Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2FX41

Protein Details
Accession A0A1Y2FX41    Localization Confidence High Confidence Score 16.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
31-55SESGHLSRTPRTPKKPKPSGDFIFYHydrophilic
91-110GGKAIKQQPKPKKSNTDEWDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
85-103KKAKSNGGKAIKQQPKPKK
239-243KGKKR
331-361HKELLKKRAESAKKAAATRIKNGTTQKRGSK
Subcellular Location(s) nucl 11.5, cyto_nucl 10.833, cyto 9, cyto_mito 7.333, mito 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009061  DNA-bd_dom_put_sf  
IPR022656  XPA_C  
IPR037129  XPA_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF05181  XPA_C  
CDD cd21075  DBD_XPA-like  
Amino Acid Sequences MSNSRFRTPSPEPGPAPILDLTTPSPALAPSESGHLSRTPRTPKKPKPSGDFIFYDSEDGGQDPLAHLDEDDEDEFEPAASTPTKKAKSNGGKAIKQQPKPKKSNTDEWDDIPDWGEQQHCFLWDLPVELLDKILASPTLTLRDHLSLAATCRTLRAPYYTFSSSSKPRTLTGPLWEALMILRPPANTGNSTRSNKHPTTQHYKLIDRIFSNEDKCAVAEMKVLWPAVKVKGGEGSSSKGKKRAREEDVGVVGEAMISKQWQEAIDMIEDSKITKTDALKHYKISEKQLAPLPHITKRNPHDRHGNTVMRLYVEAAVEAKALKVHGGPVGHKELLKKRAESAKKAAATRIKNGTTQKRGSKSSYRGPRIGGYYYGYRGYDKGYW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.47
3 0.45
4 0.35
5 0.3
6 0.21
7 0.22
8 0.19
9 0.18
10 0.18
11 0.15
12 0.15
13 0.13
14 0.15
15 0.14
16 0.14
17 0.12
18 0.17
19 0.18
20 0.18
21 0.2
22 0.21
23 0.24
24 0.28
25 0.35
26 0.41
27 0.5
28 0.6
29 0.69
30 0.76
31 0.83
32 0.88
33 0.89
34 0.86
35 0.86
36 0.81
37 0.77
38 0.69
39 0.61
40 0.55
41 0.46
42 0.39
43 0.29
44 0.24
45 0.18
46 0.15
47 0.12
48 0.08
49 0.08
50 0.07
51 0.09
52 0.09
53 0.08
54 0.08
55 0.08
56 0.09
57 0.12
58 0.12
59 0.11
60 0.1
61 0.11
62 0.11
63 0.1
64 0.09
65 0.07
66 0.08
67 0.09
68 0.11
69 0.15
70 0.24
71 0.28
72 0.31
73 0.34
74 0.43
75 0.51
76 0.58
77 0.63
78 0.63
79 0.63
80 0.67
81 0.75
82 0.73
83 0.7
84 0.71
85 0.71
86 0.73
87 0.77
88 0.79
89 0.79
90 0.77
91 0.8
92 0.75
93 0.73
94 0.65
95 0.59
96 0.57
97 0.47
98 0.4
99 0.31
100 0.27
101 0.18
102 0.16
103 0.16
104 0.1
105 0.11
106 0.12
107 0.11
108 0.13
109 0.13
110 0.13
111 0.12
112 0.13
113 0.11
114 0.12
115 0.12
116 0.1
117 0.1
118 0.08
119 0.07
120 0.06
121 0.06
122 0.05
123 0.04
124 0.05
125 0.06
126 0.11
127 0.11
128 0.12
129 0.14
130 0.15
131 0.15
132 0.14
133 0.14
134 0.1
135 0.12
136 0.13
137 0.12
138 0.11
139 0.11
140 0.12
141 0.12
142 0.12
143 0.15
144 0.14
145 0.15
146 0.21
147 0.21
148 0.22
149 0.23
150 0.26
151 0.27
152 0.3
153 0.32
154 0.28
155 0.27
156 0.29
157 0.31
158 0.3
159 0.29
160 0.27
161 0.23
162 0.22
163 0.21
164 0.18
165 0.14
166 0.13
167 0.09
168 0.06
169 0.07
170 0.07
171 0.08
172 0.09
173 0.11
174 0.1
175 0.13
176 0.18
177 0.25
178 0.27
179 0.28
180 0.33
181 0.39
182 0.38
183 0.4
184 0.4
185 0.39
186 0.46
187 0.48
188 0.49
189 0.46
190 0.46
191 0.48
192 0.45
193 0.41
194 0.32
195 0.31
196 0.27
197 0.26
198 0.26
199 0.21
200 0.19
201 0.17
202 0.16
203 0.15
204 0.12
205 0.09
206 0.09
207 0.09
208 0.1
209 0.11
210 0.11
211 0.1
212 0.1
213 0.12
214 0.12
215 0.14
216 0.13
217 0.12
218 0.16
219 0.17
220 0.17
221 0.17
222 0.18
223 0.23
224 0.27
225 0.29
226 0.31
227 0.35
228 0.4
229 0.48
230 0.54
231 0.53
232 0.55
233 0.57
234 0.55
235 0.54
236 0.47
237 0.38
238 0.28
239 0.21
240 0.15
241 0.11
242 0.06
243 0.04
244 0.03
245 0.04
246 0.04
247 0.06
248 0.06
249 0.07
250 0.09
251 0.1
252 0.11
253 0.11
254 0.11
255 0.1
256 0.09
257 0.09
258 0.09
259 0.08
260 0.08
261 0.11
262 0.13
263 0.21
264 0.29
265 0.37
266 0.38
267 0.4
268 0.45
269 0.49
270 0.51
271 0.5
272 0.51
273 0.44
274 0.47
275 0.51
276 0.47
277 0.43
278 0.46
279 0.43
280 0.4
281 0.45
282 0.43
283 0.45
284 0.5
285 0.58
286 0.55
287 0.56
288 0.61
289 0.58
290 0.65
291 0.65
292 0.63
293 0.54
294 0.52
295 0.48
296 0.38
297 0.35
298 0.27
299 0.21
300 0.15
301 0.14
302 0.12
303 0.11
304 0.1
305 0.1
306 0.09
307 0.07
308 0.07
309 0.08
310 0.08
311 0.09
312 0.12
313 0.14
314 0.16
315 0.2
316 0.26
317 0.27
318 0.28
319 0.33
320 0.38
321 0.45
322 0.48
323 0.44
324 0.46
325 0.55
326 0.6
327 0.61
328 0.61
329 0.61
330 0.61
331 0.62
332 0.62
333 0.61
334 0.58
335 0.58
336 0.58
337 0.52
338 0.52
339 0.6
340 0.63
341 0.63
342 0.67
343 0.68
344 0.67
345 0.69
346 0.71
347 0.71
348 0.69
349 0.7
350 0.73
351 0.72
352 0.68
353 0.66
354 0.65
355 0.59
356 0.54
357 0.47
358 0.4
359 0.37
360 0.37
361 0.37
362 0.32
363 0.29
364 0.27