Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2D007

Protein Details
Accession A0A1Y2D007    Localization Confidence Low Confidence Score 7.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
5-26NTNTVLTRPKYPPNRPNHRFSGHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 14, nucl 9.5, cyto_nucl 8, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR001356  Homeobox_dom  
IPR007527  Znf_SWIM  
IPR039903  Zswim2  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0061630  F:ubiquitin protein ligase activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00046  Homeodomain  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50071  HOMEOBOX_2  
PS50966  ZF_SWIM  
CDD cd00086  homeodomain  
Amino Acid Sequences MNPNNTNTVLTRPKYPPNRPNHRFSGEERKLLQTAMLNGCDATLKSKDQRTELAIKLNVDEERIRQWFSNNRSKSKELLSIPPSISTPPPITSAVLSPFVPNFGITSVPPAPPSLPKEVRLEPYRPNPTHLMVERIAKAQLQRCRLVAKRIISPLHVEYKVNSSVKGTVHVCSVKEKPHCECVDFESGRNCKHLIFIFMRVLGLGPNSPILYQRALLKSELLNMFAQGAACDPTYVVSSFVSK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.67
3 0.68
4 0.71
5 0.8
6 0.78
7 0.81
8 0.8
9 0.75
10 0.68
11 0.66
12 0.67
13 0.61
14 0.62
15 0.56
16 0.52
17 0.47
18 0.43
19 0.39
20 0.3
21 0.3
22 0.28
23 0.26
24 0.22
25 0.21
26 0.21
27 0.2
28 0.17
29 0.14
30 0.13
31 0.16
32 0.22
33 0.28
34 0.31
35 0.33
36 0.36
37 0.38
38 0.42
39 0.41
40 0.42
41 0.39
42 0.36
43 0.34
44 0.33
45 0.28
46 0.23
47 0.22
48 0.16
49 0.19
50 0.21
51 0.21
52 0.19
53 0.24
54 0.3
55 0.36
56 0.45
57 0.44
58 0.49
59 0.53
60 0.55
61 0.53
62 0.49
63 0.49
64 0.42
65 0.44
66 0.41
67 0.39
68 0.37
69 0.35
70 0.31
71 0.25
72 0.23
73 0.18
74 0.17
75 0.14
76 0.16
77 0.16
78 0.16
79 0.15
80 0.16
81 0.15
82 0.15
83 0.14
84 0.12
85 0.11
86 0.11
87 0.11
88 0.09
89 0.07
90 0.06
91 0.07
92 0.06
93 0.1
94 0.11
95 0.11
96 0.12
97 0.12
98 0.12
99 0.15
100 0.18
101 0.21
102 0.22
103 0.24
104 0.28
105 0.3
106 0.35
107 0.35
108 0.34
109 0.32
110 0.38
111 0.44
112 0.4
113 0.41
114 0.38
115 0.36
116 0.38
117 0.34
118 0.3
119 0.22
120 0.25
121 0.22
122 0.21
123 0.2
124 0.16
125 0.18
126 0.2
127 0.24
128 0.26
129 0.26
130 0.26
131 0.31
132 0.33
133 0.36
134 0.35
135 0.33
136 0.34
137 0.37
138 0.37
139 0.33
140 0.34
141 0.31
142 0.31
143 0.29
144 0.24
145 0.21
146 0.24
147 0.28
148 0.26
149 0.23
150 0.18
151 0.21
152 0.21
153 0.25
154 0.21
155 0.17
156 0.2
157 0.22
158 0.21
159 0.23
160 0.25
161 0.28
162 0.32
163 0.35
164 0.35
165 0.42
166 0.43
167 0.4
168 0.39
169 0.37
170 0.41
171 0.38
172 0.36
173 0.35
174 0.37
175 0.36
176 0.36
177 0.32
178 0.23
179 0.26
180 0.26
181 0.24
182 0.24
183 0.27
184 0.27
185 0.27
186 0.27
187 0.22
188 0.21
189 0.15
190 0.13
191 0.09
192 0.08
193 0.09
194 0.09
195 0.1
196 0.11
197 0.13
198 0.14
199 0.15
200 0.21
201 0.23
202 0.25
203 0.25
204 0.26
205 0.24
206 0.3
207 0.29
208 0.25
209 0.21
210 0.2
211 0.2
212 0.18
213 0.17
214 0.1
215 0.1
216 0.1
217 0.1
218 0.09
219 0.09
220 0.09
221 0.11
222 0.12
223 0.12