FuNGI

A0A1Y2C737

Protein Details

Accession

A0A1Y2C737

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
575-621	VNKGKARTKGESKEEKKARKQAVKEAKKDRRSEKKTTKELFKKETSH	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
577-613	KGKARTKGESKEEKKARKQAVKEAKKDRRSEKKTTKE

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, cyto_nucl 12.5, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MGKKGKSFIDKSKSLTFQVVHRSQRDPAMADMDASKLVLKPVAPSYNLLRKGKALQPGEVDYDFEEMESEDEDLDAYLENMDDEDDEEDDDDEDEDDDDDYEDYDEDEEPEIQEQVDFGQERKDAEEQARAAALASLRNAPSLADASKLGKTAASASASSSKADPAKDVSVFGIFFKDQKDYDYTQHLKPIGEDPNAVFIDSKAAQERAKAEAKHKGGIRFMDDSASTAMSEVPRRKVGFNIPNEVLGSEYEDRVGMLARGEKVNVIDVEPSMRETIYALEDEAYVEEDIDDFFDALNADDVPEELKDKLDPEDYFPDQEDDDEYSDDGEGDWYDEYQKYKNQGDSDDEYEEDDELGSLMERKTALTNLSMTSSAMVRTKLLTNLDDQFDEALKAYDDDQIGDLEGDAYDPDTMEPTQLDSHVAKISEARMNKIFDSFLESTEVVGRKGLVLPKVPESVKIDAIRDDLRDVTRVTEAMKLSVDETIESGEALDEAMEEEIFRMYPKRPENKWDVETVLSTYSNIYNHPHMIKDIMTSTRKIKLSKRGPVLVDPNPAPSVVSEEGDEDDDEEDEVVNKGKARTKGESKEEKKARKQAVKEAKKDRRSEKKTTKELFKKETSHQQKAALNKAGQAMFVPV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.57
2	0.56
3	0.48
4	0.45
5	0.51
6	0.53
7	0.51
8	0.52
9	0.53
10	0.5
11	0.55
12	0.52
13	0.44
14	0.38
15	0.36
16	0.32
17	0.29
18	0.27
19	0.22
20	0.18
21	0.16
22	0.15
23	0.11
24	0.12
25	0.12
26	0.12
27	0.15
28	0.21
29	0.26
30	0.26
31	0.28
32	0.35
33	0.42
34	0.5
35	0.48
36	0.43
37	0.42
38	0.48
39	0.5
40	0.51
41	0.45
42	0.41
43	0.43
44	0.44
45	0.45
46	0.39
47	0.35
48	0.26
49	0.25
50	0.21
51	0.16
52	0.13
53	0.09
54	0.09
55	0.09
56	0.08
57	0.06
58	0.06
59	0.07
60	0.06
61	0.06
62	0.06
63	0.05
64	0.05
65	0.05
66	0.05
67	0.05
68	0.05
69	0.05
70	0.06
71	0.07
72	0.07
73	0.07
74	0.08
75	0.08
76	0.08
77	0.09
78	0.08
79	0.07
80	0.07
81	0.07
82	0.07
83	0.07
84	0.07
85	0.07
86	0.07
87	0.07
88	0.07
89	0.07
90	0.07
91	0.08
92	0.08
93	0.08
94	0.1
95	0.1
96	0.1
97	0.11
98	0.11
99	0.09
100	0.09
101	0.08
102	0.07
103	0.11
104	0.11
105	0.11
106	0.15
107	0.16
108	0.17
109	0.2
110	0.22
111	0.21
112	0.23
113	0.28
114	0.24
115	0.24
116	0.24
117	0.2
118	0.18
119	0.17
120	0.15
121	0.11
122	0.12
123	0.14
124	0.13
125	0.14
126	0.14
127	0.12
128	0.13
129	0.14
130	0.13
131	0.11
132	0.12
133	0.14
134	0.15
135	0.16
136	0.14
137	0.12
138	0.12
139	0.13
140	0.15
141	0.15
142	0.13
143	0.15
144	0.21
145	0.21
146	0.21
147	0.19
148	0.19
149	0.2
150	0.21
151	0.2
152	0.18
153	0.21
154	0.21
155	0.21
156	0.18
157	0.17
158	0.17
159	0.16
160	0.15
161	0.11
162	0.12
163	0.13
164	0.15
165	0.13
166	0.16
167	0.2
168	0.2
169	0.23
170	0.31
171	0.34
172	0.32
173	0.37
174	0.36
175	0.32
176	0.3
177	0.33
178	0.3
179	0.27
180	0.26
181	0.22
182	0.26
183	0.26
184	0.25
185	0.19
186	0.13
187	0.17
188	0.16
189	0.17
190	0.13
191	0.15
192	0.15
193	0.18
194	0.19
195	0.2
196	0.25
197	0.26
198	0.28
199	0.34
200	0.36
201	0.39
202	0.41
203	0.39
204	0.36
205	0.36
206	0.36
207	0.29
208	0.27
209	0.24
210	0.2
211	0.18
212	0.16
213	0.14
214	0.11
215	0.08
216	0.09
217	0.09
218	0.15
219	0.17
220	0.19
221	0.23
222	0.25
223	0.25
224	0.28
225	0.35
226	0.38
227	0.38
228	0.41
229	0.37
230	0.36
231	0.36
232	0.32
233	0.24
234	0.16
235	0.16
236	0.1
237	0.1
238	0.09
239	0.09
240	0.09
241	0.08
242	0.08
243	0.05
244	0.05
245	0.08
246	0.09
247	0.09
248	0.09
249	0.1
250	0.1
251	0.11
252	0.11
253	0.09
254	0.08
255	0.08
256	0.09
257	0.09
258	0.09
259	0.07
260	0.07
261	0.06
262	0.06
263	0.07
264	0.07
265	0.07
266	0.06
267	0.06
268	0.07
269	0.07
270	0.06
271	0.06
272	0.05
273	0.05
274	0.05
275	0.04
276	0.04
277	0.04
278	0.04
279	0.03
280	0.03
281	0.04
282	0.04
283	0.04
284	0.04
285	0.04
286	0.04
287	0.04
288	0.04
289	0.04
290	0.04
291	0.05
292	0.05
293	0.06
294	0.06
295	0.07
296	0.08
297	0.11
298	0.11
299	0.13
300	0.18
301	0.18
302	0.19
303	0.18
304	0.18
305	0.15
306	0.14
307	0.12
308	0.09
309	0.09
310	0.08
311	0.08
312	0.07
313	0.07
314	0.07
315	0.06
316	0.05
317	0.04
318	0.04
319	0.04
320	0.04
321	0.05
322	0.07
323	0.08
324	0.1
325	0.12
326	0.16
327	0.19
328	0.22
329	0.22
330	0.23
331	0.27
332	0.28
333	0.29
334	0.25
335	0.22
336	0.2
337	0.18
338	0.16
339	0.11
340	0.08
341	0.05
342	0.04
343	0.04
344	0.03
345	0.05
346	0.04
347	0.05
348	0.06
349	0.06
350	0.07
351	0.08
352	0.09
353	0.09
354	0.1
355	0.1
356	0.11
357	0.11
358	0.1
359	0.09
360	0.09
361	0.09
362	0.09
363	0.09
364	0.08
365	0.1
366	0.11
367	0.13
368	0.14
369	0.14
370	0.15
371	0.18
372	0.18
373	0.17
374	0.16
375	0.14
376	0.13
377	0.12
378	0.1
379	0.07
380	0.06
381	0.06
382	0.07
383	0.09
384	0.09
385	0.09
386	0.1
387	0.09
388	0.09
389	0.09
390	0.08
391	0.05
392	0.05
393	0.04
394	0.04
395	0.04
396	0.04
397	0.04
398	0.04
399	0.05
400	0.06
401	0.06
402	0.06
403	0.08
404	0.08
405	0.08
406	0.11
407	0.1
408	0.12
409	0.13
410	0.13
411	0.12
412	0.13
413	0.16
414	0.18
415	0.18
416	0.2
417	0.22
418	0.23
419	0.24
420	0.24
421	0.2
422	0.16
423	0.23
424	0.2
425	0.17
426	0.18
427	0.18
428	0.17
429	0.22
430	0.22
431	0.14
432	0.14
433	0.13
434	0.11
435	0.14
436	0.17
437	0.15
438	0.18
439	0.2
440	0.23
441	0.28
442	0.27
443	0.28
444	0.29
445	0.29
446	0.31
447	0.3
448	0.28
449	0.25
450	0.28
451	0.25
452	0.22
453	0.2
454	0.17
455	0.16
456	0.17
457	0.16
458	0.15
459	0.15
460	0.15
461	0.15
462	0.17
463	0.16
464	0.16
465	0.16
466	0.14
467	0.14
468	0.15
469	0.14
470	0.09
471	0.09
472	0.09
473	0.08
474	0.07
475	0.07
476	0.05
477	0.05
478	0.05
479	0.04
480	0.03
481	0.04
482	0.04
483	0.04
484	0.04
485	0.05
486	0.05
487	0.05
488	0.06
489	0.08
490	0.11
491	0.19
492	0.28
493	0.36
494	0.39
495	0.47
496	0.55
497	0.61
498	0.6
499	0.56
500	0.5
501	0.42
502	0.4
503	0.34
504	0.28
505	0.19
506	0.17
507	0.15
508	0.15
509	0.14
510	0.15
511	0.17
512	0.18
513	0.22
514	0.23
515	0.23
516	0.22
517	0.23
518	0.22
519	0.21
520	0.21
521	0.24
522	0.25
523	0.26
524	0.29
525	0.35
526	0.38
527	0.41
528	0.45
529	0.49
530	0.56
531	0.63
532	0.67
533	0.66
534	0.65
535	0.67
536	0.67
537	0.61
538	0.58
539	0.5
540	0.45
541	0.39
542	0.36
543	0.29
544	0.22
545	0.23
546	0.18
547	0.18
548	0.14
549	0.15
550	0.16
551	0.17
552	0.17
553	0.12
554	0.11
555	0.1
556	0.1
557	0.09
558	0.08
559	0.07
560	0.08
561	0.09
562	0.1
563	0.13
564	0.16
565	0.23
566	0.29
567	0.35
568	0.43
569	0.51
570	0.59
571	0.66
572	0.73
573	0.72
574	0.77
575	0.8
576	0.82
577	0.81
578	0.82
579	0.83
580	0.81
581	0.81
582	0.81
583	0.83
584	0.83
585	0.83
586	0.85
587	0.85
588	0.84
589	0.87
590	0.86
591	0.87
592	0.84
593	0.86
594	0.85
595	0.86
596	0.87
597	0.87
598	0.88
599	0.87
600	0.88
601	0.86
602	0.83
603	0.78
604	0.75
605	0.78
606	0.76
607	0.75
608	0.7
609	0.69
610	0.65
611	0.67
612	0.68
613	0.65
614	0.56
615	0.51
616	0.53
617	0.45
618	0.41

A0A1Y2C737

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer