Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4R1H6

Protein Details
Accession C4R1H6    Localization Confidence High Confidence Score 17.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
181-201IFKCRVCRRCKDQKPEKYSLLHydrophilic
262-302DNEWAKREEQRIKRRDKKFETKLKQMRKRTRAEEYTRKLREBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
64-87KALELRKKHEQKAAARPSEPPKPA
268-294REEQRIKRRDKKFETKLKQMRKRTRAE
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009061  DNA-bd_dom_put_sf  
IPR000465  XPA  
IPR022656  XPA_C  
IPR022658  XPA_CS  
IPR037129  XPA_sf  
IPR022652  Znf_XPA_CS  
Gene Ontology GO:0000110  C:nucleotide-excision repair factor 1 complex  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:1901255  P:nucleotide-excision repair involved in interstrand cross-link repair  
GO:0000715  P:nucleotide-excision repair, DNA damage recognition  
GO:0070914  P:UV-damage excision repair  
KEGG ppa:PAS_chr2-1_0702  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05181  XPA_C  
PF01286  XPA_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00753  XPA_2  
CDD cd21077  DBD_Rad14  
Amino Acid Sequences MERQRQIAENRQRALEKLKQRGLAQDIVDTPAGATRVKVPEKKVVKPHSLTKAQQDKIEANRLKALELRKKHEQKAAARPSEPPKPATVRDATKAVPRNRIPSIKKSDYIEYDLAEMKDTYGGFLDTDQEPENATEKSLQDWLIENENKIVHEPAPPVDREAAPKCFECGSIELDQQLWTIFKCRVCRRCKDQKPEKYSLLTKTECKEDYLLTDPELADHDLLHRLEKTNPYSGTYSKMQLYLRYQVEEFAFKKWNGPEELDNEWAKREEQRIKRRDKKFETKLKQMRKRTRAEEYTRKLREQKYGKSHVHQWSMPIDGGKSGLVRRRCTDCGLETEEYII
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.54
3 0.53
4 0.55
5 0.58
6 0.58
7 0.58
8 0.62
9 0.59
10 0.56
11 0.47
12 0.41
13 0.36
14 0.33
15 0.32
16 0.24
17 0.19
18 0.16
19 0.16
20 0.12
21 0.12
22 0.15
23 0.23
24 0.31
25 0.35
26 0.37
27 0.46
28 0.53
29 0.6
30 0.63
31 0.64
32 0.65
33 0.66
34 0.7
35 0.7
36 0.71
37 0.67
38 0.67
39 0.69
40 0.63
41 0.6
42 0.55
43 0.52
44 0.49
45 0.57
46 0.49
47 0.41
48 0.44
49 0.41
50 0.38
51 0.37
52 0.4
53 0.39
54 0.43
55 0.48
56 0.53
57 0.61
58 0.65
59 0.67
60 0.66
61 0.65
62 0.7
63 0.73
64 0.67
65 0.6
66 0.61
67 0.61
68 0.61
69 0.55
70 0.46
71 0.41
72 0.42
73 0.43
74 0.42
75 0.42
76 0.37
77 0.38
78 0.39
79 0.35
80 0.37
81 0.43
82 0.42
83 0.45
84 0.44
85 0.46
86 0.49
87 0.57
88 0.54
89 0.55
90 0.61
91 0.56
92 0.57
93 0.54
94 0.53
95 0.48
96 0.47
97 0.39
98 0.3
99 0.27
100 0.26
101 0.23
102 0.19
103 0.15
104 0.11
105 0.12
106 0.11
107 0.09
108 0.07
109 0.08
110 0.07
111 0.07
112 0.09
113 0.08
114 0.1
115 0.1
116 0.1
117 0.1
118 0.11
119 0.13
120 0.1
121 0.1
122 0.11
123 0.11
124 0.12
125 0.13
126 0.13
127 0.12
128 0.13
129 0.14
130 0.19
131 0.19
132 0.18
133 0.18
134 0.18
135 0.17
136 0.16
137 0.16
138 0.1
139 0.12
140 0.12
141 0.13
142 0.15
143 0.15
144 0.15
145 0.16
146 0.16
147 0.18
148 0.2
149 0.21
150 0.2
151 0.2
152 0.21
153 0.19
154 0.19
155 0.16
156 0.14
157 0.14
158 0.14
159 0.14
160 0.13
161 0.13
162 0.13
163 0.11
164 0.1
165 0.07
166 0.05
167 0.07
168 0.1
169 0.12
170 0.19
171 0.27
172 0.36
173 0.42
174 0.5
175 0.57
176 0.65
177 0.72
178 0.76
179 0.79
180 0.8
181 0.82
182 0.81
183 0.75
184 0.68
185 0.63
186 0.57
187 0.53
188 0.45
189 0.4
190 0.36
191 0.38
192 0.33
193 0.31
194 0.26
195 0.2
196 0.21
197 0.22
198 0.21
199 0.17
200 0.17
201 0.16
202 0.15
203 0.16
204 0.13
205 0.09
206 0.08
207 0.09
208 0.11
209 0.11
210 0.12
211 0.12
212 0.13
213 0.16
214 0.22
215 0.24
216 0.26
217 0.27
218 0.29
219 0.3
220 0.3
221 0.31
222 0.28
223 0.27
224 0.22
225 0.26
226 0.24
227 0.25
228 0.28
229 0.31
230 0.3
231 0.29
232 0.28
233 0.27
234 0.27
235 0.29
236 0.26
237 0.22
238 0.25
239 0.23
240 0.28
241 0.28
242 0.31
243 0.28
244 0.31
245 0.31
246 0.3
247 0.34
248 0.33
249 0.32
250 0.28
251 0.27
252 0.25
253 0.22
254 0.23
255 0.27
256 0.33
257 0.42
258 0.52
259 0.6
260 0.7
261 0.79
262 0.83
263 0.86
264 0.87
265 0.88
266 0.87
267 0.89
268 0.87
269 0.88
270 0.89
271 0.89
272 0.89
273 0.88
274 0.89
275 0.87
276 0.87
277 0.84
278 0.84
279 0.83
280 0.83
281 0.83
282 0.81
283 0.82
284 0.78
285 0.77
286 0.74
287 0.7
288 0.7
289 0.68
290 0.69
291 0.69
292 0.74
293 0.74
294 0.72
295 0.76
296 0.74
297 0.72
298 0.63
299 0.57
300 0.5
301 0.47
302 0.43
303 0.35
304 0.27
305 0.2
306 0.2
307 0.18
308 0.17
309 0.19
310 0.25
311 0.3
312 0.34
313 0.39
314 0.45
315 0.47
316 0.49
317 0.51
318 0.47
319 0.48
320 0.49
321 0.46