FuNGI

A0A1Y2CR42

Protein Details

Accession

A0A1Y2CR42

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
441-488	LPPQLPSPPPQKRPPSRKSFNYRALEEKHKAKLKASKKHDKADHTRLQ	Hydrophilic
494-521	SSSSKHPSPHLSKNKLRKQNAKQRSLDL	Hydrophilic
535-559	DRGGGIQKRRGKRERASSKAQTRES	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
451-482	QKRPPSRKSFNYRALEEKHKAKLKASKKHDKA
540-553	IQKRRGKRERASSK
581-599	GRSNHEGNSGKGERRKRRQ

Subcellular Location(s)

nucl 15.5, cyto_nucl 12.5, cyto 6.5, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043519 NT_sf IPR045862 Trf4-like
Gene Ontology	GO:0031499 C:TRAMP complex GO:0043631 P:RNA polyadenylation

Amino Acid Sequences

MRSSNHTSSIEFVRKARVPVLKMVDRVTNMNIDVCYNVLGGYQAVECVKLWVEKVPGLRELVLLVKLFLSTKDLSEVFSGGLGGYSIVSLCLAFLQLRNPITGEIEMSTSLPSKKRPHSSSSSFSSTSSTITPGQTFLQFCRFFGTQFDYHTLGIKFTPTTPIPQAHFFNKLSSPHYQPSKPYLLTLLNPLDPSTDLTKGSSKIQSVSFAFRSAIPVLERGLTASFASKKPRIVTPTRYWERDFERGDDLPTLQPVLSDPEPIQLTQATSIFSELVFISRRMVKARDLGTGVSVSLFGKDGDRGTATEVDDNEPHSSHVRFEDEDDAERDSFMIGGIMMQDSGDESDSADEEDAEFTAVLDDVEEEVELTVETVEPEKAPTLPDDSDGYIAFDFDASDSVDQYGFTIDRTPVIPLPDSLSDQTPSTTSHEPIQSQQLVRTLPPQLPSPPPQKRPPSRKSFNYRALEEKHKAKLKASKKHDKADHTRLQKEIDSSSSSKHPSPHLSKNKLRKQNAKQRSLDLSLPVSQFDEFDKFDRGGGIQKRRGKRERASSKAQTRESDWKKWERELQDDFIGFRFGGKGRSNHEGNSGKGERRKRRQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.43
2	0.45
3	0.48
4	0.46
5	0.42
6	0.47
7	0.55
8	0.52
9	0.51
10	0.51
11	0.49
12	0.44
13	0.44
14	0.38
15	0.32
16	0.28
17	0.27
18	0.25
19	0.2
20	0.19
21	0.16
22	0.15
23	0.11
24	0.1
25	0.08
26	0.08
27	0.07
28	0.08
29	0.08
30	0.09
31	0.09
32	0.1
33	0.1
34	0.11
35	0.13
36	0.13
37	0.14
38	0.16
39	0.19
40	0.22
41	0.26
42	0.28
43	0.29
44	0.29
45	0.29
46	0.25
47	0.23
48	0.22
49	0.2
50	0.17
51	0.14
52	0.12
53	0.12
54	0.13
55	0.12
56	0.14
57	0.12
58	0.13
59	0.17
60	0.17
61	0.18
62	0.18
63	0.19
64	0.14
65	0.13
66	0.12
67	0.08
68	0.08
69	0.06
70	0.05
71	0.04
72	0.04
73	0.04
74	0.04
75	0.04
76	0.04
77	0.04
78	0.04
79	0.05
80	0.06
81	0.07
82	0.1
83	0.15
84	0.16
85	0.17
86	0.17
87	0.17
88	0.18
89	0.18
90	0.16
91	0.12
92	0.12
93	0.12
94	0.11
95	0.12
96	0.12
97	0.15
98	0.17
99	0.23
100	0.31
101	0.39
102	0.48
103	0.52
104	0.57
105	0.63
106	0.67
107	0.67
108	0.65
109	0.62
110	0.53
111	0.49
112	0.44
113	0.36
114	0.3
115	0.24
116	0.2
117	0.17
118	0.18
119	0.18
120	0.17
121	0.18
122	0.2
123	0.21
124	0.2
125	0.26
126	0.25
127	0.25
128	0.28
129	0.27
130	0.24
131	0.26
132	0.3
133	0.22
134	0.25
135	0.28
136	0.25
137	0.25
138	0.29
139	0.26
140	0.2
141	0.19
142	0.17
143	0.15
144	0.13
145	0.19
146	0.15
147	0.19
148	0.22
149	0.26
150	0.27
151	0.31
152	0.34
153	0.31
154	0.36
155	0.33
156	0.32
157	0.32
158	0.32
159	0.3
160	0.31
161	0.34
162	0.34
163	0.4
164	0.38
165	0.38
166	0.42
167	0.45
168	0.4
169	0.36
170	0.33
171	0.29
172	0.28
173	0.3
174	0.26
175	0.21
176	0.21
177	0.2
178	0.17
179	0.16
180	0.17
181	0.14
182	0.14
183	0.13
184	0.14
185	0.17
186	0.18
187	0.21
188	0.21
189	0.19
190	0.21
191	0.21
192	0.24
193	0.23
194	0.26
195	0.23
196	0.21
197	0.21
198	0.19
199	0.2
200	0.17
201	0.17
202	0.12
203	0.12
204	0.12
205	0.12
206	0.12
207	0.1
208	0.1
209	0.08
210	0.08
211	0.1
212	0.12
213	0.14
214	0.2
215	0.21
216	0.24
217	0.25
218	0.3
219	0.33
220	0.36
221	0.42
222	0.45
223	0.53
224	0.55
225	0.56
226	0.53
227	0.52
228	0.5
229	0.5
230	0.44
231	0.35
232	0.35
233	0.33
234	0.32
235	0.28
236	0.24
237	0.17
238	0.15
239	0.13
240	0.09
241	0.08
242	0.07
243	0.11
244	0.1
245	0.11
246	0.11
247	0.13
248	0.14
249	0.14
250	0.14
251	0.1
252	0.1
253	0.1
254	0.11
255	0.08
256	0.08
257	0.08
258	0.07
259	0.07
260	0.07
261	0.06
262	0.07
263	0.08
264	0.08
265	0.09
266	0.11
267	0.12
268	0.14
269	0.15
270	0.15
271	0.2
272	0.21
273	0.22
274	0.2
275	0.2
276	0.18
277	0.17
278	0.15
279	0.09
280	0.08
281	0.06
282	0.05
283	0.05
284	0.05
285	0.05
286	0.06
287	0.06
288	0.06
289	0.07
290	0.07
291	0.08
292	0.11
293	0.1
294	0.12
295	0.12
296	0.13
297	0.13
298	0.14
299	0.13
300	0.11
301	0.11
302	0.11
303	0.11
304	0.11
305	0.12
306	0.12
307	0.12
308	0.13
309	0.17
310	0.16
311	0.17
312	0.17
313	0.17
314	0.15
315	0.14
316	0.13
317	0.08
318	0.07
319	0.06
320	0.05
321	0.03
322	0.03
323	0.03
324	0.03
325	0.03
326	0.03
327	0.03
328	0.03
329	0.04
330	0.04
331	0.04
332	0.04
333	0.04
334	0.05
335	0.05
336	0.05
337	0.04
338	0.04
339	0.05
340	0.04
341	0.04
342	0.04
343	0.04
344	0.04
345	0.04
346	0.04
347	0.03
348	0.04
349	0.03
350	0.04
351	0.04
352	0.03
353	0.03
354	0.04
355	0.03
356	0.03
357	0.03
358	0.03
359	0.04
360	0.04
361	0.05
362	0.05
363	0.06
364	0.06
365	0.07
366	0.08
367	0.08
368	0.11
369	0.11
370	0.13
371	0.14
372	0.14
373	0.14
374	0.14
375	0.14
376	0.1
377	0.1
378	0.08
379	0.06
380	0.06
381	0.05
382	0.06
383	0.05
384	0.05
385	0.06
386	0.06
387	0.07
388	0.06
389	0.06
390	0.07
391	0.06
392	0.07
393	0.09
394	0.08
395	0.09
396	0.1
397	0.12
398	0.12
399	0.14
400	0.15
401	0.13
402	0.16
403	0.16
404	0.18
405	0.17
406	0.17
407	0.16
408	0.16
409	0.16
410	0.13
411	0.14
412	0.17
413	0.18
414	0.17
415	0.21
416	0.24
417	0.24
418	0.26
419	0.31
420	0.3
421	0.28
422	0.29
423	0.28
424	0.26
425	0.26
426	0.27
427	0.23
428	0.22
429	0.23
430	0.24
431	0.24
432	0.29
433	0.34
434	0.41
435	0.47
436	0.51
437	0.58
438	0.66
439	0.73
440	0.78
441	0.81
442	0.82
443	0.82
444	0.85
445	0.86
446	0.85
447	0.84
448	0.81
449	0.74
450	0.71
451	0.68
452	0.66
453	0.63
454	0.59
455	0.57
456	0.58
457	0.56
458	0.55
459	0.58
460	0.6
461	0.64
462	0.68
463	0.71
464	0.71
465	0.79
466	0.8
467	0.8
468	0.8
469	0.8
470	0.79
471	0.76
472	0.73
473	0.66
474	0.62
475	0.55
476	0.48
477	0.4
478	0.35
479	0.31
480	0.28
481	0.29
482	0.31
483	0.31
484	0.31
485	0.33
486	0.35
487	0.39
488	0.46
489	0.53
490	0.59
491	0.65
492	0.71
493	0.79
494	0.84
495	0.84
496	0.86
497	0.85
498	0.86
499	0.87
500	0.89
501	0.88
502	0.82
503	0.78
504	0.75
505	0.69
506	0.6
507	0.53
508	0.46
509	0.41
510	0.37
511	0.31
512	0.26
513	0.22
514	0.2
515	0.19
516	0.2
517	0.16
518	0.18
519	0.21
520	0.2
521	0.2
522	0.21
523	0.19
524	0.24
525	0.31
526	0.39
527	0.44
528	0.52
529	0.6
530	0.69
531	0.77
532	0.77
533	0.78
534	0.8
535	0.82
536	0.81
537	0.83
538	0.83
539	0.84
540	0.84
541	0.8
542	0.72
543	0.68
544	0.71
545	0.68
546	0.67
547	0.65
548	0.66
549	0.65
550	0.69
551	0.71
552	0.66
553	0.68
554	0.65
555	0.62
556	0.59
557	0.55
558	0.49
559	0.41
560	0.36
561	0.27
562	0.22
563	0.2
564	0.15
565	0.21
566	0.26
567	0.3
568	0.33
569	0.41
570	0.43
571	0.41
572	0.49
573	0.47
574	0.44
575	0.49
576	0.49
577	0.48
578	0.53
579	0.62

A0A1Y2CR42

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer