FuNGI

A0A1Y2CSE4

Protein Details

Accession

A0A1Y2CSE4

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
388-411	KEEMEGKRKKRRGVRIKKGVKGVE	Basic
431-452	EEGKKKGTRKLAAKSKPRGKTT	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
388-408	KEEMEGKRKKRRGVRIKKGVK
433-470	GKKKGTRKLAAKSKPRGKTTAKPRATAKTTTITKRKGK

Subcellular Location(s)

mito 16, nucl 7, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR000305 GIY-YIG_endonuc IPR035901 GIY-YIG_endonuc_sf IPR027520 Slx1 IPR013083 Znf_RING/FYVE/PHD
Gene Ontology	GO:0033557 C:Slx1-Slx4 complex GO:0017108 F:5'-flap endonuclease activity GO:0006310 P:DNA recombination GO:0006281 P:DNA repair
Pfam	View protein in Pfam PF01541 GIY-YIG
PROSITE	View protein in PROSITE PS50164 GIY_YIG
CDD	cd10455 GIY-YIG_SLX1

Amino Acid Sequences

MARGRAISPRPTPSPTPTPTPSTRSTVLNHSIAPFYACYLLRSINPKRQQTYIGSTPNPPKRIREHNGLLQGGAFKTRLARPWEQELIVYNFPTKLQALQFEWAWQNPDRSRLLRRAAPSPSPAPSTSLSSTIKASKATKSSSTATTTTAQFPRTALSNRPLSKVQVLQYMLTTPPWSSFDLRVLLFSTEAQTWWTEARRLGPTLRTEAGVRKWEKERAKLGVQGDAWEDGRGEKLDRVRVELRREGVDGERRVRIGEVQAEAPLGQGREERIIVDDDAFFLPHWAKWTALTESTFTPKCAICTQPVNIEDHLSFLLCTSPTFPSCLAVTHLPCLASHFHSTSPSPSPSSPSNPLKTILPLLPTTGPCPTCQTTVHWQELIRGCYRRKEEMEGKRKKRRGVRIKKGVKGVEEMEDVEAEDEEEDGEEDGEEEGKKKGTRKLAAKSKPRGKTTAKPRATAKTTTITKRKGKSPLPTSPPSSEDERFDLTDLSGASDVGEEEAERSWAHSVAQEGAFAAASDSEGEGEVSGFEEEEQQGAKGKEKGISRYAPSSPHQLANSPLPFGSSFSSSQAVDSASLQPNPPSPPPPPPPPAPAPNPPPP

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.6
2	0.56
3	0.58
4	0.56
5	0.58
6	0.58
7	0.59
8	0.56
9	0.53
10	0.51
11	0.47
12	0.46
13	0.47
14	0.48
15	0.44
16	0.41
17	0.37
18	0.35
19	0.31
20	0.3
21	0.22
22	0.17
23	0.19
24	0.18
25	0.17
26	0.18
27	0.2
28	0.23
29	0.31
30	0.38
31	0.43
32	0.51
33	0.58
34	0.59
35	0.6
36	0.61
37	0.59
38	0.6
39	0.58
40	0.57
41	0.52
42	0.55
43	0.62
44	0.64
45	0.64
46	0.58
47	0.56
48	0.57
49	0.65
50	0.65
51	0.65
52	0.64
53	0.66
54	0.71
55	0.65
56	0.57
57	0.48
58	0.43
59	0.33
60	0.28
61	0.2
62	0.12
63	0.17
64	0.2
65	0.25
66	0.3
67	0.36
68	0.39
69	0.46
70	0.5
71	0.46
72	0.44
73	0.42
74	0.4
75	0.36
76	0.32
77	0.25
78	0.21
79	0.21
80	0.22
81	0.18
82	0.16
83	0.16
84	0.21
85	0.22
86	0.24
87	0.24
88	0.26
89	0.28
90	0.25
91	0.27
92	0.25
93	0.3
94	0.28
95	0.34
96	0.34
97	0.36
98	0.41
99	0.45
100	0.49
101	0.47
102	0.49
103	0.5
104	0.51
105	0.51
106	0.5
107	0.46
108	0.43
109	0.41
110	0.38
111	0.34
112	0.31
113	0.32
114	0.28
115	0.3
116	0.28
117	0.26
118	0.28
119	0.28
120	0.28
121	0.27
122	0.28
123	0.28
124	0.31
125	0.33
126	0.34
127	0.35
128	0.37
129	0.36
130	0.38
131	0.33
132	0.32
133	0.31
134	0.3
135	0.31
136	0.31
137	0.28
138	0.24
139	0.24
140	0.22
141	0.24
142	0.25
143	0.23
144	0.26
145	0.34
146	0.35
147	0.38
148	0.38
149	0.36
150	0.38
151	0.38
152	0.34
153	0.32
154	0.31
155	0.28
156	0.27
157	0.26
158	0.22
159	0.18
160	0.16
161	0.1
162	0.11
163	0.13
164	0.14
165	0.15
166	0.16
167	0.19
168	0.21
169	0.21
170	0.2
171	0.19
172	0.17
173	0.15
174	0.14
175	0.12
176	0.1
177	0.1
178	0.1
179	0.09
180	0.09
181	0.11
182	0.13
183	0.13
184	0.14
185	0.18
186	0.2
187	0.22
188	0.23
189	0.25
190	0.26
191	0.28
192	0.28
193	0.25
194	0.23
195	0.26
196	0.28
197	0.31
198	0.3
199	0.31
200	0.34
201	0.41
202	0.44
203	0.46
204	0.47
205	0.44
206	0.45
207	0.46
208	0.43
209	0.4
210	0.35
211	0.3
212	0.25
213	0.21
214	0.19
215	0.14
216	0.13
217	0.08
218	0.09
219	0.09
220	0.09
221	0.1
222	0.13
223	0.18
224	0.19
225	0.24
226	0.28
227	0.32
228	0.37
229	0.37
230	0.36
231	0.32
232	0.33
233	0.29
234	0.27
235	0.3
236	0.27
237	0.26
238	0.26
239	0.24
240	0.24
241	0.23
242	0.2
243	0.15
244	0.15
245	0.14
246	0.13
247	0.13
248	0.12
249	0.12
250	0.11
251	0.1
252	0.07
253	0.06
254	0.06
255	0.07
256	0.08
257	0.08
258	0.08
259	0.09
260	0.1
261	0.09
262	0.1
263	0.09
264	0.09
265	0.09
266	0.09
267	0.07
268	0.07
269	0.07
270	0.07
271	0.09
272	0.09
273	0.09
274	0.1
275	0.13
276	0.13
277	0.14
278	0.15
279	0.14
280	0.14
281	0.18
282	0.17
283	0.15
284	0.15
285	0.14
286	0.15
287	0.16
288	0.17
289	0.15
290	0.18
291	0.19
292	0.22
293	0.23
294	0.23
295	0.21
296	0.21
297	0.18
298	0.16
299	0.14
300	0.09
301	0.08
302	0.06
303	0.07
304	0.05
305	0.06
306	0.07
307	0.08
308	0.09
309	0.1
310	0.1
311	0.11
312	0.11
313	0.11
314	0.12
315	0.13
316	0.13
317	0.13
318	0.14
319	0.13
320	0.12
321	0.14
322	0.13
323	0.13
324	0.14
325	0.14
326	0.14
327	0.15
328	0.16
329	0.18
330	0.19
331	0.18
332	0.19
333	0.18
334	0.21
335	0.22
336	0.27
337	0.31
338	0.34
339	0.35
340	0.34
341	0.35
342	0.32
343	0.31
344	0.28
345	0.22
346	0.18
347	0.15
348	0.16
349	0.17
350	0.16
351	0.17
352	0.18
353	0.17
354	0.16
355	0.21
356	0.21
357	0.2
358	0.21
359	0.24
360	0.29
361	0.34
362	0.36
363	0.32
364	0.3
365	0.35
366	0.38
367	0.37
368	0.32
369	0.31
370	0.31
371	0.36
372	0.39
373	0.39
374	0.37
375	0.42
376	0.47
377	0.53
378	0.62
379	0.66
380	0.72
381	0.76
382	0.79
383	0.78
384	0.78
385	0.78
386	0.79
387	0.8
388	0.81
389	0.82
390	0.86
391	0.85
392	0.83
393	0.74
394	0.65
395	0.57
396	0.47
397	0.39
398	0.31
399	0.26
400	0.19
401	0.16
402	0.14
403	0.11
404	0.09
405	0.06
406	0.05
407	0.04
408	0.04
409	0.04
410	0.04
411	0.04
412	0.04
413	0.04
414	0.04
415	0.05
416	0.06
417	0.06
418	0.07
419	0.08
420	0.11
421	0.14
422	0.18
423	0.24
424	0.32
425	0.4
426	0.47
427	0.56
428	0.64
429	0.71
430	0.76
431	0.8
432	0.81
433	0.81
434	0.77
435	0.74
436	0.71
437	0.71
438	0.72
439	0.73
440	0.68
441	0.64
442	0.65
443	0.66
444	0.64
445	0.58
446	0.51
447	0.49
448	0.52
449	0.56
450	0.59
451	0.59
452	0.62
453	0.64
454	0.68
455	0.68
456	0.68
457	0.7
458	0.7
459	0.71
460	0.71
461	0.71
462	0.69
463	0.63
464	0.58
465	0.51
466	0.48
467	0.41
468	0.36
469	0.34
470	0.32
471	0.29
472	0.28
473	0.25
474	0.19
475	0.19
476	0.16
477	0.14
478	0.11
479	0.1
480	0.09
481	0.09
482	0.09
483	0.07
484	0.07
485	0.05
486	0.06
487	0.06
488	0.07
489	0.07
490	0.08
491	0.09
492	0.09
493	0.1
494	0.11
495	0.12
496	0.16
497	0.16
498	0.15
499	0.14
500	0.14
501	0.13
502	0.11
503	0.1
504	0.05
505	0.05
506	0.06
507	0.06
508	0.05
509	0.06
510	0.06
511	0.06
512	0.06
513	0.06
514	0.06
515	0.06
516	0.06
517	0.06
518	0.08
519	0.08
520	0.09
521	0.1
522	0.09
523	0.15
524	0.16
525	0.21
526	0.22
527	0.24
528	0.28
529	0.32
530	0.38
531	0.4
532	0.44
533	0.44
534	0.46
535	0.47
536	0.47
537	0.45
538	0.48
539	0.44
540	0.44
541	0.41
542	0.37
543	0.39
544	0.43
545	0.41
546	0.34
547	0.3
548	0.27
549	0.26
550	0.26
551	0.24
552	0.19
553	0.19
554	0.2
555	0.23
556	0.21
557	0.21
558	0.2
559	0.18
560	0.16
561	0.17
562	0.21
563	0.22
564	0.24
565	0.25
566	0.26
567	0.29
568	0.33
569	0.35
570	0.33
571	0.33
572	0.41
573	0.48
574	0.54
575	0.57
576	0.57
577	0.6
578	0.63
579	0.67
580	0.65
581	0.67

A0A1Y2CSE4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer