Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2G420

Protein Details
Accession A0A1Y2G420    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
18-40ETLSTIKPRRVGQKRKSTDDEDGHydrophilic
921-942TTNPLHSPRRLVKRPRASCPSVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto 8.5, cyto_mito 6, mito 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012310  DNA_ligase_ATP-dep_cent  
IPR012308  DNA_ligase_ATP-dep_N  
IPR036599  DNA_ligase_N_sf  
IPR029710  LIG4  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003910  F:DNA ligase (ATP) activity  
GO:0051103  P:DNA ligation involved in DNA repair  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006260  P:DNA replication  
Pfam View protein in Pfam  
PF01068  DNA_ligase_A_M  
PF04675  DNA_ligase_A_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50160  DNA_LIGASE_A3  
Amino Acid Sequences MAFADNAIPFSQFASLIETLSTIKPRRVGQKRKSTDDEDGTSLHLKHVQSWISHYKQQFPVGGGEGDGKDARLPLGTVRIFLRFFFPEEGARRRFGMQETILCQHLCALYRVDKRQFDNWNAPSLGQRAETSGCLGTEVGSWMRRKGRGLRSSGAAGLTLGRVDQLLDELAAKCEFSARDVRFSPFLPHPRRSTRAILHDLLAPLSAFETSLMIQLILRDLSPLIYATPSDSGHIAITEYNTAAYKRVEVWQVLREWHPAGEAHYRVVKDLDYVGKALEDLLRDGGSAPEPLPVFGVPVQIPKANRPGTCAVACKHLRGRVAVETKYDGERLQIHVDLTRPRDDQIRIFSKSTRESTVERRGLLPIIRAALGLPPCPFDPFDPLLSSRLASLAGSSSSRHASRFILEGEMVPYDEEKSAIQEFWTLGCAKSGRIVPPSPDRGSQSSCRTGETMSQEREGRSHRWVESFLHLKIVWFDLLAVEAESLVDVPFEERRARLASVVREISGYSKLADSVDIDFSQITALSDLRLRMAHIITNRAEGLMLKPLASRYNDWRSDMRWIKLKKDFIPGAGDTLDFHVLGASWNKKRGRELLLPPSMYTTFFIGLRADHLGARLSKCEKPHYHVLFSTSYGLDRKKLGQLDMYIRSRDPLRFELTGTTFEECERPKGSFKVYESPCCTFTFSLAGDLTTANSRPSIIFKEPTVFELNGAGFQRSGGSSYYELRWPRITKINRLDGDPLSLQALQTTAVDAMRIVTADDSQKLVQHLWSRVSTAVKAPETEQERYDRELRDWVGRLEKADKVGARQSLLRELPTFEQPRSSLGALASLTNLRAEGKGKARESTPTAEQEQEQEPSRSSLRIEETVVHFDLDLTSSPTPASGEPPLTLPSSPTPRPTNLRALPPLSPPTPPSAELASSSTTTNPLHSPRRLVKRPRASCPSVLPSTLPTALATSADAAQPPSQRLRNRHSLSSFSSPTILTVLASLASSSNPPSPSPLNPYDAFAWSFGVSPILGATVLQPRQPCLERENYFLNPLDVLWCAGWLPTDRSVAYAGPRRTGYIFVEGGQADVEVLKQKRGTIVQGRGSAMTVWIVEKSACASMGDWDGEGVLSVF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.15
3 0.15
4 0.15
5 0.15
6 0.16
7 0.19
8 0.26
9 0.23
10 0.26
11 0.31
12 0.37
13 0.47
14 0.56
15 0.64
16 0.67
17 0.75
18 0.8
19 0.84
20 0.85
21 0.81
22 0.79
23 0.75
24 0.69
25 0.6
26 0.52
27 0.46
28 0.42
29 0.36
30 0.29
31 0.27
32 0.23
33 0.24
34 0.3
35 0.3
36 0.28
37 0.35
38 0.42
39 0.43
40 0.49
41 0.47
42 0.5
43 0.52
44 0.56
45 0.52
46 0.44
47 0.43
48 0.39
49 0.37
50 0.28
51 0.27
52 0.22
53 0.21
54 0.2
55 0.16
56 0.14
57 0.14
58 0.14
59 0.11
60 0.12
61 0.11
62 0.2
63 0.2
64 0.21
65 0.22
66 0.26
67 0.26
68 0.26
69 0.28
70 0.22
71 0.24
72 0.25
73 0.26
74 0.28
75 0.34
76 0.41
77 0.39
78 0.4
79 0.39
80 0.37
81 0.39
82 0.35
83 0.36
84 0.33
85 0.36
86 0.38
87 0.39
88 0.39
89 0.35
90 0.32
91 0.27
92 0.25
93 0.21
94 0.18
95 0.2
96 0.27
97 0.34
98 0.42
99 0.47
100 0.51
101 0.54
102 0.6
103 0.63
104 0.62
105 0.64
106 0.59
107 0.58
108 0.53
109 0.49
110 0.45
111 0.39
112 0.34
113 0.26
114 0.24
115 0.2
116 0.21
117 0.21
118 0.2
119 0.18
120 0.16
121 0.15
122 0.14
123 0.12
124 0.11
125 0.13
126 0.13
127 0.17
128 0.18
129 0.23
130 0.29
131 0.31
132 0.36
133 0.43
134 0.51
135 0.55
136 0.6
137 0.58
138 0.57
139 0.56
140 0.52
141 0.42
142 0.32
143 0.24
144 0.18
145 0.14
146 0.1
147 0.08
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.06
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.08
156 0.09
157 0.11
158 0.11
159 0.11
160 0.09
161 0.12
162 0.12
163 0.13
164 0.22
165 0.22
166 0.28
167 0.3
168 0.33
169 0.33
170 0.34
171 0.36
172 0.36
173 0.44
174 0.45
175 0.49
176 0.53
177 0.59
178 0.62
179 0.62
180 0.62
181 0.59
182 0.61
183 0.61
184 0.55
185 0.48
186 0.48
187 0.43
188 0.35
189 0.27
190 0.19
191 0.12
192 0.11
193 0.09
194 0.06
195 0.05
196 0.06
197 0.06
198 0.08
199 0.08
200 0.07
201 0.07
202 0.08
203 0.09
204 0.08
205 0.08
206 0.07
207 0.07
208 0.07
209 0.08
210 0.08
211 0.07
212 0.07
213 0.07
214 0.08
215 0.11
216 0.11
217 0.11
218 0.11
219 0.11
220 0.11
221 0.11
222 0.1
223 0.08
224 0.09
225 0.09
226 0.09
227 0.09
228 0.1
229 0.1
230 0.11
231 0.11
232 0.12
233 0.13
234 0.17
235 0.19
236 0.2
237 0.23
238 0.26
239 0.27
240 0.29
241 0.28
242 0.27
243 0.25
244 0.23
245 0.21
246 0.17
247 0.18
248 0.22
249 0.22
250 0.21
251 0.24
252 0.24
253 0.23
254 0.24
255 0.2
256 0.14
257 0.17
258 0.18
259 0.15
260 0.15
261 0.14
262 0.13
263 0.13
264 0.13
265 0.11
266 0.09
267 0.08
268 0.09
269 0.09
270 0.09
271 0.1
272 0.1
273 0.09
274 0.09
275 0.09
276 0.11
277 0.11
278 0.11
279 0.12
280 0.11
281 0.12
282 0.11
283 0.14
284 0.11
285 0.13
286 0.15
287 0.17
288 0.18
289 0.2
290 0.28
291 0.3
292 0.3
293 0.32
294 0.34
295 0.36
296 0.37
297 0.37
298 0.3
299 0.34
300 0.35
301 0.35
302 0.36
303 0.35
304 0.34
305 0.33
306 0.35
307 0.34
308 0.39
309 0.36
310 0.33
311 0.32
312 0.31
313 0.31
314 0.28
315 0.2
316 0.17
317 0.18
318 0.18
319 0.18
320 0.18
321 0.17
322 0.17
323 0.2
324 0.23
325 0.23
326 0.25
327 0.23
328 0.23
329 0.28
330 0.29
331 0.3
332 0.34
333 0.37
334 0.36
335 0.37
336 0.39
337 0.38
338 0.41
339 0.4
340 0.35
341 0.32
342 0.32
343 0.39
344 0.46
345 0.44
346 0.4
347 0.38
348 0.36
349 0.35
350 0.32
351 0.26
352 0.17
353 0.15
354 0.14
355 0.13
356 0.12
357 0.13
358 0.13
359 0.13
360 0.12
361 0.12
362 0.12
363 0.14
364 0.14
365 0.12
366 0.17
367 0.18
368 0.19
369 0.19
370 0.2
371 0.2
372 0.2
373 0.19
374 0.13
375 0.11
376 0.1
377 0.08
378 0.07
379 0.06
380 0.07
381 0.07
382 0.08
383 0.09
384 0.12
385 0.13
386 0.13
387 0.14
388 0.14
389 0.15
390 0.17
391 0.16
392 0.14
393 0.14
394 0.14
395 0.13
396 0.12
397 0.1
398 0.08
399 0.07
400 0.07
401 0.07
402 0.07
403 0.06
404 0.08
405 0.09
406 0.09
407 0.09
408 0.09
409 0.09
410 0.09
411 0.11
412 0.09
413 0.08
414 0.1
415 0.11
416 0.09
417 0.13
418 0.15
419 0.16
420 0.19
421 0.2
422 0.22
423 0.28
424 0.34
425 0.32
426 0.32
427 0.33
428 0.32
429 0.36
430 0.37
431 0.36
432 0.37
433 0.36
434 0.35
435 0.32
436 0.29
437 0.3
438 0.31
439 0.31
440 0.26
441 0.29
442 0.29
443 0.28
444 0.31
445 0.3
446 0.26
447 0.24
448 0.26
449 0.25
450 0.25
451 0.26
452 0.26
453 0.28
454 0.29
455 0.25
456 0.24
457 0.22
458 0.21
459 0.2
460 0.19
461 0.13
462 0.09
463 0.08
464 0.05
465 0.06
466 0.06
467 0.05
468 0.04
469 0.04
470 0.03
471 0.03
472 0.03
473 0.03
474 0.03
475 0.02
476 0.04
477 0.04
478 0.06
479 0.07
480 0.07
481 0.1
482 0.12
483 0.12
484 0.14
485 0.18
486 0.18
487 0.22
488 0.22
489 0.2
490 0.18
491 0.18
492 0.17
493 0.14
494 0.12
495 0.08
496 0.08
497 0.08
498 0.08
499 0.08
500 0.08
501 0.08
502 0.09
503 0.08
504 0.08
505 0.08
506 0.08
507 0.07
508 0.06
509 0.05
510 0.04
511 0.04
512 0.05
513 0.06
514 0.06
515 0.07
516 0.07
517 0.07
518 0.08
519 0.09
520 0.1
521 0.1
522 0.14
523 0.14
524 0.15
525 0.15
526 0.13
527 0.12
528 0.1
529 0.1
530 0.1
531 0.1
532 0.09
533 0.09
534 0.1
535 0.13
536 0.14
537 0.15
538 0.18
539 0.26
540 0.27
541 0.29
542 0.3
543 0.28
544 0.36
545 0.38
546 0.34
547 0.33
548 0.34
549 0.37
550 0.42
551 0.45
552 0.39
553 0.42
554 0.4
555 0.34
556 0.36
557 0.3
558 0.26
559 0.22
560 0.19
561 0.11
562 0.12
563 0.11
564 0.07
565 0.07
566 0.05
567 0.05
568 0.06
569 0.09
570 0.13
571 0.14
572 0.2
573 0.23
574 0.24
575 0.27
576 0.31
577 0.34
578 0.37
579 0.42
580 0.45
581 0.47
582 0.46
583 0.43
584 0.41
585 0.35
586 0.27
587 0.21
588 0.13
589 0.1
590 0.09
591 0.1
592 0.08
593 0.08
594 0.09
595 0.09
596 0.08
597 0.07
598 0.08
599 0.09
600 0.11
601 0.11
602 0.13
603 0.16
604 0.18
605 0.2
606 0.27
607 0.27
608 0.31
609 0.41
610 0.41
611 0.4
612 0.39
613 0.4
614 0.33
615 0.32
616 0.29
617 0.19
618 0.16
619 0.16
620 0.16
621 0.14
622 0.14
623 0.15
624 0.18
625 0.19
626 0.19
627 0.19
628 0.21
629 0.25
630 0.3
631 0.3
632 0.27
633 0.25
634 0.26
635 0.26
636 0.24
637 0.23
638 0.19
639 0.21
640 0.21
641 0.22
642 0.24
643 0.23
644 0.24
645 0.21
646 0.19
647 0.15
648 0.14
649 0.17
650 0.14
651 0.16
652 0.15
653 0.16
654 0.17
655 0.2
656 0.22
657 0.24
658 0.26
659 0.33
660 0.34
661 0.39
662 0.41
663 0.41
664 0.4
665 0.35
666 0.35
667 0.25
668 0.23
669 0.19
670 0.15
671 0.15
672 0.13
673 0.12
674 0.11
675 0.11
676 0.1
677 0.09
678 0.09
679 0.07
680 0.07
681 0.07
682 0.08
683 0.1
684 0.14
685 0.16
686 0.17
687 0.18
688 0.21
689 0.21
690 0.23
691 0.25
692 0.2
693 0.17
694 0.18
695 0.17
696 0.16
697 0.16
698 0.14
699 0.1
700 0.1
701 0.1
702 0.08
703 0.09
704 0.07
705 0.09
706 0.1
707 0.12
708 0.14
709 0.18
710 0.19
711 0.2
712 0.25
713 0.25
714 0.27
715 0.35
716 0.37
717 0.42
718 0.49
719 0.55
720 0.51
721 0.51
722 0.51
723 0.42
724 0.41
725 0.32
726 0.25
727 0.18
728 0.17
729 0.14
730 0.1
731 0.1
732 0.07
733 0.07
734 0.07
735 0.06
736 0.06
737 0.06
738 0.05
739 0.06
740 0.05
741 0.05
742 0.05
743 0.05
744 0.06
745 0.08
746 0.09
747 0.1
748 0.1
749 0.12
750 0.13
751 0.13
752 0.15
753 0.19
754 0.21
755 0.23
756 0.23
757 0.23
758 0.24
759 0.25
760 0.23
761 0.21
762 0.24
763 0.21
764 0.21
765 0.21
766 0.25
767 0.28
768 0.29
769 0.27
770 0.27
771 0.28
772 0.31
773 0.35
774 0.3
775 0.27
776 0.31
777 0.31
778 0.31
779 0.31
780 0.3
781 0.3
782 0.29
783 0.3
784 0.28
785 0.28
786 0.24
787 0.26
788 0.24
789 0.22
790 0.26
791 0.26
792 0.24
793 0.25
794 0.24
795 0.28
796 0.28
797 0.26
798 0.22
799 0.23
800 0.24
801 0.3
802 0.31
803 0.24
804 0.27
805 0.25
806 0.26
807 0.28
808 0.25
809 0.19
810 0.16
811 0.18
812 0.15
813 0.15
814 0.14
815 0.11
816 0.11
817 0.09
818 0.09
819 0.08
820 0.09
821 0.1
822 0.14
823 0.21
824 0.28
825 0.29
826 0.31
827 0.32
828 0.35
829 0.37
830 0.37
831 0.34
832 0.31
833 0.32
834 0.32
835 0.31
836 0.31
837 0.29
838 0.28
839 0.26
840 0.23
841 0.22
842 0.23
843 0.24
844 0.21
845 0.19
846 0.21
847 0.22
848 0.23
849 0.23
850 0.24
851 0.26
852 0.29
853 0.28
854 0.23
855 0.19
856 0.17
857 0.16
858 0.13
859 0.11
860 0.11
861 0.1
862 0.1
863 0.1
864 0.11
865 0.12
866 0.11
867 0.14
868 0.13
869 0.14
870 0.14
871 0.16
872 0.18
873 0.18
874 0.17
875 0.17
876 0.2
877 0.25
878 0.27
879 0.31
880 0.34
881 0.38
882 0.44
883 0.46
884 0.5
885 0.48
886 0.53
887 0.52
888 0.51
889 0.48
890 0.47
891 0.48
892 0.39
893 0.36
894 0.3
895 0.31
896 0.31
897 0.29
898 0.27
899 0.24
900 0.23
901 0.23
902 0.24
903 0.2
904 0.18
905 0.18
906 0.16
907 0.17
908 0.16
909 0.17
910 0.19
911 0.24
912 0.31
913 0.33
914 0.4
915 0.46
916 0.57
917 0.64
918 0.7
919 0.73
920 0.77
921 0.82
922 0.83
923 0.82
924 0.77
925 0.72
926 0.7
927 0.66
928 0.58
929 0.51
930 0.43
931 0.36
932 0.35
933 0.31
934 0.24
935 0.17
936 0.16
937 0.15
938 0.15
939 0.13
940 0.1
941 0.1
942 0.1
943 0.11
944 0.11
945 0.15
946 0.17
947 0.2
948 0.25
949 0.31
950 0.38
951 0.45
952 0.51
953 0.58
954 0.61
955 0.65
956 0.62
957 0.61
958 0.6
959 0.61
960 0.55
961 0.45
962 0.42
963 0.33
964 0.3
965 0.26
966 0.2
967 0.12
968 0.1
969 0.09
970 0.08
971 0.08
972 0.07
973 0.06
974 0.07
975 0.08
976 0.1
977 0.14
978 0.15
979 0.16
980 0.2
981 0.24
982 0.27
983 0.34
984 0.35
985 0.36
986 0.36
987 0.39
988 0.36
989 0.36
990 0.33
991 0.25
992 0.23
993 0.18
994 0.18
995 0.15
996 0.13
997 0.1
998 0.09
999 0.08
1000 0.07
1001 0.06
1002 0.06
1003 0.09
1004 0.15
1005 0.17
1006 0.2
1007 0.21
1008 0.22
1009 0.29
1010 0.32
1011 0.32
1012 0.3
1013 0.39
1014 0.39
1015 0.43
1016 0.48
1017 0.43
1018 0.44
1019 0.42
1020 0.37
1021 0.27
1022 0.25
1023 0.21
1024 0.15
1025 0.15
1026 0.11
1027 0.1
1028 0.09
1029 0.09
1030 0.11
1031 0.13
1032 0.16
1033 0.19
1034 0.21
1035 0.21
1036 0.22
1037 0.24
1038 0.24
1039 0.28
1040 0.33
1041 0.31
1042 0.34
1043 0.34
1044 0.36
1045 0.35
1046 0.37
1047 0.32
1048 0.3
1049 0.29
1050 0.25
1051 0.28
1052 0.25
1053 0.24
1054 0.2
1055 0.17
1056 0.11
1057 0.1
1058 0.11
1059 0.14
1060 0.15
1061 0.19
1062 0.2
1063 0.22
1064 0.27
1065 0.3
1066 0.38
1067 0.39
1068 0.47
1069 0.5
1070 0.54
1071 0.54
1072 0.49
1073 0.47
1074 0.39
1075 0.3
1076 0.22
1077 0.16
1078 0.12
1079 0.11
1080 0.12
1081 0.11
1082 0.11
1083 0.12
1084 0.13
1085 0.12
1086 0.12
1087 0.12
1088 0.15
1089 0.18
1090 0.18
1091 0.16
1092 0.14
1093 0.14
1094 0.13