Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2G1K6

Protein Details
Accession A0A1Y2G1K6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
410-449EVVEAPKKQQKKDKASKEKGSKEKGSKDKSKKKSKKVKQEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
341-363PKIKKAAKAAAKAAKASSKKRPR
415-449PKKQQKKDKASKEKGSKEKGSKDKSKKKSKKVKQE
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12.333, mito_nucl 10.166, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041178  RPA43_OB  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
Amino Acid Sequences MASASSSNLRLQAITSSDPQSEFIQFRASMRLPIAPRWAADGTAGGAAGTGGMEGVKEVLASWVMRYLPPLRAVLLTFDPLPTFAHQTESFPASKDPFTYAKRRSTGNALLSEDDDEEEDEEALSQNGEKPVKQIKFKVLPMIEGSGFGLANVEFKGMAWRPRVGQKIVGSPTLSTPSHISLLIHNLFNASIPASHIQTNDYHFDPEFPVPEAIQKRQQLSFPSAIVEEEKTEQEEVEEKAEVADEEELAELEDRKADEEVEEDKEEEEIDEEAQEEEAYREKGWWRHNVTNEPLGGDEGRIEFTIVGITIANSMISLTGSLLADPFSPAAAAATTSATAPKIKKAAKAAAKAAKASSKKRPRADSESDAGDDSDAFDSDSSRSPSPPALKAPPKVEPGADSEVESEEEEVVEAPKKQQKKDKASKEKGSKEKGSKDKSKKKSKKVKQE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.24
3 0.25
4 0.26
5 0.27
6 0.28
7 0.27
8 0.28
9 0.26
10 0.23
11 0.25
12 0.24
13 0.25
14 0.3
15 0.29
16 0.27
17 0.27
18 0.33
19 0.3
20 0.34
21 0.39
22 0.33
23 0.32
24 0.35
25 0.34
26 0.27
27 0.25
28 0.22
29 0.16
30 0.15
31 0.14
32 0.08
33 0.08
34 0.07
35 0.06
36 0.05
37 0.03
38 0.03
39 0.03
40 0.03
41 0.03
42 0.04
43 0.04
44 0.04
45 0.04
46 0.05
47 0.07
48 0.07
49 0.08
50 0.11
51 0.12
52 0.12
53 0.15
54 0.18
55 0.2
56 0.23
57 0.24
58 0.21
59 0.22
60 0.23
61 0.23
62 0.21
63 0.19
64 0.17
65 0.16
66 0.15
67 0.14
68 0.16
69 0.14
70 0.16
71 0.15
72 0.2
73 0.2
74 0.22
75 0.25
76 0.26
77 0.25
78 0.22
79 0.24
80 0.22
81 0.22
82 0.21
83 0.22
84 0.25
85 0.3
86 0.37
87 0.41
88 0.47
89 0.48
90 0.49
91 0.48
92 0.49
93 0.52
94 0.48
95 0.46
96 0.4
97 0.38
98 0.36
99 0.34
100 0.26
101 0.19
102 0.14
103 0.1
104 0.09
105 0.08
106 0.08
107 0.06
108 0.06
109 0.06
110 0.06
111 0.06
112 0.05
113 0.08
114 0.12
115 0.14
116 0.13
117 0.17
118 0.26
119 0.31
120 0.35
121 0.37
122 0.41
123 0.48
124 0.49
125 0.53
126 0.44
127 0.41
128 0.38
129 0.37
130 0.28
131 0.21
132 0.19
133 0.12
134 0.11
135 0.09
136 0.08
137 0.05
138 0.06
139 0.06
140 0.06
141 0.05
142 0.05
143 0.1
144 0.12
145 0.16
146 0.18
147 0.19
148 0.22
149 0.29
150 0.33
151 0.29
152 0.33
153 0.31
154 0.36
155 0.36
156 0.35
157 0.29
158 0.25
159 0.25
160 0.25
161 0.22
162 0.16
163 0.15
164 0.15
165 0.15
166 0.15
167 0.14
168 0.11
169 0.17
170 0.17
171 0.16
172 0.14
173 0.13
174 0.13
175 0.12
176 0.12
177 0.06
178 0.04
179 0.06
180 0.07
181 0.08
182 0.1
183 0.1
184 0.11
185 0.13
186 0.15
187 0.16
188 0.15
189 0.15
190 0.14
191 0.14
192 0.15
193 0.14
194 0.13
195 0.12
196 0.12
197 0.11
198 0.16
199 0.18
200 0.18
201 0.23
202 0.25
203 0.26
204 0.27
205 0.29
206 0.26
207 0.28
208 0.27
209 0.21
210 0.19
211 0.17
212 0.16
213 0.15
214 0.12
215 0.09
216 0.08
217 0.08
218 0.08
219 0.08
220 0.08
221 0.07
222 0.09
223 0.09
224 0.09
225 0.09
226 0.08
227 0.08
228 0.08
229 0.08
230 0.06
231 0.05
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.05
238 0.04
239 0.04
240 0.05
241 0.05
242 0.06
243 0.06
244 0.06
245 0.06
246 0.08
247 0.1
248 0.12
249 0.12
250 0.12
251 0.12
252 0.12
253 0.12
254 0.1
255 0.08
256 0.06
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.06
261 0.06
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.07
266 0.08
267 0.08
268 0.09
269 0.13
270 0.19
271 0.24
272 0.32
273 0.37
274 0.42
275 0.47
276 0.52
277 0.52
278 0.5
279 0.45
280 0.37
281 0.3
282 0.25
283 0.2
284 0.14
285 0.11
286 0.08
287 0.08
288 0.08
289 0.08
290 0.06
291 0.06
292 0.07
293 0.06
294 0.05
295 0.04
296 0.05
297 0.05
298 0.05
299 0.05
300 0.04
301 0.04
302 0.04
303 0.04
304 0.04
305 0.04
306 0.05
307 0.05
308 0.06
309 0.06
310 0.06
311 0.06
312 0.07
313 0.07
314 0.05
315 0.05
316 0.05
317 0.05
318 0.05
319 0.05
320 0.05
321 0.05
322 0.06
323 0.06
324 0.07
325 0.08
326 0.12
327 0.13
328 0.16
329 0.24
330 0.26
331 0.31
332 0.37
333 0.45
334 0.48
335 0.53
336 0.57
337 0.56
338 0.55
339 0.52
340 0.48
341 0.46
342 0.45
343 0.46
344 0.49
345 0.53
346 0.6
347 0.66
348 0.72
349 0.73
350 0.75
351 0.77
352 0.73
353 0.67
354 0.61
355 0.54
356 0.47
357 0.38
358 0.29
359 0.21
360 0.16
361 0.12
362 0.09
363 0.08
364 0.07
365 0.08
366 0.1
367 0.15
368 0.17
369 0.18
370 0.18
371 0.2
372 0.27
373 0.31
374 0.34
375 0.36
376 0.42
377 0.48
378 0.54
379 0.57
380 0.57
381 0.56
382 0.53
383 0.47
384 0.4
385 0.38
386 0.37
387 0.33
388 0.27
389 0.24
390 0.23
391 0.23
392 0.21
393 0.16
394 0.11
395 0.1
396 0.09
397 0.09
398 0.09
399 0.11
400 0.12
401 0.18
402 0.25
403 0.31
404 0.38
405 0.48
406 0.57
407 0.65
408 0.75
409 0.8
410 0.84
411 0.89
412 0.92
413 0.93
414 0.92
415 0.91
416 0.89
417 0.88
418 0.86
419 0.86
420 0.85
421 0.85
422 0.85
423 0.87
424 0.88
425 0.89
426 0.91
427 0.92
428 0.92
429 0.94