Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2CBW6

Protein Details
Accession A0A1Y2CBW6    Localization Confidence High Confidence Score 18.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
9-34TTSSIRRPTSHRIPLHKKQRPLDPLCHydrophilic
219-242FSKLQTRKMKGLKRGRKNDDDGEEBasic
245-266DGEDAPEKPKKQPRKFAKKNKDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
226-235KMKGLKRGRK
251-266EKPKKQPRKFAKKNKD
Subcellular Location(s) nucl 15, mito_nucl 13.333, mito 10.5, cyto_nucl 8.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR039770  Rpf2  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0000470  P:maturation of LSU-rRNA  
GO:0000027  P:ribosomal large subunit assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MVYYSAKRTTSSIRRPTSHRIPLHKKQRPLDPLCLPLQKTPHCLTLIRTFNHEILDLVELTLRRGLPMEAFEGPKPAMGNRPTLVFNGDLWETDEEFVKIKNSLQDLLGNGNGSTHADKVNLKGLDHVISVSVDVDKTIHFRTYMIVLKKSGTKLPKVELSECGPSFEFKVGRTRFADDAVYKQAYRVPKELTVKKVKNIERDEMGDKVGRVHMENQDFSKLQTRKMKGLKRGRKNDDDGEEGGDGEDAPEKPKKQPRKFAKKNKD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.64
2 0.69
3 0.75
4 0.76
5 0.75
6 0.72
7 0.73
8 0.75
9 0.8
10 0.86
11 0.84
12 0.82
13 0.79
14 0.81
15 0.8
16 0.77
17 0.75
18 0.69
19 0.67
20 0.64
21 0.63
22 0.55
23 0.49
24 0.5
25 0.45
26 0.46
27 0.44
28 0.43
29 0.39
30 0.38
31 0.39
32 0.41
33 0.44
34 0.39
35 0.4
36 0.38
37 0.37
38 0.37
39 0.32
40 0.23
41 0.17
42 0.18
43 0.13
44 0.11
45 0.11
46 0.1
47 0.11
48 0.13
49 0.11
50 0.1
51 0.1
52 0.11
53 0.1
54 0.12
55 0.14
56 0.14
57 0.16
58 0.16
59 0.17
60 0.17
61 0.17
62 0.16
63 0.14
64 0.18
65 0.18
66 0.22
67 0.2
68 0.23
69 0.22
70 0.22
71 0.23
72 0.17
73 0.15
74 0.14
75 0.13
76 0.11
77 0.12
78 0.12
79 0.11
80 0.11
81 0.11
82 0.09
83 0.1
84 0.1
85 0.09
86 0.09
87 0.09
88 0.12
89 0.13
90 0.13
91 0.14
92 0.15
93 0.15
94 0.16
95 0.15
96 0.12
97 0.1
98 0.09
99 0.09
100 0.08
101 0.08
102 0.07
103 0.07
104 0.08
105 0.09
106 0.1
107 0.17
108 0.16
109 0.16
110 0.16
111 0.17
112 0.16
113 0.16
114 0.14
115 0.08
116 0.07
117 0.07
118 0.06
119 0.05
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.04
124 0.06
125 0.07
126 0.08
127 0.08
128 0.08
129 0.09
130 0.13
131 0.18
132 0.18
133 0.19
134 0.19
135 0.2
136 0.23
137 0.24
138 0.24
139 0.22
140 0.24
141 0.25
142 0.27
143 0.31
144 0.31
145 0.31
146 0.3
147 0.3
148 0.31
149 0.29
150 0.28
151 0.22
152 0.2
153 0.2
154 0.2
155 0.17
156 0.13
157 0.22
158 0.21
159 0.25
160 0.27
161 0.29
162 0.27
163 0.27
164 0.3
165 0.21
166 0.23
167 0.24
168 0.24
169 0.2
170 0.2
171 0.22
172 0.24
173 0.26
174 0.27
175 0.25
176 0.3
177 0.39
178 0.44
179 0.48
180 0.54
181 0.53
182 0.56
183 0.61
184 0.6
185 0.61
186 0.6
187 0.56
188 0.49
189 0.51
190 0.48
191 0.4
192 0.37
193 0.3
194 0.25
195 0.22
196 0.21
197 0.17
198 0.16
199 0.2
200 0.25
201 0.27
202 0.3
203 0.29
204 0.32
205 0.31
206 0.31
207 0.36
208 0.31
209 0.34
210 0.41
211 0.44
212 0.48
213 0.58
214 0.64
215 0.65
216 0.75
217 0.77
218 0.79
219 0.86
220 0.85
221 0.85
222 0.83
223 0.81
224 0.75
225 0.69
226 0.59
227 0.52
228 0.43
229 0.35
230 0.28
231 0.2
232 0.14
233 0.1
234 0.13
235 0.1
236 0.14
237 0.2
238 0.22
239 0.31
240 0.41
241 0.52
242 0.58
243 0.69
244 0.76
245 0.82
246 0.91