FuNGI

A0A1Y2CI20

Protein Details

Accession

A0A1Y2CI20

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
531-551	AVKQERASRRAEKKTTKETFG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
514-563	IKRPRGETAEQKKARKEAVKQERASRRAEKKTTKETFGNEFKRQKRIAGK

Subcellular Location(s)

nucl 19, cyto 4, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MSLWRKPGTKTFQLVHRSQRDPLINDPDASDRVLKEIDTSQQKKGSSSSKKQTQEDFATNEAELGDAAAYGIYFDDAEYNYMQHLRTVGDHAESYLVEAPVSKKGKGKAARLDDGGFTMKDDAERGQPVDLPEDSLPSHPLDEASYLDITSNKAPTMGLQPDLDPRVREVLEALDDEAYAVDDGEGTDEEEDFFEGIMKGGEVEERDVWEDDDEDVDDVTGGVSRLDVEDDDNLPLEARIARFKAQQGGRGADSDDEDDYSEGGDTIADLKAASARRPPRKGASMAGSQFSMTSSAMFRNEGLRTLDDRFDQIEKLYEEDSDESWGGESDEEDDYVPDLGPPREDLDQIMDDFLSRYEVLGGKMRHVLDPTPGVEGNAGKLDRIRKSLATMDLGEAEEGEDPELAARRIEKAKILAAVERQWKEEAGKKNRIKMEYAKPKERWDCETVLSTYSNVSNHPRLLRVRENGPRPARIRIDEKTGFPVVEGGEEKKDEEEDEEMEEESDDGAPRPETIKRPRGETAEQKKARKEAVKQERASRRAEKKTTKETFGNEFKRQKRIAGKAVAGGAAADIRVGEGVRRLA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.67
2	0.68
3	0.68
4	0.63
5	0.6
6	0.62
7	0.61
8	0.57
9	0.58
10	0.57
11	0.5
12	0.47
13	0.46
14	0.41
15	0.36
16	0.34
17	0.29
18	0.2
19	0.21
20	0.21
21	0.19
22	0.18
23	0.2
24	0.26
25	0.34
26	0.37
27	0.4
28	0.45
29	0.46
30	0.44
31	0.47
32	0.5
33	0.49
34	0.56
35	0.61
36	0.65
37	0.72
38	0.76
39	0.76
40	0.74
41	0.71
42	0.67
43	0.6
44	0.53
45	0.47
46	0.41
47	0.35
48	0.26
49	0.19
50	0.12
51	0.09
52	0.07
53	0.04
54	0.04
55	0.04
56	0.04
57	0.04
58	0.04
59	0.04
60	0.04
61	0.04
62	0.06
63	0.07
64	0.09
65	0.09
66	0.1
67	0.11
68	0.13
69	0.13
70	0.12
71	0.13
72	0.12
73	0.14
74	0.17
75	0.17
76	0.17
77	0.17
78	0.16
79	0.16
80	0.15
81	0.15
82	0.15
83	0.14
84	0.11
85	0.13
86	0.14
87	0.21
88	0.24
89	0.24
90	0.26
91	0.3
92	0.39
93	0.45
94	0.51
95	0.52
96	0.57
97	0.6
98	0.57
99	0.55
100	0.47
101	0.42
102	0.36
103	0.26
104	0.19
105	0.16
106	0.14
107	0.12
108	0.13
109	0.12
110	0.14
111	0.16
112	0.16
113	0.16
114	0.18
115	0.18
116	0.2
117	0.19
118	0.18
119	0.16
120	0.17
121	0.17
122	0.16
123	0.17
124	0.14
125	0.14
126	0.11
127	0.12
128	0.11
129	0.11
130	0.11
131	0.11
132	0.11
133	0.1
134	0.11
135	0.11
136	0.12
137	0.13
138	0.13
139	0.11
140	0.11
141	0.11
142	0.12
143	0.18
144	0.18
145	0.18
146	0.17
147	0.18
148	0.22
149	0.25
150	0.25
151	0.19
152	0.18
153	0.2
154	0.2
155	0.19
156	0.15
157	0.14
158	0.14
159	0.14
160	0.14
161	0.09
162	0.09
163	0.09
164	0.08
165	0.07
166	0.05
167	0.04
168	0.04
169	0.03
170	0.04
171	0.04
172	0.05
173	0.05
174	0.05
175	0.05
176	0.05
177	0.05
178	0.06
179	0.05
180	0.05
181	0.05
182	0.05
183	0.05
184	0.05
185	0.05
186	0.05
187	0.05
188	0.06
189	0.05
190	0.07
191	0.07
192	0.08
193	0.1
194	0.1
195	0.11
196	0.1
197	0.1
198	0.09
199	0.09
200	0.08
201	0.07
202	0.06
203	0.06
204	0.05
205	0.04
206	0.04
207	0.04
208	0.04
209	0.03
210	0.03
211	0.04
212	0.04
213	0.05
214	0.05
215	0.05
216	0.07
217	0.08
218	0.08
219	0.08
220	0.08
221	0.08
222	0.07
223	0.07
224	0.07
225	0.07
226	0.1
227	0.11
228	0.13
229	0.15
230	0.17
231	0.24
232	0.24
233	0.28
234	0.28
235	0.29
236	0.28
237	0.26
238	0.25
239	0.18
240	0.18
241	0.13
242	0.1
243	0.08
244	0.08
245	0.07
246	0.07
247	0.06
248	0.05
249	0.04
250	0.04
251	0.03
252	0.03
253	0.04
254	0.04
255	0.04
256	0.04
257	0.04
258	0.08
259	0.08
260	0.09
261	0.15
262	0.23
263	0.31
264	0.34
265	0.38
266	0.39
267	0.43
268	0.44
269	0.41
270	0.38
271	0.35
272	0.33
273	0.31
274	0.26
275	0.21
276	0.19
277	0.16
278	0.12
279	0.07
280	0.06
281	0.06
282	0.07
283	0.08
284	0.08
285	0.08
286	0.1
287	0.11
288	0.12
289	0.13
290	0.13
291	0.14
292	0.16
293	0.17
294	0.14
295	0.15
296	0.15
297	0.14
298	0.13
299	0.11
300	0.13
301	0.11
302	0.13
303	0.12
304	0.1
305	0.1
306	0.11
307	0.11
308	0.1
309	0.09
310	0.08
311	0.08
312	0.08
313	0.07
314	0.06
315	0.06
316	0.06
317	0.06
318	0.06
319	0.06
320	0.06
321	0.07
322	0.07
323	0.07
324	0.05
325	0.07
326	0.07
327	0.08
328	0.08
329	0.1
330	0.11
331	0.11
332	0.11
333	0.12
334	0.13
335	0.12
336	0.12
337	0.1
338	0.09
339	0.09
340	0.08
341	0.07
342	0.06
343	0.05
344	0.07
345	0.08
346	0.1
347	0.15
348	0.16
349	0.16
350	0.2
351	0.2
352	0.2
353	0.2
354	0.19
355	0.16
356	0.18
357	0.18
358	0.16
359	0.15
360	0.15
361	0.14
362	0.14
363	0.12
364	0.13
365	0.12
366	0.1
367	0.13
368	0.18
369	0.19
370	0.22
371	0.24
372	0.21
373	0.24
374	0.28
375	0.28
376	0.25
377	0.23
378	0.21
379	0.2
380	0.19
381	0.16
382	0.12
383	0.1
384	0.08
385	0.07
386	0.06
387	0.05
388	0.05
389	0.06
390	0.07
391	0.07
392	0.07
393	0.08
394	0.11
395	0.15
396	0.16
397	0.17
398	0.18
399	0.2
400	0.23
401	0.23
402	0.22
403	0.22
404	0.26
405	0.32
406	0.31
407	0.3
408	0.28
409	0.28
410	0.28
411	0.33
412	0.37
413	0.38
414	0.48
415	0.5
416	0.57
417	0.62
418	0.61
419	0.59
420	0.57
421	0.59
422	0.6
423	0.64
424	0.65
425	0.63
426	0.69
427	0.72
428	0.68
429	0.63
430	0.56
431	0.51
432	0.45
433	0.46
434	0.38
435	0.33
436	0.29
437	0.23
438	0.2
439	0.19
440	0.17
441	0.15
442	0.2
443	0.21
444	0.25
445	0.26
446	0.3
447	0.32
448	0.39
449	0.44
450	0.43
451	0.48
452	0.53
453	0.57
454	0.61
455	0.62
456	0.62
457	0.57
458	0.6
459	0.56
460	0.53
461	0.54
462	0.48
463	0.52
464	0.48
465	0.47
466	0.45
467	0.41
468	0.36
469	0.29
470	0.28
471	0.19
472	0.19
473	0.19
474	0.16
475	0.17
476	0.17
477	0.18
478	0.17
479	0.17
480	0.15
481	0.15
482	0.15
483	0.13
484	0.15
485	0.15
486	0.14
487	0.14
488	0.13
489	0.11
490	0.1
491	0.1
492	0.08
493	0.08
494	0.09
495	0.09
496	0.11
497	0.13
498	0.18
499	0.26
500	0.35
501	0.43
502	0.44
503	0.5
504	0.54
505	0.58
506	0.61
507	0.64
508	0.64
509	0.66
510	0.71
511	0.71
512	0.72
513	0.7
514	0.7
515	0.67
516	0.66
517	0.66
518	0.7
519	0.74
520	0.73
521	0.78
522	0.79
523	0.75
524	0.74
525	0.73
526	0.71
527	0.72
528	0.77
529	0.77
530	0.76
531	0.83
532	0.83
533	0.8
534	0.75
535	0.7
536	0.7
537	0.7
538	0.69
539	0.67
540	0.7
541	0.69
542	0.73
543	0.69
544	0.68
545	0.68
546	0.69
547	0.68
548	0.67
549	0.64
550	0.59
551	0.58
552	0.5
553	0.4
554	0.31
555	0.22
556	0.15
557	0.11
558	0.07
559	0.05
560	0.05
561	0.06
562	0.06
563	0.07

A0A1Y2CI20

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer