FuNGI

A0A1Y2CG88

Protein Details

Accession

A0A1Y2CG88

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
654-680	ITLLVKQTEPPKKRKRNENTVERQSNE	Hydrophilic
787-820	KARQSNTRQKHEGPRNKPKEGKQKHKTTEIKEGT	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
795-812	QKHEGPRNKPKEGKQKHK

Subcellular Location(s)

nucl 20, mito 3, cyto 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012337 RNaseH-like_sf IPR002156 RNaseH_domain IPR036397 RNaseH_sf
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0004523 F:RNA-DNA hybrid ribonuclease activity
Pfam	View protein in Pfam PF00075 RNase_H
PROSITE	View protein in PROSITE PS50879 RNASE_H_1

Amino Acid Sequences

MANLQNQLALPHSIFETPFPTKVSKGTHYLASTMHRFHSKAITMNAIRHIDPITQEIKQEFGKVMGGETSIFHAIDNWVIYNQISKHLSRHNIIFVEQVLCYFSEKMLTPKQMETRFPLFDKTDYNWFRKLTTALNRKDTTNRTRLSLTKRTRPNPFATEPTASRICGLGKKHEIVTWNDPETEEQHYGEIMGIERDEGTTTHRLHHYVELTENDYEGNNEYTFAIEHQNRTFIVECNGVTCTQGYLQNGKCILYKRDGFMNVWSNKDQSNKLYELADITNEQPAEDQQQYTSRQIIECKTITSVKDSIPRETNNLQTKHESPLGVTEEEKTTGQNRAAIYFEGPQELITAIGALRARECNTRDAIYSDGSLTFINGKPSLAGSVVAWDGTQKGRRINFGIEGNASSTNAEMYAANAALLGVNGPTDMYIDNMAVIQTFKRLGRSNFNIKRRELFTLSNVYTAAQMCHIAKSITGPIPILHHVKSHTGVPGNEMADSDANDGHMAPLLKMKLEGQSLIQFTLCTNNIMLEGNYRETLTMINKAKTFLAWIEQPAHSHIAEVQNSINFGLTFALLQRGHKQTSYFTSEAHSHYRKWDINAMHRLLPVQSEMRRRHQDAYPNGTCRVCHQEEETNDHLWSCIETEAIRMEIWEKMITLLVKQTEPPKKRKRNENTVERQSNEANNTKIRSWLKNWDGQTRDNRPPQPRDEIGSEADKMTFTHIAGYGLIPNIMYRILEKCGIRKPQTQRMIILTTWKELKMMARERIWKPRCDKTTAWEETNQITATIKARQSNTRQKHEGPRNKPKEGKQKHKTTEIKEGTRCQHCMEPLNTDEPHKHGGSYGQQIRAIDMISSNNMGIRKIPPGIINTLATYMDQYAREEEFCYNPDMITKERGTDQQDAQDWEDANLWWDTDDTDISENDETRHYTQEEGVEEQHQPPPKRIREELATGPSFLSHE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.16
2	0.17
3	0.21
4	0.22
5	0.24
6	0.26
7	0.27
8	0.27
9	0.33
10	0.38
11	0.36
12	0.39
13	0.4
14	0.43
15	0.42
16	0.42
17	0.39
18	0.39
19	0.39
20	0.35
21	0.36
22	0.35
23	0.34
24	0.35
25	0.4
26	0.38
27	0.39
28	0.4
29	0.44
30	0.42
31	0.45
32	0.49
33	0.44
34	0.4
35	0.36
36	0.35
37	0.28
38	0.27
39	0.28
40	0.25
41	0.23
42	0.25
43	0.24
44	0.26
45	0.24
46	0.25
47	0.21
48	0.19
49	0.21
50	0.18
51	0.18
52	0.16
53	0.15
54	0.13
55	0.13
56	0.15
57	0.13
58	0.13
59	0.12
60	0.12
61	0.12
62	0.14
63	0.14
64	0.12
65	0.11
66	0.12
67	0.12
68	0.16
69	0.16
70	0.21
71	0.23
72	0.23
73	0.29
74	0.36
75	0.42
76	0.41
77	0.45
78	0.43
79	0.42
80	0.42
81	0.38
82	0.32
83	0.28
84	0.24
85	0.2
86	0.15
87	0.14
88	0.15
89	0.13
90	0.11
91	0.13
92	0.14
93	0.2
94	0.26
95	0.31
96	0.32
97	0.37
98	0.45
99	0.47
100	0.49
101	0.5
102	0.49
103	0.48
104	0.46
105	0.46
106	0.4
107	0.37
108	0.38
109	0.35
110	0.4
111	0.4
112	0.43
113	0.43
114	0.42
115	0.4
116	0.39
117	0.38
118	0.36
119	0.42
120	0.47
121	0.49
122	0.56
123	0.57
124	0.57
125	0.62
126	0.62
127	0.61
128	0.6
129	0.55
130	0.5
131	0.53
132	0.57
133	0.57
134	0.59
135	0.59
136	0.59
137	0.67
138	0.71
139	0.76
140	0.75
141	0.73
142	0.7
143	0.67
144	0.64
145	0.59
146	0.57
147	0.49
148	0.49
149	0.43
150	0.35
151	0.31
152	0.26
153	0.24
154	0.24
155	0.26
156	0.28
157	0.32
158	0.35
159	0.36
160	0.36
161	0.37
162	0.38
163	0.43
164	0.4
165	0.37
166	0.35
167	0.34
168	0.33
169	0.32
170	0.31
171	0.25
172	0.19
173	0.17
174	0.17
175	0.16
176	0.15
177	0.14
178	0.09
179	0.08
180	0.07
181	0.07
182	0.07
183	0.07
184	0.07
185	0.07
186	0.11
187	0.16
188	0.17
189	0.22
190	0.24
191	0.25
192	0.27
193	0.32
194	0.3
195	0.26
196	0.29
197	0.26
198	0.27
199	0.26
200	0.24
201	0.19
202	0.16
203	0.15
204	0.13
205	0.13
206	0.1
207	0.1
208	0.1
209	0.1
210	0.11
211	0.11
212	0.16
213	0.17
214	0.2
215	0.21
216	0.23
217	0.22
218	0.25
219	0.25
220	0.2
221	0.2
222	0.2
223	0.18
224	0.18
225	0.19
226	0.16
227	0.15
228	0.13
229	0.11
230	0.11
231	0.14
232	0.15
233	0.2
234	0.22
235	0.26
236	0.26
237	0.26
238	0.27
239	0.28
240	0.29
241	0.29
242	0.3
243	0.28
244	0.33
245	0.34
246	0.32
247	0.34
248	0.4
249	0.35
250	0.36
251	0.36
252	0.31
253	0.32
254	0.35
255	0.32
256	0.26
257	0.29
258	0.27
259	0.27
260	0.26
261	0.24
262	0.22
263	0.2
264	0.18
265	0.14
266	0.13
267	0.14
268	0.13
269	0.13
270	0.11
271	0.11
272	0.14
273	0.14
274	0.14
275	0.13
276	0.18
277	0.21
278	0.22
279	0.24
280	0.2
281	0.2
282	0.24
283	0.25
284	0.25
285	0.23
286	0.22
287	0.23
288	0.24
289	0.23
290	0.24
291	0.24
292	0.22
293	0.29
294	0.3
295	0.32
296	0.34
297	0.34
298	0.35
299	0.36
300	0.41
301	0.42
302	0.42
303	0.4
304	0.39
305	0.4
306	0.39
307	0.39
308	0.3
309	0.22
310	0.25
311	0.25
312	0.22
313	0.2
314	0.18
315	0.16
316	0.18
317	0.17
318	0.14
319	0.13
320	0.15
321	0.16
322	0.17
323	0.17
324	0.17
325	0.18
326	0.17
327	0.16
328	0.16
329	0.15
330	0.13
331	0.12
332	0.11
333	0.1
334	0.1
335	0.08
336	0.05
337	0.05
338	0.04
339	0.06
340	0.07
341	0.06
342	0.07
343	0.09
344	0.11
345	0.15
346	0.17
347	0.18
348	0.2
349	0.21
350	0.21
351	0.21
352	0.21
353	0.17
354	0.16
355	0.13
356	0.11
357	0.11
358	0.1
359	0.08
360	0.1
361	0.1
362	0.12
363	0.11
364	0.11
365	0.1
366	0.11
367	0.11
368	0.09
369	0.08
370	0.06
371	0.07
372	0.07
373	0.07
374	0.06
375	0.06
376	0.07
377	0.09
378	0.13
379	0.13
380	0.18
381	0.2
382	0.22
383	0.25
384	0.25
385	0.27
386	0.25
387	0.24
388	0.2
389	0.19
390	0.18
391	0.16
392	0.14
393	0.1
394	0.08
395	0.06
396	0.05
397	0.06
398	0.04
399	0.04
400	0.05
401	0.05
402	0.05
403	0.05
404	0.04
405	0.04
406	0.04
407	0.03
408	0.02
409	0.02
410	0.02
411	0.02
412	0.02
413	0.03
414	0.03
415	0.04
416	0.04
417	0.04
418	0.05
419	0.05
420	0.05
421	0.04
422	0.05
423	0.04
424	0.05
425	0.07
426	0.07
427	0.11
428	0.14
429	0.17
430	0.24
431	0.3
432	0.4
433	0.46
434	0.54
435	0.55
436	0.52
437	0.54
438	0.49
439	0.47
440	0.39
441	0.33
442	0.29
443	0.31
444	0.3
445	0.26
446	0.23
447	0.2
448	0.17
449	0.16
450	0.13
451	0.07
452	0.08
453	0.08
454	0.08
455	0.08
456	0.07
457	0.07
458	0.08
459	0.1
460	0.1
461	0.1
462	0.1
463	0.1
464	0.12
465	0.14
466	0.15
467	0.12
468	0.12
469	0.13
470	0.15
471	0.15
472	0.15
473	0.14
474	0.15
475	0.14
476	0.15
477	0.17
478	0.15
479	0.14
480	0.13
481	0.12
482	0.1
483	0.1
484	0.09
485	0.06
486	0.06
487	0.06
488	0.06
489	0.05
490	0.06
491	0.06
492	0.05
493	0.08
494	0.08
495	0.08
496	0.08
497	0.09
498	0.1
499	0.11
500	0.11
501	0.1
502	0.13
503	0.13
504	0.13
505	0.13
506	0.1
507	0.1
508	0.13
509	0.12
510	0.09
511	0.09
512	0.09
513	0.09
514	0.1
515	0.1
516	0.08
517	0.09
518	0.09
519	0.1
520	0.1
521	0.09
522	0.09
523	0.1
524	0.1
525	0.16
526	0.17
527	0.19
528	0.2
529	0.21
530	0.21
531	0.19
532	0.19
533	0.12
534	0.12
535	0.11
536	0.12
537	0.14
538	0.15
539	0.15
540	0.16
541	0.17
542	0.14
543	0.13
544	0.14
545	0.16
546	0.16
547	0.16
548	0.15
549	0.14
550	0.14
551	0.14
552	0.12
553	0.07
554	0.07
555	0.06
556	0.05
557	0.05
558	0.05
559	0.1
560	0.1
561	0.11
562	0.16
563	0.19
564	0.21
565	0.22
566	0.22
567	0.2
568	0.25
569	0.3
570	0.25
571	0.22
572	0.23
573	0.25
574	0.27
575	0.32
576	0.29
577	0.23
578	0.26
579	0.32
580	0.32
581	0.31
582	0.35
583	0.32
584	0.38
585	0.45
586	0.44
587	0.39
588	0.37
589	0.35
590	0.29
591	0.26
592	0.19
593	0.16
594	0.19
595	0.25
596	0.29
597	0.37
598	0.43
599	0.45
600	0.47
601	0.47
602	0.52
603	0.5
604	0.55
605	0.52
606	0.49
607	0.49
608	0.45
609	0.41
610	0.35
611	0.36
612	0.29
613	0.25
614	0.25
615	0.3
616	0.31
617	0.38
618	0.37
619	0.31
620	0.29
621	0.27
622	0.24
623	0.17
624	0.16
625	0.1
626	0.07
627	0.06
628	0.06
629	0.07
630	0.08
631	0.09
632	0.08
633	0.07
634	0.08
635	0.09
636	0.1
637	0.09
638	0.08
639	0.08
640	0.1
641	0.1
642	0.09
643	0.12
644	0.12
645	0.12
646	0.14
647	0.23
648	0.3
649	0.36
650	0.46
651	0.54
652	0.63
653	0.71
654	0.8
655	0.82
656	0.84
657	0.88
658	0.89
659	0.88
660	0.88
661	0.85
662	0.75
663	0.68
664	0.6
665	0.53
666	0.47
667	0.41
668	0.33
669	0.31
670	0.33
671	0.3
672	0.35
673	0.35
674	0.35
675	0.35
676	0.42
677	0.42
678	0.46
679	0.49
680	0.5
681	0.49
682	0.51
683	0.56
684	0.54
685	0.58
686	0.59
687	0.63
688	0.63
689	0.66
690	0.65
691	0.64
692	0.58
693	0.54
694	0.5
695	0.45
696	0.4
697	0.36
698	0.32
699	0.24
700	0.22
701	0.18
702	0.15
703	0.15
704	0.13
705	0.1
706	0.12
707	0.12
708	0.12
709	0.13
710	0.13
711	0.11
712	0.1
713	0.1
714	0.08
715	0.07
716	0.07
717	0.07
718	0.06
719	0.06
720	0.09
721	0.11
722	0.15
723	0.16
724	0.21
725	0.29
726	0.37
727	0.41
728	0.47
729	0.53
730	0.59
731	0.66
732	0.64
733	0.59
734	0.56
735	0.54
736	0.46
737	0.46
738	0.37
739	0.32
740	0.32
741	0.29
742	0.24
743	0.21
744	0.26
745	0.27
746	0.33
747	0.35
748	0.38
749	0.47
750	0.52
751	0.62
752	0.62
753	0.61
754	0.59
755	0.63
756	0.63
757	0.61
758	0.58
759	0.53
760	0.59
761	0.57
762	0.54
763	0.48
764	0.45
765	0.4
766	0.42
767	0.35
768	0.25
769	0.2
770	0.19
771	0.18
772	0.22
773	0.23
774	0.25
775	0.29
776	0.36
777	0.45
778	0.54
779	0.6
780	0.63
781	0.66
782	0.68
783	0.76
784	0.79
785	0.8
786	0.79
787	0.82
788	0.81
789	0.84
790	0.84
791	0.83
792	0.83
793	0.84
794	0.84
795	0.83
796	0.85
797	0.83
798	0.86
799	0.85
800	0.8
801	0.8
802	0.78
803	0.75
804	0.7
805	0.71
806	0.69
807	0.67
808	0.63
809	0.55
810	0.51
811	0.47
812	0.49
813	0.43
814	0.41
815	0.37
816	0.41
817	0.39
818	0.37
819	0.35
820	0.31
821	0.34
822	0.28
823	0.26
824	0.21
825	0.26
826	0.29
827	0.37
828	0.39
829	0.38
830	0.4
831	0.4
832	0.4
833	0.35
834	0.29
835	0.2
836	0.15
837	0.13
838	0.13
839	0.14
840	0.13
841	0.14
842	0.15
843	0.15
844	0.16
845	0.16
846	0.19
847	0.2
848	0.22
849	0.22
850	0.25
851	0.29
852	0.29
853	0.28
854	0.25
855	0.24
856	0.22
857	0.19
858	0.17
859	0.15
860	0.15
861	0.15
862	0.16
863	0.17
864	0.19
865	0.2
866	0.2
867	0.21
868	0.21
869	0.21
870	0.23
871	0.2
872	0.19
873	0.21
874	0.22
875	0.22
876	0.26
877	0.26
878	0.25
879	0.28
880	0.34
881	0.35
882	0.39
883	0.39
884	0.4
885	0.43
886	0.44
887	0.43
888	0.42
889	0.37
890	0.32
891	0.31
892	0.23
893	0.21
894	0.18
895	0.16
896	0.11
897	0.11
898	0.11
899	0.11
900	0.11
901	0.1
902	0.12
903	0.12
904	0.15
905	0.17
906	0.17
907	0.17
908	0.19
909	0.22
910	0.22
911	0.27
912	0.25
913	0.25
914	0.27
915	0.3
916	0.3
917	0.29
918	0.29
919	0.27
920	0.29
921	0.3
922	0.32
923	0.36
924	0.35
925	0.41
926	0.49
927	0.54
928	0.6
929	0.62
930	0.63
931	0.62
932	0.66
933	0.66
934	0.64
935	0.57
936	0.5
937	0.45

A0A1Y2CG88

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer