Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2CSM3

Protein Details
Accession A0A1Y2CSM3    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-29REREEESPKPSRKTKSQRKSSALESSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
13-18PSRKTK
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR006224  PsdUridine_synth_RluA-like_CS  
IPR006145  PsdUridine_synth_RsuA/RluA  
Gene Ontology GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF00849  PseudoU_synth_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01129  PSI_RLU  
PS50889  S4  
Amino Acid Sequences MSKREREEESPKPSRKTKSQRKSSALESSEFKEEASFVIDESTGLRRVEPYWHTYRINAKGRWFNRTLLNVFKEEFKDQNEDYYTRAILKGKISVNNESKDINYIIKSNDVVSHSVHRHEPPVTSQPIRFVFKSDDLLVVDKPGSIPVHPTGRYNHNTITGILKSKEYGFGNLYPVNRLDRLTSGILLLALTKEKASQLATELSDRNVSKTYLSRVRGKFPSENASNKSPPSIPGYPIANDPLYANPEFWGEDLGKGGVKDKEAVSEKIKAAKVKGVSIDGEDIADHSITKGGIPSSIAGVTLNMDEFPCARCAITLPDPTNSQLRIYLHSWKYSGESGWEYETPMPDWADPDFVE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.75
2 0.77
3 0.79
4 0.81
5 0.81
6 0.85
7 0.88
8 0.87
9 0.84
10 0.81
11 0.79
12 0.71
13 0.63
14 0.56
15 0.49
16 0.46
17 0.41
18 0.33
19 0.24
20 0.21
21 0.18
22 0.18
23 0.14
24 0.1
25 0.11
26 0.11
27 0.1
28 0.12
29 0.14
30 0.14
31 0.14
32 0.15
33 0.15
34 0.17
35 0.24
36 0.26
37 0.3
38 0.33
39 0.38
40 0.39
41 0.42
42 0.49
43 0.52
44 0.57
45 0.53
46 0.55
47 0.59
48 0.61
49 0.63
50 0.57
51 0.51
52 0.49
53 0.52
54 0.47
55 0.45
56 0.46
57 0.4
58 0.39
59 0.39
60 0.35
61 0.32
62 0.32
63 0.28
64 0.3
65 0.28
66 0.33
67 0.32
68 0.29
69 0.28
70 0.27
71 0.25
72 0.2
73 0.22
74 0.19
75 0.19
76 0.2
77 0.25
78 0.26
79 0.31
80 0.34
81 0.4
82 0.43
83 0.42
84 0.41
85 0.36
86 0.33
87 0.29
88 0.27
89 0.21
90 0.16
91 0.16
92 0.16
93 0.17
94 0.17
95 0.15
96 0.17
97 0.16
98 0.17
99 0.16
100 0.22
101 0.21
102 0.23
103 0.25
104 0.23
105 0.24
106 0.24
107 0.24
108 0.22
109 0.28
110 0.3
111 0.3
112 0.29
113 0.32
114 0.35
115 0.37
116 0.32
117 0.28
118 0.27
119 0.27
120 0.29
121 0.24
122 0.21
123 0.19
124 0.2
125 0.17
126 0.14
127 0.12
128 0.09
129 0.09
130 0.09
131 0.09
132 0.07
133 0.1
134 0.12
135 0.17
136 0.18
137 0.2
138 0.21
139 0.28
140 0.31
141 0.31
142 0.29
143 0.27
144 0.27
145 0.26
146 0.26
147 0.2
148 0.2
149 0.18
150 0.17
151 0.14
152 0.14
153 0.18
154 0.15
155 0.15
156 0.15
157 0.15
158 0.18
159 0.2
160 0.2
161 0.16
162 0.17
163 0.16
164 0.15
165 0.14
166 0.12
167 0.1
168 0.13
169 0.13
170 0.12
171 0.1
172 0.1
173 0.09
174 0.08
175 0.07
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.05
181 0.05
182 0.06
183 0.07
184 0.07
185 0.08
186 0.11
187 0.12
188 0.13
189 0.14
190 0.13
191 0.17
192 0.17
193 0.16
194 0.15
195 0.15
196 0.14
197 0.16
198 0.22
199 0.25
200 0.28
201 0.36
202 0.36
203 0.43
204 0.45
205 0.47
206 0.45
207 0.41
208 0.45
209 0.41
210 0.44
211 0.41
212 0.43
213 0.4
214 0.37
215 0.36
216 0.29
217 0.26
218 0.29
219 0.27
220 0.23
221 0.25
222 0.26
223 0.25
224 0.25
225 0.26
226 0.19
227 0.17
228 0.16
229 0.14
230 0.16
231 0.15
232 0.14
233 0.12
234 0.13
235 0.13
236 0.12
237 0.12
238 0.09
239 0.09
240 0.09
241 0.1
242 0.09
243 0.09
244 0.13
245 0.12
246 0.12
247 0.14
248 0.14
249 0.21
250 0.24
251 0.27
252 0.27
253 0.31
254 0.32
255 0.37
256 0.39
257 0.35
258 0.33
259 0.35
260 0.33
261 0.31
262 0.31
263 0.26
264 0.24
265 0.23
266 0.23
267 0.18
268 0.16
269 0.13
270 0.11
271 0.1
272 0.09
273 0.07
274 0.06
275 0.07
276 0.07
277 0.07
278 0.09
279 0.08
280 0.09
281 0.1
282 0.1
283 0.11
284 0.11
285 0.11
286 0.09
287 0.09
288 0.09
289 0.09
290 0.09
291 0.07
292 0.07
293 0.08
294 0.08
295 0.1
296 0.1
297 0.1
298 0.1
299 0.1
300 0.12
301 0.18
302 0.24
303 0.3
304 0.31
305 0.34
306 0.35
307 0.38
308 0.41
309 0.35
310 0.29
311 0.27
312 0.26
313 0.28
314 0.3
315 0.37
316 0.36
317 0.38
318 0.38
319 0.34
320 0.36
321 0.34
322 0.31
323 0.26
324 0.25
325 0.24
326 0.28
327 0.27
328 0.26
329 0.26
330 0.27
331 0.24
332 0.24
333 0.23
334 0.19
335 0.21
336 0.19