Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2D8D0

Protein Details
Accession A0A1Y2D8D0    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
461-482MDAPPARKRPRDKGPLLSRMSPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
467-471RKRPR
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 12.5, cyto 10.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039577  Rad18  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
IPR001293  Znf_TRAF  
Gene Ontology GO:0003697  F:single-stranded DNA binding  
GO:0061630  F:ubiquitin protein ligase activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006301  P:postreplication repair  
GO:0006513  P:protein monoubiquitination  
Pfam View protein in Pfam  
PF13923  zf-C3HC4_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50089  ZF_RING_2  
PS50145  ZF_TRAF  
Amino Acid Sequences MYRNSLSARVVCQDVFEQATLSGCEEDHGFCADCIGNWVTVRETCPTCREEITEDGLQEVRLLDRLVAGMSIECSFEECDWEGENSDFDDHVSSCSHSPVPCPNVENGCTLHFSIADLQDHLPECPWSTEICPRGGQDCGGEGEGLYHRKDRKEHFDVCENHRCPTTRCTTVGTRAFLITHTPGCRAQEAARKLAEAEVKNLRREVASLKTGDQAELGKIPEHLICTSNSLLFASCSLYLHADLLQVCQEVLERGTLSGCSEDHPFCYDCIKTWVKKNGTCPLCVQRTKESQLRETKLLSREVGCLRARCVEEECGWEGEFSELQPHLDSTLSDHIKYDCSFTLFRCARGGVDCGGPNKGTFTRGPAEDAHDAVCEAYRCTTSTCTTIGTLKLIQAHTPGCAAMDQARKSAIDEAASLRERTRFLEQSLSRAQQRIVELERSRDRPGVSGARIFSRSVQEMDAPPARKRPRDKGPLLSRMSPVEAAPSTAPAASPSRKDRDLSARR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.23
3 0.2
4 0.18
5 0.15
6 0.17
7 0.15
8 0.16
9 0.13
10 0.11
11 0.11
12 0.12
13 0.12
14 0.12
15 0.14
16 0.14
17 0.13
18 0.16
19 0.15
20 0.13
21 0.17
22 0.17
23 0.16
24 0.16
25 0.17
26 0.17
27 0.19
28 0.21
29 0.23
30 0.25
31 0.26
32 0.3
33 0.31
34 0.32
35 0.32
36 0.33
37 0.31
38 0.32
39 0.35
40 0.32
41 0.3
42 0.29
43 0.27
44 0.24
45 0.2
46 0.17
47 0.11
48 0.1
49 0.11
50 0.09
51 0.09
52 0.09
53 0.09
54 0.08
55 0.08
56 0.07
57 0.08
58 0.08
59 0.08
60 0.07
61 0.09
62 0.1
63 0.1
64 0.12
65 0.12
66 0.13
67 0.14
68 0.15
69 0.15
70 0.15
71 0.15
72 0.13
73 0.13
74 0.12
75 0.1
76 0.12
77 0.1
78 0.11
79 0.12
80 0.13
81 0.12
82 0.15
83 0.18
84 0.16
85 0.19
86 0.26
87 0.29
88 0.3
89 0.32
90 0.33
91 0.35
92 0.37
93 0.36
94 0.29
95 0.27
96 0.26
97 0.24
98 0.2
99 0.15
100 0.14
101 0.16
102 0.17
103 0.16
104 0.16
105 0.16
106 0.18
107 0.19
108 0.18
109 0.15
110 0.13
111 0.13
112 0.13
113 0.14
114 0.12
115 0.14
116 0.21
117 0.23
118 0.24
119 0.25
120 0.24
121 0.26
122 0.25
123 0.23
124 0.17
125 0.15
126 0.14
127 0.13
128 0.12
129 0.1
130 0.11
131 0.13
132 0.15
133 0.14
134 0.18
135 0.21
136 0.25
137 0.31
138 0.35
139 0.42
140 0.48
141 0.53
142 0.53
143 0.59
144 0.6
145 0.62
146 0.66
147 0.58
148 0.52
149 0.48
150 0.45
151 0.39
152 0.4
153 0.39
154 0.33
155 0.33
156 0.36
157 0.37
158 0.43
159 0.45
160 0.4
161 0.34
162 0.31
163 0.29
164 0.25
165 0.24
166 0.17
167 0.16
168 0.15
169 0.16
170 0.18
171 0.19
172 0.19
173 0.18
174 0.21
175 0.25
176 0.27
177 0.29
178 0.27
179 0.26
180 0.26
181 0.27
182 0.28
183 0.21
184 0.22
185 0.27
186 0.3
187 0.31
188 0.31
189 0.28
190 0.23
191 0.23
192 0.22
193 0.19
194 0.19
195 0.19
196 0.19
197 0.23
198 0.23
199 0.21
200 0.19
201 0.14
202 0.12
203 0.13
204 0.12
205 0.09
206 0.09
207 0.1
208 0.1
209 0.1
210 0.1
211 0.1
212 0.1
213 0.12
214 0.12
215 0.12
216 0.11
217 0.1
218 0.09
219 0.08
220 0.08
221 0.07
222 0.06
223 0.06
224 0.07
225 0.07
226 0.07
227 0.07
228 0.07
229 0.07
230 0.07
231 0.07
232 0.08
233 0.07
234 0.06
235 0.06
236 0.06
237 0.05
238 0.05
239 0.05
240 0.04
241 0.05
242 0.05
243 0.05
244 0.05
245 0.06
246 0.05
247 0.06
248 0.09
249 0.09
250 0.1
251 0.12
252 0.12
253 0.12
254 0.14
255 0.13
256 0.11
257 0.18
258 0.21
259 0.22
260 0.28
261 0.36
262 0.39
263 0.42
264 0.47
265 0.49
266 0.47
267 0.45
268 0.42
269 0.41
270 0.44
271 0.43
272 0.41
273 0.38
274 0.42
275 0.46
276 0.46
277 0.41
278 0.41
279 0.47
280 0.47
281 0.43
282 0.4
283 0.41
284 0.4
285 0.39
286 0.33
287 0.26
288 0.27
289 0.26
290 0.3
291 0.26
292 0.24
293 0.23
294 0.27
295 0.26
296 0.23
297 0.24
298 0.21
299 0.2
300 0.22
301 0.23
302 0.19
303 0.18
304 0.17
305 0.14
306 0.13
307 0.11
308 0.08
309 0.1
310 0.09
311 0.09
312 0.09
313 0.09
314 0.08
315 0.09
316 0.09
317 0.09
318 0.17
319 0.18
320 0.18
321 0.19
322 0.19
323 0.21
324 0.22
325 0.21
326 0.14
327 0.16
328 0.17
329 0.17
330 0.26
331 0.25
332 0.25
333 0.24
334 0.24
335 0.22
336 0.22
337 0.24
338 0.15
339 0.17
340 0.18
341 0.18
342 0.19
343 0.18
344 0.16
345 0.18
346 0.17
347 0.17
348 0.15
349 0.18
350 0.21
351 0.22
352 0.24
353 0.22
354 0.26
355 0.25
356 0.25
357 0.21
358 0.17
359 0.16
360 0.13
361 0.14
362 0.09
363 0.09
364 0.1
365 0.1
366 0.1
367 0.13
368 0.15
369 0.16
370 0.17
371 0.18
372 0.18
373 0.18
374 0.2
375 0.19
376 0.19
377 0.18
378 0.17
379 0.21
380 0.2
381 0.19
382 0.2
383 0.19
384 0.17
385 0.17
386 0.15
387 0.11
388 0.11
389 0.11
390 0.14
391 0.21
392 0.21
393 0.22
394 0.23
395 0.23
396 0.24
397 0.27
398 0.22
399 0.16
400 0.17
401 0.18
402 0.23
403 0.25
404 0.24
405 0.21
406 0.23
407 0.23
408 0.26
409 0.31
410 0.28
411 0.28
412 0.37
413 0.36
414 0.4
415 0.46
416 0.47
417 0.43
418 0.41
419 0.4
420 0.35
421 0.36
422 0.35
423 0.32
424 0.36
425 0.35
426 0.41
427 0.48
428 0.47
429 0.48
430 0.46
431 0.43
432 0.37
433 0.42
434 0.41
435 0.37
436 0.38
437 0.37
438 0.38
439 0.39
440 0.37
441 0.34
442 0.32
443 0.31
444 0.28
445 0.28
446 0.27
447 0.27
448 0.33
449 0.36
450 0.34
451 0.34
452 0.42
453 0.48
454 0.52
455 0.59
456 0.62
457 0.66
458 0.74
459 0.78
460 0.8
461 0.83
462 0.84
463 0.81
464 0.76
465 0.68
466 0.6
467 0.55
468 0.45
469 0.35
470 0.31
471 0.26
472 0.24
473 0.21
474 0.2
475 0.18
476 0.17
477 0.17
478 0.15
479 0.21
480 0.23
481 0.3
482 0.36
483 0.42
484 0.45
485 0.47
486 0.51