FuNGI

G9NS53

Protein Details

Accession

G9NS53

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
7-53	NPNGPPRSQKSNPLRPLRKRPVNPLVSSSRKPAPKPNRPPTNNAAST	Hydrophilic
185-208	VAKEVAPKRPKKQKEEKTMFNRAP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
17-43	SNPLRPLRKRPVNPLVSSSRKPAPKPN
188-203	EVAPKRPKKQKEEKTM
491-509	KQKLSEMGKKGKSLKRAGS
522-526	RKKFK
664-670	KRLRRRK

Subcellular Location(s)

nucl 21, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSAPSGNPNGPPRSQKSNPLRPLRKRPVNPLVSSSRKPAPKPNRPPTNNAASTSAQATANGSKPNIEELRKQYGGWSEPPPPYPFNDIPIMTTKKALLNGIRYHLMKFSQTKLGDKPIDPTDQDEFARPVTLHRRDARQPPPGRVVKEEEPERPPVDEQEAERMAQIKAEREAQRAIDQAKIAPVAKEVAPKRPKKQKEEKTMFNRAPKTSAAKKESDLRYEEALPWHLEDADGKNVWVGSYVAALSESSVAFMIDKSVFRMVPLEKSYKFNAKPPFQPFTIDQAEAFMTRKVDVGRWVMKDEEKKAGLNDLEATRRMLYGRGQMIKTESDTFKAASRAEKMEHDELDVSGDEFQDDDETPHFERNDDEDTKDSKERIRREQLGANLFGEGDEQEVDKELQEQLREELERQKYGKTTKKALIKRDREDIYESDNSGSNPWSSSSDDDSSDEEDEAGKDDEKKEGENKEGQGDGKDKSKSQSAKGSTTPQGKQKLSEMGKKGKSLKRAGSPALSESSGNESTRKKFKKASGAATDSRPSTPGLQTNTVRRPKITAGSGSDGEFTAGEMSDGAMQKKKIKLIGSSRGTPSASRAGSPNPAQAGASPSSSGGLIESWEILEKIPADGITIGDLINLFQGRVGDGPGRMPRQEWIGLVKQLCDYGPDKRLRRRK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.57
2	0.62
3	0.66
4	0.71
5	0.76
6	0.79
7	0.83
8	0.84
9	0.91
10	0.91
11	0.91
12	0.87
13	0.88
14	0.88
15	0.86
16	0.79
17	0.75
18	0.73
19	0.7
20	0.66
21	0.61
22	0.59
23	0.57
24	0.57
25	0.61
26	0.63
27	0.66
28	0.74
29	0.79
30	0.82
31	0.81
32	0.84
33	0.81
34	0.81
35	0.74
36	0.65
37	0.6
38	0.5
39	0.47
40	0.41
41	0.36
42	0.25
43	0.21
44	0.21
45	0.21
46	0.23
47	0.24
48	0.23
49	0.22
50	0.23
51	0.3
52	0.33
53	0.33
54	0.36
55	0.39
56	0.48
57	0.47
58	0.46
59	0.42
60	0.43
61	0.43
62	0.4
63	0.39
64	0.37
65	0.4
66	0.44
67	0.44
68	0.39
69	0.39
70	0.42
71	0.39
72	0.36
73	0.37
74	0.34
75	0.32
76	0.38
77	0.4
78	0.32
79	0.32
80	0.3
81	0.28
82	0.3
83	0.32
84	0.29
85	0.31
86	0.34
87	0.37
88	0.4
89	0.37
90	0.36
91	0.35
92	0.32
93	0.3
94	0.3
95	0.3
96	0.33
97	0.35
98	0.38
99	0.39
100	0.46
101	0.44
102	0.41
103	0.42
104	0.38
105	0.41
106	0.37
107	0.37
108	0.32
109	0.31
110	0.31
111	0.28
112	0.25
113	0.21
114	0.23
115	0.19
116	0.21
117	0.28
118	0.33
119	0.38
120	0.41
121	0.48
122	0.52
123	0.62
124	0.64
125	0.65
126	0.64
127	0.63
128	0.68
129	0.67
130	0.62
131	0.57
132	0.56
133	0.52
134	0.55
135	0.53
136	0.49
137	0.46
138	0.48
139	0.45
140	0.4
141	0.34
142	0.29
143	0.29
144	0.27
145	0.24
146	0.28
147	0.27
148	0.26
149	0.25
150	0.25
151	0.2
152	0.2
153	0.2
154	0.16
155	0.17
156	0.25
157	0.26
158	0.27
159	0.3
160	0.29
161	0.3
162	0.31
163	0.3
164	0.24
165	0.22
166	0.21
167	0.2
168	0.2
169	0.18
170	0.15
171	0.14
172	0.14
173	0.14
174	0.21
175	0.21
176	0.29
177	0.38
178	0.44
179	0.52
180	0.6
181	0.67
182	0.7
183	0.8
184	0.8
185	0.82
186	0.84
187	0.85
188	0.84
189	0.85
190	0.8
191	0.76
192	0.72
193	0.61
194	0.56
195	0.49
196	0.47
197	0.45
198	0.49
199	0.46
200	0.42
201	0.43
202	0.5
203	0.51
204	0.47
205	0.42
206	0.36
207	0.34
208	0.33
209	0.33
210	0.25
211	0.24
212	0.2
213	0.17
214	0.16
215	0.13
216	0.11
217	0.11
218	0.12
219	0.14
220	0.13
221	0.12
222	0.12
223	0.12
224	0.12
225	0.11
226	0.09
227	0.05
228	0.06
229	0.06
230	0.05
231	0.06
232	0.06
233	0.05
234	0.06
235	0.05
236	0.05
237	0.05
238	0.05
239	0.05
240	0.05
241	0.07
242	0.07
243	0.07
244	0.09
245	0.1
246	0.1
247	0.1
248	0.14
249	0.13
250	0.17
251	0.2
252	0.23
253	0.23
254	0.26
255	0.29
256	0.33
257	0.34
258	0.35
259	0.41
260	0.41
261	0.47
262	0.49
263	0.5
264	0.43
265	0.45
266	0.4
267	0.38
268	0.36
269	0.29
270	0.23
271	0.2
272	0.2
273	0.18
274	0.17
275	0.11
276	0.08
277	0.08
278	0.1
279	0.1
280	0.1
281	0.13
282	0.17
283	0.2
284	0.21
285	0.22
286	0.22
287	0.25
288	0.27
289	0.27
290	0.27
291	0.23
292	0.23
293	0.22
294	0.24
295	0.2
296	0.17
297	0.17
298	0.14
299	0.14
300	0.14
301	0.15
302	0.12
303	0.12
304	0.12
305	0.11
306	0.11
307	0.14
308	0.18
309	0.21
310	0.21
311	0.21
312	0.22
313	0.22
314	0.21
315	0.2
316	0.16
317	0.14
318	0.14
319	0.15
320	0.15
321	0.16
322	0.15
323	0.14
324	0.16
325	0.16
326	0.16
327	0.18
328	0.2
329	0.21
330	0.2
331	0.18
332	0.16
333	0.14
334	0.14
335	0.12
336	0.08
337	0.06
338	0.06
339	0.05
340	0.05
341	0.05
342	0.05
343	0.05
344	0.06
345	0.06
346	0.08
347	0.09
348	0.12
349	0.12
350	0.11
351	0.12
352	0.14
353	0.19
354	0.18
355	0.19
356	0.19
357	0.21
358	0.24
359	0.25
360	0.23
361	0.22
362	0.27
363	0.32
364	0.38
365	0.44
366	0.46
367	0.48
368	0.51
369	0.51
370	0.48
371	0.44
372	0.35
373	0.27
374	0.22
375	0.18
376	0.14
377	0.09
378	0.05
379	0.05
380	0.04
381	0.04
382	0.06
383	0.06
384	0.06
385	0.07
386	0.08
387	0.09
388	0.1
389	0.1
390	0.11
391	0.13
392	0.14
393	0.14
394	0.21
395	0.22
396	0.25
397	0.25
398	0.26
399	0.28
400	0.35
401	0.42
402	0.39
403	0.43
404	0.45
405	0.54
406	0.57
407	0.63
408	0.66
409	0.67
410	0.66
411	0.67
412	0.63
413	0.56
414	0.54
415	0.45
416	0.41
417	0.34
418	0.31
419	0.24
420	0.23
421	0.21
422	0.18
423	0.17
424	0.11
425	0.1
426	0.11
427	0.12
428	0.12
429	0.14
430	0.17
431	0.18
432	0.19
433	0.19
434	0.2
435	0.19
436	0.18
437	0.16
438	0.12
439	0.11
440	0.1
441	0.11
442	0.1
443	0.09
444	0.11
445	0.11
446	0.15
447	0.15
448	0.17
449	0.21
450	0.22
451	0.26
452	0.29
453	0.29
454	0.29
455	0.3
456	0.28
457	0.26
458	0.26
459	0.23
460	0.24
461	0.25
462	0.23
463	0.24
464	0.31
465	0.31
466	0.33
467	0.4
468	0.39
469	0.42
470	0.44
471	0.47
472	0.47
473	0.51
474	0.5
475	0.49
476	0.52
477	0.49
478	0.47
479	0.45
480	0.48
481	0.46
482	0.49
483	0.49
484	0.5
485	0.52
486	0.56
487	0.61
488	0.56
489	0.59
490	0.58
491	0.59
492	0.58
493	0.6
494	0.58
495	0.52
496	0.49
497	0.44
498	0.39
499	0.33
500	0.25
501	0.21
502	0.23
503	0.22
504	0.21
505	0.23
506	0.24
507	0.29
508	0.4
509	0.43
510	0.42
511	0.47
512	0.54
513	0.61
514	0.64
515	0.68
516	0.66
517	0.68
518	0.67
519	0.63
520	0.59
521	0.5
522	0.43
523	0.34
524	0.27
525	0.24
526	0.24
527	0.26
528	0.28
529	0.33
530	0.37
531	0.44
532	0.52
533	0.56
534	0.53
535	0.49
536	0.48
537	0.46
538	0.49
539	0.45
540	0.4
541	0.38
542	0.41
543	0.41
544	0.38
545	0.34
546	0.27
547	0.23
548	0.17
549	0.13
550	0.09
551	0.07
552	0.07
553	0.06
554	0.06
555	0.1
556	0.12
557	0.14
558	0.17
559	0.19
560	0.26
561	0.3
562	0.33
563	0.34
564	0.36
565	0.42
566	0.48
567	0.56
568	0.56
569	0.57
570	0.56
571	0.55
572	0.52
573	0.44
574	0.39
575	0.37
576	0.32
577	0.28
578	0.28
579	0.28
580	0.34
581	0.35
582	0.36
583	0.29
584	0.29
585	0.28
586	0.26
587	0.28
588	0.22
589	0.21
590	0.17
591	0.15
592	0.15
593	0.15
594	0.14
595	0.09
596	0.08
597	0.07
598	0.08
599	0.08
600	0.07
601	0.09
602	0.09
603	0.08
604	0.1
605	0.1
606	0.1
607	0.11
608	0.11
609	0.11
610	0.11
611	0.11
612	0.11
613	0.1
614	0.09
615	0.09
616	0.09
617	0.07
618	0.1
619	0.1
620	0.08
621	0.09
622	0.1
623	0.1
624	0.11
625	0.14
626	0.13
627	0.14
628	0.2
629	0.26
630	0.3
631	0.29
632	0.3
633	0.3
634	0.33
635	0.35
636	0.31
637	0.31
638	0.33
639	0.38
640	0.38
641	0.37
642	0.32
643	0.31
644	0.29
645	0.27
646	0.23
647	0.25
648	0.33
649	0.4
650	0.47

G9NS53

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer