290 0.22
291 0.19
292 0.15
293 0.1
294 0.12
295 0.12
296 0.14
297 0.15
298 0.19
299 0.23
300 0.27
301 0.31
302 0.32
303 0.36
304 0.35
305 0.32
306 0.3
307 0.27
308 0.24
309 0.21
310 0.17
311 0.13
312 0.11
313 0.11
314 0.09
315 0.1
316 0.09
317 0.08
318 0.08
319 0.08
320 0.11
321 0.18
322 0.26
323 0.33
324 0.39
325 0.46
326 0.49
327 0.54
328 0.6
329 0.59
330 0.6
331 0.53
332 0.47
333 0.42
334 0.4
335 0.39
336 0.33
337 0.32
338 0.28
339 0.26
340 0.25
341 0.23
342 0.22
343 0.21
344 0.22
345 0.22
346 0.29
347 0.31
348 0.31
349 0.33
350 0.34
351 0.34
352 0.33
353 0.29
354 0.23
355 0.29
356 0.31
357 0.34
358 0.33
359 0.3
360 0.36
361 0.36
362 0.36
363 0.31
364 0.29
365 0.27
366 0.31
367 0.34
368 0.31
369 0.37
370 0.36
371 0.34
372 0.41
373 0.41
374 0.42
375 0.4
376 0.43
377 0.36
378 0.39
379 0.43
380 0.42
381 0.5
382 0.52
383 0.59
384 0.57
385 0.58
386 0.6
387 0.57
388 0.54
389 0.47
390 0.42
391 0.33
392 0.31
393 0.29
394 0.24
395 0.28
396 0.27
397 0.25
398 0.29
399 0.3
400 0.32
401 0.4
402 0.43
403 0.38
404 0.36
405 0.35
406 0.29
407 0.28
408 0.27
409 0.18
410 0.18
411 0.2
412 0.22
413 0.25
414 0.25
415 0.26
416 0.26
417 0.32
418 0.31
419 0.37
420 0.37
421 0.39
422 0.43
423 0.44
424 0.42
425 0.36
426 0.32
427 0.22
428 0.23
429 0.19
430 0.15
431 0.13
432 0.13
433 0.11
434 0.12
435 0.12
436 0.09
437 0.07
438 0.06
439 0.06
440 0.07
441 0.07
442 0.07
443 0.07
444 0.08
445 0.09
446 0.09
447 0.11
448 0.11
449 0.11
450 0.11
451 0.1
452 0.1
453 0.1
454 0.12
455 0.14
456 0.17
457 0.25
458 0.29
459 0.3
460 0.32
461 0.34
462 0.37
463 0.35
464 0.33
465 0.33
466 0.36
467 0.38
468 0.36
469 0.34
470 0.28
471 0.29
472 0.28
473 0.2
474 0.14
475 0.18
476 0.18
477 0.25
478 0.29
479 0.34
480 0.43
481 0.48
482 0.49
483 0.48
484 0.54
485 0.48
486 0.52
487 0.53
488 0.5
489 0.5
490 0.54
491 0.51
492 0.51
493 0.57
494 0.56
495 0.53
496 0.55
497 0.54
498 0.54
499 0.53
500 0.52
501 0.44
502 0.44
503 0.4
504 0.33
505 0.3
506 0.25
507 0.24
508 0.23
509 0.23
510 0.16
511 0.2
512 0.19
513 0.17
514 0.17
515 0.17
516 0.13
517 0.13
518 0.12
519 0.08
520 0.09
521 0.09
522 0.1
523 0.1
524 0.11
525 0.12
526 0.17
527 0.23
528 0.31
529 0.4
530 0.46
531 0.55
532 0.63
533 0.72
534 0.79
535 0.83
536 0.85
537 0.86
538 0.89
539 0.91
540 0.9
541 0.84
542 0.77
543 0.75
544 0.67
545 0.57
546 0.49
547 0.41
548 0.32
549 0.31
550 0.27
551 0.21
552 0.19
553 0.18
554 0.17
555 0.17
556 0.18
557 0.14
558 0.16
559 0.15
560 0.18
561 0.19
562 0.22
563 0.23
564 0.24
565 0.24
566 0.24
567 0.27
568 0.25
569 0.25
570 0.24
571 0.29
572 0.34
573 0.4
574 0.44
575 0.43
576 0.43
577 0.46
578 0.49
579 0.42
580 0.38
581 0.33
582 0.28
583 0.31
584 0.31
585 0.27
586 0.24
587 0.28
588 0.28
589 0.34
590 0.4
591 0.43
592 0.47
593 0.52
594 0.61
595 0.56
596 0.57
597 0.55
598 0.53
599 0.44
600 0.37
601 0.32
602 0.24
603 0.26
604 0.22
605 0.18
606 0.14
607 0.14
608 0.14
609 0.13
610 0.13
611 0.11
612 0.11
613 0.12
614 0.13
615 0.14
616 0.13
617 0.13
618 0.11
619 0.1
620 0.09
621 0.09
622 0.08
623 0.06
624 0.07
625 0.07
626 0.08
627 0.09
628 0.16
629 0.17
630 0.24
631 0.28
632 0.35
633 0.45
634 0.45
635 0.52
636 0.48
637 0.54
638 0.54
639 0.55
640 0.49
641 0.42
642 0.44
643 0.39
644 0.44
645 0.46
646 0.42