Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2C7H2

Protein Details
Accession A0A1Y2C7H2    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
49-74DDTPAPKAKPKAKREPAKKRNTDSSDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
53-68APKAKPKAKREPAKKR
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036864  Zn2-C6_fun-type_DNA-bd_sf  
IPR001138  Zn2Cys6_DnaBD  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Gene Ontology GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00172  Zn_clus  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
PS50157  ZINC_FINGER_C2H2_2  
PS00463  ZN2_CY6_FUNGAL_1  
PS50048  ZN2_CY6_FUNGAL_2  
CDD cd00067  GAL4  
Amino Acid Sequences MPEHLSRHQQARHSDIKEFVCATCNKGFARRDILRRHELGHQKNKDSGDDTPAPKAKPKAKREPAKKRNTDSSDISIEAPPAKISRASRACTACSKSKLRCDGEQPCSRCRRGGVECSFERETPGAVDHPSKSPSDRSEGESASLVGDSGEDEGGYHNGGHPGMMGGHPGWSMPGMSPYGLPLRPPSLGPHGALPPSSFQQPMGIGSPSHYYSRPPDQFGPGGPGGPGS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.52
3 0.5
4 0.47
5 0.42
6 0.35
7 0.33
8 0.3
9 0.32
10 0.29
11 0.3
12 0.28
13 0.34
14 0.36
15 0.34
16 0.43
17 0.45
18 0.5
19 0.55
20 0.61
21 0.6
22 0.6
23 0.58
24 0.57
25 0.6
26 0.61
27 0.63
28 0.62
29 0.58
30 0.61
31 0.6
32 0.54
33 0.48
34 0.39
35 0.36
36 0.36
37 0.35
38 0.37
39 0.39
40 0.38
41 0.39
42 0.45
43 0.46
44 0.49
45 0.57
46 0.61
47 0.68
48 0.77
49 0.83
50 0.87
51 0.89
52 0.9
53 0.89
54 0.84
55 0.84
56 0.8
57 0.74
58 0.67
59 0.61
60 0.52
61 0.45
62 0.4
63 0.3
64 0.25
65 0.2
66 0.16
67 0.12
68 0.1
69 0.1
70 0.12
71 0.13
72 0.21
73 0.25
74 0.27
75 0.32
76 0.34
77 0.35
78 0.37
79 0.4
80 0.36
81 0.37
82 0.41
83 0.4
84 0.45
85 0.5
86 0.49
87 0.48
88 0.49
89 0.52
90 0.54
91 0.56
92 0.52
93 0.51
94 0.53
95 0.5
96 0.44
97 0.37
98 0.35
99 0.32
100 0.38
101 0.36
102 0.37
103 0.37
104 0.41
105 0.41
106 0.34
107 0.31
108 0.22
109 0.19
110 0.13
111 0.14
112 0.09
113 0.09
114 0.11
115 0.11
116 0.13
117 0.14
118 0.14
119 0.15
120 0.17
121 0.18
122 0.22
123 0.22
124 0.24
125 0.26
126 0.26
127 0.25
128 0.23
129 0.21
130 0.15
131 0.13
132 0.09
133 0.05
134 0.05
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.03
139 0.04
140 0.05
141 0.05
142 0.06
143 0.05
144 0.06
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.06
149 0.06
150 0.07
151 0.07
152 0.07
153 0.06
154 0.07
155 0.07
156 0.07
157 0.06
158 0.06
159 0.07
160 0.06
161 0.08
162 0.08
163 0.08
164 0.09
165 0.1
166 0.14
167 0.14
168 0.15
169 0.16
170 0.18
171 0.18
172 0.19
173 0.22
174 0.25
175 0.27
176 0.26
177 0.27
178 0.27
179 0.28
180 0.27
181 0.24
182 0.2
183 0.21
184 0.22
185 0.19
186 0.16
187 0.18
188 0.18
189 0.2
190 0.19
191 0.18
192 0.16
193 0.17
194 0.21
195 0.2
196 0.22
197 0.2
198 0.21
199 0.26
200 0.37
201 0.4
202 0.42
203 0.43
204 0.47
205 0.48
206 0.46
207 0.47
208 0.37
209 0.33