FuNGI

A0A1Y2CJU1

Protein Details

Accession

A0A1Y2CJU1

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
581-668	SGVDEGKDKKRSKHRRRRHRSRGSDSEGSSEDSEERRERRRKRRERDGEGGEEGGGNDERRKKKSSSKKKSSSSRKHRHRSDSEASDA	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
587-605	KDKKRSKHRRRRHRSRGSD
614-660	EERRERRRKRRERDGEGGEEGGGNDERRKKKSSSKKKSSSSRKHRHR

Subcellular Location(s)

nucl 26

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR034772 CPSF6/7 IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0006397 P:mRNA processing

Amino Acid Sequences

MLISQYRQGLTFLMADFDIYGDSADYSLTNDDLLNPSSLSSSTQATDSNKQPSSKNIDSTTTSKTNGETLASSSWSGSSAVNKPTTSSSSTTQLQPQPPSMQSFDTNDASVDWNNHQNVSQMASQQLQNMRALVLENLTWWTTDEDLYLACLSSGIPKESLSISDISFAEFRGNGKSKGTAQIVFQSNKDALTAKAYFDINELHNVKPIVRVSLYDSFRPHAFATSGPAPFDSSQGNQNMMQQQQQSGMNAGGMMNPMGMPMMPNMMGGGMTGGMGGMGNQMMGGTQPGNSFMGPGGGGGMMMNRGVHNGVGGGFMANRGGGMMNPGMMGRGMPMPPPSAPITPIPAMNGTPTPTVEDSLAPPGLQDVQSSIAPPSVAPLSEPRERRPSVSSTTGSTAAAPKSPRPVHHQDSHNASYPPSNHPYPDRDWQPPYSNHDRDWPPHSDRDRDLYSDRDHTFPPYAGRGGRGGWGGRGRGRGGYDYPRGGGGGAPFRGEPRFDPYYDAPPPPPPRDWNNRPPHDGYHHDRPPVRDESHYHPPGYYNRAGGGGSGGPAPSQNRPVVEVVERRPVAVVVEKESVSGSGVDEGKDKKRSKHRRRRHRSRGSDSEGSSEDSEERRERRRKRRERDGEGGEEGGGNDERRKKKSSSKKKSSSSRKHRHRSDSEASDAEPREVSLVGRGNALLNKHQQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.14
2	0.13
3	0.12
4	0.12
5	0.1
6	0.07
7	0.07
8	0.06
9	0.06
10	0.06
11	0.06
12	0.06
13	0.07
14	0.08
15	0.08
16	0.09
17	0.09
18	0.11
19	0.14
20	0.15
21	0.15
22	0.14
23	0.14
24	0.14
25	0.15
26	0.15
27	0.14
28	0.15
29	0.14
30	0.16
31	0.2
32	0.24
33	0.3
34	0.34
35	0.4
36	0.42
37	0.44
38	0.45
39	0.48
40	0.53
41	0.52
42	0.52
43	0.47
44	0.47
45	0.49
46	0.51
47	0.51
48	0.45
49	0.41
50	0.36
51	0.34
52	0.32
53	0.28
54	0.26
55	0.2
56	0.19
57	0.19
58	0.19
59	0.19
60	0.16
61	0.15
62	0.14
63	0.14
64	0.13
65	0.16
66	0.2
67	0.26
68	0.29
69	0.29
70	0.29
71	0.32
72	0.34
73	0.32
74	0.3
75	0.28
76	0.31
77	0.34
78	0.35
79	0.39
80	0.43
81	0.45
82	0.44
83	0.45
84	0.45
85	0.44
86	0.45
87	0.4
88	0.36
89	0.33
90	0.34
91	0.34
92	0.31
93	0.29
94	0.25
95	0.23
96	0.23
97	0.21
98	0.19
99	0.18
100	0.22
101	0.23
102	0.24
103	0.23
104	0.22
105	0.22
106	0.23
107	0.22
108	0.17
109	0.18
110	0.2
111	0.2
112	0.24
113	0.27
114	0.25
115	0.24
116	0.22
117	0.2
118	0.18
119	0.18
120	0.14
121	0.11
122	0.09
123	0.08
124	0.1
125	0.1
126	0.1
127	0.1
128	0.1
129	0.1
130	0.1
131	0.1
132	0.09
133	0.09
134	0.1
135	0.09
136	0.07
137	0.06
138	0.06
139	0.06
140	0.11
141	0.13
142	0.13
143	0.13
144	0.14
145	0.15
146	0.16
147	0.17
148	0.14
149	0.13
150	0.12
151	0.15
152	0.15
153	0.15
154	0.14
155	0.13
156	0.13
157	0.12
158	0.13
159	0.17
160	0.21
161	0.2
162	0.22
163	0.24
164	0.25
165	0.31
166	0.33
167	0.27
168	0.25
169	0.32
170	0.37
171	0.35
172	0.33
173	0.29
174	0.27
175	0.25
176	0.24
177	0.18
178	0.12
179	0.16
180	0.17
181	0.14
182	0.17
183	0.17
184	0.16
185	0.17
186	0.19
187	0.14
188	0.21
189	0.22
190	0.19
191	0.22
192	0.23
193	0.22
194	0.23
195	0.23
196	0.18
197	0.17
198	0.17
199	0.2
200	0.28
201	0.3
202	0.28
203	0.29
204	0.28
205	0.28
206	0.29
207	0.24
208	0.18
209	0.16
210	0.14
211	0.18
212	0.2
213	0.21
214	0.19
215	0.19
216	0.19
217	0.18
218	0.19
219	0.16
220	0.12
221	0.17
222	0.18
223	0.19
224	0.18
225	0.21
226	0.24
227	0.23
228	0.25
229	0.21
230	0.2
231	0.21
232	0.22
233	0.18
234	0.16
235	0.15
236	0.11
237	0.11
238	0.1
239	0.07
240	0.06
241	0.06
242	0.04
243	0.04
244	0.04
245	0.04
246	0.04
247	0.03
248	0.03
249	0.05
250	0.05
251	0.05
252	0.05
253	0.05
254	0.05
255	0.04
256	0.04
257	0.03
258	0.03
259	0.03
260	0.02
261	0.02
262	0.02
263	0.02
264	0.02
265	0.02
266	0.02
267	0.02
268	0.02
269	0.02
270	0.03
271	0.03
272	0.03
273	0.04
274	0.05
275	0.06
276	0.07
277	0.07
278	0.07
279	0.07
280	0.07
281	0.06
282	0.06
283	0.05
284	0.04
285	0.04
286	0.03
287	0.04
288	0.03
289	0.03
290	0.04
291	0.03
292	0.04
293	0.04
294	0.04
295	0.04
296	0.04
297	0.04
298	0.04
299	0.04
300	0.04
301	0.04
302	0.04
303	0.04
304	0.03
305	0.03
306	0.03
307	0.03
308	0.03
309	0.04
310	0.04
311	0.04
312	0.05
313	0.05
314	0.05
315	0.05
316	0.05
317	0.04
318	0.06
319	0.06
320	0.06
321	0.07
322	0.09
323	0.09
324	0.11
325	0.13
326	0.12
327	0.13
328	0.13
329	0.15
330	0.15
331	0.15
332	0.13
333	0.12
334	0.11
335	0.11
336	0.11
337	0.09
338	0.09
339	0.09
340	0.1
341	0.09
342	0.1
343	0.1
344	0.1
345	0.09
346	0.11
347	0.11
348	0.09
349	0.08
350	0.08
351	0.08
352	0.08
353	0.07
354	0.05
355	0.07
356	0.08
357	0.08
358	0.08
359	0.08
360	0.07
361	0.07
362	0.08
363	0.06
364	0.06
365	0.06
366	0.1
367	0.14
368	0.2
369	0.22
370	0.24
371	0.31
372	0.32
373	0.34
374	0.34
375	0.33
376	0.32
377	0.36
378	0.33
379	0.28
380	0.29
381	0.28
382	0.24
383	0.21
384	0.19
385	0.14
386	0.16
387	0.15
388	0.14
389	0.22
390	0.24
391	0.26
392	0.31
393	0.39
394	0.42
395	0.49
396	0.52
397	0.48
398	0.53
399	0.53
400	0.49
401	0.42
402	0.36
403	0.31
404	0.29
405	0.3
406	0.27
407	0.25
408	0.23
409	0.26
410	0.3
411	0.32
412	0.37
413	0.36
414	0.37
415	0.4
416	0.42
417	0.45
418	0.44
419	0.48
420	0.5
421	0.47
422	0.43
423	0.47
424	0.46
425	0.44
426	0.45
427	0.43
428	0.38
429	0.43
430	0.45
431	0.43
432	0.42
433	0.44
434	0.41
435	0.38
436	0.36
437	0.32
438	0.32
439	0.34
440	0.33
441	0.29
442	0.28
443	0.27
444	0.27
445	0.24
446	0.24
447	0.19
448	0.2
449	0.19
450	0.19
451	0.18
452	0.16
453	0.17
454	0.17
455	0.15
456	0.16
457	0.18
458	0.19
459	0.21
460	0.22
461	0.21
462	0.21
463	0.23
464	0.22
465	0.23
466	0.27
467	0.28
468	0.27
469	0.26
470	0.24
471	0.23
472	0.2
473	0.18
474	0.14
475	0.15
476	0.14
477	0.15
478	0.14
479	0.16
480	0.17
481	0.17
482	0.16
483	0.18
484	0.21
485	0.2
486	0.25
487	0.27
488	0.33
489	0.35
490	0.36
491	0.31
492	0.36
493	0.42
494	0.41
495	0.43
496	0.4
497	0.45
498	0.53
499	0.6
500	0.62
501	0.67
502	0.68
503	0.7
504	0.68
505	0.65
506	0.61
507	0.6
508	0.56
509	0.56
510	0.55
511	0.55
512	0.55
513	0.53
514	0.53
515	0.52
516	0.47
517	0.41
518	0.41
519	0.43
520	0.5
521	0.5
522	0.44
523	0.38
524	0.4
525	0.41
526	0.43
527	0.38
528	0.28
529	0.26
530	0.27
531	0.26
532	0.22
533	0.19
534	0.12
535	0.11
536	0.1
537	0.09
538	0.08
539	0.1
540	0.12
541	0.14
542	0.18
543	0.19
544	0.2
545	0.22
546	0.24
547	0.25
548	0.28
549	0.31
550	0.3
551	0.37
552	0.36
553	0.34
554	0.33
555	0.3
556	0.26
557	0.26
558	0.25
559	0.2
560	0.23
561	0.22
562	0.22
563	0.22
564	0.2
565	0.15
566	0.14
567	0.1
568	0.12
569	0.13
570	0.13
571	0.17
572	0.21
573	0.26
574	0.35
575	0.38
576	0.43
577	0.53
578	0.64
579	0.72
580	0.79
581	0.84
582	0.86
583	0.94
584	0.97
585	0.97
586	0.97
587	0.96
588	0.95
589	0.94
590	0.91
591	0.87
592	0.77
593	0.7
594	0.6
595	0.52
596	0.43
597	0.33
598	0.28
599	0.22
600	0.26
601	0.28
602	0.32
603	0.39
604	0.48
605	0.57
606	0.65
607	0.75
608	0.81
609	0.86
610	0.92
611	0.93
612	0.92
613	0.92
614	0.89
615	0.83
616	0.75
617	0.64
618	0.53
619	0.42
620	0.33
621	0.26
622	0.19
623	0.14
624	0.18
625	0.26
626	0.33
627	0.37
628	0.43
629	0.46
630	0.55
631	0.65
632	0.71
633	0.73
634	0.78
635	0.84
636	0.88
637	0.93
638	0.94
639	0.94
640	0.94
641	0.94
642	0.94
643	0.94
644	0.94
645	0.94
646	0.91
647	0.89
648	0.87
649	0.83
650	0.78
651	0.69
652	0.6
653	0.57
654	0.5
655	0.42
656	0.32
657	0.25
658	0.21
659	0.19
660	0.18
661	0.17
662	0.21
663	0.2
664	0.21
665	0.21
666	0.23
667	0.25
668	0.28

A0A1Y2CJU1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer