Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2CCT4

Protein Details
Accession A0A1Y2CCT4    Localization Confidence High Confidence Score 19
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
213-238SSDGANSDKEKRKKKKSSSASRNSLTHydrophilic
255-301SDSDPERARKKKKASKRKSYSSDSSDSEKKSKKSSKRSRKHDSSDDSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
221-229KEKRKKKKS
261-295RARKKKKASKRKSYSSDSSDSEKKSKKSSKRSRKH
309-377KRTKKSLVDKAEKEAEKARKAEERERIKAEKAEAKLREKEEKAREKEEKARQKELKKQQDEEEKRAKKE
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 14, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006166  ERCC4_domain  
IPR033310  Mms4/EME1/EME2  
Gene Ontology GO:0048476  C:Holliday junction resolvase complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0004518  F:nuclease activity  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF02732  ERCC4  
Amino Acid Sequences MLSGMDDVDAAIEEVRMVVPFDVSVSDIRLDLGVSGSAEATINRWFDGLFLEGTPRDPSLSLTRSQSVVDHPKPATEVVPPKPRALASFVISDDSDSDAPIVDLSAKLPKRPSVKPDVVVIDDSDTDLDMPPLPKKSTFESYARPSPPIASFASSTTSVSIPAPVVQKTSVAQAWKSQFDAELALLDSSEDETAPKPKKRQIVGLSQSLSSDSSDGANSDKEKRKKKKSSSASRNSLTSLMDKKYGTNSFASSDSDSDPERARKKKKASKRKSYSSDSSDSEKKSKKSSKRSRKHDSSDDSSEEESSSKRTKKSLVDKAEKEAEKARKAEERERIKAEKAEAKLREKEEKAREKEEKARQKELKKQQDEEEKRAKKELKDANVQRNKHAIVTEMSVHVDPAFVTALPGGAKILDAIQEAGAKLKMVPQPIHSAIEWSRNVTREFDIAGDKWIPCEPRTEREPYLLVRLSASEFSKLVLRPGGDGVQSYIANIRRQFGSKSKLIILLEGIKELLKSRTKNISAHIQNEIRGGGGGGGGGSRQHLEPIASKEDMDAQLLWLQMFGDCFVQQAESLEETCGLIVSFTTTIAMIPERKYRSETHLRLNFGDEVKKGDSIQDH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.06
2 0.06
3 0.06
4 0.07
5 0.07
6 0.07
7 0.07
8 0.08
9 0.08
10 0.09
11 0.1
12 0.11
13 0.11
14 0.11
15 0.11
16 0.11
17 0.1
18 0.09
19 0.09
20 0.08
21 0.08
22 0.08
23 0.08
24 0.08
25 0.08
26 0.08
27 0.09
28 0.12
29 0.12
30 0.12
31 0.12
32 0.12
33 0.12
34 0.14
35 0.14
36 0.11
37 0.11
38 0.14
39 0.14
40 0.16
41 0.18
42 0.16
43 0.15
44 0.14
45 0.18
46 0.23
47 0.25
48 0.27
49 0.3
50 0.32
51 0.31
52 0.32
53 0.3
54 0.3
55 0.37
56 0.36
57 0.39
58 0.37
59 0.37
60 0.38
61 0.37
62 0.31
63 0.28
64 0.33
65 0.35
66 0.45
67 0.45
68 0.45
69 0.47
70 0.46
71 0.41
72 0.38
73 0.34
74 0.26
75 0.28
76 0.27
77 0.26
78 0.25
79 0.22
80 0.18
81 0.17
82 0.15
83 0.11
84 0.11
85 0.09
86 0.09
87 0.09
88 0.08
89 0.06
90 0.06
91 0.07
92 0.15
93 0.16
94 0.19
95 0.23
96 0.29
97 0.35
98 0.4
99 0.46
100 0.48
101 0.53
102 0.53
103 0.55
104 0.52
105 0.48
106 0.43
107 0.36
108 0.27
109 0.21
110 0.19
111 0.14
112 0.1
113 0.09
114 0.08
115 0.08
116 0.09
117 0.1
118 0.13
119 0.17
120 0.19
121 0.21
122 0.23
123 0.28
124 0.32
125 0.36
126 0.37
127 0.4
128 0.45
129 0.52
130 0.51
131 0.46
132 0.41
133 0.39
134 0.36
135 0.32
136 0.26
137 0.2
138 0.19
139 0.19
140 0.21
141 0.19
142 0.17
143 0.16
144 0.14
145 0.13
146 0.12
147 0.12
148 0.1
149 0.12
150 0.15
151 0.14
152 0.15
153 0.14
154 0.15
155 0.15
156 0.18
157 0.17
158 0.16
159 0.17
160 0.21
161 0.25
162 0.25
163 0.25
164 0.22
165 0.2
166 0.19
167 0.19
168 0.13
169 0.1
170 0.09
171 0.08
172 0.08
173 0.07
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.05
178 0.05
179 0.07
180 0.14
181 0.21
182 0.26
183 0.3
184 0.36
185 0.44
186 0.46
187 0.54
188 0.52
189 0.56
190 0.57
191 0.58
192 0.54
193 0.46
194 0.43
195 0.35
196 0.29
197 0.19
198 0.14
199 0.08
200 0.07
201 0.07
202 0.08
203 0.08
204 0.09
205 0.11
206 0.19
207 0.27
208 0.35
209 0.45
210 0.55
211 0.65
212 0.73
213 0.82
214 0.84
215 0.86
216 0.9
217 0.9
218 0.91
219 0.87
220 0.79
221 0.7
222 0.61
223 0.51
224 0.41
225 0.34
226 0.28
227 0.21
228 0.22
229 0.21
230 0.21
231 0.25
232 0.26
233 0.23
234 0.2
235 0.2
236 0.19
237 0.2
238 0.2
239 0.15
240 0.15
241 0.14
242 0.14
243 0.14
244 0.14
245 0.16
246 0.2
247 0.26
248 0.33
249 0.39
250 0.46
251 0.56
252 0.64
253 0.72
254 0.77
255 0.81
256 0.84
257 0.87
258 0.89
259 0.86
260 0.83
261 0.79
262 0.73
263 0.67
264 0.58
265 0.53
266 0.47
267 0.42
268 0.42
269 0.4
270 0.37
271 0.41
272 0.48
273 0.52
274 0.59
275 0.68
276 0.72
277 0.77
278 0.85
279 0.87
280 0.87
281 0.85
282 0.83
283 0.78
284 0.73
285 0.67
286 0.59
287 0.5
288 0.41
289 0.34
290 0.26
291 0.19
292 0.13
293 0.13
294 0.16
295 0.18
296 0.19
297 0.21
298 0.25
299 0.33
300 0.42
301 0.48
302 0.52
303 0.57
304 0.57
305 0.59
306 0.62
307 0.54
308 0.46
309 0.43
310 0.39
311 0.35
312 0.34
313 0.33
314 0.31
315 0.34
316 0.4
317 0.42
318 0.44
319 0.45
320 0.49
321 0.49
322 0.45
323 0.44
324 0.41
325 0.37
326 0.33
327 0.35
328 0.34
329 0.37
330 0.4
331 0.41
332 0.44
333 0.4
334 0.46
335 0.48
336 0.54
337 0.53
338 0.56
339 0.57
340 0.55
341 0.62
342 0.64
343 0.64
344 0.6
345 0.65
346 0.65
347 0.68
348 0.73
349 0.74
350 0.75
351 0.7
352 0.68
353 0.66
354 0.7
355 0.68
356 0.66
357 0.66
358 0.6
359 0.56
360 0.59
361 0.56
362 0.47
363 0.51
364 0.51
365 0.46
366 0.51
367 0.57
368 0.61
369 0.65
370 0.64
371 0.57
372 0.55
373 0.49
374 0.4
375 0.34
376 0.25
377 0.19
378 0.2
379 0.18
380 0.14
381 0.15
382 0.13
383 0.13
384 0.1
385 0.09
386 0.07
387 0.06
388 0.06
389 0.05
390 0.05
391 0.05
392 0.06
393 0.06
394 0.06
395 0.05
396 0.04
397 0.04
398 0.04
399 0.05
400 0.05
401 0.05
402 0.06
403 0.06
404 0.07
405 0.07
406 0.09
407 0.08
408 0.07
409 0.07
410 0.13
411 0.15
412 0.18
413 0.19
414 0.2
415 0.26
416 0.28
417 0.31
418 0.24
419 0.26
420 0.24
421 0.3
422 0.28
423 0.25
424 0.26
425 0.27
426 0.28
427 0.27
428 0.26
429 0.2
430 0.2
431 0.18
432 0.18
433 0.16
434 0.18
435 0.18
436 0.16
437 0.16
438 0.19
439 0.19
440 0.16
441 0.24
442 0.25
443 0.29
444 0.33
445 0.38
446 0.37
447 0.39
448 0.41
449 0.35
450 0.39
451 0.34
452 0.3
453 0.24
454 0.23
455 0.21
456 0.21
457 0.21
458 0.15
459 0.14
460 0.14
461 0.18
462 0.17
463 0.18
464 0.17
465 0.17
466 0.16
467 0.18
468 0.19
469 0.15
470 0.15
471 0.15
472 0.15
473 0.15
474 0.14
475 0.17
476 0.18
477 0.22
478 0.23
479 0.24
480 0.24
481 0.26
482 0.3
483 0.33
484 0.36
485 0.35
486 0.38
487 0.37
488 0.39
489 0.37
490 0.34
491 0.29
492 0.28
493 0.25
494 0.22
495 0.2
496 0.15
497 0.15
498 0.17
499 0.2
500 0.21
501 0.23
502 0.29
503 0.38
504 0.42
505 0.44
506 0.47
507 0.51
508 0.5
509 0.51
510 0.53
511 0.45
512 0.43
513 0.42
514 0.37
515 0.27
516 0.21
517 0.18
518 0.1
519 0.08
520 0.06
521 0.05
522 0.05
523 0.05
524 0.05
525 0.06
526 0.07
527 0.07
528 0.08
529 0.1
530 0.12
531 0.17
532 0.22
533 0.26
534 0.25
535 0.25
536 0.24
537 0.29
538 0.27
539 0.24
540 0.19
541 0.16
542 0.18
543 0.18
544 0.17
545 0.12
546 0.11
547 0.1
548 0.1
549 0.1
550 0.09
551 0.09
552 0.09
553 0.09
554 0.1
555 0.1
556 0.11
557 0.13
558 0.12
559 0.13
560 0.13
561 0.13
562 0.13
563 0.12
564 0.11
565 0.08
566 0.06
567 0.05
568 0.08
569 0.07
570 0.07
571 0.08
572 0.08
573 0.08
574 0.1
575 0.14
576 0.15
577 0.18
578 0.26
579 0.3
580 0.32
581 0.36
582 0.38
583 0.44
584 0.52
585 0.54
586 0.56
587 0.59
588 0.61
589 0.59
590 0.59
591 0.55
592 0.47
593 0.46
594 0.36
595 0.35
596 0.33
597 0.33
598 0.29