Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2D7R5

Protein Details
Accession A0A1Y2D7R5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
240-266KERERKEEEKEARRRKRERKAEGEEGDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
240-276KERERKEEEKEARRRKRERKAEGEEGDGEGKGKGKGK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 14, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003195  TFIID_TAF13  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF02269  TFIID-18kDa  
Amino Acid Sequences MCYVFHGEPKEGGEDEVVQYLEDVVRAQLGEVVQQARTQAARRGARHLGVEDLIFLVRHDREKLNRIRTYLSWKDVRKKVKDSEGADEELDNMEGEPADRTLKASKMQVQIPWDVTNMFGDFLSEETDGADDEEVEAYEDSKKRLREADNLTRTMTKEQYLHYADCAQASFVYRKSKKFRDFLNLNNSLDGAAFNDEVMDVLGFLAYEMVRTLCEAGIATKRSLALSRANAAVTELRLEKERERKEEEKEARRRKRERKAEGEEGDGEGKGKGKGKEMEEDTKDTPTNEDGKPSPSTAADSTSKKPRRNVASAASPSAASPRSPPRTLLAPTSLFSEPVASSSLPTTLGSNSTDPTTAEAIIEGLVGEVLGAQEKGAPLLLHEVNAGYGAMLQGKASLKASGMRNWRGGVARSNRFI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.19
3 0.19
4 0.17
5 0.14
6 0.13
7 0.13
8 0.12
9 0.1
10 0.09
11 0.07
12 0.08
13 0.08
14 0.08
15 0.1
16 0.1
17 0.11
18 0.14
19 0.16
20 0.15
21 0.16
22 0.16
23 0.16
24 0.19
25 0.2
26 0.23
27 0.31
28 0.38
29 0.4
30 0.46
31 0.48
32 0.49
33 0.49
34 0.44
35 0.38
36 0.31
37 0.29
38 0.22
39 0.18
40 0.15
41 0.12
42 0.11
43 0.12
44 0.13
45 0.16
46 0.19
47 0.24
48 0.3
49 0.4
50 0.49
51 0.55
52 0.57
53 0.57
54 0.57
55 0.55
56 0.58
57 0.56
58 0.53
59 0.51
60 0.54
61 0.61
62 0.65
63 0.7
64 0.68
65 0.69
66 0.7
67 0.72
68 0.73
69 0.67
70 0.68
71 0.62
72 0.56
73 0.49
74 0.41
75 0.32
76 0.24
77 0.2
78 0.12
79 0.08
80 0.07
81 0.06
82 0.06
83 0.06
84 0.07
85 0.08
86 0.08
87 0.1
88 0.13
89 0.16
90 0.19
91 0.22
92 0.29
93 0.33
94 0.36
95 0.37
96 0.37
97 0.38
98 0.37
99 0.33
100 0.27
101 0.21
102 0.19
103 0.17
104 0.14
105 0.11
106 0.08
107 0.08
108 0.07
109 0.07
110 0.09
111 0.08
112 0.07
113 0.07
114 0.07
115 0.07
116 0.07
117 0.07
118 0.04
119 0.05
120 0.05
121 0.05
122 0.05
123 0.05
124 0.06
125 0.1
126 0.12
127 0.13
128 0.18
129 0.18
130 0.2
131 0.27
132 0.3
133 0.34
134 0.42
135 0.51
136 0.52
137 0.53
138 0.52
139 0.48
140 0.45
141 0.4
142 0.32
143 0.24
144 0.2
145 0.2
146 0.25
147 0.26
148 0.25
149 0.23
150 0.23
151 0.21
152 0.19
153 0.18
154 0.11
155 0.09
156 0.11
157 0.12
158 0.13
159 0.23
160 0.25
161 0.32
162 0.4
163 0.48
164 0.53
165 0.56
166 0.57
167 0.58
168 0.59
169 0.59
170 0.61
171 0.57
172 0.5
173 0.45
174 0.4
175 0.3
176 0.26
177 0.19
178 0.1
179 0.06
180 0.06
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.04
187 0.02
188 0.02
189 0.03
190 0.02
191 0.02
192 0.03
193 0.03
194 0.03
195 0.03
196 0.03
197 0.03
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.06
204 0.1
205 0.11
206 0.11
207 0.11
208 0.12
209 0.12
210 0.13
211 0.14
212 0.14
213 0.15
214 0.16
215 0.17
216 0.16
217 0.16
218 0.16
219 0.14
220 0.1
221 0.1
222 0.09
223 0.09
224 0.11
225 0.13
226 0.17
227 0.25
228 0.3
229 0.33
230 0.4
231 0.43
232 0.47
233 0.55
234 0.59
235 0.6
236 0.66
237 0.72
238 0.74
239 0.8
240 0.85
241 0.85
242 0.87
243 0.87
244 0.86
245 0.86
246 0.84
247 0.84
248 0.76
249 0.68
250 0.58
251 0.49
252 0.4
253 0.3
254 0.22
255 0.13
256 0.12
257 0.11
258 0.15
259 0.15
260 0.2
261 0.25
262 0.27
263 0.34
264 0.37
265 0.43
266 0.4
267 0.44
268 0.4
269 0.37
270 0.36
271 0.29
272 0.26
273 0.21
274 0.24
275 0.2
276 0.23
277 0.21
278 0.24
279 0.25
280 0.25
281 0.23
282 0.18
283 0.21
284 0.18
285 0.21
286 0.22
287 0.25
288 0.29
289 0.38
290 0.45
291 0.47
292 0.52
293 0.56
294 0.59
295 0.61
296 0.62
297 0.58
298 0.6
299 0.58
300 0.55
301 0.47
302 0.38
303 0.32
304 0.3
305 0.24
306 0.15
307 0.18
308 0.25
309 0.31
310 0.32
311 0.34
312 0.34
313 0.39
314 0.41
315 0.4
316 0.36
317 0.32
318 0.31
319 0.34
320 0.3
321 0.24
322 0.22
323 0.2
324 0.14
325 0.14
326 0.15
327 0.11
328 0.11
329 0.12
330 0.13
331 0.11
332 0.12
333 0.12
334 0.11
335 0.13
336 0.14
337 0.15
338 0.15
339 0.15
340 0.16
341 0.15
342 0.17
343 0.16
344 0.14
345 0.13
346 0.12
347 0.11
348 0.1
349 0.1
350 0.06
351 0.05
352 0.04
353 0.04
354 0.03
355 0.03
356 0.03
357 0.04
358 0.04
359 0.04
360 0.06
361 0.07
362 0.07
363 0.09
364 0.08
365 0.08
366 0.15
367 0.15
368 0.14
369 0.15
370 0.14
371 0.13
372 0.14
373 0.13
374 0.06
375 0.06
376 0.06
377 0.08
378 0.07
379 0.07
380 0.11
381 0.12
382 0.15
383 0.15
384 0.16
385 0.15
386 0.22
387 0.26
388 0.3
389 0.37
390 0.41
391 0.43
392 0.43
393 0.46
394 0.44
395 0.44
396 0.46
397 0.47