Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2EDB2

Protein Details
Accession A0A1Y2EDB2    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
212-245STSLLRRLPRPPRRLPPPRRLAPRPKRRTLPLSPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
217-269RRLPRPPRRLPPPRRLAPRPKRRTLPLSPSPRPRSPPPPLVPRERSPPKRPLK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039663  AIP/AIPL1/TTC9  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Pfam View protein in Pfam  
PF14559  TPR_19  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MPTHSQEELIQITDEAFAQRLKGNTLFKEGDLKGALREYHAVLLRLKGLDSALQSAFGSPAPEVIITPKDDAEEKAKAEESKEPTLQEKVKQAIGLTYLNSAAIHIKNENFKRALECADSALKIDENNDKAKFRAAQARIGMGEISKGKAALEELQKKTPDVAIANALKQLAADEKTRAAQAKSQFTFSQRECTARSLPPPPTTVPPSLPASTSLLRRLPRPPRRLPPPRRLAPRPKRRTLPLSPSPRPRSPPPPLVPRERSPPKRPLKLSFPPLPQSQDPPLCSFSRFPLAGYPPPLGLCFAPFRTPF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.11
3 0.11
4 0.09
5 0.11
6 0.14
7 0.15
8 0.18
9 0.24
10 0.28
11 0.29
12 0.36
13 0.36
14 0.33
15 0.4
16 0.36
17 0.35
18 0.31
19 0.3
20 0.25
21 0.27
22 0.26
23 0.2
24 0.22
25 0.19
26 0.22
27 0.24
28 0.24
29 0.22
30 0.23
31 0.24
32 0.22
33 0.21
34 0.16
35 0.14
36 0.15
37 0.15
38 0.17
39 0.14
40 0.15
41 0.15
42 0.14
43 0.14
44 0.12
45 0.12
46 0.08
47 0.09
48 0.08
49 0.08
50 0.08
51 0.1
52 0.12
53 0.13
54 0.14
55 0.14
56 0.14
57 0.15
58 0.17
59 0.19
60 0.2
61 0.19
62 0.2
63 0.22
64 0.22
65 0.23
66 0.28
67 0.29
68 0.31
69 0.32
70 0.31
71 0.31
72 0.37
73 0.38
74 0.35
75 0.35
76 0.32
77 0.32
78 0.31
79 0.28
80 0.23
81 0.23
82 0.2
83 0.15
84 0.13
85 0.11
86 0.11
87 0.1
88 0.1
89 0.1
90 0.1
91 0.11
92 0.11
93 0.14
94 0.21
95 0.23
96 0.27
97 0.25
98 0.25
99 0.26
100 0.26
101 0.26
102 0.21
103 0.19
104 0.18
105 0.18
106 0.17
107 0.15
108 0.14
109 0.12
110 0.1
111 0.12
112 0.14
113 0.15
114 0.19
115 0.2
116 0.2
117 0.2
118 0.23
119 0.22
120 0.2
121 0.27
122 0.24
123 0.28
124 0.28
125 0.29
126 0.26
127 0.25
128 0.22
129 0.13
130 0.13
131 0.09
132 0.08
133 0.07
134 0.07
135 0.06
136 0.07
137 0.07
138 0.1
139 0.17
140 0.24
141 0.26
142 0.29
143 0.29
144 0.29
145 0.29
146 0.25
147 0.2
148 0.13
149 0.12
150 0.14
151 0.14
152 0.15
153 0.15
154 0.14
155 0.12
156 0.11
157 0.11
158 0.08
159 0.09
160 0.09
161 0.1
162 0.11
163 0.12
164 0.13
165 0.14
166 0.13
167 0.16
168 0.2
169 0.28
170 0.28
171 0.3
172 0.3
173 0.31
174 0.36
175 0.33
176 0.35
177 0.27
178 0.29
179 0.28
180 0.31
181 0.32
182 0.29
183 0.32
184 0.3
185 0.34
186 0.34
187 0.34
188 0.33
189 0.33
190 0.35
191 0.33
192 0.29
193 0.29
194 0.3
195 0.28
196 0.26
197 0.23
198 0.23
199 0.23
200 0.24
201 0.24
202 0.25
203 0.26
204 0.28
205 0.35
206 0.42
207 0.49
208 0.56
209 0.61
210 0.66
211 0.75
212 0.83
213 0.84
214 0.84
215 0.84
216 0.85
217 0.85
218 0.85
219 0.85
220 0.85
221 0.87
222 0.86
223 0.84
224 0.83
225 0.81
226 0.8
227 0.78
228 0.77
229 0.75
230 0.76
231 0.75
232 0.78
233 0.78
234 0.75
235 0.72
236 0.7
237 0.69
238 0.68
239 0.7
240 0.68
241 0.7
242 0.71
243 0.75
244 0.74
245 0.69
246 0.71
247 0.72
248 0.73
249 0.7
250 0.75
251 0.75
252 0.78
253 0.8
254 0.77
255 0.76
256 0.76
257 0.77
258 0.75
259 0.71
260 0.67
261 0.65
262 0.63
263 0.56
264 0.53
265 0.52
266 0.5
267 0.47
268 0.45
269 0.45
270 0.41
271 0.41
272 0.37
273 0.33
274 0.35
275 0.32
276 0.29
277 0.32
278 0.37
279 0.4
280 0.41
281 0.38
282 0.31
283 0.32
284 0.32
285 0.26
286 0.21
287 0.19
288 0.21
289 0.22