Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2CQS9

Protein Details
Accession A0A1Y2CQS9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
96-124GDDQSAGKKPQQPKKKPQKTLHTPRLFTAHydrophilic
694-724KVTTHNKRKVDDKKSKPIEKKTPTKNSHSSEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
107-111QPKKK
705-713DKKSKPIEK
Subcellular Location(s) cyto 10, plas 6, cyto_nucl 6, extr 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR046351  UTP4  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0030686  C:90S preribosome  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
Amino Acid Sequences MKEAERTPLQIHRCRFVEYVPSAINSLSFISKDVKRPLLACARANGDIEIWNPISWHIERTIPGITGAGSIESIAWIPVVDEDDDEDDDDEDDVEGDDQSAGKKPQQPKKKPQKTLHTPRLFTAGLDGFITEWDLVTLAPISRVESGGGAIWSMAVSPLGKKLRLVVKTGVFEFSRLLQLDRKTLLFTKRHATVKIVHRILSVAFHPTKPIISAGSSDSCIRSYSTQNYRLLHRLTVDTGKRREETLVWALTYLPSGTLVSGDSIGAVSFFDDESHTLMKSVKSHYADVLCLAAGSQGDVVYSSGVDRRVLQYRLTKKPLFRQNWVLSGDRRFHSHDVRALALCETKPIDSLVSGGMDATFVISKTISQFPDSKQQRQSPFPQKSLISLADEGRLLMARFDDSVKVWALGQSIATAEELQGGVQFGERLGVAQKERLVAELKIKCTTNLIASAISSDGALIAVSDLFSTKLFAVFIDPSRVFRVKKFPSPSLIPGSVSITFTPDSKRLILAGTDSIIRVIDVSDPSVDEFEIVAVFTEHRGKLRSQSNAMAGVEGPSAPKHIGAELITSLTVSTDCQWLASGDMANRVNVYTLDGLKHHATIPQLQAQHTSLAFSFNTANLIVTLNSNEIFIYDAEHARLTDWSRNNSHTLPKHFLERTDTIMGASSCETAPQKIVVWGALYLACLDTNKSIVKVTTHNKRKVDDKKSKPIEKKTPTKNSHSSEDSDGAAEGWDIKGGAFSIQFNYGPTMFFGFLAGGEEAVVVERPVLSVMDALPSGFYRKTFSA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.5
3 0.45
4 0.46
5 0.4
6 0.42
7 0.36
8 0.35
9 0.31
10 0.29
11 0.26
12 0.18
13 0.18
14 0.14
15 0.12
16 0.13
17 0.19
18 0.23
19 0.31
20 0.37
21 0.4
22 0.41
23 0.42
24 0.48
25 0.52
26 0.52
27 0.48
28 0.45
29 0.45
30 0.44
31 0.45
32 0.37
33 0.28
34 0.25
35 0.23
36 0.23
37 0.19
38 0.17
39 0.16
40 0.16
41 0.2
42 0.19
43 0.2
44 0.18
45 0.2
46 0.21
47 0.24
48 0.25
49 0.21
50 0.2
51 0.18
52 0.16
53 0.14
54 0.13
55 0.1
56 0.08
57 0.07
58 0.07
59 0.07
60 0.07
61 0.05
62 0.05
63 0.05
64 0.05
65 0.06
66 0.08
67 0.08
68 0.08
69 0.1
70 0.12
71 0.12
72 0.13
73 0.12
74 0.11
75 0.11
76 0.11
77 0.09
78 0.07
79 0.07
80 0.07
81 0.07
82 0.06
83 0.06
84 0.06
85 0.07
86 0.08
87 0.13
88 0.14
89 0.19
90 0.27
91 0.36
92 0.45
93 0.56
94 0.65
95 0.72
96 0.82
97 0.87
98 0.9
99 0.91
100 0.92
101 0.92
102 0.93
103 0.93
104 0.91
105 0.82
106 0.73
107 0.69
108 0.58
109 0.46
110 0.41
111 0.31
112 0.22
113 0.2
114 0.19
115 0.13
116 0.13
117 0.14
118 0.08
119 0.06
120 0.05
121 0.05
122 0.05
123 0.06
124 0.07
125 0.06
126 0.07
127 0.08
128 0.09
129 0.1
130 0.11
131 0.11
132 0.1
133 0.1
134 0.1
135 0.1
136 0.08
137 0.07
138 0.06
139 0.06
140 0.05
141 0.05
142 0.04
143 0.05
144 0.06
145 0.13
146 0.17
147 0.17
148 0.18
149 0.24
150 0.31
151 0.33
152 0.36
153 0.35
154 0.37
155 0.4
156 0.41
157 0.38
158 0.3
159 0.28
160 0.25
161 0.21
162 0.2
163 0.18
164 0.18
165 0.2
166 0.22
167 0.25
168 0.26
169 0.25
170 0.24
171 0.28
172 0.34
173 0.33
174 0.34
175 0.36
176 0.41
177 0.44
178 0.43
179 0.41
180 0.42
181 0.47
182 0.54
183 0.5
184 0.43
185 0.39
186 0.39
187 0.36
188 0.3
189 0.22
190 0.19
191 0.19
192 0.18
193 0.19
194 0.19
195 0.19
196 0.18
197 0.18
198 0.12
199 0.11
200 0.13
201 0.14
202 0.15
203 0.16
204 0.16
205 0.16
206 0.15
207 0.15
208 0.15
209 0.15
210 0.18
211 0.25
212 0.32
213 0.38
214 0.42
215 0.43
216 0.46
217 0.49
218 0.46
219 0.38
220 0.33
221 0.28
222 0.26
223 0.31
224 0.33
225 0.35
226 0.36
227 0.39
228 0.38
229 0.37
230 0.36
231 0.3
232 0.3
233 0.29
234 0.27
235 0.23
236 0.22
237 0.21
238 0.19
239 0.18
240 0.12
241 0.07
242 0.05
243 0.06
244 0.05
245 0.05
246 0.06
247 0.06
248 0.06
249 0.06
250 0.05
251 0.05
252 0.05
253 0.04
254 0.04
255 0.03
256 0.04
257 0.04
258 0.04
259 0.05
260 0.06
261 0.08
262 0.09
263 0.08
264 0.09
265 0.11
266 0.12
267 0.15
268 0.17
269 0.21
270 0.23
271 0.24
272 0.25
273 0.25
274 0.24
275 0.21
276 0.18
277 0.12
278 0.09
279 0.08
280 0.06
281 0.05
282 0.05
283 0.04
284 0.04
285 0.04
286 0.04
287 0.05
288 0.04
289 0.04
290 0.04
291 0.06
292 0.07
293 0.08
294 0.08
295 0.12
296 0.17
297 0.18
298 0.22
299 0.28
300 0.35
301 0.43
302 0.48
303 0.49
304 0.47
305 0.55
306 0.61
307 0.58
308 0.54
309 0.56
310 0.53
311 0.54
312 0.54
313 0.47
314 0.4
315 0.39
316 0.38
317 0.3
318 0.29
319 0.27
320 0.28
321 0.29
322 0.3
323 0.3
324 0.27
325 0.28
326 0.26
327 0.23
328 0.21
329 0.18
330 0.14
331 0.12
332 0.11
333 0.09
334 0.09
335 0.09
336 0.08
337 0.07
338 0.08
339 0.07
340 0.06
341 0.06
342 0.05
343 0.05
344 0.04
345 0.04
346 0.04
347 0.03
348 0.03
349 0.04
350 0.04
351 0.04
352 0.07
353 0.11
354 0.11
355 0.13
356 0.15
357 0.17
358 0.27
359 0.31
360 0.34
361 0.37
362 0.43
363 0.46
364 0.48
365 0.55
366 0.56
367 0.57
368 0.53
369 0.5
370 0.44
371 0.41
372 0.4
373 0.31
374 0.23
375 0.19
376 0.17
377 0.15
378 0.14
379 0.12
380 0.09
381 0.08
382 0.07
383 0.05
384 0.05
385 0.04
386 0.05
387 0.06
388 0.06
389 0.06
390 0.08
391 0.08
392 0.08
393 0.08
394 0.08
395 0.08
396 0.08
397 0.07
398 0.06
399 0.06
400 0.06
401 0.06
402 0.05
403 0.04
404 0.05
405 0.05
406 0.04
407 0.04
408 0.04
409 0.04
410 0.04
411 0.04
412 0.03
413 0.04
414 0.04
415 0.04
416 0.05
417 0.07
418 0.07
419 0.09
420 0.1
421 0.11
422 0.11
423 0.12
424 0.13
425 0.12
426 0.2
427 0.22
428 0.23
429 0.24
430 0.24
431 0.23
432 0.23
433 0.23
434 0.16
435 0.14
436 0.13
437 0.11
438 0.11
439 0.11
440 0.09
441 0.08
442 0.07
443 0.05
444 0.04
445 0.03
446 0.03
447 0.03
448 0.03
449 0.02
450 0.03
451 0.03
452 0.03
453 0.04
454 0.04
455 0.05
456 0.05
457 0.06
458 0.06
459 0.06
460 0.08
461 0.09
462 0.1
463 0.15
464 0.15
465 0.16
466 0.2
467 0.23
468 0.22
469 0.24
470 0.33
471 0.33
472 0.4
473 0.45
474 0.43
475 0.45
476 0.48
477 0.49
478 0.45
479 0.41
480 0.33
481 0.28
482 0.28
483 0.24
484 0.21
485 0.17
486 0.13
487 0.12
488 0.13
489 0.14
490 0.14
491 0.15
492 0.14
493 0.15
494 0.13
495 0.14
496 0.13
497 0.12
498 0.11
499 0.1
500 0.09
501 0.09
502 0.09
503 0.08
504 0.07
505 0.06
506 0.05
507 0.07
508 0.07
509 0.07
510 0.07
511 0.08
512 0.08
513 0.09
514 0.08
515 0.06
516 0.06
517 0.05
518 0.05
519 0.05
520 0.04
521 0.04
522 0.05
523 0.06
524 0.1
525 0.1
526 0.12
527 0.14
528 0.15
529 0.22
530 0.29
531 0.33
532 0.32
533 0.35
534 0.36
535 0.37
536 0.36
537 0.29
538 0.23
539 0.18
540 0.15
541 0.12
542 0.1
543 0.07
544 0.08
545 0.08
546 0.08
547 0.07
548 0.08
549 0.09
550 0.09
551 0.11
552 0.1
553 0.1
554 0.09
555 0.09
556 0.08
557 0.07
558 0.06
559 0.06
560 0.06
561 0.08
562 0.08
563 0.08
564 0.08
565 0.08
566 0.09
567 0.1
568 0.11
569 0.09
570 0.15
571 0.16
572 0.15
573 0.15
574 0.15
575 0.14
576 0.12
577 0.14
578 0.11
579 0.11
580 0.12
581 0.13
582 0.16
583 0.16
584 0.17
585 0.15
586 0.15
587 0.16
588 0.2
589 0.23
590 0.25
591 0.26
592 0.26
593 0.28
594 0.27
595 0.28
596 0.23
597 0.2
598 0.15
599 0.16
600 0.15
601 0.13
602 0.13
603 0.11
604 0.12
605 0.11
606 0.11
607 0.09
608 0.1
609 0.09
610 0.09
611 0.1
612 0.1
613 0.1
614 0.09
615 0.09
616 0.08
617 0.09
618 0.08
619 0.09
620 0.1
621 0.11
622 0.12
623 0.13
624 0.13
625 0.12
626 0.16
627 0.16
628 0.22
629 0.26
630 0.31
631 0.34
632 0.37
633 0.4
634 0.41
635 0.46
636 0.46
637 0.48
638 0.48
639 0.47
640 0.52
641 0.49
642 0.48
643 0.46
644 0.41
645 0.4
646 0.37
647 0.35
648 0.27
649 0.29
650 0.26
651 0.2
652 0.19
653 0.14
654 0.11
655 0.15
656 0.16
657 0.13
658 0.15
659 0.15
660 0.16
661 0.16
662 0.17
663 0.15
664 0.15
665 0.14
666 0.13
667 0.12
668 0.11
669 0.09
670 0.09
671 0.09
672 0.08
673 0.09
674 0.09
675 0.12
676 0.13
677 0.14
678 0.15
679 0.16
680 0.19
681 0.26
682 0.33
683 0.41
684 0.5
685 0.57
686 0.6
687 0.63
688 0.7
689 0.72
690 0.74
691 0.74
692 0.74
693 0.77
694 0.83
695 0.89
696 0.88
697 0.89
698 0.88
699 0.88
700 0.88
701 0.88
702 0.88
703 0.85
704 0.85
705 0.84
706 0.79
707 0.76
708 0.7
709 0.64
710 0.58
711 0.53
712 0.45
713 0.36
714 0.3
715 0.23
716 0.18
717 0.14
718 0.1
719 0.08
720 0.07
721 0.07
722 0.06
723 0.07
724 0.07
725 0.09
726 0.09
727 0.1
728 0.12
729 0.15
730 0.16
731 0.16
732 0.19
733 0.18
734 0.18
735 0.18
736 0.19
737 0.16
738 0.16
739 0.15
740 0.12
741 0.11
742 0.14
743 0.12
744 0.09
745 0.08
746 0.08
747 0.07
748 0.08
749 0.08
750 0.05
751 0.06
752 0.06
753 0.06
754 0.07
755 0.07
756 0.07
757 0.08
758 0.08
759 0.11
760 0.11
761 0.1
762 0.11
763 0.12
764 0.15
765 0.15
766 0.15