Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4R0T1

Protein Details
Accession C4R0T1    Localization Confidence High Confidence Score 18.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-24MPPKRKGSKKKPKADSGTKTNGRVBasic
102-128PLNESPVKRNPKQKRRSSLSNRGKRVSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
3-14PKRKGSKKKPKA
109-124KRNPKQKRRSSLSNRG
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013218  Dsn1/Mis13  
Gene Ontology GO:0000444  C:MIS12/MIND type complex  
GO:0051301  P:cell division  
GO:0007059  P:chromosome segregation  
KEGG ppa:PAS_chr2-1_0475  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08202  MIS13  
Amino Acid Sequences MPPKRKGSKKKPKADSGTKTNGRVNLTSNASSILKKAKQANSSLSQLLQNSHPLLDNIDELNEHTRHSQRFEEDEGFVFKRLKKDSDDDVEYTEASRSMILPLNESPVKRNPKQKRRSSLSNRGKRVSSIGNGFTGTPHDDVEIKHFHKHLDESLPEPHRMRQLLIWTGKRLLKKKQTHKDNTIVNIAKVIKEELIRDLIDGKLNTSWWNRVDSDEEDEFDVTTFLPNQQNETNKKNLALLQHSLEQLKEEEKVWEEKLRQLTGTLALSPDISSVDVSNNETCSKTQETVSRLEKKVEEIGESIDIPLEKKLDLFADYTHKLRSIERTSRIYIDNKSNEIASLLSKKQEMKELPQDLLKAISRIDRS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.92
2 0.9
3 0.88
4 0.88
5 0.84
6 0.79
7 0.73
8 0.67
9 0.61
10 0.53
11 0.48
12 0.44
13 0.43
14 0.39
15 0.34
16 0.33
17 0.3
18 0.29
19 0.28
20 0.3
21 0.28
22 0.32
23 0.41
24 0.44
25 0.48
26 0.53
27 0.57
28 0.53
29 0.55
30 0.5
31 0.43
32 0.39
33 0.35
34 0.32
35 0.27
36 0.25
37 0.22
38 0.21
39 0.21
40 0.18
41 0.18
42 0.17
43 0.17
44 0.13
45 0.13
46 0.12
47 0.12
48 0.18
49 0.16
50 0.16
51 0.19
52 0.24
53 0.26
54 0.3
55 0.33
56 0.32
57 0.35
58 0.39
59 0.38
60 0.34
61 0.33
62 0.34
63 0.3
64 0.28
65 0.28
66 0.25
67 0.29
68 0.31
69 0.33
70 0.33
71 0.37
72 0.42
73 0.46
74 0.47
75 0.41
76 0.4
77 0.37
78 0.33
79 0.28
80 0.21
81 0.14
82 0.1
83 0.09
84 0.07
85 0.09
86 0.13
87 0.12
88 0.14
89 0.15
90 0.2
91 0.22
92 0.22
93 0.24
94 0.28
95 0.37
96 0.4
97 0.5
98 0.55
99 0.64
100 0.74
101 0.8
102 0.82
103 0.81
104 0.87
105 0.87
106 0.87
107 0.87
108 0.86
109 0.82
110 0.75
111 0.68
112 0.57
113 0.51
114 0.44
115 0.37
116 0.32
117 0.28
118 0.25
119 0.25
120 0.24
121 0.2
122 0.17
123 0.15
124 0.11
125 0.1
126 0.1
127 0.11
128 0.11
129 0.15
130 0.2
131 0.19
132 0.22
133 0.22
134 0.22
135 0.23
136 0.24
137 0.23
138 0.22
139 0.21
140 0.21
141 0.27
142 0.29
143 0.29
144 0.29
145 0.28
146 0.27
147 0.26
148 0.25
149 0.2
150 0.22
151 0.27
152 0.31
153 0.3
154 0.27
155 0.31
156 0.33
157 0.36
158 0.35
159 0.37
160 0.42
161 0.5
162 0.59
163 0.65
164 0.72
165 0.75
166 0.77
167 0.75
168 0.69
169 0.62
170 0.59
171 0.5
172 0.4
173 0.35
174 0.29
175 0.23
176 0.19
177 0.17
178 0.11
179 0.11
180 0.12
181 0.1
182 0.11
183 0.11
184 0.1
185 0.11
186 0.1
187 0.12
188 0.11
189 0.11
190 0.09
191 0.1
192 0.13
193 0.13
194 0.16
195 0.15
196 0.18
197 0.17
198 0.18
199 0.21
200 0.2
201 0.24
202 0.21
203 0.2
204 0.18
205 0.17
206 0.16
207 0.13
208 0.11
209 0.06
210 0.06
211 0.06
212 0.08
213 0.12
214 0.12
215 0.15
216 0.19
217 0.26
218 0.3
219 0.34
220 0.36
221 0.33
222 0.34
223 0.32
224 0.31
225 0.29
226 0.28
227 0.26
228 0.24
229 0.25
230 0.26
231 0.25
232 0.22
233 0.19
234 0.16
235 0.15
236 0.13
237 0.11
238 0.12
239 0.14
240 0.17
241 0.18
242 0.22
243 0.22
244 0.26
245 0.31
246 0.3
247 0.28
248 0.26
249 0.25
250 0.23
251 0.22
252 0.17
253 0.12
254 0.11
255 0.11
256 0.11
257 0.1
258 0.07
259 0.07
260 0.06
261 0.07
262 0.08
263 0.09
264 0.12
265 0.13
266 0.14
267 0.15
268 0.16
269 0.16
270 0.19
271 0.21
272 0.2
273 0.23
274 0.26
275 0.28
276 0.35
277 0.43
278 0.47
279 0.45
280 0.47
281 0.45
282 0.42
283 0.45
284 0.39
285 0.32
286 0.24
287 0.25
288 0.23
289 0.22
290 0.18
291 0.14
292 0.13
293 0.12
294 0.13
295 0.11
296 0.1
297 0.1
298 0.11
299 0.11
300 0.12
301 0.13
302 0.14
303 0.2
304 0.23
305 0.25
306 0.25
307 0.26
308 0.26
309 0.28
310 0.35
311 0.37
312 0.43
313 0.48
314 0.52
315 0.53
316 0.55
317 0.57
318 0.53
319 0.49
320 0.51
321 0.49
322 0.46
323 0.44
324 0.4
325 0.36
326 0.31
327 0.26
328 0.21
329 0.22
330 0.22
331 0.24
332 0.27
333 0.3
334 0.32
335 0.4
336 0.4
337 0.42
338 0.5
339 0.51
340 0.51
341 0.5
342 0.48
343 0.4
344 0.41
345 0.35
346 0.26
347 0.23