Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2CSM8

Protein Details
Accession A0A1Y2CSM8    Localization Confidence High Confidence Score 16.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
59-81KTWFSNWRSKNKKEGNPPPPLPHHydrophilic
285-309SSSSSSSARPKPKSKKELARAAKLIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
293-318RPKPKSKKELARAAKLIMGTLKKLKR
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 15
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR001356  Homeobox_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00046  Homeodomain  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50071  HOMEOBOX_2  
CDD cd00086  homeodomain  
Amino Acid Sequences MTDLDASTPTSGSTSVPLQRFRADQAQILKGYYELNPRPSAEEVKVIAEEVQESAQKVKTWFSNWRSKNKKEGNPPPPLPHQMHALATASSVSGTPPPAAPKPPASDDIPAEPLVVDSVKIRPPPKRITNLSSQALQQLQQHASPTPTPEVSFMPANLLASYPPPPDPIPAHLLPPNGIFNITSLMRSTYFTPVTTEDFEVKRRRKLDDEAASNVVAAQKKGMPPAPAKSGGGSVTASIINAGMNYHAHNQLPSVAPTALPVFHQPTPQPPPQQQHLYVPPASVSSSSSSSARPKPKSKKELARAAKLIMGTLKKLKRANNGHINPEAVLLLQQAKNLGLIPHNAGLDGDDDMGLNDSSSDSSSSGSSSSGSDSDSSSGSDSGSGSSSGSSSGSDDEMQY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.24
3 0.29
4 0.32
5 0.34
6 0.38
7 0.39
8 0.41
9 0.44
10 0.39
11 0.39
12 0.42
13 0.45
14 0.42
15 0.41
16 0.35
17 0.28
18 0.28
19 0.26
20 0.29
21 0.27
22 0.31
23 0.34
24 0.34
25 0.37
26 0.39
27 0.4
28 0.33
29 0.34
30 0.3
31 0.29
32 0.28
33 0.25
34 0.22
35 0.18
36 0.16
37 0.12
38 0.12
39 0.12
40 0.12
41 0.15
42 0.16
43 0.19
44 0.19
45 0.22
46 0.25
47 0.28
48 0.37
49 0.41
50 0.49
51 0.53
52 0.63
53 0.68
54 0.7
55 0.75
56 0.76
57 0.78
58 0.78
59 0.82
60 0.81
61 0.82
62 0.81
63 0.76
64 0.73
65 0.71
66 0.63
67 0.54
68 0.5
69 0.43
70 0.39
71 0.34
72 0.29
73 0.22
74 0.18
75 0.17
76 0.11
77 0.09
78 0.08
79 0.07
80 0.07
81 0.08
82 0.09
83 0.1
84 0.15
85 0.17
86 0.2
87 0.23
88 0.26
89 0.3
90 0.32
91 0.34
92 0.32
93 0.33
94 0.32
95 0.32
96 0.29
97 0.24
98 0.21
99 0.18
100 0.15
101 0.12
102 0.1
103 0.08
104 0.07
105 0.1
106 0.13
107 0.17
108 0.21
109 0.26
110 0.33
111 0.42
112 0.49
113 0.54
114 0.57
115 0.58
116 0.63
117 0.64
118 0.59
119 0.52
120 0.44
121 0.39
122 0.34
123 0.31
124 0.24
125 0.22
126 0.21
127 0.2
128 0.21
129 0.18
130 0.19
131 0.19
132 0.19
133 0.16
134 0.16
135 0.15
136 0.16
137 0.16
138 0.16
139 0.16
140 0.13
141 0.13
142 0.12
143 0.12
144 0.11
145 0.1
146 0.07
147 0.08
148 0.1
149 0.09
150 0.1
151 0.11
152 0.12
153 0.14
154 0.15
155 0.17
156 0.21
157 0.2
158 0.22
159 0.22
160 0.22
161 0.2
162 0.2
163 0.18
164 0.13
165 0.12
166 0.1
167 0.08
168 0.1
169 0.09
170 0.08
171 0.07
172 0.09
173 0.09
174 0.1
175 0.11
176 0.13
177 0.13
178 0.13
179 0.14
180 0.15
181 0.16
182 0.17
183 0.16
184 0.15
185 0.16
186 0.21
187 0.28
188 0.29
189 0.33
190 0.34
191 0.36
192 0.36
193 0.41
194 0.45
195 0.44
196 0.45
197 0.42
198 0.41
199 0.38
200 0.34
201 0.29
202 0.22
203 0.15
204 0.11
205 0.09
206 0.1
207 0.11
208 0.14
209 0.16
210 0.16
211 0.18
212 0.21
213 0.25
214 0.24
215 0.23
216 0.22
217 0.21
218 0.18
219 0.17
220 0.13
221 0.09
222 0.09
223 0.09
224 0.08
225 0.06
226 0.06
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.04
231 0.05
232 0.06
233 0.09
234 0.1
235 0.11
236 0.11
237 0.11
238 0.13
239 0.14
240 0.14
241 0.14
242 0.12
243 0.12
244 0.13
245 0.13
246 0.11
247 0.1
248 0.12
249 0.13
250 0.14
251 0.17
252 0.17
253 0.23
254 0.29
255 0.34
256 0.37
257 0.39
258 0.43
259 0.47
260 0.53
261 0.48
262 0.47
263 0.48
264 0.47
265 0.42
266 0.37
267 0.3
268 0.25
269 0.23
270 0.17
271 0.13
272 0.11
273 0.12
274 0.14
275 0.14
276 0.16
277 0.23
278 0.3
279 0.38
280 0.42
281 0.51
282 0.6
283 0.7
284 0.77
285 0.8
286 0.83
287 0.83
288 0.87
289 0.84
290 0.82
291 0.74
292 0.65
293 0.57
294 0.47
295 0.38
296 0.32
297 0.26
298 0.2
299 0.26
300 0.28
301 0.32
302 0.37
303 0.42
304 0.48
305 0.55
306 0.62
307 0.65
308 0.66
309 0.65
310 0.63
311 0.58
312 0.48
313 0.4
314 0.3
315 0.19
316 0.15
317 0.11
318 0.14
319 0.13
320 0.13
321 0.14
322 0.14
323 0.14
324 0.15
325 0.15
326 0.12
327 0.14
328 0.16
329 0.18
330 0.18
331 0.17
332 0.16
333 0.15
334 0.14
335 0.13
336 0.1
337 0.07
338 0.07
339 0.07
340 0.09
341 0.08
342 0.07
343 0.06
344 0.07
345 0.07
346 0.08
347 0.09
348 0.08
349 0.09
350 0.1
351 0.1
352 0.1
353 0.1
354 0.1
355 0.1
356 0.12
357 0.11
358 0.12
359 0.13
360 0.13
361 0.15
362 0.14
363 0.15
364 0.14
365 0.14
366 0.12
367 0.13
368 0.12
369 0.11
370 0.12
371 0.11
372 0.1
373 0.1
374 0.1
375 0.1
376 0.1
377 0.09
378 0.09
379 0.11
380 0.13