Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2BNJ3

Protein Details
Accession A0A1Y2BNJ3    Localization Confidence High Confidence Score 16.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
441-466LPVAPPPPPPRRKLKRVTSVRPETVQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
265-273KAKKPRRST
279-284ARPHKK
449-455PPRRKLK
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 11.5, mito 6, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
IPR008984  SMAD_FHA_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
CDD cd22671  FHA_APTX-like  
cd00084  HMG-box_SF  
Amino Acid Sequences MLYAIRLVPKAVSSSTLPPPLNEGETTIGRGFQGLSDGQLSRKQLSVLVDASAGTIFVTRLGNNPSRFLPAATSTTSTTSAASVVAPPKELPKDTPVQLFHGDTLFLVGLKHAFTVVVEHVSTTMALPTQALGTIALAGGGPSLTASLGRATTFSKKGGTTLAQSLSGGFAENKWDDDLDTDMHRITHQEKERRWTDDEDDDGKFDTKKFGIARKTGAKRRVCRADFSDESDDLFGFEDEAIELIHTREDSGLTQTKDETALSPKAKKPRRSTSTVVPARPHKKKTLQLNPVTSDSINSSVESSSPAKPKTPRVTRSQSYLSAIERRRRVEELRQKRTQSRVSVIEEGAEEGEDDDDDEEVEGVGARTRKSSVQTKRRITAYAMYSKEERKKIKNENPNASTAEVTALLRSRFNLLQDNDRDHYHALAAEKNGEGPSSSSLPVAPPPPPPRRKLKRVTSVRPETVQEESSAESEEIPLLSRRKIKVIPESLDVEVLQEQQHDSDESSGSPIIMKRKL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.31
3 0.37
4 0.36
5 0.34
6 0.38
7 0.38
8 0.37
9 0.31
10 0.27
11 0.24
12 0.25
13 0.28
14 0.23
15 0.21
16 0.18
17 0.18
18 0.16
19 0.12
20 0.14
21 0.11
22 0.12
23 0.15
24 0.16
25 0.17
26 0.21
27 0.24
28 0.22
29 0.24
30 0.23
31 0.23
32 0.25
33 0.27
34 0.24
35 0.22
36 0.2
37 0.19
38 0.19
39 0.15
40 0.11
41 0.07
42 0.06
43 0.06
44 0.08
45 0.09
46 0.09
47 0.13
48 0.2
49 0.27
50 0.28
51 0.31
52 0.3
53 0.34
54 0.34
55 0.31
56 0.28
57 0.25
58 0.27
59 0.26
60 0.27
61 0.23
62 0.24
63 0.25
64 0.22
65 0.18
66 0.16
67 0.14
68 0.12
69 0.11
70 0.13
71 0.15
72 0.16
73 0.16
74 0.17
75 0.22
76 0.25
77 0.26
78 0.26
79 0.27
80 0.33
81 0.35
82 0.41
83 0.37
84 0.37
85 0.38
86 0.36
87 0.31
88 0.26
89 0.22
90 0.16
91 0.15
92 0.11
93 0.09
94 0.08
95 0.07
96 0.07
97 0.07
98 0.07
99 0.06
100 0.06
101 0.05
102 0.08
103 0.09
104 0.1
105 0.1
106 0.1
107 0.1
108 0.1
109 0.11
110 0.08
111 0.07
112 0.06
113 0.06
114 0.06
115 0.06
116 0.06
117 0.06
118 0.06
119 0.05
120 0.05
121 0.05
122 0.05
123 0.05
124 0.04
125 0.04
126 0.03
127 0.03
128 0.03
129 0.02
130 0.03
131 0.03
132 0.03
133 0.04
134 0.05
135 0.06
136 0.06
137 0.07
138 0.1
139 0.15
140 0.17
141 0.18
142 0.19
143 0.19
144 0.2
145 0.22
146 0.22
147 0.2
148 0.22
149 0.22
150 0.2
151 0.19
152 0.18
153 0.15
154 0.13
155 0.11
156 0.07
157 0.06
158 0.1
159 0.1
160 0.11
161 0.1
162 0.11
163 0.1
164 0.11
165 0.12
166 0.1
167 0.11
168 0.1
169 0.1
170 0.1
171 0.1
172 0.12
173 0.13
174 0.19
175 0.26
176 0.33
177 0.35
178 0.43
179 0.47
180 0.49
181 0.5
182 0.45
183 0.42
184 0.38
185 0.39
186 0.35
187 0.31
188 0.27
189 0.25
190 0.22
191 0.19
192 0.15
193 0.14
194 0.11
195 0.15
196 0.17
197 0.23
198 0.27
199 0.29
200 0.34
201 0.4
202 0.48
203 0.51
204 0.56
205 0.58
206 0.58
207 0.64
208 0.68
209 0.6
210 0.57
211 0.54
212 0.54
213 0.48
214 0.48
215 0.43
216 0.33
217 0.32
218 0.28
219 0.23
220 0.15
221 0.14
222 0.09
223 0.05
224 0.05
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.03
230 0.04
231 0.03
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.04
236 0.05
237 0.06
238 0.09
239 0.13
240 0.13
241 0.14
242 0.14
243 0.14
244 0.14
245 0.14
246 0.11
247 0.11
248 0.16
249 0.18
250 0.22
251 0.25
252 0.34
253 0.42
254 0.49
255 0.53
256 0.59
257 0.62
258 0.65
259 0.65
260 0.64
261 0.68
262 0.65
263 0.59
264 0.52
265 0.55
266 0.57
267 0.6
268 0.55
269 0.51
270 0.53
271 0.57
272 0.64
273 0.66
274 0.66
275 0.66
276 0.67
277 0.63
278 0.57
279 0.51
280 0.41
281 0.31
282 0.23
283 0.18
284 0.14
285 0.12
286 0.11
287 0.09
288 0.1
289 0.12
290 0.13
291 0.15
292 0.2
293 0.2
294 0.24
295 0.28
296 0.37
297 0.44
298 0.5
299 0.51
300 0.55
301 0.63
302 0.6
303 0.63
304 0.58
305 0.5
306 0.44
307 0.41
308 0.35
309 0.35
310 0.37
311 0.38
312 0.38
313 0.39
314 0.39
315 0.4
316 0.42
317 0.45
318 0.51
319 0.55
320 0.6
321 0.64
322 0.65
323 0.67
324 0.7
325 0.66
326 0.6
327 0.54
328 0.51
329 0.49
330 0.48
331 0.42
332 0.36
333 0.29
334 0.25
335 0.19
336 0.13
337 0.09
338 0.05
339 0.06
340 0.04
341 0.04
342 0.04
343 0.04
344 0.04
345 0.04
346 0.04
347 0.04
348 0.04
349 0.04
350 0.04
351 0.06
352 0.08
353 0.08
354 0.1
355 0.11
356 0.14
357 0.19
358 0.29
359 0.37
360 0.46
361 0.56
362 0.62
363 0.66
364 0.66
365 0.62
366 0.56
367 0.52
368 0.48
369 0.47
370 0.41
371 0.38
372 0.39
373 0.44
374 0.48
375 0.49
376 0.49
377 0.48
378 0.56
379 0.65
380 0.72
381 0.75
382 0.77
383 0.8
384 0.76
385 0.72
386 0.65
387 0.55
388 0.46
389 0.35
390 0.27
391 0.18
392 0.15
393 0.13
394 0.14
395 0.13
396 0.13
397 0.14
398 0.17
399 0.17
400 0.19
401 0.26
402 0.26
403 0.34
404 0.37
405 0.43
406 0.4
407 0.4
408 0.4
409 0.32
410 0.31
411 0.23
412 0.21
413 0.17
414 0.19
415 0.19
416 0.19
417 0.18
418 0.19
419 0.18
420 0.15
421 0.14
422 0.12
423 0.14
424 0.15
425 0.15
426 0.14
427 0.14
428 0.16
429 0.19
430 0.2
431 0.18
432 0.25
433 0.33
434 0.43
435 0.5
436 0.54
437 0.62
438 0.69
439 0.77
440 0.79
441 0.81
442 0.82
443 0.85
444 0.9
445 0.9
446 0.89
447 0.84
448 0.77
449 0.69
450 0.61
451 0.55
452 0.45
453 0.36
454 0.28
455 0.24
456 0.21
457 0.2
458 0.17
459 0.14
460 0.13
461 0.13
462 0.11
463 0.11
464 0.16
465 0.16
466 0.22
467 0.29
468 0.3
469 0.36
470 0.41
471 0.47
472 0.53
473 0.59
474 0.57
475 0.55
476 0.57
477 0.51
478 0.47
479 0.39
480 0.31
481 0.23
482 0.21
483 0.16
484 0.14
485 0.14
486 0.13
487 0.15
488 0.15
489 0.14
490 0.15
491 0.15
492 0.15
493 0.17
494 0.16
495 0.15
496 0.16
497 0.19