FuNGI

A0A1Y2CBL1

Protein Details

Accession

A0A1Y2CBL1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
111-133	DREDDYRKRRLNRTLSPERKDQF	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
162-169	KRKIEEKK

Subcellular Location(s)

plas 13, nucl 8.5, cyto_nucl 6.5, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011989 ARM-like IPR016024 ARM-type_fold IPR015016 SF3b_su1 IPR038737 SF3b_su1-like IPR034085 TOG
Gene Ontology	GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0003729 F:mRNA binding GO:0000245 P:spliceosomal complex assembly
Pfam	View protein in Pfam PF08920 SF3b1

Amino Acid Sequences

MEDDLDDEIRRAQEARRLARNTVKLAGQTYENPDKVGLAGVSFDKELFDNKVDLDDYDFGQDDADADADYGAKARGLASFSAPKNALLDVADASADDSSAMMAGSSRRIADREDDYRKRRLNRTLSPERKDQFNAENSSEAARSYAEVMREAELDREHDRLKRKIEEKKKEAEQAEREAAAQEAHRIITGERPTAGEPSSDAPPARKRRWDQPAASQEEKKSDWEQDDDAPKKSKWDDDAEPASAPVAARKRNRWDETPVNPSAGGATTAWDATPKAAAPGKKSRWDETPVNASQFAATPVGNMGMGMMTPVPGMQIPMTPEASNALRWEKELDARNRPMSDEELDSILPDKGYKIIEPPSSYVPIRTPARKLMATPTPMAGSGGFVMQDEMQEKPFEVPPEIAGIGNLQFFKQEDMQYFGKLLDERDDMELNIEEIKERKIMRLLLKIKNGTPPIRKQSLRQITDKAREFGAGPLFNQILPLLMSPSLEDQERHLLVKVIDRILYKLDDLVRPFVHKILVVIEPLLIDEDYYARVEGREIISNLSKAAGLATMIATMRPDIDHVDEYVRNTTARAFSVVASALGIPALLPFLKAVCRSKKSWQARHTGIKIVQQIAILMGCAVLPHLKSLVEAIGHGLEDEEQQKVRTITALAISALAEAAAPYGIESFDSVLKPLWVGIKKHRGKGLAAFLKAIGYIIPLMDVEYANYYTKEVMSTLIREFQSPDEEMKKIVLKVVKQCAGTEGVEPAYIKAEILPEFFRHFWVRRMALDRRNYKQVVETTVELAQKVGVTEIVGRIVEDLKDESEPYRKMVMETIDKVVSELGTADIDERLEEILIDGILYAFQEQTVEDVVMLNGFGTVVNSLSMRVKPYLPQICSTILWRLNNKSAKVRQQAADLISRIAVVMKTCAEEKLMGHLGVVLYEYLGEEYPEVLGSILRALKSIVNVIGMSSMTPPIKDLLPRLTPILKNRHEKVQENCIDLVGRIADRGAEFVSAREWMRICFELLDMLKAHKKGIRRATVNTFGYIAKAIGPQDVLATLLNNLKVQERQNRVCTTVAIAIVAETCAPFTVLPALMNEYRVPELNVQNGVLKSMSFLFEYVGEMGKDYIYAVTPLLEDALMDRDLVHRQTACTTVKHIALGVVGLGCEDALLHLLNFVWPNVFEVSPHVINAVMDAIEGMRMSLGPSVILSYCLQGLYHPARRVREIYWKIYNNLYIGSQDTLVAFYPRMENEGQNKYARYELDLIV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.32
2	0.39
3	0.46
4	0.49
5	0.54
6	0.61
7	0.64
8	0.62
9	0.57
10	0.52
11	0.46
12	0.44
13	0.41
14	0.35
15	0.33
16	0.37
17	0.41
18	0.38
19	0.36
20	0.34
21	0.32
22	0.29
23	0.27
24	0.19
25	0.1
26	0.12
27	0.12
28	0.14
29	0.14
30	0.13
31	0.12
32	0.12
33	0.15
34	0.17
35	0.18
36	0.17
37	0.17
38	0.2
39	0.2
40	0.2
41	0.21
42	0.19
43	0.17
44	0.19
45	0.19
46	0.16
47	0.15
48	0.15
49	0.11
50	0.1
51	0.09
52	0.07
53	0.07
54	0.07
55	0.07
56	0.07
57	0.07
58	0.07
59	0.07
60	0.07
61	0.08
62	0.1
63	0.12
64	0.13
65	0.17
66	0.25
67	0.26
68	0.32
69	0.32
70	0.31
71	0.3
72	0.29
73	0.25
74	0.17
75	0.18
76	0.12
77	0.12
78	0.11
79	0.09
80	0.1
81	0.08
82	0.07
83	0.06
84	0.05
85	0.04
86	0.05
87	0.04
88	0.04
89	0.05
90	0.06
91	0.09
92	0.11
93	0.12
94	0.13
95	0.15
96	0.17
97	0.22
98	0.28
99	0.35
100	0.44
101	0.52
102	0.55
103	0.64
104	0.69
105	0.72
106	0.73
107	0.74
108	0.74
109	0.74
110	0.8
111	0.82
112	0.84
113	0.81
114	0.81
115	0.74
116	0.7
117	0.64
118	0.59
119	0.55
120	0.53
121	0.53
122	0.46
123	0.44
124	0.39
125	0.38
126	0.33
127	0.25
128	0.18
129	0.13
130	0.11
131	0.13
132	0.15
133	0.14
134	0.16
135	0.17
136	0.18
137	0.19
138	0.18
139	0.18
140	0.16
141	0.19
142	0.19
143	0.21
144	0.23
145	0.27
146	0.34
147	0.38
148	0.44
149	0.5
150	0.56
151	0.63
152	0.71
153	0.77
154	0.76
155	0.79
156	0.79
157	0.78
158	0.74
159	0.72
160	0.67
161	0.63
162	0.6
163	0.51
164	0.44
165	0.37
166	0.33
167	0.25
168	0.19
169	0.15
170	0.13
171	0.13
172	0.12
173	0.13
174	0.13
175	0.19
176	0.21
177	0.2
178	0.2
179	0.21
180	0.22
181	0.24
182	0.24
183	0.17
184	0.15
185	0.16
186	0.18
187	0.19
188	0.18
189	0.21
190	0.3
191	0.39
192	0.45
193	0.51
194	0.54
195	0.62
196	0.72
197	0.76
198	0.71
199	0.72
200	0.75
201	0.74
202	0.74
203	0.68
204	0.6
205	0.56
206	0.52
207	0.45
208	0.39
209	0.36
210	0.33
211	0.32
212	0.33
213	0.34
214	0.42
215	0.41
216	0.42
217	0.42
218	0.39
219	0.41
220	0.41
221	0.39
222	0.35
223	0.38
224	0.38
225	0.42
226	0.46
227	0.42
228	0.4
229	0.35
230	0.3
231	0.24
232	0.2
233	0.17
234	0.19
235	0.25
236	0.3
237	0.38
238	0.48
239	0.57
240	0.62
241	0.61
242	0.64
243	0.66
244	0.67
245	0.67
246	0.58
247	0.5
248	0.44
249	0.39
250	0.31
251	0.23
252	0.17
253	0.1
254	0.1
255	0.09
256	0.09
257	0.09
258	0.09
259	0.09
260	0.08
261	0.09
262	0.08
263	0.11
264	0.15
265	0.18
266	0.23
267	0.33
268	0.39
269	0.46
270	0.5
271	0.5
272	0.51
273	0.56
274	0.54
275	0.49
276	0.52
277	0.45
278	0.44
279	0.4
280	0.35
281	0.29
282	0.25
283	0.21
284	0.14
285	0.11
286	0.09
287	0.09
288	0.09
289	0.09
290	0.07
291	0.06
292	0.04
293	0.04
294	0.04
295	0.04
296	0.03
297	0.04
298	0.04
299	0.04
300	0.04
301	0.05
302	0.05
303	0.07
304	0.09
305	0.12
306	0.14
307	0.13
308	0.13
309	0.16
310	0.16
311	0.16
312	0.16
313	0.17
314	0.15
315	0.16
316	0.19
317	0.17
318	0.23
319	0.3
320	0.34
321	0.39
322	0.44
323	0.47
324	0.45
325	0.44
326	0.4
327	0.35
328	0.31
329	0.25
330	0.21
331	0.19
332	0.18
333	0.17
334	0.16
335	0.13
336	0.11
337	0.09
338	0.08
339	0.09
340	0.1
341	0.11
342	0.13
343	0.18
344	0.21
345	0.23
346	0.25
347	0.26
348	0.28
349	0.28
350	0.26
351	0.22
352	0.26
353	0.3
354	0.31
355	0.31
356	0.33
357	0.37
358	0.37
359	0.36
360	0.36
361	0.37
362	0.36
363	0.34
364	0.3
365	0.25
366	0.24
367	0.24
368	0.17
369	0.11
370	0.08
371	0.07
372	0.06
373	0.06
374	0.06
375	0.06
376	0.07
377	0.07
378	0.08
379	0.08
380	0.09
381	0.09
382	0.11
383	0.13
384	0.14
385	0.14
386	0.14
387	0.13
388	0.15
389	0.15
390	0.13
391	0.1
392	0.1
393	0.09
394	0.1
395	0.1
396	0.07
397	0.08
398	0.08
399	0.1
400	0.12
401	0.14
402	0.13
403	0.18
404	0.2
405	0.19
406	0.2
407	0.17
408	0.17
409	0.15
410	0.15
411	0.13
412	0.13
413	0.14
414	0.15
415	0.16
416	0.14
417	0.14
418	0.14
419	0.11
420	0.11
421	0.09
422	0.08
423	0.08
424	0.1
425	0.12
426	0.12
427	0.14
428	0.16
429	0.22
430	0.26
431	0.34
432	0.4
433	0.43
434	0.48
435	0.48
436	0.46
437	0.48
438	0.47
439	0.44
440	0.43
441	0.45
442	0.46
443	0.51
444	0.51
445	0.48
446	0.54
447	0.58
448	0.56
449	0.52
450	0.52
451	0.52
452	0.59
453	0.58
454	0.49
455	0.39
456	0.35
457	0.33
458	0.28
459	0.27
460	0.19
461	0.16
462	0.17
463	0.17
464	0.16
465	0.15
466	0.12
467	0.07
468	0.07
469	0.07
470	0.06
471	0.06
472	0.06
473	0.06
474	0.07
475	0.08
476	0.08
477	0.08
478	0.09
479	0.14
480	0.14
481	0.15
482	0.14
483	0.15
484	0.15
485	0.19
486	0.2
487	0.16
488	0.18
489	0.17
490	0.18
491	0.17
492	0.17
493	0.13
494	0.13
495	0.14
496	0.14
497	0.15
498	0.17
499	0.16
500	0.17
501	0.18
502	0.16
503	0.15
504	0.12
505	0.12
506	0.11
507	0.12
508	0.1
509	0.1
510	0.09
511	0.08
512	0.08
513	0.08
514	0.05
515	0.04
516	0.04
517	0.04
518	0.05
519	0.05
520	0.05
521	0.05
522	0.05
523	0.06
524	0.08
525	0.09
526	0.11
527	0.11
528	0.13
529	0.14
530	0.14
531	0.14
532	0.12
533	0.1
534	0.07
535	0.07
536	0.05
537	0.04
538	0.04
539	0.04
540	0.04
541	0.04
542	0.05
543	0.04
544	0.04
545	0.05
546	0.04
547	0.05
548	0.05
549	0.07
550	0.08
551	0.08
552	0.11
553	0.11
554	0.13
555	0.13
556	0.13
557	0.11
558	0.11
559	0.12
560	0.11
561	0.1
562	0.11
563	0.1
564	0.1
565	0.11
566	0.11
567	0.09
568	0.08
569	0.07
570	0.05
571	0.04
572	0.04
573	0.03
574	0.02
575	0.03
576	0.03
577	0.03
578	0.03
579	0.04
580	0.05
581	0.08
582	0.13
583	0.19
584	0.23
585	0.26
586	0.32
587	0.42
588	0.5
589	0.57
590	0.58
591	0.59
592	0.62
593	0.67
594	0.62
595	0.56
596	0.49
597	0.45
598	0.41
599	0.34
600	0.29
601	0.21
602	0.19
603	0.15
604	0.12
605	0.08
606	0.05
607	0.04
608	0.03
609	0.03
610	0.03
611	0.03
612	0.04
613	0.04
614	0.05
615	0.05
616	0.05
617	0.05
618	0.06
619	0.05
620	0.05
621	0.05
622	0.05
623	0.05
624	0.05
625	0.05
626	0.04
627	0.05
628	0.06
629	0.06
630	0.06
631	0.07
632	0.09
633	0.09
634	0.09
635	0.08
636	0.08
637	0.08
638	0.09
639	0.09
640	0.07
641	0.07
642	0.07
643	0.06
644	0.05
645	0.04
646	0.03
647	0.03
648	0.03
649	0.02
650	0.02
651	0.02
652	0.03
653	0.03
654	0.03
655	0.03
656	0.04
657	0.06
658	0.06
659	0.06
660	0.06
661	0.06
662	0.06
663	0.07
664	0.11
665	0.13
666	0.16
667	0.22
668	0.33
669	0.37
670	0.41
671	0.43
672	0.4
673	0.38
674	0.41
675	0.43
676	0.37
677	0.34
678	0.31
679	0.27
680	0.26
681	0.24
682	0.19
683	0.09
684	0.04
685	0.04
686	0.03
687	0.04
688	0.03
689	0.04
690	0.04
691	0.04
692	0.04
693	0.05
694	0.07
695	0.07
696	0.07
697	0.08
698	0.07
699	0.08
700	0.08
701	0.07
702	0.07
703	0.08
704	0.1
705	0.1
706	0.15
707	0.15
708	0.15
709	0.16
710	0.15
711	0.17
712	0.16
713	0.18
714	0.16
715	0.16
716	0.16
717	0.16
718	0.17
719	0.15
720	0.17
721	0.17
722	0.18
723	0.24
724	0.3
725	0.32
726	0.3
727	0.3
728	0.29
729	0.29
730	0.26
731	0.2
732	0.15
733	0.11
734	0.11
735	0.11
736	0.1
737	0.09
738	0.08
739	0.07
740	0.06
741	0.08
742	0.08
743	0.1
744	0.11
745	0.11
746	0.13
747	0.14
748	0.16
749	0.18
750	0.19
751	0.21
752	0.26
753	0.27
754	0.27
755	0.34
756	0.38
757	0.41
758	0.48
759	0.51
760	0.49
761	0.54
762	0.51
763	0.45
764	0.44
765	0.4
766	0.35
767	0.31
768	0.28
769	0.23
770	0.26
771	0.25
772	0.2
773	0.17
774	0.13
775	0.11
776	0.1
777	0.08
778	0.05
779	0.05
780	0.05
781	0.06
782	0.06
783	0.06
784	0.06
785	0.06
786	0.07
787	0.07
788	0.07
789	0.08
790	0.08
791	0.08
792	0.09
793	0.1
794	0.15
795	0.16
796	0.17
797	0.19
798	0.18
799	0.19
800	0.21
801	0.23
802	0.23
803	0.24
804	0.25
805	0.22
806	0.22
807	0.21
808	0.18
809	0.14
810	0.09
811	0.07
812	0.05
813	0.05
814	0.05
815	0.05
816	0.05
817	0.05
818	0.05
819	0.05
820	0.05
821	0.05
822	0.05
823	0.04
824	0.04
825	0.04
826	0.04
827	0.03
828	0.03
829	0.03
830	0.03
831	0.04
832	0.03
833	0.03
834	0.04
835	0.04
836	0.05
837	0.06
838	0.06
839	0.05
840	0.06
841	0.06
842	0.05
843	0.05
844	0.04
845	0.03
846	0.03
847	0.03
848	0.03
849	0.04
850	0.04
851	0.04
852	0.05
853	0.06
854	0.08
855	0.09
856	0.11
857	0.13
858	0.14
859	0.16
860	0.25
861	0.31
862	0.3
863	0.31
864	0.31
865	0.32
866	0.32
867	0.32
868	0.29
869	0.26
870	0.28
871	0.3
872	0.32
873	0.38
874	0.42
875	0.43
876	0.45
877	0.48
878	0.53
879	0.56
880	0.57
881	0.51
882	0.49
883	0.51
884	0.44
885	0.42
886	0.33
887	0.27
888	0.21
889	0.2
890	0.16
891	0.13
892	0.11
893	0.07
894	0.08
895	0.08
896	0.09
897	0.1
898	0.1
899	0.11
900	0.11
901	0.11
902	0.16
903	0.18
904	0.16
905	0.15
906	0.16
907	0.15
908	0.14
909	0.14
910	0.07
911	0.05
912	0.05
913	0.05
914	0.04
915	0.05
916	0.05
917	0.04
918	0.05
919	0.05
920	0.05
921	0.05
922	0.05
923	0.05
924	0.05
925	0.07
926	0.09
927	0.08
928	0.09
929	0.09
930	0.11
931	0.11
932	0.13
933	0.11
934	0.1
935	0.1
936	0.1
937	0.1
938	0.09
939	0.09
940	0.08
941	0.1
942	0.1
943	0.1
944	0.1
945	0.11
946	0.13
947	0.14
948	0.17
949	0.2
950	0.23
951	0.24
952	0.27
953	0.31
954	0.33
955	0.38
956	0.45
957	0.46
958	0.52
959	0.54
960	0.6
961	0.6
962	0.62
963	0.61
964	0.62
965	0.59
966	0.54
967	0.51
968	0.43
969	0.37
970	0.31
971	0.26
972	0.17
973	0.12
974	0.09
975	0.08
976	0.09
977	0.08
978	0.09
979	0.08
980	0.08
981	0.08
982	0.09
983	0.1
984	0.12
985	0.12
986	0.14
987	0.14
988	0.14
989	0.17
990	0.18
991	0.18
992	0.16
993	0.15
994	0.18
995	0.18
996	0.19
997	0.16
998	0.18
999	0.22
1000	0.22
1001	0.24
1002	0.22
1003	0.27
1004	0.34
1005	0.43
1006	0.49
1007	0.48
1008	0.54
1009	0.6
1010	0.66
1011	0.62
1012	0.54
1013	0.46
1014	0.37
1015	0.34
1016	0.28
1017	0.2
1018	0.12
1019	0.13
1020	0.12
1021	0.12
1022	0.12
1023	0.11
1024	0.11
1025	0.1
1026	0.1
1027	0.08
1028	0.08
1029	0.09
1030	0.11
1031	0.12
1032	0.12
1033	0.13
1034	0.15
1035	0.19
1036	0.25
1037	0.32
1038	0.38
1039	0.44
1040	0.51
1041	0.53
1042	0.53
1043	0.5
1044	0.44
1045	0.39
1046	0.33
1047	0.27
1048	0.2
1049	0.17
1050	0.14
1051	0.13
1052	0.12
1053	0.09
1054	0.05
1055	0.05
1056	0.05
1057	0.06
1058	0.05
1059	0.06
1060	0.09
1061	0.1
1062	0.1
1063	0.11
1064	0.16
1065	0.16
1066	0.18
1067	0.18
1068	0.17
1069	0.18
1070	0.18
1071	0.19
1072	0.2
1073	0.23
1074	0.25
1075	0.26
1076	0.25
1077	0.28
1078	0.27
1079	0.26
1080	0.2
1081	0.17
1082	0.14
1083	0.14
1084	0.15
1085	0.11
1086	0.11
1087	0.11
1088	0.11
1089	0.13
1090	0.12
1091	0.13
1092	0.11
1093	0.11
1094	0.11
1095	0.1
1096	0.1
1097	0.09
1098	0.08
1099	0.07
1100	0.08
1101	0.08
1102	0.08
1103	0.08
1104	0.08
1105	0.08
1106	0.07
1107	0.06
1108	0.07
1109	0.1
1110	0.09
1111	0.09
1112	0.09
1113	0.11
1114	0.15
1115	0.17
1116	0.19
1117	0.17
1118	0.18
1119	0.21
1120	0.27
1121	0.28
1122	0.26
1123	0.29
1124	0.3
1125	0.3
1126	0.29
1127	0.27
1128	0.22
1129	0.19
1130	0.17
1131	0.14
1132	0.09
1133	0.07
1134	0.07
1135	0.06
1136	0.05
1137	0.04
1138	0.04
1139	0.03
1140	0.04
1141	0.05
1142	0.05
1143	0.06
1144	0.06
1145	0.09
1146	0.1
1147	0.1
1148	0.1
1149	0.1
1150	0.12
1151	0.15
1152	0.14
1153	0.13
1154	0.17
1155	0.22
1156	0.22
1157	0.22
1158	0.19
1159	0.17
1160	0.17
1161	0.18
1162	0.14
1163	0.08
1164	0.07
1165	0.07
1166	0.07
1167	0.07
1168	0.07
1169	0.06
1170	0.05
1171	0.05
1172	0.06
1173	0.07
1174	0.08
1175	0.07
1176	0.07
1177	0.1
1178	0.1
1179	0.12
1180	0.12
1181	0.11
1182	0.12
1183	0.12
1184	0.12
1185	0.1
1186	0.18
1187	0.24
1188	0.32
1189	0.37
1190	0.41
1191	0.45
1192	0.5
1193	0.54
1194	0.5
1195	0.53
1196	0.52
1197	0.54
1198	0.59
1199	0.59
1200	0.57
1201	0.58
1202	0.56
1203	0.46
1204	0.41
1205	0.34
1206	0.26
1207	0.23
1208	0.22
1209	0.18
1210	0.15
1211	0.14
1212	0.14
1213	0.14
1214	0.14
1215	0.12
1216	0.12
1217	0.16
1218	0.16
1219	0.19
1220	0.2
1221	0.25
1222	0.32
1223	0.39
1224	0.42
1225	0.42
1226	0.43
1227	0.42
1228	0.44
1229	0.39
1230	0.35

A0A1Y2CBL1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer