FuNGI

A0A1Y2BNN1

Protein Details

Accession

A0A1Y2BNN1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
330-355	EEKAVEKKEKKDKKEKKEKSEGVKEV	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
335-377	EKKEKKDKKEKKEKSEGVKEVKAVAGKEVEKPVVAAKEAASKL
382-389	AKAAAAKE
392-394	AKS
408-410	KEK
415-444	KQAATKDAPSVKPKSADAGSKKEKKGLKRP
512-536	KKKAIELKKAGLLDKAAHPAIKKVK

Subcellular Location(s)

cyto 19, cyto_nucl 13.333, nucl 5.5, mito_nucl 4.166

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR010301 RRP1
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0030688 C:preribosome, small subunit precursor GO:0006364 P:rRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF05997 Nop52

Amino Acid Sequences

MAAASTSTSTSGAPASAAAANGGGFGKNLAHTDKSVRDKAVHALSEWLIAAEDLSEITVLKLWKGLFYCYWMSDKTTIQHELAERLAGIALDLSPEKAILYIRGFWGIIIREWPGLDRLRLDKFYNLLRNFHRVAFQLIEKNEFNEELVDEYMSILEEGPVSANNVRVSDGLRYHTASAYLDEMNNGISDEAEVPAEIGLKFFGPFIKAFATTTNTVYVEKLEEMFGKVADVLENNVRYEDEPEKKEFAVKLPNTRITQEIYGLINKDTTLFRNRKALNAVCARFFKDGGVKVEDVKGAQSAPQVGLRPLKPLKPLSSVASAPASAPEDEEKAVEKKEKKDKKEKKEKSEGVKEVKAVAGKEVEKPVVAAKEAASKLPIPTAKAAAAKEAVAKSSGGKDASTKPVAVKEKEAVSKQAATKDAPSVKPKSADAGSKKEKKGLKRPAEEEATPNFNDMDEGWEDEKPSPPKKAKLDSIAVMKPAAVAIATRINTEKNSKPIKIKATAAEIEELKKKAIELKKAGLLDKAAHPAIKKVKRSIVLKMENNTVKTFDKTAPIGMIPIEIPPFSPSKSALKVRK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.09
2	0.1
3	0.11
4	0.11
5	0.1
6	0.09
7	0.09
8	0.1
9	0.1
10	0.08
11	0.07
12	0.07
13	0.09
14	0.1
15	0.13
16	0.15
17	0.16
18	0.18
19	0.25
20	0.32
21	0.39
22	0.42
23	0.42
24	0.41
25	0.42
26	0.47
27	0.48
28	0.41
29	0.34
30	0.34
31	0.31
32	0.3
33	0.28
34	0.2
35	0.13
36	0.11
37	0.11
38	0.07
39	0.06
40	0.05
41	0.05
42	0.05
43	0.05
44	0.05
45	0.08
46	0.08
47	0.08
48	0.12
49	0.12
50	0.16
51	0.17
52	0.2
53	0.18
54	0.23
55	0.25
56	0.24
57	0.27
58	0.25
59	0.27
60	0.27
61	0.29
62	0.28
63	0.31
64	0.31
65	0.29
66	0.32
67	0.3
68	0.29
69	0.27
70	0.24
71	0.18
72	0.15
73	0.15
74	0.1
75	0.09
76	0.06
77	0.05
78	0.06
79	0.07
80	0.07
81	0.07
82	0.07
83	0.07
84	0.07
85	0.08
86	0.1
87	0.12
88	0.14
89	0.15
90	0.17
91	0.16
92	0.15
93	0.19
94	0.16
95	0.15
96	0.14
97	0.15
98	0.14
99	0.14
100	0.15
101	0.16
102	0.17
103	0.18
104	0.2
105	0.23
106	0.27
107	0.3
108	0.31
109	0.3
110	0.3
111	0.36
112	0.42
113	0.39
114	0.4
115	0.4
116	0.44
117	0.43
118	0.42
119	0.38
120	0.3
121	0.31
122	0.28
123	0.29
124	0.29
125	0.28
126	0.31
127	0.28
128	0.28
129	0.26
130	0.23
131	0.2
132	0.14
133	0.14
134	0.11
135	0.11
136	0.09
137	0.08
138	0.08
139	0.07
140	0.07
141	0.06
142	0.05
143	0.04
144	0.04
145	0.04
146	0.05
147	0.05
148	0.07
149	0.08
150	0.11
151	0.11
152	0.12
153	0.12
154	0.13
155	0.14
156	0.16
157	0.17
158	0.17
159	0.17
160	0.18
161	0.19
162	0.18
163	0.18
164	0.15
165	0.14
166	0.14
167	0.13
168	0.11
169	0.11
170	0.1
171	0.09
172	0.09
173	0.08
174	0.05
175	0.04
176	0.05
177	0.05
178	0.06
179	0.05
180	0.05
181	0.05
182	0.05
183	0.07
184	0.06
185	0.05
186	0.05
187	0.05
188	0.06
189	0.06
190	0.07
191	0.07
192	0.07
193	0.09
194	0.11
195	0.11
196	0.11
197	0.13
198	0.16
199	0.15
200	0.16
201	0.17
202	0.16
203	0.16
204	0.15
205	0.14
206	0.12
207	0.11
208	0.1
209	0.09
210	0.09
211	0.1
212	0.1
213	0.09
214	0.08
215	0.07
216	0.07
217	0.06
218	0.06
219	0.06
220	0.09
221	0.1
222	0.1
223	0.1
224	0.1
225	0.1
226	0.14
227	0.19
228	0.21
229	0.23
230	0.25
231	0.27
232	0.27
233	0.29
234	0.26
235	0.23
236	0.27
237	0.27
238	0.32
239	0.35
240	0.4
241	0.38
242	0.39
243	0.37
244	0.29
245	0.28
246	0.21
247	0.19
248	0.14
249	0.14
250	0.14
251	0.13
252	0.11
253	0.1
254	0.11
255	0.09
256	0.11
257	0.18
258	0.19
259	0.21
260	0.29
261	0.29
262	0.31
263	0.35
264	0.34
265	0.33
266	0.38
267	0.37
268	0.32
269	0.32
270	0.32
271	0.27
272	0.26
273	0.2
274	0.17
275	0.19
276	0.19
277	0.2
278	0.18
279	0.18
280	0.19
281	0.19
282	0.15
283	0.12
284	0.09
285	0.07
286	0.07
287	0.07
288	0.07
289	0.07
290	0.09
291	0.1
292	0.11
293	0.15
294	0.14
295	0.19
296	0.21
297	0.23
298	0.25
299	0.27
300	0.29
301	0.29
302	0.31
303	0.28
304	0.29
305	0.27
306	0.24
307	0.22
308	0.19
309	0.14
310	0.13
311	0.12
312	0.08
313	0.09
314	0.09
315	0.09
316	0.09
317	0.09
318	0.1
319	0.1
320	0.12
321	0.17
322	0.21
323	0.28
324	0.38
325	0.46
326	0.52
327	0.62
328	0.71
329	0.76
330	0.83
331	0.85
332	0.84
333	0.88
334	0.86
335	0.85
336	0.84
337	0.8
338	0.74
339	0.67
340	0.58
341	0.48
342	0.42
343	0.34
344	0.25
345	0.19
346	0.16
347	0.15
348	0.18
349	0.19
350	0.17
351	0.15
352	0.15
353	0.16
354	0.14
355	0.13
356	0.11
357	0.1
358	0.17
359	0.17
360	0.17
361	0.16
362	0.16
363	0.16
364	0.2
365	0.2
366	0.15
367	0.16
368	0.17
369	0.19
370	0.21
371	0.21
372	0.18
373	0.18
374	0.16
375	0.18
376	0.17
377	0.15
378	0.13
379	0.13
380	0.12
381	0.14
382	0.16
383	0.13
384	0.13
385	0.16
386	0.19
387	0.25
388	0.25
389	0.24
390	0.22
391	0.29
392	0.35
393	0.33
394	0.32
395	0.29
396	0.33
397	0.37
398	0.37
399	0.33
400	0.3
401	0.34
402	0.33
403	0.34
404	0.31
405	0.28
406	0.28
407	0.32
408	0.35
409	0.34
410	0.37
411	0.37
412	0.38
413	0.39
414	0.38
415	0.36
416	0.34
417	0.37
418	0.37
419	0.43
420	0.49
421	0.55
422	0.56
423	0.58
424	0.6
425	0.61
426	0.66
427	0.67
428	0.68
429	0.68
430	0.7
431	0.7
432	0.71
433	0.63
434	0.57
435	0.5
436	0.45
437	0.36
438	0.33
439	0.26
440	0.2
441	0.19
442	0.15
443	0.14
444	0.11
445	0.14
446	0.14
447	0.15
448	0.17
449	0.17
450	0.24
451	0.27
452	0.3
453	0.36
454	0.4
455	0.48
456	0.55
457	0.62
458	0.62
459	0.63
460	0.64
461	0.6
462	0.61
463	0.55
464	0.48
465	0.4
466	0.32
467	0.25
468	0.2
469	0.15
470	0.07
471	0.05
472	0.07
473	0.13
474	0.13
475	0.14
476	0.16
477	0.18
478	0.21
479	0.27
480	0.3
481	0.34
482	0.41
483	0.45
484	0.51
485	0.56
486	0.61
487	0.6
488	0.59
489	0.55
490	0.54
491	0.52
492	0.46
493	0.43
494	0.37
495	0.35
496	0.36
497	0.32
498	0.26
499	0.24
500	0.23
501	0.28
502	0.33
503	0.39
504	0.39
505	0.44
506	0.49
507	0.51
508	0.52
509	0.46
510	0.41
511	0.35
512	0.33
513	0.33
514	0.28
515	0.27
516	0.27
517	0.32
518	0.41
519	0.45
520	0.47
521	0.49
522	0.56
523	0.62
524	0.65
525	0.66
526	0.67
527	0.68
528	0.68
529	0.65
530	0.67
531	0.64
532	0.63
533	0.55
534	0.48
535	0.41
536	0.38
537	0.38
538	0.31
539	0.32
540	0.31
541	0.32
542	0.31
543	0.28
544	0.26
545	0.22
546	0.21
547	0.15
548	0.16
549	0.15
550	0.12
551	0.13
552	0.14
553	0.16
554	0.16
555	0.18
556	0.2
557	0.25
558	0.34

A0A1Y2BNN1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer