Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4R0L6

Protein Details
Accession C4R0L6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
75-95QQERTYKDRMKERQLDRQEEDHydrophilic
108-138DQKFNDAKPENQPTRKRKKRWDVKSSEGDSVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
122-127RKRKKR
Subcellular Location(s) plas 15, nucl 4, E.R. 3, cyto 2, golg 2, mito_nucl 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011989  ARM-like  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR038737  SF3b_su1-like  
Gene Ontology GO:0071014  C:post-mRNA release spliceosomal complex  
GO:0005686  C:U2 snRNP  
GO:0071004  C:U2-type prespliceosome  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
GO:0000245  P:spliceosomal complex assembly  
KEGG ppa:PAS_chr2-1_0418  -  
Amino Acid Sequences MSHHNDSGLIPFDPKGSNGVQAAPQYTIPKEYEEEMIDNAEDIDPLEGSIVSSKPKESDYHKRKYDNLMNINLTQQERTYKDRMKERQLDRQEEDIQKLLKQKQEQADQKFNDAKPENQPTRKRKKRWDVKSSEGDSVTVNILPVINGIELNNSILDKILPNGYTIVEPPLSYKPLNDLPPDYKQEDQGYLLPEESTLALENKAVETAQELAIENLGEKEKKVHTLISNIIEGASNMRKPALRQLTENARTFGAQAIFDQLLPLFMKRNLDEHQRHLLVKIVGRVLYQLDDLIRPYTYKILVVIMPLLIDEDYYTRIEGREIVANLSKAAGLAHMISTLRPDIDHSDEYVRNTVSRTFAVMSCALGIPVVLPFLKAVCNSKKSWQARHTGMKIVQQIAILAGSGVLPHLNGLVAAISKGLSDEHVHVRTIAAQAASALAESSAPYGAESFQQILDELYKGIRRHRGKGLAAFLKAIGYIIPLLDPDYADYYAKMVFKVLIREFESPDEEMKRTCLKVLQQCCDTEGIEKQYLIIEVIGSFFKSFWNRRTALDRRTAKLCCETTFHLSKRVGAGLVLDNILVHLKDESEPFRRMTAETCYKVVQSYGTAELSDKSVDQLLDGILIAFQEQVIQDNVILKSFSVIISSLGLRIGVHLPSIVSIILYRLKNREPEPRRQAASLITVVAPVIKKCGNEDMLLKLGSVIYESLGEVYPDVLASILEAMKAVIAVVGVESMNPPMSQILPTLSPILRNRNEMVQETAIGLIGMIAQRAPEYVNAREWMRICFSLVEMVKSQRKSIRKAANRTVGYIAVAIGPQDVLVTLLNNLRVQDRQLRVCTAVAIGIVAESCAPFTVLPALMNEYQTVENNVQNGVLKALAFMFESIGSMGKDYIYATLPLIEDALTDRDLVHRQTAANVVKHMALNNVGFGLEDAFIHFLNLLWPNIFETSPHVIARILEGIEGCRNVIGCGIVMNYTLTGLFHPARKVRDSYWKVYNPMYVQSCDSMVPYYPDFKDQILTKDTEQVTPTVIEELDIWV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.2
3 0.18
4 0.22
5 0.22
6 0.24
7 0.25
8 0.26
9 0.28
10 0.25
11 0.26
12 0.25
13 0.26
14 0.27
15 0.24
16 0.24
17 0.25
18 0.25
19 0.27
20 0.26
21 0.26
22 0.23
23 0.23
24 0.2
25 0.18
26 0.17
27 0.13
28 0.1
29 0.09
30 0.08
31 0.07
32 0.07
33 0.07
34 0.06
35 0.07
36 0.1
37 0.11
38 0.14
39 0.15
40 0.17
41 0.18
42 0.21
43 0.26
44 0.31
45 0.41
46 0.47
47 0.56
48 0.63
49 0.66
50 0.7
51 0.75
52 0.76
53 0.75
54 0.73
55 0.7
56 0.66
57 0.61
58 0.58
59 0.53
60 0.45
61 0.35
62 0.3
63 0.3
64 0.3
65 0.35
66 0.41
67 0.43
68 0.5
69 0.59
70 0.65
71 0.69
72 0.75
73 0.76
74 0.78
75 0.8
76 0.81
77 0.75
78 0.73
79 0.71
80 0.65
81 0.61
82 0.55
83 0.47
84 0.43
85 0.46
86 0.45
87 0.43
88 0.44
89 0.49
90 0.52
91 0.61
92 0.67
93 0.67
94 0.72
95 0.66
96 0.68
97 0.68
98 0.6
99 0.6
100 0.54
101 0.5
102 0.5
103 0.58
104 0.6
105 0.62
106 0.71
107 0.72
108 0.81
109 0.87
110 0.87
111 0.88
112 0.9
113 0.92
114 0.93
115 0.93
116 0.9
117 0.89
118 0.9
119 0.83
120 0.77
121 0.66
122 0.56
123 0.45
124 0.38
125 0.3
126 0.2
127 0.15
128 0.1
129 0.1
130 0.09
131 0.09
132 0.08
133 0.07
134 0.07
135 0.07
136 0.08
137 0.09
138 0.09
139 0.1
140 0.09
141 0.08
142 0.08
143 0.09
144 0.08
145 0.09
146 0.12
147 0.12
148 0.12
149 0.14
150 0.14
151 0.14
152 0.14
153 0.16
154 0.13
155 0.13
156 0.15
157 0.18
158 0.21
159 0.2
160 0.2
161 0.22
162 0.28
163 0.32
164 0.32
165 0.33
166 0.35
167 0.41
168 0.46
169 0.43
170 0.38
171 0.39
172 0.39
173 0.35
174 0.33
175 0.3
176 0.27
177 0.25
178 0.24
179 0.19
180 0.16
181 0.15
182 0.13
183 0.1
184 0.08
185 0.09
186 0.09
187 0.09
188 0.1
189 0.09
190 0.1
191 0.09
192 0.07
193 0.08
194 0.1
195 0.1
196 0.1
197 0.1
198 0.1
199 0.11
200 0.11
201 0.09
202 0.09
203 0.11
204 0.1
205 0.1
206 0.15
207 0.16
208 0.21
209 0.22
210 0.25
211 0.25
212 0.3
213 0.35
214 0.33
215 0.32
216 0.28
217 0.26
218 0.21
219 0.18
220 0.18
221 0.16
222 0.14
223 0.14
224 0.16
225 0.16
226 0.18
227 0.28
228 0.33
229 0.31
230 0.34
231 0.4
232 0.49
233 0.55
234 0.55
235 0.47
236 0.38
237 0.36
238 0.33
239 0.3
240 0.21
241 0.15
242 0.13
243 0.15
244 0.15
245 0.14
246 0.14
247 0.1
248 0.11
249 0.11
250 0.11
251 0.1
252 0.11
253 0.15
254 0.16
255 0.2
256 0.22
257 0.31
258 0.34
259 0.37
260 0.43
261 0.43
262 0.42
263 0.39
264 0.4
265 0.33
266 0.32
267 0.3
268 0.24
269 0.22
270 0.21
271 0.21
272 0.17
273 0.15
274 0.13
275 0.1
276 0.09
277 0.09
278 0.1
279 0.11
280 0.1
281 0.09
282 0.1
283 0.12
284 0.12
285 0.12
286 0.11
287 0.12
288 0.12
289 0.12
290 0.12
291 0.09
292 0.08
293 0.07
294 0.07
295 0.05
296 0.05
297 0.04
298 0.05
299 0.07
300 0.07
301 0.08
302 0.08
303 0.08
304 0.09
305 0.1
306 0.1
307 0.13
308 0.14
309 0.15
310 0.17
311 0.17
312 0.17
313 0.16
314 0.14
315 0.09
316 0.09
317 0.07
318 0.05
319 0.05
320 0.05
321 0.06
322 0.06
323 0.06
324 0.07
325 0.08
326 0.07
327 0.07
328 0.08
329 0.11
330 0.15
331 0.16
332 0.16
333 0.21
334 0.22
335 0.24
336 0.24
337 0.21
338 0.18
339 0.18
340 0.18
341 0.15
342 0.14
343 0.14
344 0.14
345 0.14
346 0.16
347 0.15
348 0.13
349 0.12
350 0.12
351 0.1
352 0.08
353 0.07
354 0.05
355 0.04
356 0.05
357 0.04
358 0.04
359 0.04
360 0.05
361 0.06
362 0.07
363 0.13
364 0.18
365 0.22
366 0.23
367 0.29
368 0.38
369 0.42
370 0.5
371 0.5
372 0.51
373 0.55
374 0.61
375 0.58
376 0.54
377 0.52
378 0.48
379 0.46
380 0.4
381 0.34
382 0.25
383 0.23
384 0.17
385 0.15
386 0.09
387 0.06
388 0.04
389 0.03
390 0.03
391 0.03
392 0.03
393 0.03
394 0.03
395 0.03
396 0.03
397 0.03
398 0.03
399 0.03
400 0.03
401 0.03
402 0.04
403 0.03
404 0.03
405 0.04
406 0.04
407 0.05
408 0.06
409 0.09
410 0.14
411 0.15
412 0.15
413 0.15
414 0.15
415 0.16
416 0.15
417 0.14
418 0.09
419 0.07
420 0.07
421 0.08
422 0.07
423 0.05
424 0.04
425 0.03
426 0.03
427 0.03
428 0.04
429 0.04
430 0.04
431 0.04
432 0.04
433 0.05
434 0.05
435 0.06
436 0.06
437 0.06
438 0.06
439 0.07
440 0.07
441 0.07
442 0.07
443 0.06
444 0.07
445 0.1
446 0.11
447 0.15
448 0.24
449 0.26
450 0.31
451 0.37
452 0.42
453 0.41
454 0.45
455 0.48
456 0.43
457 0.4
458 0.35
459 0.29
460 0.22
461 0.19
462 0.15
463 0.08
464 0.04
465 0.04
466 0.04
467 0.03
468 0.03
469 0.04
470 0.05
471 0.05
472 0.05
473 0.07
474 0.07
475 0.07
476 0.07
477 0.07
478 0.09
479 0.1
480 0.09
481 0.07
482 0.09
483 0.1
484 0.15
485 0.15
486 0.16
487 0.18
488 0.2
489 0.21
490 0.2
491 0.21
492 0.17
493 0.18
494 0.16
495 0.14
496 0.13
497 0.14
498 0.15
499 0.14
500 0.14
501 0.15
502 0.18
503 0.25
504 0.3
505 0.32
506 0.31
507 0.31
508 0.32
509 0.3
510 0.25
511 0.19
512 0.16
513 0.15
514 0.14
515 0.13
516 0.12
517 0.12
518 0.12
519 0.1
520 0.08
521 0.05
522 0.04
523 0.05
524 0.05
525 0.05
526 0.05
527 0.04
528 0.06
529 0.11
530 0.14
531 0.16
532 0.22
533 0.24
534 0.26
535 0.34
536 0.38
537 0.39
538 0.46
539 0.46
540 0.43
541 0.47
542 0.45
543 0.39
544 0.39
545 0.36
546 0.27
547 0.27
548 0.27
549 0.27
550 0.33
551 0.32
552 0.31
553 0.3
554 0.3
555 0.28
556 0.26
557 0.21
558 0.15
559 0.15
560 0.1
561 0.1
562 0.09
563 0.07
564 0.06
565 0.06
566 0.07
567 0.05
568 0.04
569 0.04
570 0.04
571 0.05
572 0.07
573 0.11
574 0.15
575 0.17
576 0.17
577 0.18
578 0.19
579 0.18
580 0.19
581 0.23
582 0.26
583 0.26
584 0.26
585 0.26
586 0.25
587 0.25
588 0.23
589 0.16
590 0.1
591 0.1
592 0.11
593 0.1
594 0.1
595 0.1
596 0.1
597 0.11
598 0.1
599 0.08
600 0.07
601 0.08
602 0.07
603 0.07
604 0.07
605 0.06
606 0.06
607 0.06
608 0.05
609 0.04
610 0.04
611 0.04
612 0.03
613 0.03
614 0.04
615 0.04
616 0.05
617 0.06
618 0.06
619 0.06
620 0.1
621 0.1
622 0.1
623 0.1
624 0.08
625 0.08
626 0.09
627 0.08
628 0.06
629 0.06
630 0.06
631 0.07
632 0.07
633 0.07
634 0.06
635 0.07
636 0.06
637 0.07
638 0.08
639 0.07
640 0.07
641 0.06
642 0.06
643 0.07
644 0.07
645 0.06
646 0.04
647 0.04
648 0.06
649 0.11
650 0.12
651 0.14
652 0.17
653 0.19
654 0.25
655 0.28
656 0.37
657 0.38
658 0.47
659 0.54
660 0.57
661 0.57
662 0.52
663 0.5
664 0.42
665 0.4
666 0.3
667 0.23
668 0.16
669 0.14
670 0.13
671 0.13
672 0.11
673 0.08
674 0.1
675 0.11
676 0.11
677 0.13
678 0.18
679 0.17
680 0.18
681 0.2
682 0.2
683 0.21
684 0.21
685 0.19
686 0.14
687 0.12
688 0.11
689 0.1
690 0.07
691 0.05
692 0.05
693 0.05
694 0.06
695 0.06
696 0.06
697 0.05
698 0.06
699 0.05
700 0.05
701 0.05
702 0.04
703 0.03
704 0.03
705 0.05
706 0.04
707 0.04
708 0.04
709 0.04
710 0.04
711 0.04
712 0.04
713 0.03
714 0.03
715 0.03
716 0.03
717 0.03
718 0.03
719 0.03
720 0.04
721 0.05
722 0.05
723 0.05
724 0.06
725 0.06
726 0.07
727 0.07
728 0.08
729 0.09
730 0.09
731 0.1
732 0.14
733 0.13
734 0.18
735 0.2
736 0.29
737 0.29
738 0.32
739 0.33
740 0.34
741 0.37
742 0.34
743 0.34
744 0.26
745 0.24
746 0.21
747 0.2
748 0.14
749 0.11
750 0.09
751 0.05
752 0.05
753 0.05
754 0.04
755 0.04
756 0.04
757 0.04
758 0.05
759 0.06
760 0.09
761 0.13
762 0.15
763 0.18
764 0.2
765 0.21
766 0.25
767 0.25
768 0.24
769 0.23
770 0.22
771 0.2
772 0.18
773 0.18
774 0.21
775 0.2
776 0.2
777 0.19
778 0.24
779 0.29
780 0.29
781 0.33
782 0.33
783 0.39
784 0.43
785 0.5
786 0.55
787 0.58
788 0.67
789 0.72
790 0.75
791 0.7
792 0.66
793 0.59
794 0.49
795 0.4
796 0.31
797 0.22
798 0.12
799 0.11
800 0.09
801 0.06
802 0.06
803 0.05
804 0.04
805 0.04
806 0.04
807 0.04
808 0.05
809 0.06
810 0.08
811 0.1
812 0.11
813 0.12
814 0.13
815 0.14
816 0.17
817 0.24
818 0.28
819 0.32
820 0.34
821 0.36
822 0.36
823 0.35
824 0.32
825 0.24
826 0.19
827 0.13
828 0.1
829 0.08
830 0.06
831 0.05
832 0.05
833 0.04
834 0.04
835 0.04
836 0.04
837 0.05
838 0.04
839 0.05
840 0.09
841 0.09
842 0.1
843 0.11
844 0.15
845 0.16
846 0.16
847 0.16
848 0.15
849 0.16
850 0.16
851 0.19
852 0.17
853 0.17
854 0.17
855 0.17
856 0.16
857 0.16
858 0.15
859 0.12
860 0.11
861 0.09
862 0.09
863 0.09
864 0.09
865 0.08
866 0.08
867 0.08
868 0.07
869 0.07
870 0.07
871 0.09
872 0.08
873 0.08
874 0.08
875 0.07
876 0.08
877 0.08
878 0.09
879 0.09
880 0.1
881 0.1
882 0.12
883 0.12
884 0.12
885 0.12
886 0.1
887 0.08
888 0.1
889 0.12
890 0.1
891 0.1
892 0.1
893 0.13
894 0.16
895 0.18
896 0.19
897 0.19
898 0.19
899 0.21
900 0.29
901 0.31
902 0.3
903 0.3
904 0.29
905 0.29
906 0.29
907 0.28
908 0.22
909 0.2
910 0.18
911 0.17
912 0.16
913 0.13
914 0.12
915 0.11
916 0.1
917 0.07
918 0.07
919 0.07
920 0.08
921 0.08
922 0.09
923 0.08
924 0.07
925 0.11
926 0.13
927 0.13
928 0.12
929 0.13
930 0.15
931 0.17
932 0.17
933 0.13
934 0.17
935 0.22
936 0.24
937 0.24
938 0.22
939 0.22
940 0.22
941 0.24
942 0.21
943 0.15
944 0.13
945 0.14
946 0.15
947 0.18
948 0.18
949 0.15
950 0.13
951 0.13
952 0.12
953 0.13
954 0.11
955 0.08
956 0.09
957 0.09
958 0.09
959 0.09
960 0.09
961 0.08
962 0.08
963 0.08
964 0.08
965 0.07
966 0.12
967 0.14
968 0.18
969 0.24
970 0.29
971 0.34
972 0.38
973 0.42
974 0.42
975 0.51
976 0.54
977 0.55
978 0.6
979 0.61
980 0.6
981 0.59
982 0.59
983 0.5
984 0.52
985 0.49
986 0.41
987 0.37
988 0.35
989 0.34
990 0.28
991 0.27
992 0.2
993 0.18
994 0.19
995 0.19
996 0.24
997 0.24
998 0.27
999 0.28
1000 0.27
1001 0.31
1002 0.31
1003 0.34
1004 0.33
1005 0.35
1006 0.33
1007 0.4
1008 0.4
1009 0.38
1010 0.35
1011 0.3
1012 0.28
1013 0.26
1014 0.25
1015 0.18
1016 0.17
1017 0.14