Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2CSF3

Protein Details
Accession A0A1Y2CSF3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
32-53QSEAAKPGRRRQAKNACGHCKQHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18, mito 6, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR002156  RNaseH_domain  
IPR036397  RNaseH_sf  
IPR036864  Zn2-C6_fun-type_DNA-bd_sf  
IPR001138  Zn2Cys6_DnaBD  
Gene Ontology GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0004523  F:RNA-DNA hybrid ribonuclease activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF13456  RVT_3  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50048  ZN2_CY6_FUNGAL_2  
CDD cd00067  GAL4  
Amino Acid Sequences MHVAPGTQSPSPKRPASGALAVVATPPEAPSQSEAAKPGRRRQAKNACGHCKQANKKCEDARPCERCVARGIADSCVNSERKERPRGLTRGPYRRRQTSSSSEVTPTRNDATASNDNNFSQHCFYKLYPVAWPLHSSKFTLQSGNHTPLLSPLRQNNENPCTAVMLPPLPAVLSHKNSFKSVHNPFASKVSQPSSGNNLQSLNLSALRMLSEVALDENWQPHTLSRKESSTELIRANETQLSNGTQGFPVIVESANVLHFDSEPIGHQLAYAALLLALKRAKKCGFTKVYCESDSSIVITQMEGSSNPHLTPTLVPFHRDAMELLSTCPFNQNITFKHIQTFENADAENLAREALKSGCKIYRRQVRPGSEKNSGFVDVEESSSPDLPRAFGKREDMLSQVGMSTFDSVFLGMTQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.48
3 0.48
4 0.47
5 0.41
6 0.36
7 0.34
8 0.31
9 0.28
10 0.22
11 0.16
12 0.1
13 0.09
14 0.1
15 0.1
16 0.11
17 0.14
18 0.17
19 0.2
20 0.22
21 0.25
22 0.31
23 0.38
24 0.43
25 0.49
26 0.56
27 0.63
28 0.67
29 0.74
30 0.77
31 0.79
32 0.83
33 0.84
34 0.83
35 0.77
36 0.78
37 0.73
38 0.72
39 0.73
40 0.72
41 0.71
42 0.67
43 0.71
44 0.72
45 0.75
46 0.73
47 0.72
48 0.73
49 0.69
50 0.67
51 0.67
52 0.6
53 0.53
54 0.49
55 0.45
56 0.36
57 0.38
58 0.36
59 0.32
60 0.33
61 0.31
62 0.29
63 0.29
64 0.27
65 0.22
66 0.27
67 0.32
68 0.38
69 0.47
70 0.49
71 0.53
72 0.61
73 0.67
74 0.69
75 0.7
76 0.72
77 0.74
78 0.77
79 0.78
80 0.76
81 0.79
82 0.76
83 0.7
84 0.68
85 0.65
86 0.65
87 0.59
88 0.54
89 0.48
90 0.46
91 0.44
92 0.38
93 0.33
94 0.28
95 0.25
96 0.23
97 0.21
98 0.25
99 0.3
100 0.31
101 0.3
102 0.3
103 0.29
104 0.29
105 0.29
106 0.24
107 0.2
108 0.18
109 0.18
110 0.19
111 0.19
112 0.27
113 0.29
114 0.27
115 0.26
116 0.29
117 0.3
118 0.28
119 0.31
120 0.25
121 0.27
122 0.27
123 0.27
124 0.26
125 0.29
126 0.29
127 0.3
128 0.27
129 0.29
130 0.34
131 0.36
132 0.35
133 0.28
134 0.27
135 0.28
136 0.32
137 0.26
138 0.24
139 0.24
140 0.29
141 0.32
142 0.34
143 0.37
144 0.37
145 0.36
146 0.34
147 0.3
148 0.26
149 0.23
150 0.21
151 0.15
152 0.11
153 0.11
154 0.1
155 0.1
156 0.07
157 0.07
158 0.1
159 0.14
160 0.17
161 0.19
162 0.23
163 0.24
164 0.26
165 0.28
166 0.27
167 0.31
168 0.31
169 0.37
170 0.36
171 0.36
172 0.35
173 0.37
174 0.35
175 0.27
176 0.26
177 0.2
178 0.23
179 0.22
180 0.23
181 0.25
182 0.27
183 0.27
184 0.25
185 0.23
186 0.19
187 0.18
188 0.17
189 0.12
190 0.09
191 0.09
192 0.07
193 0.07
194 0.07
195 0.06
196 0.06
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.05
203 0.05
204 0.06
205 0.07
206 0.08
207 0.08
208 0.09
209 0.16
210 0.17
211 0.2
212 0.22
213 0.23
214 0.24
215 0.25
216 0.27
217 0.24
218 0.26
219 0.24
220 0.23
221 0.22
222 0.21
223 0.21
224 0.21
225 0.17
226 0.14
227 0.13
228 0.13
229 0.13
230 0.13
231 0.13
232 0.09
233 0.09
234 0.08
235 0.07
236 0.06
237 0.06
238 0.05
239 0.05
240 0.05
241 0.06
242 0.06
243 0.06
244 0.06
245 0.06
246 0.06
247 0.06
248 0.07
249 0.06
250 0.07
251 0.08
252 0.09
253 0.08
254 0.08
255 0.08
256 0.07
257 0.08
258 0.07
259 0.04
260 0.04
261 0.05
262 0.05
263 0.07
264 0.09
265 0.12
266 0.13
267 0.18
268 0.2
269 0.27
270 0.31
271 0.38
272 0.45
273 0.45
274 0.51
275 0.53
276 0.56
277 0.49
278 0.48
279 0.39
280 0.32
281 0.3
282 0.24
283 0.18
284 0.14
285 0.13
286 0.11
287 0.1
288 0.09
289 0.09
290 0.07
291 0.09
292 0.11
293 0.12
294 0.12
295 0.12
296 0.12
297 0.13
298 0.14
299 0.16
300 0.21
301 0.21
302 0.23
303 0.24
304 0.26
305 0.26
306 0.25
307 0.22
308 0.17
309 0.19
310 0.18
311 0.18
312 0.17
313 0.16
314 0.16
315 0.18
316 0.15
317 0.14
318 0.18
319 0.23
320 0.23
321 0.31
322 0.34
323 0.32
324 0.37
325 0.37
326 0.33
327 0.32
328 0.35
329 0.29
330 0.29
331 0.28
332 0.23
333 0.21
334 0.21
335 0.18
336 0.12
337 0.1
338 0.07
339 0.08
340 0.1
341 0.11
342 0.15
343 0.16
344 0.21
345 0.26
346 0.3
347 0.36
348 0.44
349 0.52
350 0.53
351 0.62
352 0.66
353 0.71
354 0.76
355 0.8
356 0.77
357 0.76
358 0.71
359 0.63
360 0.57
361 0.49
362 0.4
363 0.3
364 0.27
365 0.18
366 0.19
367 0.18
368 0.16
369 0.16
370 0.18
371 0.18
372 0.17
373 0.17
374 0.16
375 0.22
376 0.27
377 0.29
378 0.31
379 0.37
380 0.39
381 0.42
382 0.43
383 0.39
384 0.36
385 0.32
386 0.28
387 0.23
388 0.19
389 0.16
390 0.14
391 0.14
392 0.12
393 0.11
394 0.11
395 0.1