Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2D4C5

Protein Details
Accession A0A1Y2D4C5    Localization Confidence High Confidence Score 18.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
95-120DAAPAKLKRPRPAKPTKGKGAGRYFAHydrophilic
155-177RTAGKGKLGRGKRQRREKSAFLDBasic
820-839EEGEQGRKKVRRNLMRRGQNBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
99-115AKLKRPRPAKPTKGKGA
157-172AGKGKLGRGKRQRREK
Subcellular Location(s) mito 13, nucl 10, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045116  Clp1/Grc3  
IPR032319  CLP1_P  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0051731  F:polynucleotide 5'-hydroxyl-kinase activity  
GO:0006396  P:RNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF16575  CLP1_P  
Amino Acid Sequences MATAPLQGKPAQLNKRTRTDSPPSVQPTTQLASNSSMNSPTPPLSAVAARKAALAAQAKIIDPPIHSIDSDNDSDDDVVQQVLADALADPQGQQDAAPAKLKRPRPAKPTKGKGAGRYFAGTADEDSERPSTRPTSGASTEIEVEGAESFEEAARTAGKGKLGRGKRQRREKSAFLDPVCFSSFAPSAGTNAFRVELPSSEGEQRNAAVFCLMTAETLIIHGSYRLTPIFGSTSILGSILTPPPSDASSLSLSAASATAHRVFSPSSHPLPPLEALPPSFASSSTSPSTLSLPGGSLVSLTAFSSVVLVEELGAEIEGVETVLRSSGMGCGNAMWQVEDTFGRSEHWGGAGWRLILEPTPSLTSLRPLESWESTLASFGYRGRTANARSFDDEEEEEEEEEEELAAGAERLVLLVEGPKRVGKSTFTKLLLNRLLYRYETVAYLDTDLGQPEFTTPGFVSLNVVREPVLGPSFTHLSLPISSHFLGTTSPASDPSAYLAAISSLLATFSLDVEYPLTDEAPRRRGAAAASSRTSSKIRDRVPLIINTQGWVKGLGADLLAKLKAEARPTHVVSFEPAEESTEGGWSGQEQMAPPPPEYQDPSCQVIRLVGAPSSPLDSKWSAADLRTLSLISYFHAVFPRDPTPSDVPRTNTFPTAWDFSTPLVSQTPFTVDWTASRKQIKGVHLLDSDVPYEQVLYALNGSVVALLEEIESINQLEEAMPPSAPSAQAHAFPLLYLPPPPTSTRSLGLALIRSIDPTTQTLHLLTPVHSSHLAASPLTLVKGAIDLPLPLLLDFKAGEMELNKGVCGTEWKDVPYLTVEEGEQGRKKVRRNLMRRGQN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.62
2 0.7
3 0.73
4 0.71
5 0.71
6 0.71
7 0.71
8 0.67
9 0.69
10 0.66
11 0.65
12 0.6
13 0.55
14 0.51
15 0.44
16 0.41
17 0.33
18 0.29
19 0.28
20 0.3
21 0.29
22 0.25
23 0.25
24 0.23
25 0.24
26 0.24
27 0.22
28 0.2
29 0.19
30 0.19
31 0.19
32 0.24
33 0.25
34 0.28
35 0.29
36 0.28
37 0.27
38 0.26
39 0.24
40 0.25
41 0.25
42 0.21
43 0.22
44 0.24
45 0.24
46 0.24
47 0.26
48 0.21
49 0.18
50 0.22
51 0.22
52 0.21
53 0.21
54 0.22
55 0.23
56 0.26
57 0.26
58 0.23
59 0.2
60 0.2
61 0.2
62 0.18
63 0.15
64 0.11
65 0.1
66 0.08
67 0.07
68 0.06
69 0.06
70 0.05
71 0.05
72 0.04
73 0.05
74 0.06
75 0.07
76 0.07
77 0.07
78 0.08
79 0.08
80 0.08
81 0.12
82 0.14
83 0.16
84 0.23
85 0.23
86 0.29
87 0.37
88 0.44
89 0.49
90 0.55
91 0.61
92 0.65
93 0.75
94 0.79
95 0.82
96 0.86
97 0.87
98 0.87
99 0.84
100 0.83
101 0.8
102 0.73
103 0.65
104 0.57
105 0.48
106 0.39
107 0.35
108 0.27
109 0.19
110 0.18
111 0.17
112 0.15
113 0.17
114 0.18
115 0.18
116 0.18
117 0.2
118 0.2
119 0.2
120 0.23
121 0.23
122 0.27
123 0.28
124 0.3
125 0.28
126 0.26
127 0.26
128 0.23
129 0.2
130 0.13
131 0.12
132 0.09
133 0.08
134 0.06
135 0.05
136 0.05
137 0.05
138 0.06
139 0.06
140 0.06
141 0.07
142 0.07
143 0.1
144 0.12
145 0.16
146 0.18
147 0.23
148 0.31
149 0.37
150 0.47
151 0.55
152 0.65
153 0.7
154 0.79
155 0.84
156 0.85
157 0.86
