Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2C5I1

Protein Details
Accession A0A1Y2C5I1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
268-293LPDTLKSKKTTKRTKQAEKDEKRLYCHydrophilic
434-460KSSFSRTSLEHRRKKKVWSVNGSSGTVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 12, nucl 9.5, cyto_nucl 7, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006941  RNase_CAF1  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04857  CAF1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MEATRVTRFNIGALSPRLRLELSRASFISFDCEFTGLGDSAATRAQDLRVRYAALRTTATTRGLVSFGVAAFQQGKDDSADDSAAALDFCVTSMGNVVFEPAAAAFLSDHNFDFNKHWKDAVPFKPGNDSSDHSLPGTPNQLIRDLFVYILSLNVPIVIHNGLLDLMFIYQSFYAELPEELDTFVADLADMFPAGLVDTKFVADYVTRERASFLGYLFRKYERKMLKSYHPYLSLSPAIQVNPSVPASILLPNGQISATLSFKLLTKLPDTLKSKKTTKRTKQAEKDEKRLYCVQYASHGYCPNGPACHKSHDLDTILDAEELEAQLNQRKKSKSLTDGSIDPVTVPTTTSNTASATASTELTPIPIQSQTPLPPITPSLFETYHSACFDAYMTGYVFSVQQRMHPSESISEFVKAHGNKLYLMGKDVPLHIVKSSFSRTSLEHRRKKKVWSVNGSSGTVSGIAK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.3
3 0.31
4 0.31
5 0.29
6 0.29
7 0.28
8 0.32
9 0.32
10 0.35
11 0.35
12 0.34
13 0.34
14 0.33
15 0.32
16 0.23
17 0.21
18 0.17
19 0.17
20 0.16
21 0.16
22 0.19
23 0.13
24 0.13
25 0.11
26 0.1
27 0.1
28 0.12
29 0.11
30 0.09
31 0.1
32 0.14
33 0.18
34 0.2
35 0.25
36 0.25
37 0.27
38 0.28
39 0.31
40 0.31
41 0.3
42 0.3
43 0.26
44 0.28
45 0.29
46 0.3
47 0.26
48 0.24
49 0.22
50 0.2
51 0.18
52 0.15
53 0.13
54 0.11
55 0.1
56 0.09
57 0.09
58 0.1
59 0.1
60 0.11
61 0.1
62 0.11
63 0.11
64 0.12
65 0.12
66 0.12
67 0.12
68 0.1
69 0.1
70 0.09
71 0.08
72 0.07
73 0.06
74 0.05
75 0.05
76 0.05
77 0.05
78 0.05
79 0.04
80 0.07
81 0.08
82 0.08
83 0.08
84 0.09
85 0.08
86 0.08
87 0.08
88 0.05
89 0.06
90 0.05
91 0.05
92 0.05
93 0.07
94 0.08
95 0.09
96 0.09
97 0.11
98 0.11
99 0.13
100 0.17
101 0.25
102 0.29
103 0.28
104 0.3
105 0.3
106 0.36
107 0.44
108 0.45
109 0.45
110 0.41
111 0.41
112 0.48
113 0.47
114 0.43
115 0.37
116 0.33
117 0.3
118 0.31
119 0.31
120 0.23
121 0.24
122 0.23
123 0.22
124 0.23
125 0.18
126 0.18
127 0.18
128 0.21
129 0.19
130 0.2
131 0.18
132 0.15
133 0.14
134 0.12
135 0.11
136 0.07
137 0.08
138 0.07
139 0.05
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.06
145 0.06
146 0.06
147 0.05
148 0.06
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.04
156 0.04
157 0.04
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.06
162 0.06
163 0.07
164 0.07
165 0.08
166 0.08
167 0.07
168 0.07
169 0.06
170 0.06
171 0.06
172 0.04
173 0.03
174 0.03
175 0.03
176 0.03
177 0.03
178 0.03
179 0.03
180 0.03
181 0.03
182 0.05
183 0.04
184 0.05
185 0.05
186 0.06
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.05
191 0.07
192 0.11
193 0.16
194 0.16
195 0.16
196 0.17
197 0.17
198 0.18
199 0.17
200 0.13
201 0.16
202 0.16
203 0.18
204 0.18
205 0.22
206 0.22
207 0.23
208 0.31
209 0.29
210 0.33
211 0.36
212 0.39
213 0.45
214 0.51
215 0.54
216 0.5
217 0.45
218 0.42
219 0.38
220 0.37
221 0.29
222 0.21
223 0.17
224 0.15
225 0.13
226 0.12
227 0.11
228 0.08
229 0.09
230 0.09
231 0.08
232 0.07
233 0.07
234 0.08
235 0.09
236 0.09
237 0.08
238 0.08
239 0.08
240 0.08
241 0.08
242 0.06
243 0.06
244 0.07
245 0.07
246 0.07
247 0.07
248 0.08
249 0.09
250 0.1
251 0.11
252 0.11
253 0.12
254 0.15
255 0.17
256 0.24
257 0.29
258 0.34
259 0.38
260 0.43
261 0.49
262 0.52
263 0.61
264 0.65
265 0.69
266 0.73
267 0.78
268 0.82
269 0.85
270 0.89
271 0.9
272 0.85
273 0.84
274 0.82
275 0.72
276 0.66
277 0.62
278 0.52
279 0.45
280 0.39
281 0.31
282 0.28
283 0.31
284 0.29
285 0.28
286 0.28
287 0.25
288 0.25
289 0.26
290 0.23
291 0.22
292 0.2
293 0.21
294 0.22
295 0.26
296 0.27
297 0.27
298 0.27
299 0.29
300 0.29
301 0.25
302 0.23
303 0.19
304 0.17
305 0.16
306 0.13
307 0.09
308 0.08
309 0.07
310 0.07
311 0.06
312 0.06
313 0.11
314 0.16
315 0.19
316 0.25
317 0.27
318 0.3
319 0.37
320 0.44
321 0.47
322 0.48
323 0.5
324 0.47
325 0.47
326 0.48
327 0.41
328 0.33
329 0.25
330 0.2
331 0.16
332 0.12
333 0.11
334 0.09
335 0.11
336 0.12
337 0.13
338 0.14
339 0.14
340 0.15
341 0.15
342 0.14
343 0.13
344 0.13
345 0.13
346 0.12
347 0.12
348 0.1
349 0.11
350 0.11
351 0.09
352 0.1
353 0.1
354 0.11
355 0.12
356 0.16
357 0.17
358 0.21
359 0.21
360 0.2
361 0.2
362 0.22
363 0.22
364 0.21
365 0.2
366 0.21
367 0.21
368 0.22
369 0.24
370 0.25
371 0.27
372 0.25
373 0.23
374 0.18
375 0.18
376 0.18
377 0.14
378 0.12
379 0.1
380 0.1
381 0.09
382 0.1
383 0.1
384 0.11
385 0.11
386 0.15
387 0.13
388 0.18
389 0.24
390 0.28
391 0.3
392 0.3
393 0.31
394 0.32
395 0.34
396 0.32
397 0.28
398 0.26
399 0.23
400 0.23
401 0.29
402 0.24
403 0.24
404 0.27
405 0.26
406 0.24
407 0.3
408 0.33
409 0.26
410 0.3
411 0.29
412 0.27
413 0.28
414 0.29
415 0.28
416 0.25
417 0.26
418 0.23
419 0.22
420 0.2
421 0.23
422 0.28
423 0.25
424 0.25
425 0.27
426 0.28
427 0.37
428 0.47
429 0.53
430 0.57
431 0.64
432 0.73
433 0.76
434 0.83
435 0.83
436 0.82
437 0.82
438 0.83
439 0.82
440 0.81
441 0.81
442 0.72
443 0.62
444 0.52
445 0.42