Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2CCA1

Protein Details
Accession A0A1Y2CCA1    Localization Confidence High Confidence Score 16.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
66-88AVTKELNRKTAKKPRPTPTPISLHydrophilic
100-143KRGLTLPKEHKLRKKLEKYKPALDKENEKEKKRRKVSSNEGLQIBasic
590-616GKKAAYLAEKKRKNEERERAGKKAKSEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
106-134PKEHKLRKKLEKYKPALDKENEKEKKRRK
544-616KAKSRQKGGKGGPKAPVVKPVKEASAVRAKVEAPKVGVQKKKAAVPGKKAAYLAEKKRKNEERERAGKKAKSE
Subcellular Location(s) cyto 16.5, cyto_mito 10.833, nucl 5.5, mito_nucl 5.333, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001678  MeTrfase_RsmB/NOP2  
IPR023267  RCMT  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0008173  F:RNA methyltransferase activity  
GO:0008757  F:S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF01189  Methyltr_RsmB-F  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51686  SAM_MT_RSMB_NOP  
Amino Acid Sequences MAEAKRAKFGKEGEASRFLKVIVEVLKFRPHLQHLLTHSKLLEVEPTLFIAPVWADAAPKVRSAAAVTKELNRKTAKKPRPTPTPISLATVMLHDLLFAKRGLTLPKEHKLRKKLEKYKPALDKENEKEKKRRKVSSNEGLQIPLPENVASAIEGIGKGKKKAHDAEAGEADGVGEVRWLRVNTLKWTVEAAVEWFEEQRWELYENVESMIEAAKEKSKVYALDAHIEPLLALPSTVSLPSLQPFTDGRLIAQDKASCMPAWVLLSEVLAEEYAEQERLANSGKSESFAEADARQERRKKNGVKVLDATAAPGNKTTMAAAMSGEMGKVVAIERDAGRFKVLKSMCQKAGATNVTPMNTDFLSIDPQDIKFKNISHFLVDPSCSGSGIPSRLDHLIPEAPEEEQAQRIRALSNFQVTILSHAMRFTGARRVVYSTCSIWAQEDEGVVMRILAKKEFQEKGWTLAPRDEVLPTWERRGIVEECGGDATIADSLVRCLPEDQSNGFFVACFVRGEPASGDDSVAAIEVDGEAAPELTHAERQEAFKAKSRQKGGKGGPKAPVVKPVKEASAVRAKVEAPKVGVQKKKAAVPGKKAAYLAEKKRKNEERERAGKKAKSE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.55
3 0.51
4 0.48
5 0.39
6 0.32
7 0.27
8 0.26
9 0.22
10 0.24
11 0.26
12 0.28
13 0.35
14 0.34
15 0.37
16 0.39
17 0.38
18 0.41
19 0.4
20 0.44
21 0.45
22 0.53
23 0.52
24 0.48
25 0.43
26 0.38
27 0.36
28 0.3
29 0.27
30 0.19
31 0.2
32 0.18
33 0.19
34 0.18
35 0.17
36 0.15
37 0.13
38 0.11
39 0.09
40 0.09
41 0.08
42 0.08
43 0.1
44 0.16
45 0.16
46 0.17
47 0.17
48 0.16
49 0.17
50 0.2
51 0.26
52 0.24
53 0.28
54 0.3
55 0.37
56 0.44
57 0.44
58 0.48
59 0.47
60 0.5
61 0.55
62 0.64
63 0.65
64 0.69
65 0.77
66 0.8
67 0.84
68 0.86
69 0.83
70 0.79
71 0.77
72 0.67
73 0.62
74 0.54
75 0.44
76 0.36
77 0.29
78 0.23
79 0.16
80 0.14
81 0.09
82 0.1
83 0.09
84 0.1
85 0.09
86 0.09
87 0.1
88 0.13
89 0.17
90 0.18
91 0.26
92 0.32
93 0.41
94 0.5
95 0.57
96 0.64
97 0.69
98 0.75
99 0.78
100 0.82
101 0.84
102 0.85
103 0.88
104 0.86
105 0.86
106 0.86
107 0.81
108 0.79
109 0.73
110 0.72
111 0.69
112 0.73
113 0.71
114 0.69
115 0.72
116 0.73
117 0.79
118 0.78
119 0.8
120 0.78
121 0.81
122 0.84
123 0.84
124 0.84
125 0.78
126 0.7
127 0.61
128 0.53
129 0.44
130 0.35
131 0.26
132 0.17
133 0.12
134 0.11
135 0.1
136 0.1
137 0.09
138 0.07
139 0.06
140 0.06
141 0.06
142 0.07
143 0.12
144 0.13
145 0.16
146 0.2
147 0.23
148 0.29
149 0.34
150 0.38
151 0.41
152 0.42
153 0.44
154 0.42
155 0.39
156 0.32
157 0.27
158 0.22
159 0.13
160 0.11
161 0.06
162 0.05
163 0.04
164 0.05
165 0.08
166 0.08
167 0.1
168 0.15
169 0.18
170 0.22
171 0.29
172 0.29
173 0.26
174 0.28
175 0.27
176 0.22
177 0.2
178 0.16
179 0.11
180 0.1
181 0.1
182 0.09
183 0.08
184 0.08
185 0.08
186 0.08
187 0.08
188 0.09
189 0.1
190 0.11
191 0.12
192 0.12
193 0.12
194 0.11
195 0.1
196 0.09
197 0.09
198 0.08
199 0.07
200 0.08
201 0.1
202 0.11
203 0.12
204 0.13
205 0.13
206 0.14
207 0.16
208 0.22
209 0.2
210 0.25
211 0.25
212 0.24
213 0.22
214 0.22
215 0.19
216 0.12
217 0.11
218 0.05
219 0.05
220 0.04
221 0.04
222 0.05
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.06
227 0.07
228 0.09
229 0.08
230 0.09
231 0.1
232 0.13
233 0.16
234 0.15
235 0.14
236 0.19
237 0.2
238 0.19
239 0.21
240 0.18
241 0.16
242 0.17
243 0.18
244 0.12
245 0.11
246 0.1
247 0.09
248 0.09
249 0.08
250 0.08
251 0.07
252 0.07
253 0.06
254 0.06
255 0.05
256 0.04
257 0.04
258 0.03
259 0.04
260 0.04
261 0.05
262 0.04
263 0.05
264 0.05
265 0.06
266 0.08
267 0.07
268 0.07
269 0.1
270 0.1
271 0.11
272 0.11
273 0.11
274 0.1
275 0.1
276 0.12
277 0.09
278 0.12
279 0.16
280 0.18
281 0.22
282 0.28
283 0.3
284 0.35
285 0.43
286 0.47
287 0.51
288 0.56
289 0.55
290 0.52
291 0.52
292 0.47
293 0.4
294 0.34
295 0.27
296 0.2
297 0.17
298 0.13
299 0.11
300 0.09
301 0.07
302 0.08
303 0.06
304 0.06
305 0.06
306 0.06
307 0.06
308 0.06
309 0.06
310 0.05
311 0.05
312 0.04
313 0.04
314 0.03
315 0.03
316 0.03
317 0.03
318 0.03
319 0.05
320 0.05
321 0.08
322 0.09
323 0.09
324 0.11
325 0.12
326 0.12
327 0.19
328 0.19
329 0.23
330 0.27
331 0.33
332 0.32
333 0.35
334 0.35
335 0.28
336 0.33
337 0.29
338 0.24
339 0.22
340 0.22
341 0.19
342 0.19
343 0.18
344 0.14
345 0.12
346 0.12
347 0.09
348 0.08
349 0.1
350 0.1
351 0.11
352 0.1
353 0.11
354 0.16
355 0.16
356 0.17
357 0.17
358 0.19
359 0.21
360 0.24
361 0.24
362 0.22
363 0.22
364 0.22
365 0.22
366 0.21
367 0.18
368 0.15
369 0.15
370 0.12
371 0.11
372 0.1
373 0.11
374 0.12
375 0.13
376 0.11
377 0.13
378 0.14
379 0.14
380 0.13
381 0.14
382 0.15
383 0.14
384 0.15
385 0.13
386 0.12
387 0.13
388 0.14
389 0.12
390 0.14
391 0.15
392 0.14
393 0.15
394 0.15
395 0.16
396 0.15
397 0.18
398 0.15
399 0.18
400 0.17
401 0.16
402 0.17
403 0.16
404 0.18
405 0.16
406 0.15
407 0.11
408 0.11
409 0.11
410 0.11
411 0.11
412 0.1
413 0.16
414 0.18
415 0.18
416 0.2
417 0.24
418 0.24
419 0.26
420 0.27
421 0.19
422 0.19
423 0.19
424 0.18
425 0.15
426 0.15
427 0.14
428 0.12
429 0.11
430 0.09
431 0.09
432 0.1
433 0.08
434 0.08
435 0.08
436 0.1
437 0.11
438 0.12
439 0.13
440 0.16
441 0.23
442 0.25
443 0.25
444 0.3
445 0.31
446 0.34
447 0.38
448 0.38
449 0.32
450 0.34
451 0.34
452 0.27
453 0.26
454 0.23
455 0.18
456 0.2
457 0.24
458 0.22
459 0.24
460 0.25
461 0.24
462 0.24
463 0.29
464 0.26
465 0.23
466 0.24
467 0.21
468 0.19
469 0.19
470 0.19
471 0.13
472 0.11
473 0.09
474 0.06
475 0.06
476 0.05
477 0.04
478 0.06
479 0.08
480 0.09
481 0.09
482 0.1
483 0.13
484 0.18
485 0.21
486 0.22
487 0.23
488 0.23
489 0.23
490 0.22
491 0.19
492 0.15
493 0.14
494 0.12
495 0.1
496 0.09
497 0.12
498 0.12
499 0.14
500 0.14
501 0.14
502 0.16
503 0.15
504 0.15
505 0.12
506 0.12
507 0.1
508 0.1
509 0.07
510 0.04
511 0.04
512 0.04
513 0.04
514 0.04
515 0.04
516 0.04
517 0.04
518 0.04
519 0.04
520 0.06
521 0.07
522 0.1
523 0.1
524 0.14
525 0.16
526 0.19
527 0.26
528 0.32
529 0.34
530 0.4
531 0.49
532 0.54
533 0.6
534 0.66
535 0.67
536 0.67
537 0.74
538 0.75
539 0.76
540 0.76
541 0.73
542 0.71
543 0.7
544 0.69
545 0.6
546 0.6
547 0.56
548 0.51
549 0.51
550 0.48
551 0.43
552 0.43
553 0.42
554 0.39
555 0.44
556 0.41
557 0.37
558 0.36
559 0.35
560 0.37
561 0.4
562 0.37
563 0.3
564 0.36
565 0.43
566 0.49
567 0.55
568 0.52
569 0.56
570 0.57
571 0.59
572 0.61
573 0.62
574 0.63
575 0.65
576 0.7
577 0.67
578 0.65
579 0.59
580 0.55
581 0.55
582 0.56
583 0.58
584 0.58
585 0.61
586 0.63
587 0.73
588 0.79
589 0.79
590 0.8
591 0.8
592 0.8
593 0.84
594 0.87
595 0.86
596 0.86