FuNGI

A0A1Y2CML4

Protein Details

Accession

A0A1Y2CML4

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
65-90	DDADGKTKKAKKTPSKEEIEKNKRSV	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
72-80	KKAKKTPSK

Subcellular Location(s)

nucl 15.5, cyto_nucl 11, cyto 5.5, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR036047 F-box-like_dom_sf IPR001810 F-box_dom IPR001611 Leu-rich_rpt IPR003591 Leu-rich_rpt_typical-subtyp IPR032675 LRR_dom_sf IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR034221 RBM34_RRM2 IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
Pfam	View protein in Pfam PF00560 LRR_1 PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50181 FBOX PS51450 LRR PS50102 RRM
CDD	cd12394 RRM1_RBM34 cd12395 RRM2_RBM34

Amino Acid Sequences

MSLFGFTAAAAATADAALDSLFSSTKTEVVAPSRKAAAPASAEKTEKETDISVDDAVSEDDDDEDDADGKTKKAKKTPSKEEIEKNKRSVFVGNLPVAATQKAVSKKLLALFKQHGPVESIRFRSIAFLNNVPRKVSYLAKEFHPDRDTLNAYIVYKTKEAAAKALDLNGHVFEGKHLRVDKAIKSDVNDFKKSVFLGNLAFDIVEESVWQFFKDCENVRIVRDKKTNLGKGFGYVQFADGHDVDIALKMDGQELSGRKVRVTKCSKSQILQRHARKAEKGKGACRIAPPKQSNCKSTIKPLHQMSLTSLPTEVLLLIFIHVSPTESPKLFRLNRRLCSILTSPSFASQNIQQFVPLPSSLVLKNPTYLDRLWFLWPETFQYAYAKQAHSGTKEILWANQGLTSISGALPSSLNLLAGLTILDLSNNPRLCPEEIPEHLFTLNKLTTLNLANIGLQGFLSPRISQLYNLEHLNLARNALEGHIPSEIGLLVNLHHLSLRNNQLSGKIPCELGKLTQLRTLNLAHNYFCGALPLQIELLPLLDSLYLESNVIRMHRLGAFGMAH

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.05
2	0.04
3	0.04
4	0.04
5	0.04
6	0.04
7	0.05
8	0.05
9	0.06
10	0.09
11	0.1
12	0.11
13	0.12
14	0.14
15	0.17
16	0.24
17	0.32
18	0.32
19	0.35
20	0.38
21	0.37
22	0.38
23	0.35
24	0.33
25	0.31
26	0.35
27	0.37
28	0.38
29	0.38
30	0.37
31	0.4
32	0.37
33	0.32
34	0.28
35	0.23
36	0.21
37	0.22
38	0.22
39	0.17
40	0.15
41	0.14
42	0.12
43	0.11
44	0.1
45	0.08
46	0.07
47	0.07
48	0.07
49	0.07
50	0.07
51	0.07
52	0.08
53	0.08
54	0.11
55	0.12
56	0.12
57	0.2
58	0.26
59	0.33
60	0.4
61	0.51
62	0.59
63	0.68
64	0.78
65	0.8
66	0.83
67	0.84
68	0.86
69	0.87
70	0.86
71	0.83
72	0.78
73	0.73
74	0.65
75	0.59
76	0.53
77	0.46
78	0.44
79	0.43
80	0.38
81	0.35
82	0.33
83	0.32
84	0.29
85	0.24
86	0.17
87	0.11
88	0.16
89	0.19
90	0.21
91	0.22
92	0.22
93	0.26
94	0.31
95	0.37
96	0.33
97	0.36
98	0.38
99	0.42
100	0.46
101	0.43
102	0.38
103	0.34
104	0.36
105	0.36
106	0.36
107	0.35
108	0.3
109	0.3
110	0.29
111	0.29
112	0.28
113	0.27
114	0.25
115	0.28
116	0.35
117	0.41
118	0.42
119	0.39
120	0.38
121	0.34
122	0.34
123	0.33
124	0.3
125	0.3
126	0.32
127	0.33
128	0.4
129	0.39
130	0.42
131	0.39
132	0.34
133	0.29
134	0.33
135	0.33
136	0.26
137	0.27
138	0.23
139	0.22
140	0.24
141	0.24
142	0.2
143	0.18
144	0.17
145	0.18
146	0.19
147	0.19
148	0.2
149	0.19
150	0.19
151	0.19
152	0.21
153	0.18
154	0.15
155	0.16
156	0.13
157	0.12
158	0.09
159	0.09
160	0.09
161	0.13
162	0.13
163	0.16
164	0.17
165	0.18
166	0.22
167	0.26
168	0.28
169	0.29
170	0.32
171	0.29
172	0.3
173	0.38
174	0.41
175	0.43
176	0.41
177	0.36
178	0.33
179	0.34
180	0.32
181	0.25
182	0.18
183	0.14
184	0.13
185	0.13
186	0.13
187	0.11
188	0.1
189	0.08
190	0.08
191	0.06
192	0.05
193	0.04
194	0.04
195	0.06
196	0.06
197	0.06
198	0.06
199	0.07
200	0.09
201	0.14
202	0.15
203	0.16
204	0.2
205	0.22
206	0.23
207	0.32
208	0.32
209	0.35
210	0.38
211	0.38
212	0.41
213	0.48
214	0.53
215	0.45
216	0.46
217	0.38
218	0.35
219	0.37
220	0.31
221	0.25
222	0.18
223	0.17
224	0.15
225	0.15
226	0.15
227	0.11
228	0.1
229	0.08
230	0.08
231	0.07
232	0.07
233	0.07
234	0.05
235	0.05
236	0.05
237	0.06
238	0.06
239	0.06
240	0.08
241	0.09
242	0.12
243	0.15
244	0.15
245	0.15
246	0.22
247	0.23
248	0.3
249	0.37
250	0.38
251	0.43
252	0.5
253	0.52
254	0.49
255	0.54
256	0.54
257	0.55
258	0.6
259	0.57
260	0.58
261	0.6
262	0.6
263	0.58
264	0.56
265	0.55
266	0.54
267	0.52
268	0.47
269	0.5
270	0.5
271	0.46
272	0.44
273	0.43
274	0.4
275	0.45
276	0.46
277	0.46
278	0.54
279	0.56
280	0.53
281	0.51
282	0.53
283	0.46
284	0.51
285	0.52
286	0.46
287	0.5
288	0.49
289	0.47
290	0.41
291	0.4
292	0.33
293	0.32
294	0.27
295	0.2
296	0.19
297	0.15
298	0.15
299	0.14
300	0.11
301	0.04
302	0.04
303	0.04
304	0.04
305	0.04
306	0.04
307	0.04
308	0.04
309	0.05
310	0.05
311	0.09
312	0.11
313	0.12
314	0.13
315	0.15
316	0.23
317	0.27
318	0.34
319	0.41
320	0.47
321	0.5
322	0.54
323	0.53
324	0.45
325	0.46
326	0.41
327	0.36
328	0.29
329	0.27
330	0.23
331	0.23
332	0.23
333	0.18
334	0.18
335	0.16
336	0.21
337	0.2
338	0.2
339	0.18
340	0.19
341	0.2
342	0.2
343	0.15
344	0.11
345	0.1
346	0.12
347	0.12
348	0.13
349	0.15
350	0.14
351	0.16
352	0.16
353	0.17
354	0.18
355	0.18
356	0.17
357	0.17
358	0.18
359	0.19
360	0.18
361	0.18
362	0.17
363	0.17
364	0.18
365	0.18
366	0.17
367	0.16
368	0.18
369	0.17
370	0.2
371	0.23
372	0.21
373	0.2
374	0.24
375	0.26
376	0.25
377	0.27
378	0.23
379	0.2
380	0.24
381	0.22
382	0.19
383	0.18
384	0.16
385	0.14
386	0.14
387	0.14
388	0.1
389	0.1
390	0.09
391	0.08
392	0.07
393	0.07
394	0.06
395	0.06
396	0.06
397	0.06
398	0.08
399	0.07
400	0.07
401	0.07
402	0.07
403	0.06
404	0.06
405	0.06
406	0.03
407	0.04
408	0.04
409	0.04
410	0.05
411	0.08
412	0.14
413	0.14
414	0.15
415	0.15
416	0.19
417	0.21
418	0.23
419	0.24
420	0.25
421	0.27
422	0.32
423	0.32
424	0.3
425	0.28
426	0.27
427	0.23
428	0.22
429	0.2
430	0.15
431	0.14
432	0.14
433	0.16
434	0.18
435	0.18
436	0.14
437	0.14
438	0.14
439	0.14
440	0.14
441	0.1
442	0.08
443	0.08
444	0.07
445	0.08
446	0.1
447	0.09
448	0.1
449	0.14
450	0.15
451	0.16
452	0.2
453	0.23
454	0.25
455	0.25
456	0.25
457	0.23
458	0.23
459	0.26
460	0.22
461	0.18
462	0.15
463	0.15
464	0.14
465	0.14
466	0.16
467	0.11
468	0.12
469	0.11
470	0.11
471	0.1
472	0.11
473	0.1
474	0.08
475	0.07
476	0.06
477	0.06
478	0.1
479	0.1
480	0.09
481	0.1
482	0.11
483	0.15
484	0.22
485	0.31
486	0.3
487	0.31
488	0.31
489	0.34
490	0.4
491	0.41
492	0.36
493	0.29
494	0.28
495	0.28
496	0.31
497	0.29
498	0.24
499	0.29
500	0.3
501	0.3
502	0.34
503	0.35
504	0.32
505	0.34
506	0.35
507	0.33
508	0.35
509	0.35
510	0.31
511	0.3
512	0.3
513	0.28
514	0.24
515	0.21
516	0.15
517	0.14
518	0.14
519	0.14
520	0.14
521	0.13
522	0.13
523	0.11
524	0.11
525	0.09
526	0.08
527	0.08
528	0.07
529	0.07
530	0.08
531	0.1
532	0.1
533	0.1
534	0.1
535	0.12
536	0.13
537	0.14
538	0.15
539	0.13
540	0.16
541	0.18
542	0.19
543	0.18

A0A1Y2CML4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer