Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2BYM0

Protein Details
Accession A0A1Y2BYM0    Localization Confidence High Confidence Score 18.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
389-412GDLDREKKRVRRDEKGGDDRRDRDBasic
419-440RVDERRRDDRREYRHDDRRGERBasic
463-494RDDRDRDYRRDDRDGRRDERHRDGDRRDDRRRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
394-494EKKRVRRDEKGGDDRRDRDRDAGRGRVDERRRDDRREYRHDDRRGERSDDRGDGKRDGSRRDDRVESGRRDDRDRDYRRDDRDGRRDERHRDGDRRDDRRR
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto 10, plas 1, pero 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035542  CRIP  
IPR029000  Cyclophilin-like_dom_sf  
IPR002130  Cyclophilin-type_PPIase_dom  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003755  F:peptidyl-prolyl cis-trans isomerase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000413  P:protein peptidyl-prolyl isomerization  
Pfam View protein in Pfam  
PF00160  Pro_isomerase  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50072  CSA_PPIASE_2  
PS50102  RRM  
CDD cd12235  RRM_PPIL4  
Amino Acid Sequences MSVLLETSLGDIVIDLDTKRAPKASLNFLKLCKRKAYNYSLFHTLIKNFTATVGGDCTGDRDSGSSVWGLLDSSDSSDPTVKTNKFFEPERSTKLKHDSKGVVSFVCAQGRVGEEEKLLATSQFFFTLSESGAEYLNTQHAPFGRVVEGLEVLDALNAQLVDDDNRPFRDIRIKHTIILDDPFPDPPGLRCPSRSPSPPPQLLASARIAEDENLFPDVDPEVLEKEARDREAAARALTLEMIGDLPFAEIRPPENILFVCKLNPITRDEDLELIFSRFGEIRSCEIIRDKKTQDSLCYAFIDFEKKESAEEAYFKMDNVLIDDRRIHVDFSQSVSKLHADVLMGKRRGLVEEEEFGGAGLRRRRQYRNEDVGRDGGGRRGEEMVFEHDGDLDREKKRVRRDEKGGDDRRDRDRDAGRGRVDERRRDDRREYRHDDRRGERSDDRGDGKRDGSRRDDRVESGRRDDRDRDYRRDDRDGRRDERHRDGDRRDDRRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.07
3 0.09
4 0.12
5 0.14
6 0.16
7 0.17
8 0.18
9 0.24
10 0.31
11 0.4
12 0.47
13 0.52
14 0.55
15 0.59
16 0.68
17 0.67
18 0.65
19 0.64
20 0.6
21 0.62
22 0.66
23 0.7
24 0.7
25 0.7
26 0.69
27 0.66
28 0.62
29 0.56
30 0.51
31 0.44
32 0.37
33 0.32
34 0.27
35 0.21
36 0.2
37 0.19
38 0.16
39 0.15
40 0.14
41 0.13
42 0.13
43 0.13
44 0.14
45 0.13
46 0.13
47 0.11
48 0.1
49 0.11
50 0.11
51 0.13
52 0.11
53 0.1
54 0.1
55 0.1
56 0.09
57 0.07
58 0.08
59 0.07
60 0.1
61 0.11
62 0.11
63 0.12
64 0.16
65 0.16
66 0.19
67 0.27
68 0.26
69 0.29
70 0.33
71 0.36
72 0.37
73 0.4
74 0.44
75 0.45
76 0.49
77 0.52
78 0.55
79 0.53
80 0.55
81 0.62
82 0.61
83 0.54
84 0.57
85 0.55
86 0.54
87 0.57
88 0.53
89 0.43
90 0.36
91 0.37
92 0.32
93 0.28
94 0.22
95 0.17
96 0.17
97 0.18
98 0.2
99 0.18
100 0.15
101 0.14
102 0.15
103 0.15
104 0.14
105 0.12
106 0.09
107 0.09
108 0.09
109 0.1
110 0.1
111 0.1
112 0.1
113 0.1
114 0.11
115 0.11
116 0.1
117 0.1
118 0.09
119 0.09
120 0.09
121 0.08
122 0.09
123 0.11
124 0.1
125 0.1
126 0.11
127 0.12
128 0.14
129 0.14
130 0.14
131 0.13
132 0.12
133 0.13
134 0.12
135 0.11
136 0.09
137 0.08
138 0.06
139 0.05
140 0.05
141 0.05
142 0.03
143 0.04
144 0.04
145 0.04
146 0.04
147 0.04
148 0.07
149 0.09
150 0.11
151 0.13
152 0.14
153 0.16
154 0.15
155 0.17
156 0.25
157 0.25
158 0.3
159 0.37
160 0.38
161 0.38
162 0.4
163 0.39
164 0.31
165 0.31
166 0.25
167 0.17
168 0.16
169 0.14
170 0.13
171 0.12
172 0.11
173 0.11
174 0.16
175 0.18
176 0.18
177 0.2
178 0.24
179 0.29
180 0.35
181 0.38
182 0.39
183 0.46
184 0.53
185 0.53
186 0.49
187 0.46
188 0.44
189 0.4
190 0.35
191 0.27
192 0.2
193 0.17
194 0.17
195 0.15
196 0.12
197 0.12
198 0.09
199 0.09
200 0.09
201 0.09
202 0.08
203 0.08
204 0.08
205 0.06
206 0.06
207 0.06
208 0.06
209 0.07
210 0.07
211 0.06
212 0.1
213 0.11
214 0.12
215 0.11
216 0.11
217 0.13
218 0.17
219 0.18
220 0.15
221 0.13
222 0.13
223 0.12
224 0.11
225 0.09
226 0.05
227 0.04
228 0.04
229 0.03
230 0.03
231 0.03
232 0.03
233 0.03
234 0.03
235 0.04
236 0.04
237 0.05
238 0.06
239 0.08
240 0.08
241 0.1
242 0.1
243 0.12
244 0.13
245 0.13
246 0.12
247 0.11
248 0.13
249 0.13
250 0.15
251 0.16
252 0.18
253 0.19
254 0.2
255 0.2
256 0.19
257 0.18
258 0.17
259 0.14
260 0.11
261 0.1
262 0.08
263 0.08
264 0.07
265 0.08
266 0.09
267 0.09
268 0.11
269 0.14
270 0.15
271 0.15
272 0.2
273 0.26
274 0.28
275 0.33
276 0.33
277 0.34
278 0.4
279 0.41
280 0.38
281 0.37
282 0.35
283 0.3
284 0.29
285 0.25
286 0.2
287 0.19
288 0.21
289 0.15
290 0.15
291 0.14
292 0.13
293 0.13
294 0.13
295 0.15
296 0.12
297 0.13
298 0.13
299 0.15
300 0.15
301 0.15
302 0.15
303 0.13
304 0.12
305 0.13
306 0.16
307 0.13
308 0.14
309 0.15
310 0.16
311 0.18
312 0.19
313 0.17
314 0.13
315 0.17
316 0.17
317 0.2
318 0.24
319 0.21
320 0.2
321 0.21
322 0.21
323 0.17
324 0.16
325 0.14
326 0.09
327 0.15
328 0.22
329 0.28
330 0.28
331 0.28
332 0.29
333 0.28
334 0.29
335 0.25
336 0.22
337 0.17
338 0.19
339 0.2
340 0.18
341 0.17
342 0.16
343 0.15
344 0.12
345 0.14
346 0.17
347 0.21
348 0.27
349 0.33
350 0.4
351 0.48
352 0.56
353 0.63
354 0.68
355 0.71
356 0.68
357 0.65
358 0.6
359 0.53
360 0.45
361 0.35
362 0.28
363 0.23
364 0.2
365 0.18
366 0.19
367 0.17
368 0.16
369 0.18
370 0.18
371 0.17
372 0.17
373 0.16
374 0.15
375 0.16
376 0.16
377 0.18
378 0.19
379 0.19
380 0.24
381 0.3
382 0.35
383 0.44
384 0.54
385 0.58
386 0.63
387 0.71
388 0.76
389 0.81
390 0.86
391 0.85
392 0.82
393 0.81
394 0.76
395 0.75
396 0.7
397 0.62
398 0.59
399 0.56
400 0.57
401 0.56
402 0.59
403 0.53
404 0.53
405 0.54
406 0.56
407 0.58
408 0.57
409 0.58
410 0.61
411 0.65
412 0.67
413 0.74
414 0.74
415 0.77
416 0.78
417 0.79
418 0.79
419 0.83
420 0.83
421 0.82
422 0.8
423 0.79
424 0.75
425 0.73
426 0.66
427 0.64
428 0.61
429 0.58
430 0.57
431 0.55
432 0.53
433 0.49
434 0.49
435 0.49
436 0.48
437 0.48
438 0.51
439 0.53
440 0.55
441 0.58
442 0.58
443 0.56
444 0.6
445 0.64
446 0.61
447 0.61
448 0.62
449 0.59
450 0.61
451 0.63
452 0.63
453 0.64
454 0.66
455 0.66
456 0.68
457 0.72
458 0.73
459 0.78
460 0.77
461 0.77
462 0.8
463 0.8
464 0.78
465 0.8
466 0.82
467 0.79
468 0.81
469 0.8
470 0.79
471 0.79
472 0.79
473 0.8
474 0.82