158 0.84
159 0.8
160 0.78
161 0.76
162 0.66
163 0.61
164 0.52
165 0.47
166 0.41
167 0.35
168 0.25
169 0.21
170 0.2
171 0.16
172 0.17
173 0.14
174 0.14
175 0.16
176 0.17
177 0.13
178 0.13
179 0.13
180 0.12
181 0.13
182 0.13
183 0.11
184 0.13
185 0.15
186 0.16
187 0.22
188 0.24
189 0.23
190 0.23
191 0.23
192 0.22
193 0.2
194 0.18
195 0.12
196 0.1
197 0.09
198 0.1
199 0.09
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.06
205 0.06
206 0.04
207 0.04
208 0.05
209 0.06
210 0.06
211 0.08
212 0.08
213 0.09
214 0.08
215 0.1
216 0.11
217 0.11
218 0.12
219 0.11
220 0.11
221 0.11
222 0.11
223 0.09
224 0.08
225 0.1
226 0.1
227 0.1
228 0.1
229 0.1
230 0.11
231 0.12
232 0.13
233 0.11
234 0.12
235 0.13
236 0.13
237 0.13
238 0.12
239 0.11
240 0.11
241 0.1
242 0.07
243 0.06
244 0.08
245 0.1
246 0.1
247 0.1
248 0.11
249 0.11
250 0.12
251 0.18
252 0.2
253 0.22
254 0.24
255 0.24
256 0.24
257 0.26
258 0.25
259 0.21
260 0.17
261 0.15
262 0.14
263 0.15
264 0.15
265 0.14
266 0.13
267 0.12
268 0.14
269 0.14
270 0.17
271 0.16
272 0.16
273 0.15
274 0.16
275 0.17
276 0.15
277 0.14
278 0.1
279 0.09
280 0.09
281 0.09
282 0.08
283 0.06
284 0.05
285 0.05
286 0.05
287 0.05
288 0.05
289 0.04
290 0.05
291 0.05
292 0.05
293 0.05
294 0.04
295 0.04
296 0.03
297 0.03
298 0.04
299 0.03
300 0.03
301 0.03
302 0.03
303 0.03
304 0.02
305 0.02
306 0.02
307 0.02
308 0.02
309 0.03
310 0.03
311 0.03
312 0.03
313 0.07
314 0.08
315 0.08
316 0.08
317 0.08
318 0.09
319 0.1
320 0.1
321 0.07
322 0.06
323 0.06
324 0.07
325 0.07
326 0.08
327 0.08
328 0.08
329 0.09
330 0.09
331 0.1
332 0.09
333 0.09
334 0.09
335 0.09
336 0.11
337 0.11
338 0.1
339 0.09
340 0.09
341 0.08
342 0.08
343 0.08
344 0.07
345 0.07
346 0.08
347 0.08
348 0.09
349 0.09
350 0.12
351 0.13
352 0.14
353 0.13
354 0.14
355 0.16
356 0.16
357 0.17
358 0.14
359 0.13
360 0.12
361 0.12
362 0.11
363 0.08
364 0.08
365 0.08
366 0.1
367 0.1
368 0.1
369 0.11
370 0.15
371 0.18
372 0.23
373 0.25
374 0.25
375 0.26
376 0.28
377 0.27
378 0.25
379 0.22
380 0.17
381 0.16
382 0.14
383 0.12
384 0.1
385 0.1
386 0.07
387 0.07
388 0.06
389 0.04
390 0.03
391 0.03
392 0.03
393 0.02
394 0.02
395 0.02
396 0.02
397 0.02
398 0.02
399 0.02
400 0.02
401 0.05
402 0.06
403 0.07
404 0.08
405 0.09
406 0.09
407 0.1
408 0.11
409 0.12
410 0.17
411 0.22
412 0.27
413 0.28
414 0.31
415 0.31
416 0.36
417 0.36
418 0.32
419 0.3
420 0.25
421 0.25
422 0.22
423 0.22
424 0.16
425 0.14
426 0.12
427 0.11
428 0.1
429 0.09
430 0.09
431 0.08
432 0.08
433 0.07
434 0.07
435 0.07
436 0.06
437 0.05
438 0.05
439 0.06
440 0.05
441 0.06
442 0.06
443 0.08
444 0.08
445 0.08
446 0.1
447 0.11
448 0.13
449 0.12
450 0.12
451 0.1
452 0.1
453 0.11
454 0.1
455 0.09
456 0.07
457 0.07
458 0.09
459 0.1
460 0.1
461 0.1
462 0.09
463 0.09
464 0.1
465 0.11
466 0.1
467 0.11
468 0.11
469 0.11
470 0.11
471 0.1
472 0.09
473 0.1
474 0.1
475 0.08
476 0.08
477 0.09
478 0.1
479 0.1
480 0.09
481 0.09
482 0.09
483 0.08
484 0.08
485 0.07
486 0.06
487 0.06
488 0.06
489 0.04
490 0.03
491 0.03
492 0.03
493 0.03
494 0.03
495 0.03
496 0.04
497 0.04
498 0.04
499 0.05
500 0.05
501 0.05
502 0.05
503 0.06
504 0.06
505 0.1
506 0.14
507 0.18
508 0.18
509 0.19
510 0.2
511 0.2
512 0.2
513 0.25
514 0.27
515 0.27
516 0.27
517 0.27
518 0.27
519 0.29
520 0.29
521 0.24
522 0.26
523 0.3
524 0.32
525 0.37
526 0.39
527 0.43
528 0.46
529 0.46
530 0.4
531 0.37
532 0.34
533 0.28
534 0.27
535 0.2
536 0.17
537 0.14
538 0.12
539 0.08
540 0.08
541 0.08
542 0.07
543 0.07
544 0.07
545 0.08
546 0.08
547 0.06
548 0.06
549 0.09
550 0.11
551 0.15
552 0.17
553 0.21
554 0.27
555 0.3
556 0.31
557 0.29
558 0.27
559 0.24
560 0.25
561 0.19
562 0.15
563 0.12
564 0.12
565 0.12
566 0.12
567 0.1
568 0.09
569 0.08
570 0.07
571 0.07
572 0.05
573 0.08
574 0.08
575 0.08
576 0.08
577 0.11
578 0.18
579 0.2
580 0.2
581 0.21
582 0.22
583 0.24
584 0.28
585 0.28
586 0.28
587 0.3
588 0.33
589 0.31
590 0.3
591 0.27
592 0.24
593 0.22
594 0.17
595 0.14
596 0.11
597 0.1
598 0.11
599 0.11
600 0.13
601 0.12
602 0.11
603 0.13
604 0.14
605 0.15
606 0.15
607 0.17
608 0.15
609 0.15
610 0.19
611 0.16
612 0.16
613 0.16
614 0.15
615 0.12
616 0.13
617 0.12
618 0.09
619 0.11
620 0.1
621 0.11
622 0.14
623 0.16
624 0.16
625 0.2
626 0.23
627 0.22
628 0.23
629 0.27
630 0.3
631 0.34
632 0.38
633 0.38
634 0.4
635 0.42
636 0.46
637 0.42
638 0.38
639 0.34
640 0.3
641 0.3
642 0.3
643 0.26
644 0.23
645 0.22
646 0.2
647 0.23
648 0.21
649 0.19
650 0.17
651 0.16
652 0.16
653 0.15
654 0.18
655 0.15
656 0.17
657 0.17
658 0.15
659 0.19
660 0.23
661 0.25
662 0.28
663 0.31
664 0.3
665 0.34
666 0.4
667 0.4
668 0.44
669 0.43
670 0.43
671 0.4
672 0.41
673 0.37
674 0.32
675 0.29
676 0.2
677 0.18
678 0.11
679 0.11
680 0.09
681 0.08
682 0.07
683 0.07
684 0.07
685 0.07
686 0.07
687 0.06
688 0.06
689 0.06
690 0.05
691 0.05
692 0.04
693 0.04
694 0.04
695 0.05
696 0.05
697 0.04
698 0.05
699 0.05
700 0.05
701 0.05
702 0.05
703 0.06
704 0.07
705 0.1
706 0.1
707 0.1
708 0.1
709 0.11
710 0.12
711 0.13
712 0.12
713 0.14
714 0.15
715 0.18
716 0.19
717 0.19
718 0.18
719 0.17
720 0.17
721 0.14
722 0.14
723 0.13
724 0.14
725 0.15
726 0.18
727 0.21
728 0.24
729 0.27
730 0.3
731 0.3
732 0.31
733 0.3
734 0.3
735 0.3
736 0.28
737 0.23
738 0.22
739 0.2
740 0.18
741 0.17
742 0.15
743 0.15
744 0.14
745 0.17
746 0.16
747 0.17
748 0.17
749 0.17
750 0.2
751 0.2
752 0.19
753 0.21
754 0.2
755 0.22
756 0.22
757 0.21
758 0.2
759 0.23
760 0.24
761 0.18
762 0.18
763 0.17
764 0.18
765 0.18
766 0.15
767 0.11
768 0.1
769 0.11
770 0.11
771 0.09
772 0.09
773 0.08
774 0.09
775 0.11
776 0.11
777 0.1
778 0.1
779 0.09
780 0.1
781 0.1
782 0.1
783 0.1
784 0.09
785 0.11
786 0.11
787 0.14
788 0.16
789 0.16
790 0.16
791 0.15
792 0.15
793 0.14
794 0.19
795 0.19
796 0.21
797 0.23
798 0.26
799 0.28
800 0.28
801 0.29
802 0.26
803 0.25
804 0.2
805 0.2
806 0.18
807 0.2
808 0.22
809 0.28
810 0.28
811 0.29
812 0.36
813 0.4
814 0.48
815 0.54
816 0.62
817 0.66
818 0.71
819 0.79