FuNGI

A0A1Y2C396

Protein Details

Accession

A0A1Y2C396

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
72-91	NSNNNKGNSNKQRTRTCPGC	Hydrophilic
455-476	RAGGSGKKRKKKDGAGGGKKDV	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
334-339	KGKKKK
452-474	AKHRAGGSGKKRKKKDGAGGGKK
520-528	PKKRARKTK

Subcellular Location(s)

nucl 18, cyto 5, mito 2, plas 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007900 TAF4_C
Gene Ontology	GO:0005669 C:transcription factor TFIID complex GO:0006352 P:DNA-templated transcription initiation
Pfam	View protein in Pfam PF05236 TAF4

Amino Acid Sequences

MDLFLQALSATGELNSAATSNPNQPPNQQQQPPSNQQQNQQNNQQNAMAALDFSAILGFQMHQLQHPRTRFNSNNNKGNSNKQRTRTCPGCSMLWRKKCHHDADPGPSTSSAQAQQAQQQAQHLTQQQQQFQQTQQQQQQQPQNPLFQPNLAAAAAAKLQQQQQQQQLLLQQQRLQQQHAQAAPVIQDKFNAILAKVPKDKLPLAEGLIARLKVTFVLWRVVGPSEEVGREDGSKQANAQLVEGELIMLTEKVEQTNQHPTIRGSSENSYGCSSSSRRSFSTPIQPATPGAAMQFQQPPPIQLHVHQQPPPIQLQGPPQQQQQQQQNLSQDDKKGKKKKEGDDSNSKFDIGKEFDVTMGIDVRREEEDLLATSSLPSHLRNRHVPANPTGQDRSRLQSLVDMNYLRNLVDTIANKSQPGDAPLKITPQSLEYMSHALTQRLTTFLTKTIRTAKHRAGGSGKKRKKKDGAGGGKKDVSETVKVKSTNSTALKAVGGKKGMKAWMTEGGAASASAAGEDGGPKKRARKTKGEDEGGMGNMDYSDLKDVGSFESDGKKITLARTMNVKEMCRVTLKDCVHVLEQETHMRTSALMQKWSSGFLDVN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.07
2	0.06
3	0.06
4	0.06
5	0.09
6	0.12
7	0.2
8	0.26
9	0.31
10	0.33
11	0.38
12	0.47
13	0.54
14	0.6
15	0.59
16	0.6
17	0.64
18	0.72
19	0.76
20	0.76
21	0.76
22	0.71
23	0.72
24	0.75
25	0.76
26	0.74
27	0.76
28	0.74
29	0.67
30	0.66
31	0.59
32	0.49
33	0.4
34	0.33
35	0.23
36	0.15
37	0.12
38	0.1
39	0.08
40	0.07
41	0.06
42	0.05
43	0.05
44	0.05
45	0.05
46	0.07
47	0.11
48	0.12
49	0.16
50	0.23
51	0.29
52	0.36
53	0.41
54	0.45
55	0.45
56	0.54
57	0.56
58	0.6
59	0.66
60	0.67
61	0.71
62	0.69
63	0.71
64	0.65
65	0.7
66	0.7
67	0.69
68	0.68
69	0.68
70	0.74
71	0.74
72	0.8
73	0.76
74	0.71
75	0.68
76	0.63
77	0.6
78	0.59
79	0.63
80	0.64
81	0.65
82	0.66
83	0.64
84	0.71
85	0.73
86	0.72
87	0.68
88	0.68
89	0.67
90	0.7
91	0.71
92	0.62
93	0.56
94	0.49
95	0.43
96	0.34
97	0.3
98	0.22
99	0.19
100	0.22
101	0.22
102	0.27
103	0.31
104	0.32
105	0.3
106	0.31
107	0.3
108	0.27
109	0.31
110	0.29
111	0.28
112	0.32
113	0.36
114	0.36
115	0.4
116	0.43
117	0.4
118	0.39
119	0.44
120	0.45
121	0.48
122	0.51
123	0.54
124	0.55
125	0.6
126	0.67
127	0.65
128	0.66
129	0.61
130	0.6
131	0.54
132	0.53
133	0.46
134	0.37
135	0.32
136	0.24
137	0.23
138	0.16
139	0.14
140	0.1
141	0.1
142	0.1
143	0.09
144	0.1
145	0.11
146	0.14
147	0.19
148	0.25
149	0.3
150	0.35
151	0.38
152	0.37
153	0.36
154	0.37
155	0.39
156	0.38
157	0.34
158	0.31
159	0.32
160	0.39
161	0.39
162	0.39
163	0.35
164	0.35
165	0.39
166	0.36
167	0.32
168	0.25
169	0.24
170	0.23
171	0.24
172	0.21
173	0.15
174	0.15
175	0.15
176	0.15
177	0.17
178	0.15
179	0.1
180	0.14
181	0.17
182	0.22
183	0.25
184	0.25
185	0.24
186	0.28
187	0.29
188	0.26
189	0.26
190	0.22
191	0.2
192	0.24
193	0.22
194	0.2
195	0.21
196	0.2
197	0.17
198	0.15
199	0.13
200	0.09
201	0.09
202	0.1
203	0.09
204	0.11
205	0.11
206	0.11
207	0.12
208	0.13
209	0.12
210	0.11
211	0.1
212	0.09
213	0.09
214	0.1
215	0.1
216	0.09
217	0.1
218	0.1
219	0.12
220	0.13
221	0.13
222	0.12
223	0.15
224	0.18
225	0.17
226	0.17
227	0.13
228	0.12
229	0.12
230	0.11
231	0.07
232	0.04
233	0.04
234	0.04
235	0.03
236	0.03
237	0.04
238	0.05
239	0.05
240	0.06
241	0.07
242	0.1
243	0.19
244	0.22
245	0.22
246	0.24
247	0.24
248	0.27
249	0.27
250	0.26
251	0.2
252	0.19
253	0.23
254	0.22
255	0.23
256	0.2
257	0.19
258	0.18
259	0.17
260	0.17
261	0.17
262	0.2
263	0.21
264	0.22
265	0.25
266	0.27
267	0.29
268	0.38
269	0.38
270	0.35
271	0.33
272	0.32
273	0.29
274	0.28
275	0.23
276	0.13
277	0.09
278	0.09
279	0.09
280	0.1
281	0.14
282	0.12
283	0.16
284	0.16
285	0.17
286	0.16
287	0.19
288	0.17
289	0.15
290	0.22
291	0.23
292	0.28
293	0.28
294	0.29
295	0.3
296	0.32
297	0.31
298	0.25
299	0.21
300	0.18
301	0.23
302	0.28
303	0.29
304	0.29
305	0.31
306	0.36
307	0.39
308	0.44
309	0.45
310	0.45
311	0.42
312	0.44
313	0.45
314	0.42
315	0.41
316	0.36
317	0.33
318	0.34
319	0.39
320	0.45
321	0.5
322	0.53
323	0.59
324	0.66
325	0.7
326	0.73
327	0.76
328	0.73
329	0.76
330	0.75
331	0.71
332	0.63
333	0.55
334	0.44
335	0.34
336	0.31
337	0.23
338	0.19
339	0.15
340	0.15
341	0.14
342	0.14
343	0.14
344	0.1
345	0.1
346	0.08
347	0.08
348	0.08
349	0.09
350	0.1
351	0.1
352	0.1
353	0.08
354	0.09
355	0.09
356	0.1
357	0.09
358	0.08
359	0.07
360	0.07
361	0.08
362	0.08
363	0.09
364	0.15
365	0.2
366	0.26
367	0.31
368	0.35
369	0.42
370	0.46
371	0.47
372	0.45
373	0.49
374	0.46
375	0.45
376	0.43
377	0.37
378	0.37
379	0.35
380	0.34
381	0.28
382	0.26
383	0.22
384	0.25
385	0.25
386	0.23
387	0.24
388	0.21
389	0.19
390	0.2
391	0.2
392	0.15
393	0.12
394	0.1
395	0.08
396	0.12
397	0.13
398	0.17
399	0.2
400	0.21
401	0.21
402	0.21
403	0.23
404	0.19
405	0.22
406	0.2
407	0.16
408	0.2
409	0.21
410	0.24
411	0.23
412	0.22
413	0.19
414	0.17
415	0.18
416	0.15
417	0.16
418	0.14
419	0.15
420	0.15
421	0.19
422	0.18
423	0.17
424	0.17
425	0.16
426	0.15
427	0.15
428	0.16
429	0.13
430	0.13
431	0.19
432	0.22
433	0.21
434	0.24
435	0.32
436	0.38
437	0.43
438	0.48
439	0.49
440	0.51
441	0.52
442	0.52
443	0.52
444	0.54
445	0.59
446	0.63
447	0.66
448	0.68
449	0.73
450	0.78
451	0.79
452	0.78
453	0.78
454	0.78
455	0.81
456	0.82
457	0.82
458	0.78
459	0.7
460	0.61
461	0.51
462	0.43
463	0.35
464	0.31
465	0.27
466	0.26
467	0.3
468	0.31
469	0.31
470	0.33
471	0.32
472	0.34
473	0.35
474	0.34
475	0.29
476	0.3
477	0.31
478	0.3
479	0.32
480	0.27
481	0.29
482	0.28
483	0.29
484	0.32
485	0.34
486	0.3
487	0.28
488	0.27
489	0.3
490	0.29
491	0.28
492	0.24
493	0.21
494	0.2
495	0.18
496	0.15
497	0.08
498	0.07
499	0.05
500	0.05
501	0.04
502	0.04
503	0.07
504	0.11
505	0.16
506	0.19
507	0.22
508	0.3
509	0.39
510	0.48
511	0.53
512	0.6
513	0.64
514	0.72
515	0.8
516	0.78
517	0.71
518	0.65
519	0.6
520	0.5
521	0.41
522	0.3
523	0.2
524	0.13
525	0.12
526	0.09
527	0.07
528	0.09
529	0.09
530	0.09
531	0.1
532	0.11
533	0.12
534	0.14
535	0.14
536	0.14
537	0.2
538	0.21
539	0.21
540	0.21
541	0.21
542	0.21
543	0.23
544	0.28
545	0.25
546	0.28
547	0.36
548	0.37
549	0.43
550	0.45
551	0.44
552	0.42
553	0.42
554	0.42
555	0.37
556	0.37
557	0.33
558	0.38
559	0.38
560	0.38
561	0.37
562	0.38
563	0.35
564	0.35
565	0.36
566	0.32
567	0.34
568	0.35
569	0.36
570	0.33
571	0.31
572	0.29
573	0.26
574	0.26
575	0.32
576	0.3
577	0.32
578	0.32
579	0.36
580	0.37
581	0.4
582	0.34

A0A1Y2C396

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer