Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2ERT2

Protein Details
Accession A0A1Y2ERT2    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
225-250ATTTEGQKKKRVRKRPNQRARANSLDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
232-244KKKRVRKRPNQRA
Subcellular Location(s) cyto_nucl 13.833, nucl 13.5, cyto 12, mito_nucl 7.666
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038664  Gar1/Naf1_Cbf5-bd_sf  
IPR007504  H/ACA_rnp_Gar1/Naf1  
IPR040309  Naf1  
IPR009000  Transl_B-barrel_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005732  C:sno(s)RNA-containing ribonucleoprotein complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000493  P:box H/ACA snoRNP assembly  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
GO:0042254  P:ribosome biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04410  Gar1  
Amino Acid Sequences MAEEHGIPGLSAPPPAAPQPAPTATVQEAAPLADSPTLTLQLDSNSTTEAATPTEQPTETFKVPAVPIPATTTLQGLPADIEHILSLGANAKDLNADEHKATNYEQVVRDMKERAGLSGEVVMEEAGGDGLQAIEREMEQGGVQREGVEVQEVQDEVKQEEEQGDGMQTEEAEQVKEVPTAKMDVEGDDEASSSDSSSSSDSSSDSDSDAPSPRATDGPSPSSAATTTEGQKKKRVRKRPNQRARANSLDSDLSDDDVNAGALGAAPKTEHELDQPEVELPSLEKVPEGVELAAFGKVQSVIETVVVVRADTTGSYKVLDEGTVVCLEDRTVVGSIFETFGSVQQPFYSLRFPVTKLPSPEIFTVDRPVYYAPTLASFVFTRELRAMKGSDASNVWDEEVGAAEIEFSDDEQEQEYRRAQKAECVSFSLLSFARR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.16
3 0.2
4 0.17
5 0.2
6 0.26
7 0.28
8 0.29
9 0.27
10 0.3
11 0.27
12 0.28
13 0.25
14 0.2
15 0.18
16 0.16
17 0.16
18 0.12
19 0.12
20 0.11
21 0.11
22 0.11
23 0.12
24 0.14
25 0.13
26 0.13
27 0.13
28 0.14
29 0.16
30 0.16
31 0.14
32 0.13
33 0.13
34 0.13
35 0.13
36 0.12
37 0.12
38 0.13
39 0.15
40 0.16
41 0.19
42 0.19
43 0.19
44 0.24
45 0.28
46 0.27
47 0.26
48 0.24
49 0.26
50 0.27
51 0.29
52 0.27
53 0.21
54 0.21
55 0.24
56 0.26
57 0.22
58 0.22
59 0.2
60 0.16
61 0.18
62 0.17
63 0.13
64 0.11
65 0.1
66 0.11
67 0.09
68 0.09
69 0.06
70 0.06
71 0.06
72 0.05
73 0.06
74 0.09
75 0.09
76 0.09
77 0.09
78 0.09
79 0.11
80 0.11
81 0.15
82 0.13
83 0.15
84 0.15
85 0.18
86 0.18
87 0.19
88 0.19
89 0.2
90 0.2
91 0.23
92 0.23
93 0.27
94 0.3
95 0.29
96 0.31
97 0.29
98 0.27
99 0.27
100 0.26
101 0.21
102 0.2
103 0.19
104 0.17
105 0.17
106 0.16
107 0.11
108 0.11
109 0.09
110 0.07
111 0.06
112 0.06
113 0.03
114 0.03
115 0.02
116 0.02
117 0.03
118 0.03
119 0.03
120 0.03
121 0.04
122 0.04
123 0.05
124 0.05
125 0.06
126 0.06
127 0.09
128 0.11
129 0.11
130 0.11
131 0.1
132 0.1
133 0.1
134 0.1
135 0.08
136 0.06
137 0.06
138 0.08
139 0.08
140 0.08
141 0.09
142 0.1
143 0.09
144 0.1
145 0.09
146 0.09
147 0.09
148 0.09
149 0.08
150 0.08
151 0.08
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.05
156 0.06
157 0.07
158 0.07
159 0.07
160 0.07
161 0.07
162 0.08
163 0.1
164 0.1
165 0.09
166 0.09
167 0.11
168 0.11
169 0.12
170 0.11
171 0.1
172 0.11
173 0.11
174 0.11
175 0.09
176 0.09
177 0.07
178 0.08
179 0.07
180 0.05
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.06
185 0.07
186 0.06
187 0.07
188 0.07
189 0.08
190 0.09
191 0.09
192 0.09
193 0.09
194 0.09
195 0.1
196 0.12
197 0.12
198 0.11
199 0.11
200 0.11
201 0.11
202 0.12
203 0.13
204 0.14
205 0.16
206 0.17
207 0.17
208 0.17
209 0.16
210 0.15
211 0.13
212 0.12
213 0.11
214 0.14
215 0.21
216 0.25
217 0.27
218 0.34
219 0.41
220 0.5
221 0.57
222 0.65
223 0.68
224 0.75
225 0.85
226 0.89
227 0.91
228 0.92
229 0.9
230 0.87
231 0.82
232 0.78
233 0.69
234 0.59
235 0.5
236 0.4
237 0.31
238 0.27
239 0.2
240 0.14
241 0.11
242 0.1
243 0.08
244 0.08
245 0.07
246 0.04
247 0.04
248 0.03
249 0.03
250 0.04
251 0.03
252 0.03
253 0.03
254 0.04
255 0.07
256 0.08
257 0.08
258 0.1
259 0.13
260 0.14
261 0.15
262 0.16
263 0.13
264 0.13
265 0.12
266 0.1
267 0.07
268 0.08
269 0.08
270 0.07
271 0.06
272 0.07
273 0.07
274 0.08
275 0.08
276 0.07
277 0.06
278 0.07
279 0.08
280 0.08
281 0.07
282 0.06
283 0.06
284 0.06
285 0.07
286 0.06
287 0.06
288 0.06
289 0.06
290 0.07
291 0.06
292 0.08
293 0.08
294 0.07
295 0.06
296 0.06
297 0.06
298 0.06
299 0.09
300 0.08
301 0.09
302 0.1
303 0.1
304 0.11
305 0.11
306 0.11
307 0.09
308 0.08
309 0.1
310 0.1
311 0.1
312 0.08
313 0.08
314 0.08
315 0.08
316 0.07
317 0.07
318 0.08
319 0.08
320 0.08
321 0.09
322 0.09
323 0.09
324 0.09
325 0.08
326 0.07
327 0.09
328 0.11
329 0.11
330 0.1
331 0.09
332 0.12
333 0.13
334 0.15
335 0.16
336 0.14
337 0.18
338 0.2
339 0.22
340 0.29
341 0.34
342 0.38
343 0.4
344 0.45
345 0.44
346 0.45
347 0.44
348 0.4
349 0.35
350 0.31
351 0.32
352 0.28
353 0.25
354 0.22
355 0.22
356 0.2
357 0.18
358 0.18
359 0.13
360 0.14
361 0.16
362 0.14
363 0.16
364 0.14
365 0.15
366 0.19
367 0.18
368 0.19
369 0.21
370 0.22
371 0.21
372 0.25
373 0.24
374 0.21
375 0.26
376 0.24
377 0.23
378 0.23
379 0.24
380 0.24
381 0.23
382 0.22
383 0.17
384 0.16
385 0.13
386 0.13
387 0.1
388 0.08
389 0.07
390 0.06
391 0.06
392 0.07
393 0.07
394 0.05
395 0.08
396 0.08
397 0.09
398 0.11
399 0.13
400 0.15
401 0.19
402 0.25
403 0.29
404 0.33
405 0.37
406 0.36
407 0.42
408 0.5
409 0.53
410 0.5
411 0.48
412 0.46
413 0.43
414 0.42
415 0.39