FuNGI

A0A1Y2CU56

Protein Details

Accession

A0A1Y2CU56

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
122-141	KEELEKYRKERPKIQQQFAD	Hydrophilic
160-182	VGDLTRKKGTKKQKFDRYTPTSD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
112-133	RRRARREAREKEELEKYRKERP

Subcellular Location(s)

cyto_mito 9.333, mito 9, cyto_nucl 8.666, nucl 8.5, cyto 7.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR003107 HAT IPR010491 PRP1_N IPR045075 Syf1-like IPR011990 TPR-like_helical_dom_sf
Gene Ontology	GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
Pfam	View protein in Pfam PF06424 PRP1_N PF13432 TPR_16

Amino Acid Sequences

MSFKPISMPDFLSKKAPPNYIAGLGRGATGFTTRSDIGPAREAAPDPTADPLALAQAQAQAQAAQAKKDDDDEGRFQDPDTETGLFNTAPYEADDEEADRIYEQVDAAMDERRRARREAREKEELEKYRKERPKIQQQFADLKRGLAAVSADEWAALPEVGDLTRKKGTKKQKFDRYTPTSDVITVGGGFAGTVQSGIATSIDPKLTGGLTTPFGTASVAPGTDSGLIDFAQFGASRTAVLGKQIDQVSDADKGGSSTVDPKGYLTGLNSIITKTDAEISDMKKARQLLRSVITTNPKHAPGWIAAARLEEVAQKIVAARELAAKGCEECPLSEDIWLESARLNTTDNAKIILATAVRHIPSSVKIWLRAMSLEKEVKAQKRVLRRALEFIPNSVKIWKAAVSLEEDPEDARILLSRAVECVPLSIELWLALARLESYENAKKVLNKARAAIPTSHEIWITAAKLEEQAGNTHRVDILIKNAAEKCETEEFVATAQAIVKATIAIDVDPEDKQATWLEDAESSVSHGAVATARAIYAYALQEFPEEDGIWKKAAFLEKAHGTRESLDEILQRAVRYCPQAEVLWLMGAKEKWMGGDIEGAKQILESAFDANPNSEQIWLAAIKLEVETGEYGRAQLLLQKARTKADTDRVWMKSVMLERQLGNYDKALSLLDEALKKFPQFAKLWMIKAQIEELHLGNITAARETFAKSLKAVPKTASGAITLWILACRLEEKSGHLIKARALLEKARILIPKEPELWAESIRIESRAGNQSIAEGLISKALQDCPTSGLLWSEAILTESRPQRKARSRDALLKCENDPLVLITVARLFWAERKPDKARNWFSRAVKANPDLGDAWAWWLKFESVQEGDNTKVMQDVISKCVAAEPHHGERWQAASKDLKNTGKSVEEILKMIASGLPVTV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.45
2	0.48
3	0.49
4	0.43
5	0.45
6	0.47
7	0.48
8	0.46
9	0.39
10	0.34
11	0.29
12	0.28
13	0.22
14	0.19
15	0.12
16	0.12
17	0.12
18	0.11
19	0.15
20	0.15
21	0.16
22	0.2
23	0.23
24	0.25
25	0.28
26	0.29
27	0.26
28	0.28
29	0.28
30	0.26
31	0.25
32	0.23
33	0.19
34	0.2
35	0.19
36	0.16
37	0.15
38	0.12
39	0.14
40	0.13
41	0.12
42	0.1
43	0.13
44	0.14
45	0.14
46	0.14
47	0.11
48	0.13
49	0.19
50	0.19
51	0.18
52	0.2
53	0.21
54	0.21
55	0.24
56	0.26
57	0.25
58	0.29
59	0.32
60	0.34
61	0.35
62	0.34
63	0.32
64	0.35
65	0.32
66	0.28
67	0.26
68	0.23
69	0.21
70	0.22
71	0.23
72	0.16
73	0.15
74	0.14
75	0.1
76	0.1
77	0.1
78	0.12
79	0.11
80	0.12
81	0.13
82	0.13
83	0.14
84	0.14
85	0.13
86	0.1
87	0.1
88	0.09
89	0.09
90	0.08
91	0.07
92	0.07
93	0.08
94	0.09
95	0.15
96	0.15
97	0.2
98	0.27
99	0.33
100	0.36
101	0.41
102	0.49
103	0.54
104	0.64
105	0.7
106	0.71
107	0.74
108	0.73
109	0.74
110	0.75
111	0.72
112	0.68
113	0.66
114	0.62
115	0.63
116	0.68
117	0.68
118	0.68
119	0.71
120	0.76
121	0.77
122	0.82
123	0.77
124	0.76
125	0.79
126	0.72
127	0.7
128	0.59
129	0.49
130	0.41
131	0.36
132	0.29
133	0.2
134	0.17
135	0.09
136	0.1
137	0.1
138	0.09
139	0.09
140	0.09
141	0.08
142	0.08
143	0.06
144	0.05
145	0.05
146	0.06
147	0.06
148	0.11
149	0.11
150	0.15
151	0.21
152	0.24
153	0.28
154	0.36
155	0.47
156	0.54
157	0.65
158	0.71
159	0.76
160	0.81
161	0.85
162	0.87
163	0.83
164	0.79
165	0.72
166	0.65
167	0.55
168	0.47
169	0.4
170	0.3
171	0.22
172	0.15
173	0.11
174	0.07
175	0.06
176	0.05
177	0.04
178	0.04
179	0.03
180	0.03
181	0.03
182	0.03
183	0.03
184	0.04
185	0.04
186	0.04
187	0.06
188	0.08
189	0.09
190	0.09
191	0.09
192	0.1
193	0.1
194	0.09
195	0.1
196	0.1
197	0.12
198	0.12
199	0.13
200	0.11
201	0.11
202	0.12
203	0.1
204	0.1
205	0.09
206	0.08
207	0.08
208	0.08
209	0.09
210	0.09
211	0.09
212	0.08
213	0.07
214	0.07
215	0.07
216	0.07
217	0.06
218	0.06
219	0.06
220	0.07
221	0.08
222	0.08
223	0.08
224	0.08
225	0.11
226	0.1
227	0.12
228	0.13
229	0.12
230	0.18
231	0.19
232	0.19
233	0.17
234	0.18
235	0.17
236	0.18
237	0.16
238	0.11
239	0.1
240	0.1
241	0.09
242	0.09
243	0.08
244	0.1
245	0.13
246	0.13
247	0.13
248	0.14
249	0.15
250	0.15
251	0.15
252	0.11
253	0.13
254	0.13
255	0.14
256	0.14
257	0.12
258	0.13
259	0.13
260	0.12
261	0.09
262	0.11
263	0.1
264	0.13
265	0.17
266	0.18
267	0.25
268	0.27
269	0.27
270	0.27
271	0.31
272	0.33
273	0.35
274	0.36
275	0.33
276	0.36
277	0.38
278	0.37
279	0.38
280	0.41
281	0.36
282	0.37
283	0.35
284	0.32
285	0.3
286	0.29
287	0.26
288	0.19
289	0.24
290	0.21
291	0.19
292	0.18
293	0.18
294	0.18
295	0.16
296	0.15
297	0.1
298	0.09
299	0.09
300	0.08
301	0.07
302	0.08
303	0.08
304	0.09
305	0.07
306	0.07
307	0.1
308	0.11
309	0.11
310	0.11
311	0.11
312	0.11
313	0.12
314	0.13
315	0.1
316	0.09
317	0.11
318	0.13
319	0.12
320	0.12
321	0.12
322	0.11
323	0.12
324	0.12
325	0.11
326	0.09
327	0.1
328	0.09
329	0.09
330	0.1
331	0.1
332	0.14
333	0.16
334	0.15
335	0.15
336	0.15
337	0.14
338	0.13
339	0.13
340	0.1
341	0.08
342	0.09
343	0.1
344	0.1
345	0.1
346	0.1
347	0.1
348	0.11
349	0.14
350	0.17
351	0.17
352	0.18
353	0.19
354	0.2
355	0.2
356	0.2
357	0.19
358	0.16
359	0.19
360	0.2
361	0.19
362	0.22
363	0.26
364	0.28
365	0.29
366	0.32
367	0.32
368	0.4
369	0.47
370	0.5
371	0.5
372	0.48
373	0.49
374	0.48
375	0.5
376	0.41
377	0.36
378	0.33
379	0.28
380	0.27
381	0.23
382	0.2
383	0.14
384	0.14
385	0.13
386	0.1
387	0.1
388	0.1
389	0.13
390	0.14
391	0.14
392	0.13
393	0.12
394	0.11
395	0.11
396	0.1
397	0.06
398	0.05
399	0.05
400	0.05
401	0.07
402	0.07
403	0.07
404	0.08
405	0.08
406	0.09
407	0.08
408	0.08
409	0.07
410	0.07
411	0.07
412	0.06
413	0.05
414	0.05
415	0.05
416	0.05
417	0.04
418	0.04
419	0.03
420	0.03
421	0.04
422	0.04
423	0.05
424	0.09
425	0.12
426	0.13
427	0.14
428	0.15
429	0.17
430	0.23
431	0.31
432	0.33
433	0.31
434	0.32
435	0.36
436	0.37
437	0.37
438	0.32
439	0.26
440	0.23
441	0.23
442	0.22
443	0.17
444	0.15
445	0.13
446	0.13
447	0.11
448	0.08
449	0.07
450	0.06
451	0.07
452	0.07
453	0.07
454	0.07
455	0.09
456	0.1
457	0.13
458	0.13
459	0.13
460	0.13
461	0.12
462	0.12
463	0.11
464	0.12
465	0.12
466	0.12
467	0.15
468	0.15
469	0.16
470	0.15
471	0.15
472	0.16
473	0.14
474	0.15
475	0.13
476	0.12
477	0.12
478	0.12
479	0.12
480	0.08
481	0.06
482	0.05
483	0.06
484	0.05
485	0.05
486	0.05
487	0.05
488	0.05
489	0.05
490	0.05
491	0.04
492	0.04
493	0.05
494	0.06
495	0.06
496	0.07
497	0.07
498	0.07
499	0.08
500	0.08
501	0.08
502	0.08
503	0.09
504	0.09
505	0.08
506	0.09
507	0.08
508	0.07
509	0.07
510	0.06
511	0.06
512	0.05
513	0.04
514	0.04
515	0.04
516	0.05
517	0.05
518	0.04
519	0.04
520	0.04
521	0.05
522	0.04
523	0.06
524	0.06
525	0.07
526	0.07
527	0.07
528	0.08
529	0.08
530	0.08
531	0.07
532	0.07
533	0.07
534	0.09
535	0.1
536	0.1
537	0.1
538	0.1
539	0.11
540	0.15
541	0.15
542	0.14
543	0.18
544	0.23
545	0.25
546	0.26
547	0.24
548	0.22
549	0.22
550	0.22
551	0.19
552	0.14
553	0.13
554	0.13
555	0.13
556	0.15
557	0.15
558	0.13
559	0.13
560	0.14
561	0.15
562	0.17
563	0.16
564	0.15
565	0.16
566	0.16
567	0.16
568	0.16
569	0.13
570	0.11
571	0.11
572	0.1
573	0.1
574	0.1
575	0.09
576	0.09
577	0.08
578	0.08
579	0.09
580	0.09
581	0.07
582	0.13
583	0.13
584	0.14
585	0.14
586	0.14
587	0.13
588	0.12
589	0.12
590	0.06
591	0.07
592	0.06
593	0.07
594	0.08
595	0.09
596	0.09
597	0.1
598	0.1
599	0.1
600	0.1
601	0.08
602	0.08
603	0.07
604	0.09
605	0.08
606	0.08
607	0.08
608	0.07
609	0.07
610	0.07
611	0.07
612	0.05
613	0.06
614	0.06
615	0.06
616	0.07
617	0.07
618	0.07
619	0.07
620	0.07
621	0.06
622	0.09
623	0.14
624	0.18
625	0.21
626	0.25
627	0.27
628	0.29
629	0.31
630	0.3
631	0.3
632	0.34
633	0.34
634	0.34
635	0.4
636	0.4
637	0.41
638	0.38
639	0.34
640	0.29
641	0.29
642	0.28
643	0.23
644	0.23
645	0.21
646	0.23
647	0.27
648	0.24
649	0.22
650	0.2
651	0.18
652	0.16
653	0.16
654	0.14
655	0.11
656	0.1
657	0.1
658	0.12
659	0.13
660	0.14
661	0.16
662	0.17
663	0.17
664	0.2
665	0.21
666	0.25
667	0.24
668	0.27
669	0.34
670	0.37
671	0.39
672	0.38
673	0.39
674	0.33
675	0.32
676	0.3
677	0.22
678	0.19
679	0.19
680	0.15
681	0.14
682	0.12
683	0.12
684	0.1
685	0.1
686	0.09
687	0.08
688	0.08
689	0.08
690	0.09
691	0.11
692	0.13
693	0.15
694	0.15
695	0.16
696	0.24
697	0.3
698	0.32
699	0.33
700	0.32
701	0.33
702	0.35
703	0.36
704	0.29
705	0.23
706	0.2
707	0.19
708	0.17
709	0.13
710	0.1
711	0.08
712	0.08
713	0.07
714	0.07
715	0.07
716	0.08
717	0.1
718	0.11
719	0.15
720	0.23
721	0.27
722	0.28
723	0.29
724	0.29
725	0.29
726	0.36
727	0.33
728	0.28
729	0.26
730	0.27
731	0.29
732	0.3
733	0.3
734	0.27
735	0.28
736	0.28
737	0.32
738	0.33
739	0.33
740	0.33
741	0.32
742	0.29
743	0.29
744	0.28
745	0.24
746	0.21
747	0.17
748	0.18
749	0.18
750	0.18
751	0.16
752	0.15
753	0.2
754	0.26
755	0.26
756	0.24
757	0.23
758	0.23
759	0.22
760	0.21
761	0.15
762	0.08
763	0.07
764	0.09
765	0.09
766	0.08
767	0.1
768	0.12
769	0.14
770	0.14
771	0.14
772	0.15
773	0.17
774	0.17
775	0.15
776	0.14
777	0.13
778	0.13
779	0.12
780	0.1
781	0.08
782	0.09
783	0.09
784	0.09
785	0.16
786	0.23
787	0.29
788	0.33
789	0.36
790	0.46
791	0.55
792	0.63
793	0.66
794	0.69
795	0.7
796	0.76
797	0.8
798	0.79
799	0.74
800	0.69
801	0.6
802	0.55
803	0.49
804	0.38
805	0.32
806	0.24
807	0.2
808	0.17
809	0.16
810	0.11
811	0.12
812	0.11
813	0.11
814	0.1
815	0.08
816	0.14
817	0.21
818	0.28
819	0.32
820	0.4
821	0.47
822	0.56
823	0.64
824	0.69
825	0.73
826	0.75
827	0.77
828	0.78
829	0.74
830	0.75
831	0.73
832	0.67
833	0.65
834	0.58
835	0.57
836	0.49
837	0.48
838	0.39
839	0.34
840	0.3
841	0.22
842	0.23
843	0.2
844	0.19
845	0.16
846	0.17
847	0.16
848	0.17
849	0.18
850	0.2
851	0.2
852	0.22
853	0.24
854	0.25
855	0.26
856	0.26
857	0.24
858	0.18
859	0.17
860	0.16
861	0.14
862	0.18
863	0.2
864	0.21
865	0.23
866	0.23
867	0.21
868	0.24
869	0.25
870	0.21
871	0.27
872	0.3
873	0.36
874	0.4
875	0.4
876	0.38
877	0.39
878	0.43
879	0.41
880	0.35
881	0.33
882	0.37
883	0.42
884	0.49
885	0.54
886	0.54
887	0.5
888	0.52
889	0.51
890	0.46
891	0.43
892	0.4
893	0.38
894	0.34
895	0.32
896	0.31
897	0.27
898	0.23
899	0.22
900	0.18
901	0.12

A0A1Y2CU56

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer