Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2G2Z5

Protein Details
Accession A0A1Y2G2Z5    Localization Confidence High Confidence Score 18.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
179-204SSHLRPPPFALPKKKRKRSDVDGPEGBasic
337-362TPVQLDKNGKPKKPRKKKTETPSMSAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
182-196LRPPPFALPKKKRKR
266-272RKKRRER
344-354NGKPKKPRKKK
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 12, cyto 5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
Amino Acid Sequences MAPAARNNPQQLPSAPATPQTGGAGLGLGLQGMNGSAAPSPRPGGSGGTATRAGSADPDGPSGGAGASEGKSTNVDELMDAVGASGLDIGAEEESLRLANERLHAQHQAAQTGPVVDRSRKQDFIDQSVLADVVKKIAAAFQLRTLEPDTIPLIALATRHRLSSLINDAIAARDHRRNSSHLRPPPFALPKKKRKRSDVDGPEGEDGEEEESEEEDAMDEFNLDFLSGGAGGGKGKEKQPAWDSLVLDDGEKLLGVLERVDREEERKKRRERMLREQKEQEERDLAEAIAASEAAERELADSANTKGGADKLLVGGTPGGSAGPSTPRAGGAGGEDTPVQLDKNGKPKKPRKKKTETPSMSARNMSEDVKKRLTDQVAMRSLGGKNFSWLNAGPSGGMGSPSPAGLPKPRFAPASSLPPPTFNASGSTSSMPNGSSSLNPSTSAANASTSSSGLPPALSRLSGIPPLHDASRARRTEEEWERGANITEMGDLLWVLERERGAGVGKGSGRNVLWRARAGVIKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.34
3 0.33
4 0.34
5 0.3
6 0.3
7 0.24
8 0.21
9 0.18
10 0.17
11 0.13
12 0.09
13 0.09
14 0.07
15 0.06
16 0.05
17 0.04
18 0.04
19 0.04
20 0.04
21 0.04
22 0.05
23 0.06
24 0.08
25 0.1
26 0.12
27 0.14
28 0.14
29 0.15
30 0.16
31 0.17
32 0.18
33 0.23
34 0.22
35 0.24
36 0.25
37 0.24
38 0.24
39 0.21
40 0.19
41 0.14
42 0.16
43 0.16
44 0.15
45 0.16
46 0.15
47 0.15
48 0.14
49 0.13
50 0.11
51 0.06
52 0.06
53 0.07
54 0.07
55 0.09
56 0.09
57 0.09
58 0.11
59 0.11
60 0.13
61 0.11
62 0.11
63 0.1
64 0.11
65 0.1
66 0.09
67 0.08
68 0.07
69 0.06
70 0.05
71 0.05
72 0.04
73 0.03
74 0.03
75 0.03
76 0.04
77 0.03
78 0.04
79 0.04
80 0.04
81 0.04
82 0.05
83 0.05
84 0.06
85 0.06
86 0.09
87 0.12
88 0.16
89 0.18
90 0.21
91 0.24
92 0.24
93 0.29
94 0.28
95 0.27
96 0.24
97 0.22
98 0.2
99 0.19
100 0.18
101 0.19
102 0.2
103 0.21
104 0.26
105 0.32
106 0.37
107 0.38
108 0.4
109 0.41
110 0.42
111 0.46
112 0.45
113 0.38
114 0.33
115 0.3
116 0.28
117 0.2
118 0.18
119 0.11
120 0.08
121 0.08
122 0.07
123 0.07
124 0.08
125 0.12
126 0.13
127 0.14
128 0.17
129 0.2
130 0.2
131 0.22
132 0.22
133 0.21
134 0.18
135 0.19
136 0.16
137 0.13
138 0.13
139 0.11
140 0.09
141 0.08
142 0.09
143 0.09
144 0.14
145 0.14
146 0.14
147 0.14
148 0.14
149 0.15
150 0.19
151 0.24
152 0.19
153 0.19
154 0.19
155 0.19
156 0.19
157 0.19
158 0.16
159 0.13
160 0.17
161 0.19
162 0.22
163 0.25
164 0.29
165 0.35
166 0.43
167 0.5
168 0.51
169 0.56
170 0.54
171 0.54
172 0.58
173 0.59
174 0.57
175 0.58
176 0.61
177 0.67
178 0.76
179 0.83
180 0.83
181 0.83
182 0.84
183 0.82
184 0.83
185 0.81
186 0.78
187 0.7
188 0.64
189 0.56
190 0.47
191 0.38
192 0.27
193 0.18
194 0.1
195 0.07
196 0.06
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.03
208 0.04
209 0.04
210 0.03
211 0.03
212 0.03
213 0.03
214 0.03
215 0.03
216 0.03
217 0.03
218 0.04
219 0.04
220 0.06
221 0.07
222 0.09
223 0.14
224 0.15
225 0.19
226 0.22
227 0.26
228 0.28
229 0.3
230 0.29
231 0.24
232 0.26
233 0.21
234 0.19
235 0.14
236 0.1
237 0.06
238 0.06
239 0.05
240 0.03
241 0.03
242 0.03
243 0.04
244 0.05
245 0.06
246 0.07
247 0.08
248 0.08
249 0.13
250 0.22
251 0.29
252 0.37
253 0.46
254 0.51
255 0.59
256 0.68
257 0.73
258 0.73
259 0.76
260 0.79
261 0.78
262 0.79
263 0.76
264 0.72
265 0.71
266 0.63
267 0.53
268 0.44
269 0.36
270 0.31
271 0.26
272 0.2
273 0.12
274 0.11
275 0.09
276 0.06
277 0.05
278 0.04
279 0.04
280 0.04
281 0.04
282 0.04
283 0.04
284 0.04
285 0.05
286 0.05
287 0.05
288 0.06
289 0.07
290 0.09
291 0.09
292 0.08
293 0.08
294 0.09
295 0.09
296 0.08
297 0.08
298 0.07
299 0.07
300 0.07
301 0.06
302 0.06
303 0.05
304 0.05
305 0.04
306 0.04
307 0.03
308 0.04
309 0.04
310 0.07
311 0.08
312 0.09
313 0.09
314 0.09
315 0.1
316 0.1
317 0.1
318 0.08
319 0.09
320 0.08
321 0.08
322 0.08
323 0.08
324 0.08
325 0.08
326 0.06
327 0.07
328 0.11
329 0.15
330 0.25
331 0.33
332 0.37
333 0.47
334 0.57
335 0.67
336 0.74
337 0.81
338 0.81
339 0.85
340 0.9
341 0.9
342 0.91
343 0.86
344 0.8
345 0.79
346 0.74
347 0.66
348 0.58
349 0.48
350 0.4
351 0.36
352 0.33
353 0.31
354 0.32
355 0.35
356 0.37
357 0.37
358 0.36
359 0.4
360 0.4
361 0.38
362 0.36
363 0.4
364 0.39
365 0.4
366 0.38
367 0.34
368 0.33
369 0.29
370 0.27
371 0.18
372 0.16
373 0.17
374 0.17
375 0.17
376 0.16
377 0.17
378 0.15
379 0.15
380 0.13
381 0.12
382 0.12
383 0.1
384 0.1
385 0.07
386 0.07
387 0.07
388 0.07
389 0.08
390 0.08
391 0.1
392 0.17
393 0.21
394 0.22
395 0.25
396 0.29
397 0.3
398 0.3
399 0.35
400 0.32
401 0.38
402 0.39
403 0.42
404 0.4
405 0.4
406 0.4
407 0.38
408 0.35
409 0.25
410 0.25
411 0.22
412 0.24
413 0.24
414 0.24
415 0.2
416 0.2
417 0.2
418 0.17
419 0.14
420 0.13
421 0.12
422 0.12
423 0.15
424 0.19
425 0.19
426 0.19
427 0.2
428 0.19
429 0.19
430 0.19
431 0.16
432 0.14
433 0.14
434 0.15
435 0.14
436 0.13
437 0.14
438 0.12
439 0.12
440 0.11
441 0.11
442 0.09
443 0.12
444 0.13
445 0.12
446 0.13
447 0.15
448 0.17
449 0.23
450 0.23
451 0.21
452 0.23
453 0.26
454 0.25
455 0.27
456 0.27
457 0.29
458 0.39
459 0.39
460 0.4
461 0.4
462 0.42
463 0.48
464 0.54
465 0.53
466 0.45
467 0.46
468 0.43
469 0.42
470 0.4
471 0.3
472 0.22
473 0.15
474 0.13
475 0.11
476 0.09
477 0.08
478 0.06
479 0.06
480 0.08
481 0.08
482 0.09
483 0.11
484 0.11
485 0.13
486 0.13
487 0.14
488 0.13
489 0.15
490 0.16
491 0.19
492 0.22
493 0.24
494 0.25
495 0.27
496 0.26
497 0.3
498 0.33
499 0.34
500 0.35
501 0.35
502 0.37
503 0.38